Os05g0247900
| Gene Name |
Os05g0247900 |
|---|---|
| Description |
DEAD/DEAH box helicase, N-terminal domain containing protein |
| Version |
NM_001061556.1 GI:115462842 GeneID:4338212 |
| Length |
7187 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0247900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:8977181..8984367 |
| Sequence Coding Region |
8977740..8978032,8979076..8979310,8980225..8980500,8980590..8980716,8981293..8981540 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:8977181..8984367 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
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| Protein Sequence |
<aaseq>MSLHSLKETLQSSSFSQPQSESQPRSPPPLLARRPPKTSLSQQL LRLDASSSSSSFSVSPPPPPRTSPTSDAAADDAPPLPEEEDEVPCIRPRASLPPAASL DSRGPYEPLALSPPGERPVVQVPSSINCRLLVHQRDGVRFLYNLYRNNHGGVLGDDMG LGKTIQTIAFLSAVIGKDNDHGDQLVEGRKIAPILILCPTSVIRNWENEFAEWARCSV AVYHGPNRDLVLQKVETQRLEIVITSFDTFRIHGKILCGISWDLVVVDEAHRLKNEKS KLYTACLEITTRKRFGLTGTIMQNKIMELFNLFDWIVPGCLGDREHFRVYYDEPLKHG QRFSAPERFVQVADKRKKHLVSVLSKFLLRRTKEETIGHLMLGKEDNIVFCRMSDVQK RVYRRMLQQPDVQILINKDLPCSCGSPLTQVECCKRTEPHGIIWSYLHRDNPEGCSLC PFCLVLPCLGKLQQISNHLELIKPNLKDEIEKQKKDAELAAAVFDTDIELVGGGAKSE NFMGLSDAEHCGKMRALERLLSLWTLQGDKILLFSYSVRMLDILEKFLIRKGYCFSRF DGTTPMNARQLLIDEFNRCPSKQVFLISTRAGNLGVNLVSANRVVIFDPSWNPAQDLQ AQDRSFRFGQRRHVTVFRLLGAGSLEELIYSRQIYKQQLSNIAVSGKIEKRYFEGVQD DKKFQGELFGICNLFRDLSDKLFTSEIIEMHGEHGKGNTAETIGIREIVDTNIFGTQD QMKSSMTAIHNENKNLYHCGIVYAHRNEDVVNTRTNEASNCAEDKTVPRHLEELQSKK NETMHTIKAKSYSLVQKKKEFSRIASFMGMNDLEFSKWLLSVSPLQRHEVLDRYRNAK </aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6336..6628#5058..5292#3868..4143#3652..3778#2828..3075#1840..2755#858..964#14..382#gccaagcaacgccatgtcgctccacagcctcaaagaaaccctccagtcttcctccttttcacagccccaatccgagtcccaaccccgatcacctcctcctctcctcgccaggaggcccccaaaaacgtccctctcgcagcagctcctccgccttgatgcctcctcctcctcttcctccttttccgtctcgccgccaccgccccctcgcacttccccgacctcggatgcggcggcggatgatgcgccgccgctgccagaggaggaggacgaggtcccctgcatccgcccccgcgcttcccttccgccagcggcctccctcgactcccgcgggccctacgaaccgcttgctctctcgccgcccggagagcgccccgtcgtccaggtaaaatctatgctgccgcctccctcttggctactactgttcgatgttccggtccacagttcttggcgagtggcgactggtcaggttctcgcaccgtgataggttctgaccaatgttttgcacctgccatggctttttttttttgggtgattgatagcatgttgaataataggaggagagattacagcataacctgatgattatattgagcctcagggctggggcaggtgtgtatagtacaagagataaggaagacataatacaaatcaatcatatcctaatatccctttaactaccatataacagatgtggcttccctttccctcctaatatcccttccctctgttcactttagtccctccttcaacagaattttactcactttagcctctcttttatttttagttagagcaattttttagttattacaagcacattcactttgctgtgctttcctctgttttgtttggtacaggtaccctcctcgataaattgcaggctacttgtgcatcagagggatggtgtaagattcttatacaatctgtatagaaacaaccatggcggtgtgcttggagatgacatgtgaggtttggaagttattttgttacagtataagtacactgctaaataacttgtactcttgtatgatataatctcctgattgtggctgaactgaaatgaaactatacaatatccaaaacaatacatatctctttctatccatgtgaaaacattgtggttgataggtttgtgggcttaaatcgtcaaattcaatgaaacttggtaatattactcacaaccaggagattatatcatacaagggatttttttcttaaaaagattttgtaagtgacttattactattgctttattaaagtctaaactccgacatgataactagtttttttttaagtttatttaaagttttacaaaactgtgacagggaaattgtagttagtttgaaaagtatcttaaaattatagtctttaaaagataatacatgtattgcatatgtcctgatgttcctaaacttctatgtaataaccatgcacatagtttgcatggtttatattattttgtgaaaaattaataactaaaccattcccactgtatgtagctttaatccgttggcggtttacttcgtggtcttattctgttcttatcatcaatttatatacatagtttgctcatattctgcatgatgggtaagcatgtggatgattgacaggtacttgcaccggcatcacataagcataccctgtaggtctgttgggaaaaaaaatctcagggtcgatagcaagcttgagcattttatttttggggagcttttttctactcacctattattaaatctcaaaccgaaaacataataatgagatttttcaacacaacatttaaatttgatggacttctgagttctgactcccttgtttctcatgtttttttttctgatttaggggtttgggaaagactatccaaacaattgctttcttatcagctgttattggaaaagataatgaccacggtgatcaattagtggaaggaagaaagattgcccctatactcatcctctgccccacatcagtaattcgaaactgggaaaatgaatttgcagagtgggcaagatgttctgttgctgtctatcatggcccaaatcgtgacctggttcttcaaaaggttgaaactcaaagactagagatagttattaccagttttgacacttttaggattcatggcaagattttgtgtggcatctcgtgggaccttgtggttgttgatgaggcacaccggctgaagaatgaaaaatcaaagttatatacagcttgcttggaaattactactcgaaagcggtttggtctcacaggaaccataatgcaaaataaaataatggaattatttaatctgtttgactggattgtacctggttgcttgggggatcgagaacactttcgagtatattatgacgagcctttaaaacatggccagaggttcagtgctcctgagagatttgtacaagttgctgataagcgcaagaagcaccttgtttcagttcttagcaaatttctgttgagaagaacaaaggaagagaccattgggcatctcatgcttggaaaggaggataatattgttttctgcagaatgagtgacgttcaaaagcgcgtttacagaagaatgctgcaacagcctgacgtgcaaatccttataaacaaggatctcccatgtagctgtggaagtcctttgactcaggtggaatgctgcaagagaactgaaccacatggcattatctggtcttatcttcacagagacaatccagagggttgttctctgtgccccttctgtcttgttcttccttgccttgggaagcttcagcaggttatttcatattcttaaaatattttggaaagatttatgtttttttaataattccccactaattttccatagatcagtaaccatctggagctgataaagccaaacctgaaagacgaaattgagaagcagaagaaagatgctgagcttgcagctgctgtctttgacacagatattgaattagttggtggaggtgctaaaagtgaaaacttcatgggtctcagtgatgcagaacattgtggaaagatgcgtgcgttggaaagactattgtcattatggactctgcagggtgacaaaattcttcttttcagctattcagtcaggtgagtggttatccccaatgtgtccaatgcttcagtaagcatgaagattaaagcaagaataacatatctcacaagtcagaaaatttctttgttttaaaccatatttgatgttgaacaaaaagctcttattgatgtaagaccttggaattgattgttactaaatgttcataaaatatcattacttactgtagtgggtataatttctcacaagcccatcatgctccagtttttgctgaagttgtggtttatatacctttgacagtatagagcgttaaatcattgaatagatgtaaacttccttctacttgcctttctttaaatacacttttagggaatgtgattagacaggttacactgaacacaaactaaacctatttatttagacctgaaagtaagttaaaacaaaacttgcttgtatcgaatagcttatttttctcttaagcatctatcttagttcttgttcactgcgtttgcttcttggaacgtttcttgacagtacttgcgatttagatatgctgcttgatgttatatcttctgcatgtgtaatcacttgttcatgcataaattgacaaccaggatgcttgacatactagagaaatttcttatacggaagggttactgcttttctcgctttgatggaacgactcccatgaatgcacgccaattactaattgatgagttcaatagatgcccaagcaaacaggtaacttcctgttgatgtgcatttcagtactcgctgccaaaagaactttttagattagcatcgtcaaatggtgaattgcttttctacaggttttccttatatctacacgggcaggaaatttaggtgtcaacctggtcagtgctaatcgtgtggtgatttttgacccaagttggaaccctgcgcaagacttgcaagcgcaagacaggtcatttcgatttggacagaggcggcatgtcactgtatttcgcctacttggtgctggttcccttgaagagcttatttattctcgacaaatatataagcaacagctttccaatattgcggtctctggaaaaatagaaaaacgttactttgaaggagtgcaggtaatgttgtaaaactaatgcattttgatgaaattggattgattgtttcaattacttgaagggtggtacaattgtggaccatcctaatatgattcccttttcctgttctaaaatcatttccctgaattacctagtcatttaggtccttatattttttccatttcccaaaatacgtgtttctcccgtgcttgtatttggactgattattacaatcataacattcatattttattcagaaaattattgtatttcgaccatttgattatgcagtttaatatactcaccagagaatttagagtttgtaagttgatgcaaactacctggatgatgtattgttaacaaacaagcgtagacattgtgtaatccacatgatactgatattaatatttgttgttaagagtagcaatttagcagaatcaaacacgtgacacatgaactgccttgcactattcctacattgttgcatacatcaccatatgttaatgtacttcctattttggttcctagcttagcagtcataggcataagagaatggttgcactcataatacacatacagcacttaaggtagattcattattttctgttgcagtgtcctatggcacctgaatagtaaaatgatgtgtcactacatgtattaaatctagggcaatgctgccttttttaactagatagttttctcaccttacctcatgactttccaaattctgtgttaacatgaatacttttttttagaataaggcatctatcaattcactaga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