Os05g0436400

From RiceWiki
Revision as of 10:23, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os05g0436400| Description = Peptidase A22, presenilin signal peptide family protein| Version = NM_001062183.1 GI:115464096 GeneID:4338901| Lengt...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os05g0436400

Description

Peptidase A22, presenilin signal peptide family protein

Version

NM_001062183.1 GI:115464096 GeneID:4338901

Length

5129 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os05g0436400, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:21378130..21383258

Sequence Coding Region

21378139..21378266,21378365..21378450,21379055..21379182,21379323..21379373,21379630..21379716
,21380474..21380543,21381390..21381526,21381911..21381988,21382968..21383054

Expression

GEO Profiles:Os05g0436400

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008398:21378130..21383258 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008398:21378130..21383258 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgcggtttcctttggtgggaagtgctatgcttttgtccctcttccttctattcaagtttctctcaaaagatttggtcaatactgttctcactgcctactttttcattcttggcatcgctgctctctgtgcaacattgctgccttccataaaacgatttcttccaaaagaatggaacgataatgccattgtttggcgtgctccacttttccactcgctctcggtggagtttaccagatctcaagtcgttgcatcgatcccaggatttttcttttgcatatggtatgctgcgaagaagcattggctagcaaacaacgttctggggatttctttctgcattcagggaatcgagatgctatcacttggatcattcaaaactggtgctattctcttgagcggactctttttctatgatattttctgggtcttcttcactccagttatggtcagtgttgccaagtcatttgatgctccaataaagcttctatttcctacaggtgatgctgcacgcccgttctctatgcttggccttggtgacattgtaatacctggtatatttgtggcacttgcgctgcgttttgatgtctcaagaggaattaagaaccgctattttaatagtgcatttttgggttataccgtgggtctgactgtgacaataatagtgatgaactggttccaagctgcacagcctgctctgttgtacattgttcctggtgtgattggttttgttgctgttcactgtttgtggaatggtgaagtaaagccgctccttgagtacaacgagtccaaagcggaagaggaggaagcttgtgaagaagatacagatagcaagcaaaacaaaaagaaagagtag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MRFPLVGSAMLLSLFLLFKFLSKDLVNTVLTAYFFILGIAALCA TLLPSIKRFLPKEWNDNAIVWRAPLFHSLSVEFTRSQVVASIPGFFFCIWYAAKKHWL ANNVLGISFCIQGIEMLSLGSFKTGAILLSGLFFYDIFWVFFTPVMVSVAKSFDAPIK LLFPTGDAARPFSMLGLGDIVIPGIFVALALRFDVSRGIKNRYFNSAFLGYTVGLTVT IIVMNWFQAAQPALLYIVPGVIGFVAVHCLWNGEVKPLLEYNESKAEEEEACEEDTDS KQNKKKE</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>10..137#236..321#926..1053#1194..1244#1501..1587#2345..2414#3261..3397#3782..3859#4839..4925#gaacatgctatgcggtttcctttggtgggaagtgctatgcttttgtccctcttccttctattcaagtttctctcaaaagatttggtcaatactgttctcactgcctactttttcattcttggcatcgctgctctctggtaagttcaaatcctattattagaagagtttttccacacatgtaacttcttaatactgtttttgtgaaattaagaatgtttatgtttttctcttgcagtgcaacattgctgccttccataaaacgatttcttccaaaagaatggaacgataatgccattgtttggcgtgctccacttttccactgtatgactcacacctcattattgccatcatgtatcatgtcagatcaatacatctatgtaatcctatctattagtagtctactatatgagggaactatttggttgcatctctagtattgccaatttgccatacatcaaaacaatgttgtggcgacataatccatatacttattgtgtgtcatagctagaaaggatttggttttatttttgggaacatggtgtctttttccagtagaccaattcatcctagagcagaactttaaactgtctgtactgtattacaaaatcataaatacatgatatcgcttaatacaagcaagtaacacaacttattcaaaagacgttaagagtaaagttaagtatttaaattgttcctaaacaatttagtggcatctaaatatgctttcattaacagcatgttgtatggatatggtatccagttttcctgagtgaaccatataggtgctgttagtatgtcagttccttttgttaggaaattattgaaatggcaaaaaaggatcctcctttcaataacattgaaattgtatcatgcaagtcacttctttgtttactggtcttttaagttcattcacttcttatttcagcgctctcggtggagtttaccagatctcaagtcgttgcatcgatcccaggatttttcttttgcatatggtatgctgcgaagaagcattggctagcaaacaacgttctggggatttctttctgcattcaggtttgatcttattgctatttttgagatataatgttaatatgcatgagtaaattaattacggtatgaaagtttcgtagatatgttttttttcccaccaacttgtagagaaacctgaatccctgattctctttgccatccagggaatcgagatgctatcacttggatcattcaaaactggtgctattctcttggtatggattgtttgtattgaactgaaacttatattttctggtggtacttgtcaaagcaccttttattatttcagccatcaaaatcattactagttgagcatggcaatgataatttgaattttctgatatgctataatttatggttgcctttcttttgcttgcgaaattaaagtccatatttgtatacaccaccgtattgtgtaaagcatttttaatttgtaacttttgtgtatcgtggtattcccttttaattcagagcggactctttttctatgatattttctgggtcttcttcactccagttatggtcagtgttgccaagtcatttgatgctccaataaaggtaagtattccttgatttcactcttgttgcaatagccattcatttctatacctaatcaaaaaatacgtaaggtttccagtagttattttcgtctgtttcttttttttcgccgctttttcctttttttgtgccgtccagttgcaagaaaggctaaggatgagccatcgggcccataacaataccggcccaagggaccccttacagaaaccctagaaccacctgattttcatcacaaagacccctactgtcttcgcccttcgttgctccccctctcccagatccgaccgcctccgcctccggcccgccaccactcgccctgaatatctggcttctcaatccgcggaaactactccctgttgttcgtcgacctctttgtcgccggagacctctaggttttctccctctctatgttactgtatgtttgtatggtcgtctcaaactctttggatgtttctttatgtgctcggtggctaattagccaatcacacactgcagccgccatggcagcaaccttaaccctgtgtgaatggtcagtaagctcacctacattgatccgctttgttgcgtcgattggaggaacggctcttcttgtacgtgcttccttcattgatgcatcaacgcacgctgctatatgacctagctctaagtttaatccatcccgtgtgaattcgttttctaggttgcaaatatactgttttagaaatactagttttctaaaaaaaggttaatctagttctactcatttttttttgcacagcttctatttcctacaggtgatgctgcacgcccgttctctatgcttggccttggtgacattgtaatacctggttagtaataaaatctttagattatttatttcaacttttatttggcctgtgatttctggttgaatagggtcattcaggctgtcagctgcattagattgagaacttgtttgaatttatgatctatagcaagctgttagttcaactgggttgtttgttaaaaatagtaacccgattcaaaactgtatctgtttgctacatcatttgagttcctatttttttctcctgtggctctaaaggtgcgtaggcatgtagcagagaatcaaatcaactatatcataaaataatgtagatataattttagttccatttgctggtaataggagtacagttgtgtgtattgccagaaaataattgtaaattcagcatttcagctgctttgagttgcttgtaaaaatgtactccgagtctgaattctggctctgttatccagatgaagccaacaaggttggctatttgtcttcaaactacttagttttataatgaggatatatgttggtttttggctatgatattactttctatacttgaatctaaataaaatgaatagcagaatcatttgcactaccctggttcgttaatttttttttccagggattagtttagttggttggttagggtatgcatgtggatgccttctactgaataatgcattaaactccttgttgtctttattagcactaaagctcgaagaatttgttgttgctagttgctacttgccactgatcgtttgtctttccttagcagtcttcacaccattcaatagtgtaaatcatgaaattgacacatattctgcaaggtgcaactcttgtattgacacataatatgctcttctacttttggttccaggtatatttgtggcacttgcgctgcgttttgatgtctcaagaggaattaagaaccgctattttaatagtgcatttttgggttataccgtgggtctgactgtgacaataatagtgatgaactggttccaagctgcacaggtgagttctgttactaaggattctcgccatcgtgttgcctctttttttcccaagggaaacagtgagggagagcctactgtatacagattattttaaacaaaatgaactgttatacatacataaataaaaggggaaaaagaaggtaattatgttggtgcatctgccacctctacaccaccagaccacctccaccctgtataaacttgtagtagtacaaaggaagctataaaccttgtaaaaggaaaaacaaggaaataaaattacatcaagatccaaccgggactccagttataacaggaaaagaaagttgcctctgatttctgtcatctctgaaatattaatgcccctcttctttcattgtctttattttctcatcatatgcagcctgctctgttgtacattgttcctggtgtgattggttttgttgctgttcactgtttgtggaatggtgaagtaaagccggtaagtttgttaactctgaccatggtatttcccaacctgtccattgtcctgaaacttgagagtacgctgcgtaatttattctgttgaaggggcccctttttttgttacattactaaaaactcaaagttaatagccttcgttcatgatgcttaattgctactgcaaagacgtgggagttttatgtacaataggatggttgatataatttgttggaagagtcgctgtatttattttgatgttagtgttagaatggtgttgctatggttaagttattatgtaccacacgctgttaaatatttgattttctaagctgtgagcaatgcccgtaccatttatgcatgaaatggctttgtacgcatcgttagagattatgcgattccggtgctgaaaggctgagaacatgatgaagttttgaacatggatgatattctttgttgctaacatcaaattatttttttagctaaaaatgactagattattttccttctatcttttgatcactagataaaaatcacttggtttgctggttcgcagtggagtgaacagccaggcatgggctcaatccttatcactgaaatctgtgcgtcagtggggaacttttttcctactccctgggattgcctctatgggttaatcctgggacatttaacttcttgccacttttaagatgtggcaattaattatttgccattcactgtctatgacatgtgggtccagtggcaaataatttagcaccacttgtaagagtggcaaatagttaattattccgttaatcctagctaggacttgatacaccagtagggctcgcctcccacgtataatatatgtatctagtgtgtatgtgaaagctgatgcttgctggcgtgggagtgggagtggccgggtagtttagtttctgttatgcgtatccttagttttacctttattgttttcgtattttattatgattatacttgctgacattttattacattgccagctccttgagtacaacgagtccaaagcggaagaggaggaagcttgtgaagaagatacagatagcaagcaaaacaaaaagaaagagtagggctctaacaagtaacaatcataccttgaggactagaatattcagaaactttatgtaaggtcttcggcatctaagtaggctggatgacctttgggatacaagctcacttagaacttagaaatgattcacatgatagaatctttctggttttgagaattgtttggtctggtgagtagatgaggaatgcatcctaagtggtttagc</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os05g0436400, RefSeq:Os05g0436400