Os06g0105500
| Gene Name |
Os06g0105500 |
|---|---|
| Description |
SAM (and some other nucleotide) binding motif domain containing protein |
| Version |
NM_001063091.1 GI:115465913 GeneID:4339860 |
| Length |
6955 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0105500, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:374711..381665 |
| Sequence Coding Region |
374785..375089,375868..376093,376758..376883,376978..377142,377219..377337 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:374711..381665 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcctagctgctgctgcctcctcggcctcggcttcccctcgccgccctccgccctccgcatcctgcgccgccgcatggcctctcgcgccttccagctccgcctcaacccgctcaccggcgactccgaatggctcgtcgttgaggaggaggaggaggaggaccaccacccgacaccgccacccaagcagcttctcgccaccacctcctacctcgacatgctcaacgactccgcccggaaccgcgcataccgccgcgccatcgaagccgccgtcaccgacccttcctcgcgcgtcctcgacattggagctgggactgggttgctatccatgatggccgcccgagctttggcagctgttgggggtgaaactagaggaggaagtgtttcagcatgtgaatcttacctcccaatgggaaaattgatgcgaagggtactgagagccaatgggatggaaaacagggtcaaagtctttcacaagcgttcggatgagctcaaagtcagagatgacctggattcaccagctgatatattggtaagtgaaattcttgattctgagctgttgggcgagggtctgatacctactttacagcaagcatatgacatgttattggcaaaaaatccaaagatagttccttatcgagccactacatatgggcagctagttgaaagtacattcttgtggaagctacatgatttgcacaacaatgaagcaaatgctgcagacggtgtatggcttactcctggtgagatggagaggattgtgtctgtgaagccacaacaacatgcaatgcaatgtgatgcactagaagatgagatacgattgctgtcagaacccttcaaagtttttgaatttgacttttggaaacggccagatagtcatcgtgaggccaatatcaagatacgaacaacacgagatggatatgttcatgctattatttcatggtgggtacttcaattggattctgctgggtcaatcttctactcaactgctcctagatgggcgagacaatcaagtagtgaggggccgcaacgcgacatgaaggattggtgtgatcactggaagcagtgtgtatggttcatgcaaggcaaggggatccctgctacggaagaccaagttctttcgttacgagctagacataaccaaaccagcatctcctatcagctgaacatcaatgatgaagcatgtgatagaagttccaaaggtgaccatctaacgttgttgccagaacggattgcactttatggtgataaagattggagatcagctctgataaataccattaaaaatgctttaactgtgaaatcttccccaacttgtgttgtggctgacgacagcatgttcttggctctcttaatttcctccatgtcacccacttcaaaagtcatcgcgatgtaccctggtctacgggacaagggtgcagcctatcttcgatctgttgcagatgcaaataatttttccatagaccagattcaagtgattggtaaaagagcctcatctattacagctgatgacctgaaacataaaaaggttaatttattagtgggggagccattttatcttggaagtgaaggaatgcttccgtggcaaaatctacgtttctggagtgtgaggaccctacttgactcgatgttatctgaggatgcattcatcatgccttgtaaaggaatactaaagctatgtgcaatgtcacttccggacttatggaggagccgtagcagccttaaagatgtagagggttttgatcactcagttgtcaatgagactttaggagcctgtggttgcctgcctggagaccagcaaggtccttgtctgccgtattatgtatggcaatgtggttataccaagaaattaagtaaagtgtactctctgatggatttcaacttttctgagccaatccactcctgttttgggaaaacaaagatcgagttttctcatgatggaacatgccatggttttgcggtttggattgattgggttcttgatgagagaaaatccgttgtgttaacaaccggaccagataaccgatactggaaacaaggagtacagctctttagcaagcctgtagaagtaaatccaggcaagtcggtgatgcatgtagaggcgtccttcgatccttccacgggtgagataacgttcagcagttcatcaacaacctgctcctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPSCCCLLGLGFPSPPSALRILRRRMASRAFQLRLNPLTGDSEW LVVEEEEEEDHHPTPPPKQLLATTSYLDMLNDSARNRAYRRAIEAAVTDPSSRVLDIG AGTGLLSMMAARALAAVGGETRGGSVSACESYLPMGKLMRRVLRANGMENRVKVFHKR SDELKVRDDLDSPADILVSEILDSELLGEGLIPTLQQAYDMLLAKNPKIVPYRATTYG QLVESTFLWKLHDLHNNEANAADGVWLTPGEMERIVSVKPQQHAMQCDALEDEIRLLS EPFKVFEFDFWKRPDSHREANIKIRTTRDGYVHAIISWWVLQLDSAGSIFYSTAPRWA RQSSSEGPQRDMKDWCDHWKQCVWFMQGKGIPATEDQVLSLRARHNQTSISYQLNIND EACDRSSKGDHLTLLPERIALYGDKDWRSALINTIKNALTVKSSPTCVVADDSMFLAL LISSMSPTSKVIAMYPGLRDKGAAYLRSVADANNFSIDQIQVIGKRASSITADDLKHK KVNLLVGEPFYLGSEGMLPWQNLRFWSVRTLLDSMLSEDAFIMPCKGILKLCAMSLPD LWRSRSSLKDVEGFDHSVVNETLGACGCLPGDQQGPCLPYYVWQCGYTKKLSKVYSLM DFNFSEPIHSCFGKTKIEFSHDGTCHGFAVWIDWVLDERKSVVLTTGPDNRYWKQGVQ LFSKPVEVNPGKSVMHVEASFDPSTGEITFSSSSTTCS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>75..379#1158..1383#2048..2173#2268..2432#2509..2627#2701..2792#3256..3512#3900..4136#4276..4349#5514..5607#5712..5861#5936..6010#6399..6495#6584..6729#agagaccgccgccgccgccgccaaaaaaacccgtaaaccctagctcacgacggccggcgtcgcgccgccgccccatgcctagctgctgctgcctcctcggcctcggcttcccctcgccgccctccgccctccgcatcctgcgccgccgcatggcctctcgcgccttccagctccgcctcaacccgctcaccggcgactccgaatggctcgtcgttgaggaggaggaggaggaggaccaccacccgacaccgccacccaagcagcttctcgccaccacctcctacctcgacatgctcaacgactccgcccggaaccgcgcataccgccgcgccatcgaagccgccgtcaccgacccttcctcgcgcgtcctcgacattgggtcagctaacccaacccaattcaaatacctcctcaattttggtttatgctctaaatacctgaatttttctttttaagccagtccggcccaagtaggctaaccaatttcattaacattggggaaacagtacaagttacaaactcatttacaccaacagcacgcacttccagcatctaaattttttctttctaaaacactcaggttccttccaaatggacatcatctctttgatgtctacatacctcaaattgtaggccataattcaactgcctgtcgaatttaggttcacttactagcattactggattattagctaatgtgatctcatctcatctcatgactcatggatactgcatagggcaccgagatcatgctcactgttatctttaatagcaccataaagctaagcatccaaactcatgttaggtgttaattctcagggaaaatattgctttacagggttatagttggggctttttgtgaagtttttagattaggattcagtgaatatcaagccatcaggttgcattggattggataaatataaacagatagtgggctctcttttctaaattatcttttatcaatcattgaatataagttttgaccaagttatctatctctggctataggtttcctaaggctatattacaaagcaaatattactttcagccttttatgtgcaagtgtctcattgccttgcttaagttgtcctggttactgcatgattatttctagcaaaaggtggaatggatgcttatgtctttaatgatttcagagctgggactgggttgctatccatgatggccgcccgagctttggcagctgttgggggtgaaactagaggaggaagtgtttcagcatgtgaatcttacctcccaatgggaaaattgatgcgaagggtactgagagccaatgggatggaaaacagggtcaaagtctttcacaagcgttcggatgagctcaaagtcagagatgacctggattcaccagctgatatattggtatgctcttgttttaggccagcactattgaccataagatgctgctcatatatatagcaaatttggcaggggaaaatgatcattttccaatctaaagagtagcacttgatcatttgctaccccttgtctctcagacatgttgcctcaggacccatggtcagagtctacacattgtgtgggaaatgattgattttgccaccccaaatgttcagtcccccattatattctgaattaaaattgctaatctcatctatacttgattatccaaccaaaagtttcccaaaagaaaaccattctactgatctcacttattgtcaatgtgatagactatctgtatcaggcaaactgctgtagatgtattgattgttttgtttttttttcttgaatacgcaagagagttgcgtatcatttcactaagaagaagagaaaaacaggagaattgggaggggagcccctcccctcaccaagaccccacaggccaagacctttacaaacaggggattgttttgttattttgactactgccattcagaggcacggccaactcaatattgcttactttcccttctatttgtgttttaggatataagagggtttaacacttttcttgctattgtgtattatgtgtaactaatactcgtgctaacaaagacatgttctgcaggtaagtgaaattcttgattctgagctgttgggcgagggtctgatacctactttacagcaagcatatgacatgttattggcaaaaaatccaaagatagttccttatcgagccactacatatgggcaggtcagttcccagtgccttctaatatgcgtttgtcccaattttaacaatgtgagataaatttatactgaatttgttgatttccttgatgtcctagctagttgaaagtacattcttgtggaagctacatgatttgcacaacaatgaagcaaatgctgcagacggtgtatggcttactcctggtgagatggagaggattgtgtctgtgaagccacaacaacatgcaatgcaatgtgatgcactagaagatgagatacgattggtatggactttagttttgcaaaatctggtagaaaagtattgtcccaactcccaagtcctaatttgtcttaatgtagctgtcagaacccttcaaagtttttgaatttgacttttggaaacggccagatagtcatcgtgaggccaatatcaagatacgaacaacacgagatggatatgttcatgctattatttcatggtagtgcagcctcttgaagaatctctagtcttctgaaatttctctgaataaatgcatttatctgtgactgcaggtgggtacttcaattggattctgctgggtcaatcttctactcaactgctcctagatgggcgagacaatcaagtagtgaggggccgcaacgcggttggttaaataattagaattttgtccacctttttttgcatttagtcagtaccttttcctagatttatgtgatcatagagttgtgcacaacatgtagaacagttgatatgtgcatgccaattcctgataagtagaacagtcattctagagtctgacttctaccaagccatagaaaactatttattaggtcacatgcatatgtgtatacgatcatatgcttcacaaaagatcatccaaggcagacacatatgcatacacagatccattcatagaagatcatcacaatgaaaaaccataatcgctactaacttgaatatttactgtagtcgctaataaagatttgaaaccactcagtcagactagcatgctattgatgtgggccttttaggactagcattacttctgaaatactgaaactacttgaaactatagaatttattcatattgctttctgcttttatagacatgaaggattggtgtgatcactggaagcagtgtgtatggttcatgcaaggcaaggggatccctgctacggaagaccaagttctttcgttacgagctagacataaccaaaccagcatctcctatcagctgaacatcaatgatgaagcatgtgatagaagttccaaaggtgaccatctaacgttgttgccagaacggattgcactttatggtgataaagattggagatcagctctgataaataccattaaaaatgctgtgagtttccccaattcatttgcctataaatattatgatatttaagctataacttctctgtggccttccactttgcactactgggaaggaaccacttatgttggttatgtgtaacttccgtagaatccaaacatctgttacttttgggaaggagggagggaattctatgcttgcctactgacattcaagtttctaattgataacctctgttggcccccttcatgcatatatgaagcatattgttcgacgttatcagcagctctgagatgattttgcttctgttcttaaaattgatcactttttttagtgggaatacacgattaattctatatttttatgctatgtataacaacttgagcttattgatgtttaattttgccttgccagttaactgtgaaatcttccccaacttgtgttgtggctgacgacagcatgttcttggctctcttaatttcctccatgtcacccacttcaaaagtcatcgcgatgtaccctggtctacgggacaagggtgcagcctatcttcgatctgttgcagatgcaaataatttttccatagaccagattcaagtgattggtaaaagagcctcatctattacagctgatgacctgaaacataaaaaggtaaatgctgtaaatgccattagtgggtgattttgaatattcgtcgattccctcattcttgtttaaattcagagtttcatatgctgccgtgttatatgaatgcatcttgatattattaattatctgttcatctccataggttaatttattagtgggggagccattttatcttggaagtgaaggaatgcttccgtggcaaaatctacgtttctggttcgtaagataccaactcacattaccaattgcccctttaaaataaggctttctactccctaatgtcacaatctttgttcattatcttgggaaatgttgtgccacacagtctgtccttttaagaaactgggtgtgtattctgcattgttccgttctctggtccttgtgagaaatggttgtaatttatcttttaagggggtacacatgatgatttctggttagctgcattgttaaattagcgctttcttattctcttgcatggtgagcttcgacatgttttgaaacgaaggaaatacagttagttacttatcaatatgttgattaatttgcactttaaatcattcactgtgtaaaaaacttgattctttagagttgtccttttgtttttggcatatttctgtacaaggggaaaactacccccagtttgataagatgaagccattgctgattgatgttagagatttctacactctgctagtgcatgct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