Os06g0644200
| Gene Name |
Os06g0644200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Pyrophosphate-energized vacuolar membrane proton pump (EC 3.6.1.1) (Pyrophosphate-energized inorganic pyrophosphatase) (H+-PPase) (Vacuolar H+-pyrophosphatase) |
| Version |
NM_001064719.1 GI:115469169 GeneID:4341645 |
| Length |
5767 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os06g0644200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:27149901..27155667 |
| Sequence Coding Region |
27149955..27150252,27152119..27152693,27152856..27153235,27153322..27153408,27153506..27153836 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008399:27149901..27155667 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008399:27149901..27155667 source=RiceChromosome06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgaatcctagcgcgaggatctcgcaggtagcaatggcggcgatactgccggacctggcgacgcaggtgctggtcccggcggcggccgtggtcggcatcgcgttcgcggtggtgcagtgggtgctggtgtccaaggtgaagatgaccgcggagcggcgcggcggggaggggtcccccggcgcggccgccgggaaggacggcggcgccgccagcgagtacctcatcgaggaggaggaggggctcaacgagcacaacgtcgtcgagaagtgctccgagatccagcacgccatctccgaaggagcaacttctttcctcttcactgaatacaagtatgttggactattcatgggcattttcgcggtcctgatcttcctcttccttggatctgttgagggattcagcacaaagagtcaaccttgccactacagcaaggataggatgtgcaagcctgcccttgcaaatgctatcttcagtactgttgcctttgtgcttggtgcagtcacctctcttgtatctggtttccttggaatgaagattgcaacttatgcaaatgccaggacaacccttgaggcaaggaagggtgttgggaaggcattcattactgctttccgctctggtgctgtcatgggtttcctgcttgctgcaagtggccttgttgttctttacattgccatcaacttgttcggaatttattatggtgatgactgggaaggtctttttgaggctatcactgggtatggtcttggtggttcttctatggccctatttggccgtgtaggtggcggtatttacacgaaagctgctgatgttggtgctgacctagttgggaaagtagaaaggaatatccctgaagatgacccaagaaacccagctgtcattgcagataatgttggtgacaatgttggagatattgctggaatggggtcagatctctttggttcctatgctgagtcatcttgtgctgctcttgtcgttgcttcaatctcttcttttggaattaaccatgaattcactcctatgctgtacccgctcctgattagctcagttggtatcattgcttgtctgataaccacacttttcgccactgatttttttgagatcaaggctgttgatgaaattgagcctgccctcaagaagcaacttataatttccaccgttgtgatgacggttggcattgcacttgtcagttggttaggcctcccatattccttcacaatattcaactttggtgcccagaagactgtgtataactggcaacttttcttgtgtgtggcggttggtctttgggctggactaatcatcggatttgtgacagagtattacacaagcaacgcctacagccctgtccaagacgttgctgattcctgcagaaccggagctgctactaatgtcatctttggccttgctctgggatacaaatctgtcattattcctatttttgctattgcttttagtattttcctcagcttcagccttgccgcaatgtacggtgtagctgtggctgcccttggaatgcttagcacaattgcaactggtcttgccattgatgcctatggccctatcagtgacaatgctggaggaattgctgagatggctggcatgagtcacagaattcgtgagagaactgatgctctggatgctgcaggaaacaccactgctgccatcgggaagggtttcgccattggctcggcagccttggtgtctcttgccctctttggtgcctttgtgagccgtgccgccatctccactgtcgatgttctgacacctaaagttttcattggactgattgttggtgctatgctcccatactggttctctgctatgaccatgaagagtgttggcagcgcagcgctcaagatggtggaggaagtccgtaggcagttcaactccatccctgggctcatggagggcacaaccaagcctgactacgcaacctgtgtgaagatctccactgatgcatccatcaaggagatgattcccccaggtgctcttgtcatgctcagccctctcattgttgggatcttctttggtgtcgagaccctctcaggactacttgctggtgctctcgtttctggtgttcagattgccatctctgcatcaaacactggtggtgcctgggacaacgcaaagaagtacattgaggctggtgcatctgagcatgcaaggaccctgggcccgaaaggctcagactgccacaaggctgctgtgatcggcgacaccattggggatcctctcaaggacacctcaggcccctcgctcaacatcctcatcaagctgatggctgtcgagtcgctcgtgtttgccccgttcttcgccacccatggaggcatcctcttcaagtggttttag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MNPSARISQVAMAAILPDLATQVLVPAAAVVGIAFAVVQWVLVS KVKMTAERRGGEGSPGAAAGKDGGAASEYLIEEEEGLNEHNVVEKCSEIQHAISEGAT SFLFTEYKYVGLFMGIFAVLIFLFLGSVEGFSTKSQPCHYSKDRMCKPALANAIFSTV AFVLGAVTSLVSGFLGMKIATYANARTTLEARKGVGKAFITAFRSGAVMGFLLAASGL VVLYIAINLFGIYYGDDWEGLFEAITGYGLGGSSMALFGRVGGGIYTKAADVGADLVG KVERNIPEDDPRNPAVIADNVGDNVGDIAGMGSDLFGSYAESSCAALVVASISSFGIN HEFTPMLYPLLISSVGIIACLITTLFATDFFEIKAVDEIEPALKKQLIISTVVMTVGI ALVSWLGLPYSFTIFNFGAQKTVYNWQLFLCVAVGLWAGLIIGFVTEYYTSNAYSPVQ DVADSCRTGAATNVIFGLALGYKSVIIPIFAIAFSIFLSFSLAAMYGVAVAALGMLST IATGLAIDAYGPISDNAGGIAEMAGMSHRIRERTDALDAAGNTTAAIGKGFAIGSAAL VSLALFGAFVSRAAISTVDVLTPKVFIGLIVGAMLPYWFSAMTMKSVGSAALKMVEEV RRQFNSIPGLMEGTTKPDYATCVKISTDASIKEMIPPGALVMLSPLIVGIFFGVETLS GLLAGALVSGVQIAISASNTGGAWDNAKKYIEAGASEHARTLGPKGSDCHKAAVIGDT IGDPLKDTSGPSLNILIKLMAVESLVFAPFFATHGGILFKWF</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>55..352#2219..2793#2956..3335#3422..3508#3606..3936#4107..4517#4600..4659#4768..4974#tctcctctcctcctcctcttcgcgtcgaatcctcctccgagaagaggagagtacatgaatcctagcgcgaggatctcgcaggtagcaatggcggcgatactgccggacctggcgacgcaggtgctggtcccggcggcggccgtggtcggcatcgcgttcgcggtggtgcagtgggtgctggtgtccaaggtgaagatgaccgcggagcggcgcggcggggaggggtcccccggcgcggccgccgggaaggacggcggcgccgccagcgagtacctcatcgaggaggaggaggggctcaacgagcacaacgtcgtcgagaagtgctccgagatccagcacgccatctccgaaggtgagggagggggactgactcacccccgtgtgctgttcgtgtttttttttttggccttttttgggtggatctgagcacgcgcgtagttgtgtagatctcgtgccgtcgcagcggttactggcgctaatttttgctaatttagttgtttttttttggttgcttgtggcgtgaacatgttcaaaagtagcttatccgagcatcaattatggggaatttgcagcacaagattgatataattgtggggaatttgcagcacaggatttatatttttatattgctgtgaagagattataaagctcaggttaagatggcgctgcttttaatcaagcggagttgcgtgtctagcagtagtgcttgtgagcttgtgttactttatttattgtgtgaaatcatgagattcctctgagttctatcgaatttactgtggctaaagtagtattctattgtgtggaatcatgagattcctctctgagtttgattgaatttactgtgtgcctaaactataacgagagctgctacacatacgatttttcacgtacgatacttgtacgactaacgatttccagcgaaagcccgtaacgtttgtctcctgttttctagtgatgcacgcacggcgttcaccatcagttagaaatcatactagaatcgtacgcagaaatcgtatgcatagtattttcgaaactacaactatgctagtatgctagatgtgaactgttacattgttagttggatctacagaaacattaaacaatcatgttcccactttacacagcacatgttataataattcttagtcagtgcgtgctaatcgcgggtcaattaagttcgtttgttgcgtctgctgagatattttattggggagatatttttagtggggtagatcagaacttgaattgctcagttcttagaggccctcacgtaaagccctgcggtggccatgctgtggggataggagaatttactgatggaggaggacaagttattggaccagtggtcctacttattgctcttaggaggataagaagataacgatttttctgcgcacctgcattattgaagcagggagaaaatagtttcattttgactgtatccacctagcttggaaggaatcctagatgcggcgcacatggacgggacgatcttgtggtccattcattaatcataaaccttacatgtaaggttataattcaaggacagttgcaggctgagaggtggtgatttatgtagtttgtcctatgttaggcgcctgctttcttggcaggtttcatctctagcgatgcttgggtgagttttaatattgtgaaagtgttaggttctgtccttttctagtaaagttcaaacgtatttttggaaatatttgtttggtcaacatttctttcttagaagactatagggcttgcagttagtgtgccttacttgtggagtcctgctatgcatatgatctgtttcacaggaaatgctagatatgctaatagtttgcatggtttgtaatttgtgaatctggttttgtggaaactttctaggattggaactttgtttaatcaaatacatttttgttggtttcaattggttggatatttgagatattgggttactgaccagtgaccaaagtcccatctatttcactatttaatttagcctttgttaccatattttggtgctcatgtttatggagtccagtcaaacactacaattagaaaaacaggttcagttctaattataaacatatttatgcgttgctagctttggtgttttatgtttcagctattattattgttatcgctaaccttttcttgtcattgactaattgttgtatatttgtatgcgtctatgatctaaatactgttttttttaaactgtaaacaggagcaacttctttcctcttcactgaatacaagtatgttggactattcatgggcattttcgcggtcctgatcttcctcttccttggatctgttgagggattcagcacaaagagtcaaccttgccactacagcaaggataggatgtgcaagcctgcccttgcaaatgctatcttcagtactgttgcctttgtgcttggtgcagtcacctctcttgtatctggtttccttggaatgaagattgcaacttatgcaaatgccaggacaacccttgaggcaaggaagggtgttgggaaggcattcattactgctttccgctctggtgctgtcatgggtttcctgcttgctgcaagtggccttgttgttctttacattgccatcaacttgttcggaatttattatggtgatgactgggaaggtctttttgaggctatcactgggtatggtcttggtggttcttctatggccctatttggccgtgtaggtggcggtatttacacgaaagctgctgatgttggtgctgacctagttgggaaagtagaaaggaatatccctgaagatgacccaagaaacccagctgtaagaattctttcctgacgctttaaaaacttgtttcttaatattacttgaaataatttgttttgttcttttcataatgatttgtgttattgagcaaagcattaaaacatcgataggaatttatgtgcatgcaagaatgatcatttcttcctccttttgcaggtcattgcagataatgttggtgacaatgttggagatattgctggaatggggtcagatctctttggttcctatgctgagtcatcttgtgctgctcttgtcgttgcttcaatctcttcttttggaattaaccatgaattcactcctatgctgtacccgctcctgattagctcagttggtatcattgcttgtctgataaccacacttttcgccactgatttttttgagatcaaggctgttgatgaaattgagcctgccctcaagaagcaacttataatttccaccgttgtgatgacggttggcattgcacttgtcagttggttaggcctcccatattccttcacaatattcaactttggtgcccagaagactgtgtataactggtatgcccatatttaaattggaattccatcttttacttagaacttcattgttaaaatcattgacctcatttccctgattttgataggcaacttttcttgtgtgtggcggttggtctttgggctggactaatcatcggatttgtgacagagtattacacaagcaacgcctacaggtgcttataagtctgatcatattcaatgttgtctgtaatcttatatatttgcttctagtccctcatgtccctcacaccttgaatttcccttgtccagccctgtccaagacgttgctgattcctgcagaaccggagctgctactaatgtcatctttggccttgctctgggatacaaatctgtcattattcctatttttgctattgcttttagtattttcctcagcttcagccttgccgcaatgtacggtgtagctgtggctgcccttggaatgcttagcacaattgcaactggtcttgccattgatgcctatggccctatcagtgacaatgctggaggaattgctgagatggctggcatgagtcacagaattcgtgagagaactgatgctctggatgctgcaggaaacaccactgctgccatcgggaaggtaaaactgcttatcttgtcgaaagtgtttttatgttgtttttatgcttcatttccactctgaagtcaattaaaaatttaaaattgtgtttgcacttgtaaatatttttccttttgttacaaatgtcacaattttaaagttaattcccatctccatgattgtacttgtagggtttcgccattggctcggcagccttggtgtctcttgccctctttggtgcctttgtgagccgtgccgccatctccactgtcgatgttctgacacctaaagttttcattggactgattgttggtgctatgctcccatactggttctctgctatgaccatgaagagtgttggcagcgcagcgctcaagatggtggaggaagtccgtaggcagttcaactccatccctgggctcatggagggcacaaccaagcctgactacgcaacctgtgtgaagatctccactgatgcatccatcaaggagatgattcccccaggtgctcttgtcatgctcagccctctcattgttgggatcttctttggtgtcgagaccctctcaggactacttgctggtgctctcgtttctggtgttcaggttcgcacattctttttcacagccacactctcatcacttactcttgccatattgcattcataaccatgttgcttcctttcagattgccatctctgcatcaaacactggtggtgcctgggacaacgcaaagaagtacattgaggtaagaacttatcagccatcttccatcacagcaacacttgacgtcaagcagtttttttcccctcccatattcgccaaacattataactctcgttctccctggttttaggctggtgcatctgagcatgcaaggaccctgggcccgaaaggctcagactgccacaaggctgctgtgatcggcgacaccattggggatcctctcaaggacacctcaggcccctcgctcaacatcctcatcaagctgatggctgtcgagtcgctcgtgtttgccccgttcttcgccacccatggaggcatcctcttcaagtggttttagatggtgacgatagatttacgaggacgttatttttgccaggagggcgctggaaatcatccatatattatagagttcatcgagttgacacatatagttccctccgtttcctatttgttattactgtctgtccatcagtcgatcatgctaagcttattagcatcatacctgtgtctagtttttttgagtctggtagttgtagccgatgggagcaaatcactggccacctacaggtttggacaagagtaccttgaatttgcgttttcctgtaggttggatgatacgatgatggtgatgattattgtacgtgcacggaatgcacctgtctcagtgaaattttcccgggaaggttctgctgtttctttatgtccttgtgggaatgttaggatgatcttgtacaaaaaagaaaacaactctagtgatagggggtggagtacatgtgtgccaactaagtttgagttgtcttgaattattgaagtaaaatactttagctaaaatgacgtagtagtgcgtgtgcttgcttttgttttaagatagagaattatagtattattttgtatactatattttcctcctttcttgcttcgttcgtttcatattataagactttctagcagactcacattcatatatatggtaatgaatctaaatatatatgtgtgcctagatccattaataactatatgaatgtgggcaatgctagaaagttttataatatgaaacggaggtaataatatgaaatggaggcagtatcttatattttctttatcctaaataaataaatctaaatttctgg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |