Os07g0410100

From RiceWiki
Revision as of 08:32, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0410100| Description = Similar to Dihydrolipoamide S-acetyltransferase (EC 2.3.1.12)| Version = NM_001065980.1 GI:115471692 GeneID:4343003| ...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0410100

Description

Similar to Dihydrolipoamide S-acetyltransferase (EC 2.3.1.12)

Version

NM_001065980.1 GI:115471692 GeneID:4343003

Length

7685 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0410100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:13471868..13479552

Sequence Coding Region

13472343..13472413,13472502..13472597,13472934..13473036,13473116..13473211,13473274..13473340
,13473419..13473486,13473635..13473710,13473849..13473934,13474022..13474098
,13475198..13475270,13475364..13475612,13475734..13475826,13475955..13476029
,13476398..13476453,13477210..13477250,13477644..13477738,13477822..13477895
,13478789..13478882,13479221..13479256

Expression

GEO Profiles:Os07g0410100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:13471868..13479552 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:13471868..13479552 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgtccgccgcgcatctcctccgccactctcgcaagttgcggagtttacacaatgctctagactgtgagcgttctggcctcgtgcgctacttctccactgcttctggttcgttccccaccaagggaaatggtgctgagaaaagaattggaggtgccagatttcctcagcgcaagcaacctggaaaagagcttgagacctccaagttgtcactaggacttaatggaagctacacttgcaggagatcacctaacaactttatcccaaatactattactggtctcaatggttcattgtcatgtggacagatagcttcagcaagatctttctcaagcagtgcagacctgccaccacatcaggaaatagggatgccatcactctctcctacaatgaccgaggggaacattgcaaggtggctgaagaaggaaggagataaggtctcacctggtgaagttctttgtgaggtggagactgataaagccaccgtagaaatggagtgcatggaagagggctatcttgctaagatcattcatggagatggttccaaagagatcaaagttggtgagattattgctgtaaccgtggaagaagagggtgacatcaagaagtttaaggattataaaccttcaactttggctgcacctgtagccccttctgaactgaaggctcagtctgagcctacagaaccaaaggtggaggaaagagagccttccaaagcatctgagctaaaggccccaaggactgaagaaccttcgcggtcaggagatcgaatattctccagccctcttgctagaaaattggcggaagataacaatgttccactgtcgagtgtaaagggaactggtcctgatgggcgcattttgaaggcagacattgaagattacttggctaagggttgcagaaaggaagctcttgcggctccagggctaagttacaccgatgttcccaatgcacaaataagaaaggttactgcgaaccgcctgctaagctctaagcaaacaattccacattattacctgacagttgacacacgtgttgataatctcatcaagttgcgaggggaactgaatccattgcaggagtcctccggtggtaagaagatatctattaatgatctagttataaaggctgcagctctggctcttcgaaaggtccctcagtgtaatagctcctggatgaatgattttatccgccaataccacaacgtgaacatcaatgttgctgtacagactgagcatggactgtttgttccagtaatcagggatgcagacaagaaaggacttggtatgattgcggaggaggtgaagcagttggctcaaagagcaagggataacagtttgaaaccagatgattatgagggaggcacattcaccatatcaaacttgggaggtccttttggaattaagcaattttgtgccatcataaatcctcctcagtcggcaatcttggccattggttctgctgagaggagggtgatacctggcagcgccaatggtcaatacgagtttggttccttcatgtcggcaacaatgagctgtgatcacagggttattgatggtgcaatcggggcagaatttctgaaagcattcaagggctatatcgagaatccaacctcaatgttactgtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSAAHLLRHSRKLRSLHNALDCERSGLVRYFSTASGSFPTKGNG AEKRIGGARFPQRKQPGKELETSKLSLGLNGSYTCRRSPNNFIPNTITGLNGSLSCGQ IASARSFSSSADLPPHQEIGMPSLSPTMTEGNIARWLKKEGDKVSPGEVLCEVETDKA TVEMECMEEGYLAKIIHGDGSKEIKVGEIIAVTVEEEGDIKKFKDYKPSTLAAPVAPS ELKAQSEPTEPKVEEREPSKASELKAPRTEEPSRSGDRIFSSPLARKLAEDNNVPLSS VKGTGPDGRILKADIEDYLAKGCRKEALAAPGLSYTDVPNAQIRKVTANRLLSSKQTI PHYYLTVDTRVDNLIKLRGELNPLQESSGGKKISINDLVIKAAALALRKVPQCNSSWM NDFIRQYHNVNINVAVQTEHGLFVPVIRDADKKGLGMIAEEVKQLAQRARDNSLKPDD YEGGTFTISNLGGPFGIKQFCAIINPPQSAILAIGSAERRVIPGSANGQYEFGSFMSA TMSCDHRVIDGAIGAEFLKAFKGYIENPTSMLL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>7140..7210#6956..7051#6517..6619#6342..6437#6213..6279#6067..6134#5843..5918#5619..5704#5455..5531#4283..4355#3941..4189#3727..3819#3524..3598#3100..3155#2303..2343#1815..1909#1658..1731#671..764#297..332#gctaccgatcttgttctctcgccccctcccggcgcgtgattcccggacgcgactcgactcgacatcccaattcccaatacaccaccacgacccccctccgtcctcatctgtcccgcggcctcgaccacgccgggaggagccgcagccagtccgggagacgctcgtacgcctgcctcgaccgatccagcgccgccacggcgaccgtggccaaggagatccgccccctcgtcggtccgccgccaacgatctccgatcgagacaaaccctagccacgcccattgccttctcccgtcgccatgtccgccgcgcatctcctccgccactctcgcaaggttcgtctctctccctctctctctctttctctctctgcctcctctctctgtggctgcctgcgcatccgtctcccatcccaacgtgtcggaaaagccatcggatctgttctgatctgccttcccgctgcgtggagcctgcgtgccgcatgtggttgaattttcgatcgttcctggatttccttgtgctcccgtctgtgcgaattgactagtaattcacctgatttcggtcgatcgggagatctattgcctactgcagcgggaaagaaatgtttctgcgctagtaatgttacgccatcgtcaatcaattcccggtgacatttcaatctgctttactgcagttgcggagtttacacaatgctctagactgtgagcgttctggcctcgtgcgctacttctccactgcttctggttcgttccccaccaagggaaatggtatgtgctacccatcttttatcattttattttgattgtgtgtatttgtcaactaattgaccacggtacgcaagcaacctgtttgtccaactcaactggagatgtccttccacatgactaattgctgtgatagttagcaaatacctttatttctttcataagtgtctgctgcttttaatcatgcagttctgttctgttccaataactttttatttctgtattatgggtttgtttgtttcctaccataccaaaatattagcaataccaaaacctaggtgaattttagccttttttttcttggcaacctatgtgtgttattggcatattttggtagcaaaccaaacactagccaaagtactattcgaagggtcaacaatttggtagggcacattttggcgtcaaaccaaaatggtcctgccatcataactgaaaccaatatagagccttacataggcaatttagttataaaacgtttggtttcacaggtgttggtaatcctggatcctccagaggcattcattgattgtgtgttggtggtctgtagtctaatatagacagattgtcaattgattacaaacatctgtacaaaaaaaatatgttgcaacagaagtacaatccaatatgttcattttttcatttcttgacacattacctctccactaatttttgtacctttggctaagcatgggttggcttcctgagctgatactataatttttaattaaggcgtgatttctcattgacatagtataggcacactcattttgtcttgagatagtagttatttggttcctttgggaatttatttgtacagtgagaattcaccttcttgattgaatgtcctcattaagcaattttcaccattgaagttttagtgcttttggtttccacaggtgctgagaaaagaattggaggtgccagatttcctcagcgcaagcaacctggaaaagagcttgagacctccaaggttatgtccttgaaatatatcccactttattgagaccattattgtcttgtcctgactttctagtttgtcattttctctttcagttgtcactaggacttaatggaagctacacttgcaggagatcacctaacaactttatcccaaatactattactggtctcaatggttcattgtcatggtatgtgtcattttctgctatgatattgttagcttatgtggcagtgtcgggacatattgtatgagagaaccacccttacaagagaatatgaaccagcgatatttgatcactgcgtctcatgttgttggctaagatacaccataaaaaaaatcgctggcatattttgcaaggcccctgaatcatgcctatctggctccctgctttttagtacatgtctaaatgataatctcctttacttaagaacaaactccaatcctgggaatgagatttgaatctgattgtcctattctaaatttctaatagtgttctcctaacgcctgatagctgttctgtacttctgtttaccatggcgtctttataatgttcccttttctttccctgtttcttttccagtggacagatagcttcagcaagatctttctcaagcagtgcaggtactttacttacgtgttttatgccctttaattgcgataacttcataaaataaccaggatattgcaaagtagctgttcagtccttttggttgtcatgtttttgcaagagggtttcttataaacatatttggttgacgatagattactaatttggttattttggttgcggatctttttcttttttactatctattttatttactgtaccctgtcttcccacgtacttatttttacatgcatgtgatgctgtattccactatttttggatatttttctccacgcctatttctttttttaaaaaaatcagaacaactttctttttttaatgatatctaagcatctagtttatccgcttcaaaaagaaaagtctatttgaaattcagtccacatcttcccattgctctggttactatgttaaaattgtctactgcctccgtcccataataattgtatttctaggattcacatttgtcccaaaatagttgtcacaatagagtactaattgtcccataatcacttctcattcaaatttattcctattttacccttaattaccttcccactcttatgtatacaccatttgatgagggatatcatagtcttttatctcaaatcttaatatatgctaatcaaactagaattacaattattttgggatggaggtagtacataactccagtcaatgattccataatccatatagcactctgttaattgtcttatttcttaagttttgccataatttctttattccagacctgccaccacatcaggaaatagggatgccatcactctctcctacaatgaccgaggtatatctcaccaattttttttattatgaatcatgaatatcataatgtcctcttgtgtttttccttgaattgcatgtatcctatatacttatatagttcatccccactaagtgtagttaatgctatttctctcttctctcattaagccacatcaccacaattatttctagcctttggatgatagatctatggtccaaattgtctcttttttcttctctcttaaaaacatgcaatctcaattactttcaagctcaaaattgtatcaaattgttttagttttgtacatattatgcaacttaattttccgcagcaacgcggcggggtattcatctagttagtattacaccttatacttgtattgtctgtaggggaacattgcaaggtggctgaagaaggaaggagataaggtctcacctggtgaagttctttgtgaggtggagactgtaagttttctgatctctaaggcagcaatatcttagttagtacttatttttagtggtgctcaattattttcttttatttaagctgcaagagaatctaaatatcctttgaatgcatttctgctgactaggataaagccaccgtagaaatggagtgcatggaagagggctatcttgctaagatcattcatggagatggttccaaagagatcaaagttggtgaggtacatatttgaacaatcatttattatcctctgtttactaatacagttattacaaatacctcagtctttaagtttcgctgacataatcttggttgaattatgtccatgctattcattttagattattgctgtaaccgtggaagaagagggtgacatcaagaagtttaaggattataaaccttcaactttggctgcacctgtagccccttctgaactgaaggctcagtctgagcctacagaaccaaaggtggaggaaagagagccttccaaagcatctgagctaaaggccccaaggactgaagaaccttcgcggtcaggagatcgaatattctccagccctcttgctagaaaattggcggaagataacaatgtaagttttctgatgttagctgtctaggttgttacttgccaactgttgttgtaacatacttaatgaacacaaggattgtgctgcctaaaacaggttccactgtcgagtgtaaagggaactggtcctgatgggcgcattttgaaggcagacattgaagattacttgggtatgtcactttctcctatagttcccccccccccccccaaaaaaaataaaataaaattaaaataaataaataaataaataaaataaatgatgaactctataggaatttagaattttgtagttgagtaacttagaattcaacaatgaccattatattaatttatatttaacaagatcgctttgaagctataatgtgtgctcctttgacatatcatgctagttctgaatttgatgaactcttgatgtcaaattttattgtgatgtttttcctttgctgctcgttgcttgtttaatatatgaagtgttacagttgctagggattttatagaacacttgaatcatgcatgcacttgtactcgcaagagcagttaggtttttggttatgactgtgtccctgtaatacacactttatatatacttctctcaccattcaattttaatcctaatggccaagtggaaaagatgttaggcgaggaaaacatgttaaaacttccttgtaactagtatgtactatggcactccccttatataaatctactttcttcccatgcaattccttgtttctgcccttctctggtcaggttcctgcataatagcaatctgttagtgtcaatgataagaaagcaccagtatactggtgatctgaatcctcttgcttaatgttaagctgtaccactgatctttgtgctttactgtcttattatccattctaaagtaatcatattcagacatatgttgatgcgtattatgtactccattttgtggtgtatggtatttgatcacttgatttgaacatccagtcacccatatatcaagttatcagaagaaaaaaaaaatctgtttttgcttgctttgttcactcaactctgttagtttacttgttcctgtgtgcctgaatttctaaataattttgttgttttagtagcaccatcctggttgatccaaatgaaatattattaatgtaatttgcttgaactctgtatgttcaaatgtgtggttttatgctttcctttatatttgccagatttattttgtgttatgctattattctatctgtgagaattcaattgataatttttttcttaaacaaacttctgtagctaagggttgcagaaaggaagctcttgcggctccagggctaagttacaccgatgttcccaatgcacaaataagaaaggtaatttcaatcatacgttctttctgttaagtcgttttttatgcgatgttattgatctgatagtgttttaacttcaattctgtccaggttactgcgaaccgcctgctaagctctaagcaaacaattccacattattacctgacagttgacacacgtgttgataatctcatcaagtatgttgaatgctaattgtgttattaaatcactatattttgtaggaaacatatgtgatggatcaccttcaaagtccatctctctggattttgtagcttttcttttaaaagtagttctttttttttaatctaatgcaggttgcgaggggaactgaatccattgcaggagtcctccggtggtaagaagatatctattaatgatctagttataaaggtaattaccagtttctcgtgttaccgtggtttcttatgtctaccaagtgccaaccactggattgttgcagattcagcctatttatgttcgtggactgtccattttcttctgacctccaattctgaatttatcttaatttgatgtacaggctgcagctctggctcttcgaaaggtccctcagtgtaatagctcctggatgaatgattttatccgccagtaagttctgaccaggcatatcttgggactaaagttttggcaagaaaggagataatgaaaatttcatttcgcatgcagataccacaacgtgaacatcaatgttgctgtacagactgagcatggactgtttgttccagtaatcagggttagtaatctaaacttgtctaatctgtgtaagaaaatgtttctaacttttgcttgttgcaggatgcagacaagaaaggacttggtatgattgcggaggaggtgaagcagttggctcaaagagcaagggataacagtttgaaaccagatgattatgaggtatatggattgtatggtagttaatttttgcatgaaacaacagcatttttccatgagaacttttatgtggtgttttcagggaggcacattcaccatatcaaacttgggaggtccttttggaattaagcaattttgtgccatcataaatcctcctcagtcggcaatcttggccattggttctggtaataagtcatgttgcacttttactttgtttccactaattcgttgccacttagcttactctgtaaaaataattgtagcattatatatttatctgcattattttagtgtattttgaaaagtatattttccaagtccctgatctagtacttaaactcagaagtcatgcacataggaccagctgtttatagtagtatttagttgtttttcgtaaaagggctagtagtgccttttgttaatgtattctatttgctaggcaggctcattcacttagtcatgctgttttagtccgtacatagggattcatttttaactcaactgcttttttgcttgggcagctgagaggagggtgatacctggcagcgccaatggtcaatacgagtttggttccttcatgtcggcaacaatgagctgtgatcacagggttattgatggtatactctttagatcttatcggaataaatgatggcttcatggatcatgggcaagaaattaacttttgttcttgtgcgcttactctaggtgcaatcggggcagaatttctgaaagcattcaagggctatatcgagaatccaacctcaatgttactgtgaagctaaagatcatcaaaactattcttcccttgttctcgaatgatgcacagaacggtgctgtctcattttgtatatttccatcatgatttcgaggaggacctgaaaaccaagagcacagagccaagggcaggatgacctggtttttggattaatttttctttttcctgtttgtttcgttccagttacactgggaattaggatcaatttacaagccttcttttagcccgtttttatgggtttactccgcaagttcgttgacagcagagtaaattcccgggaaaccatgcaggatagcctttatacgatttgccccctttttactttttttttcatctttgtgcaaaaccaagaggcgcagaggtaataagttgcaaatcttggggagtttggtttataccctttctccgcaaaattctaacgagaaattcacaattgttcagagtaaatgatgcattgcttaatccattttgatgct</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0410100, RefSeq:Os07g0410100