Os07g0447800

From RiceWiki
Revision as of 08:34, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0447800| Description = Phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein| Version = NM_001066076.1 GI:115471884 GeneID:4343118| Length =...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0447800

Description

Phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein

Version

NM_001066076.1 GI:115471884 GeneID:4343118

Length

12030 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0447800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:15999171..16011200

Sequence Coding Region

15999278..15999284,16000884..16000950,16002251..16002434,16003509..16003561,16003855..16003943
,16005007..16005243,16007360..16007424,16007511..16007571,16007642..16007759
,16007830..16007911,16008872..16008944,16009013..16009074,16009172..16009267
,16009682..16009836,16010443..16010539,16010663..16010740,16010822..16010929

Expression

GEO Profiles:Os07g0447800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:15999171..16011200 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:15999171..16011200 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcagctgctcaaggtagcagcgttgtcccatcctctgcgaaagttgactttttaaagctccagaatggcagtgatattcgtggtgttgctgttggtggggtcgaaggcgagcccgtaaatctcactgagcctgttactgaagcaatagcttctgcatttgctgcatggttattaaacaagaagaaagcggatggatggagacgtttaagaatttctgttggacatgattctcgaatttctgcacataaattgcaggatgcagttactcttggaattaccactgcagggcatgatgttttacaatttggattggcttcaacaccagcaatgttcaacagtacacttacagaagatgagataaatcattgcccagttgatggagccataatgataacagcaagtcatcttccatacaaccggaatggtctcaaattttttacaagtgccggtggtttgaataaggctgatatcaaagatatcttggagcgcgcttctagaatatatgaggactcttctcatggtagcacacaagaattagagcaagcttcgaagggagaagtgagtaatgtcgattacatgtcaatttatgcatccgatcttgtgaaagcagttcgtaaatctgctggaaacaaagaaaaaccactggagggactgcacatagtcgtggatgcagggaatggagcaggtggcttttttgtggataaggtactcaagccgttaggcgctattactactgggagccaattcctagagcctgatggcatgtttccaaatcacattccaaatcctgaggacaaaactgcaatgaaagccattacacaagctgtggccgataacaaggcagacttgggcatcatatttgatactgatgttgacaggtctgctgctgttgattcaagtggtcgtgagttaaaccgtaacagattgattgctttgatgtctgccatagttcttgaagagcacccaggcactacaattgtgacagatagcgtgacttctgatgggctgactacatttattgaaaataaacttggagggaagcatcatcgtttcaagcgagggtacaagaatgtaatagatgaggctattcgtctgaatactattggtgaggagtcacatttagctatggaaacaagtggccatggagcactgaaagagaatcactggctcgatgatggtgcatatcttatggttaaacttttgaataagcttgctgcagctagaatattgaatccaaacgttggtagtaaagttttgactgatttggtcgagggccttgaggaggcttctgtgacagtggagataagattgaagattgatcagaatcatgcagatttgaaaggggggtccttccgtgattacggagaagctgtcttgaaacatttggagaatgcaatcagtaaagatgaatatctgtgcaaagcaccgaagaactatgaaggcgtaagagtttcaggatatggtggctggttcttattgcggttatccctccatgacccagttcttccccttaacatcgaggcgccgagcaaggatgatgccattaagcttgggcttgcagtgcttactgccgtaagtgaatttccagcattggacataacggcattgaacaagtttttgcagcagtga</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAAAQGSSVVPSSAKVDFLKLQNGSDIRGVAVGGVEGEPVNLTE PVTEAIASAFAAWLLNKKKADGWRRLRISVGHDSRISAHKLQDAVTLGITTAGHDVLQ FGLASTPAMFNSTLTEDEINHCPVDGAIMITASHLPYNRNGLKFFTSAGGLNKADIKD ILERASRIYEDSSHGSTQELEQASKGEVSNVDYMSIYASDLVKAVRKSAGNKEKPLEG LHIVVDAGNGAGGFFVDKVLKPLGAITTGSQFLEPDGMFPNHIPNPEDKTAMKAITQA VADNKADLGIIFDTDVDRSAAVDSSGRELNRNRLIALMSAIVLEEHPGTTIVTDSVTS DGLTTFIENKLGGKHHRFKRGYKNVIDEAIRLNTIGEESHLAMETSGHGALKENHWLD DGAYLMVKLLNKLAAARILNPNVGSKVLTDLVEGLEEASVTVEIRLKIDQNHADLKGG SFRDYGEAVLKHLENAISKDEYLCKAPKNYEGVRVSGYGGWFLLRLSLHDPVLPLNIE APSKDDAIKLGLAVLTAVSEFPALDITALNKFLQQ</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>108..114#1714..1780#3081..3264#4339..4391#4685..4773#5837..6073#8190..8254#8341..8401#8472..8589#8660..8741#9702..9774#9843..9904#10002..10097#10512..10666#11273..11369#11493..11570#11652..11759#atagattattccgtccgttccaacaacctctccgcctcctcgtccccgtcctcaacctcaccgcctccccgccgcagtagcagagtcgcccgccgccgcgcatccgcatggcaggtcagtgcatgcctccccttccccttccccttccccttcccctccatgatcggaattgaatccaaagcctcgagctcctcaacctccccgactgcctcatgggaggccgggaggcgaccccgcccaaacccccgaagcgatacccacgaggccaccaccaccccccgccggcggcggcggcggcggcagcgccccctccccctttccgctctctggcgggtttcctgtttcgcccaccgccgactgactccctgaggggtcgatgatatccccacttgtttgcatttaggtctgatgactccttgtgtttgtagttggattggatgtagacattctgttgtgctgtgctgtgctataacttgttgctatacgttgggttgtgaatctgttgtgccagttaatttggtgaagtaattagttagtggtggttgctagtttgatttaatgtgaaatgtaaatatcggaagcatattgtgagagagggactgccctccatggttctgacaaccccatgacagtaccgtggaatatagatgttagagcattggacacttccatgatactgtcatggggttgtcagaaagaaatatatcaaagttgaactgagaagtaatctaattatttagtaagtgcaaatttgacgagtagttttgtctcaacaataaatgctggaatgaagatctaataaatcgtgaatatagatcaacaatcttgctaacgatggagcacttccatggtgactctgacagtcagatcttctgatgactaacaccttcatcctttttgtcctgatcagtatatgtagttccctgcaaccacctctgctactaggatgattagcttggcttgaatatggcttctatggaataaaatcaacccatcggttccggaatataagttgttctaacaatccaatcctgttcctgaatataaatactacacctttctaggagacttcttcatatattatctactccctgaattaatggaatggagctcgttttaagactacctgaatccttgcacctgaacaaattttgagaattgggggaatgctgatgtttaccaatttgcatcacgttgagcaaaactatgccatttggctacaatgtttgcataaaaaccaaaataaataattatccctgtaacatttataagttgacattagaagaagatctgatagatttgaaaatttgtgcagcattatcagggaagatcattcaaaatgcattcttggcacaacatcgcccacaggctagacacagcacaagatatcccagtgacttttgtgccctcgatacccgcagcgtgcattctttccaggaatgtagactaagactggctggtacttcagccaagtggttaaatacaatatcaacagcatggattagctccagcaaacaagcatatattagctgcaatggtgtgttctaggctctcattgatcaggttgcttaatgctcactagtgttacgttaggatttttttttcgctaactcattttggtgattttatgccagattatagaatcaataccttttttttttaatgtatgtatcaacaaatctgaaaagtcacttacagtaaccttcattgcagctgctcaaggtagcagcgttgtcccatcctctgcgaaagttgactttttaaagctccagaatggcaggtataacaatgttcactctttctatgatctacaccctctagtctaactatgatattgctctttctaaggtcaaattatatggctgtttttctctttaagccaatggtaatgagcatatggtttccaactatgatgttgtttgaaagcaccgtggttcttatgttaacagtcaattccatgtctagtgcttctgtgttccttttcatttaaccatctatttgctttggtgttttgacatgcatcccatgtttttgctttatgtgctgctcttaaacacctcaatagctattaaatttcaatcttacttgtgtcagagaaaaaactctttgagataaaaaaaaatgttgtaagttgaaacaacatggaaagacctataaccatacatcctcatttgagattataattacaagaatattgcttctgtaaaccgcaaatcacataattttgagcgatgctgttgcttagctttttctggttcagctgcaattgtcaaaaggtatctggatatcctgctggtgaaatgcatatgaccattgaataattattgtatgaatacaagttcaactttggctttgaccttttttagaaagtaattacatgcgttttgggctgcattgcactttatggtaaattattcggtgatctaatggataatctagtgttaaaagtctcaaacaaaaaaaatctggcaagagcttgtgagatattgctagtttccatcctatctttacctgcatggcatggattggtgcattaaaagaactttttcttcagctctacgccattaggagaatttgtctttagttatacagcacagtaaaattccaaattgctagcttgtgtgttacatgtggttcatgtcatcctgtctatggacttgtttctcttttgacatcaattgaaggagaccttgtatctgtatctaattgggcatattttctctatattcctatctcttagcatgatattttccctgatataacatcttcctcagacctaggactaaaggttaaaattcatgtttgatcaactcttgatttatgtcatgggcatatgcctatcataatttatttggaattgtgtgattatcgtgaacttatattgttcttcttgatatagctggtatgttggaattaagttatcacttttgctaaaaaaggtgaagaatcaattgatcatacagctttgggatgttctagatggggtttataacaattttagttaaagctaaagagtttcttgtgctgcatccatgatgtgttattaatcaatttgctttactctcttctatttctcacagtgatattcgtggtgttgctgttggtggggtcgaaggcgagcccgtaaatctcactgagcctgttactgaagcaatagcttctgcatttgctgcatggttattaaacaagaagaaagcggatggatggagacgtttaagaatttctgttggacatgattctcgaatttctgcacataaattgcaggtggctcctgttctccgctcttatttttattgaacctttattcaaaataatgcattgcatgctttaaggaattaagctcaccccttataattactaaaatcctgttccaactagtgatgatttggactattctcagttttaaccactaaccagtgttgttgttttttatttttgcccaattatgttgccatgttgaaatttgggattaacaaacttttatttcatatgtggatcaagaagcattctcgcagaaagaaaaaggatgtgaacaacttttctgttttgacatctcaagcatttctatgattgcggcaaatagttgtaattatatgtattttgtctaaatataaggtggtacgaaagacttatatccagatatctgctgcttatttgcatctgatgttgtactagctacaggttgtttttcttttcttgaatgcaaattgactgaaatcgttcactttatatagtgatactgctctatttccatatattttgagaattgaacttggcttttggagcatacgtcagtataatgtatgttgttgggtaaggctgttggagttgatggatggaggtcaaaattcacaccttctgtgtttgcactgtgtgagttgattgggaaatgggagtagagctccacacgtggtgtccaaataaaaactactcattcaggagggaatagaaaattgtgcaacagataattccttgaaaagttgtgccttttgcatgcagagttttcttctactacttacaatcaattgaattaccatttgtacttttttgacaaaaaatatacacacttaatgagatattaaaaggacctttgtgcatgcctaagtatttggattcgtagttctggtacatattagtcaaggatgtgttctctgctaccttttataatttttcaatgatgttatttgatttatattaggcactgcattctgttggtaactgaacaaaaaatttccagtcctgacttctgacaagtctatatgtagtttgagcaatgtgatttggtccttcaatttttctttttgcaagtattgcttattaaaaagtgataattgtcaggatgcagttactcttggaattaccactgcagggcatgatgttttacaatttgggtgagttgaatatttaattttcttacatttatcaagatcttcagtttttcctgtagccttcaatgcttagaatttaagtgtgtaattgatgaagtcctcttgctactgtgattctttttcactgagaaaatccacacatcaattcttacgtaactacaagcctagggaactaatttgaactacatcaaatggtttccacaatttcaatcagtcttttcttcacaactttcttacttctctgcttaacaagtaaagatctgccaaatattcatttatgacaattcatgatgtagattggcttcaacaccagcaatgttcaacagtacacttacagaagatgagataaatcattgcccagttgatggagccataatgataacaggtactattcccagtttaatgtgcaacattagcaggcaagcatttctcagatgaatacacaagagttttgaaacatatacatggtgtccaatctcttctccaaacatacgtaaattttattgatgattctttgactacataattgttctctattggaaaatatctccttcattgggaatttttgttcttgccacacatatgtgcaccatcttggtattgcccatgaaaaatcatcctttcccatccttcttcctcatgggagctcctttctattttcctcctgaaatctattatctaaagcccctactattttcctattccagccccaccccatcttatccgctcttctgtaataaactcctaggagaccactatcaccaagaccttgttgcttggcaccaaactctgccaatgaaaagcacagtagggccagtgaagagggtgcacatactccactcccttttgaatccccttcggcgcaaatagtaagaatcactgccacagttctgatggcctagcagccaggggagcggggagcctgtgtgaggaggtactgctgagtggacggagctgggtaacttgggttcatacttcatagttacacacaggtagccagtggggttgcatctgctacaactcctctatgtaaatcgatcctactccatttatttgtgtagttatttattgttgggtagtttgagataatctggcatccatgcctaagcagacacactcagctattccttgaagtggacttggaattgctcctaaggatcaaggatggtgaggaagaggaaagaagacataggtgggaaaaattcttacgaggggcaacgtgtaatatcgtagtaactttcaaacatgaaacagtttcgatactggcaaaatcgagacacattctgtggtagaaccagtatggcacacatttgtagtcactagaacaaagttttccctttcttgtttttccacatgttcagtcattcttcttttgaaatgcctaattatgtagaaacaactgtttaattctctctatttttaaccaaacaaacttctgcctttcacagcaagtcatcttccatacaaccggaatggtctcaaattttttacaagtgccggtggtttgaataaggctgatatcaaagatatcttggagcgcgcttctagaatatatgaggactcttctcatggtagcacacaagaattagagcaagcttcgaagggagaagtgagtaatgtcgattacatgtcaatttatgcatccgatcttgtgaaagcagttcgtaaatctgctggaaacaaaggtacatttttatgctaatcaatataaccttttgttttgctagactagtttgcaattagatatctttcactcgcttgcttaacttttgatatccacaaactcaccaagatagcttatgccttttatgagtcatcttataatcacatactccctctgtcccaaaatatagagagttttagaatttgacacggttattaagaaagtaggtagaattaaatagaaatcgattgtgattggttgagaagtggaggtaggtgggaaaagtgaatggtggagggttgtgattggttaggaagggaatgctgatggagaagttatattttgggacaaatcctaagtgctaaaagttattatattttgggacggagggagtataatttatgtctgctcaataaaaaaaatcagttggctacctatcacacatctatactactttaaatgttggtagcggtggtggttgttcttccaccaccactcctatcactgacgtgtgggccacactgtctatactactttaaatgttggtagtggtggtggttgttctgcaccaccactcctatcactgatgtgtgggccactgtctatactactttaaatgttggtagtggtggtggttgttctgcgaattaattttgaaaatatattgtccattcaattatgtttaaggaatattcggattgcaatttttttgctgaaatataccgtcgatctcgcacagccgttgtgcgaaaatgacgtggggttgacatcgtgggcggtatcgcgcggtgaaagtgcgagactgcacggtcttgcgtggcaacaacgcaagaccgcgcggtctcacggaatggaagagcgagactgaacggtcttgctgaaccagacagtgataccggactgccatggcgattcaaatggttaattagtgattaattaccctgattagggattgattaaattatcctgattagggattaattaatcgctaatcaggataattaatcactatttcttattagttaataggtaattaggtaattaatcactaattaaagtggagaccgttccatcagcgagacggtgtcgctgtttccatcagcgagactgtttggtctcgctcttctgttccgcgagattgcacggtctcgcgttgtagccgcgtgagaccgcacggtctcgcgctttcactgcgcgataccatccgcgacatcacgcatacatcattttcgcgcaacagttgtgcgagatcgacgttatatttctgcaaaaaagttcgcatcccggatatttatgaaaaaaaattgaatgaaaagtatattgtctaatttaattcgttgttctgccaccaccactcctatcactgacgtgtgggccacattgctagtgaaaaattcaaatattcttgacttctaccgtgagagccaagagatagagagtagacttgggctagctgtcagagactagcaaccaggcctagatcttcttttcaactttagggagatggcctaagcttttttttttccaactgtaacatgatggattaggtctttggagtggataagaatggttaaaataaacaatggtctcagtccacgatgaagtcacagtgattattttttgcagcatgcacacctaatgaatacttacaatgatgaagcaatataatgtttatctgatttttcttttaatcccgtaacaagagtacgtgcattctgatagttttagttaagtttacttcaggtctctgatcatgattgtttttccatatacaattcatatgtatgcttcattgctctattatatagtttttatatatttcaatagaaaaccatcttgttgttcactacatattctttatacatgtatttgcatgtattgataaagttcccttcacttgtgaagaccactgtgccattgtgtcactctttacattctcagaaaggaaataataacttcatgtatttaacatttaacctgtatctagtatacttatgtcagccataaagggtgcagtaaggaaatgtgggataacaatgttgaaatggttgagaaaacgattgtgaaatggttaaatataaattatgataaagataagaaaactcctggttcttatgtctgttctcatatggtcttagaaaaaccactggagggactgcacatagtcgtggatgcagggaatggagcaggtggcttttttgtggtaatccctttacttccatatttccattaattgtttttcagcaatgcaccattttttgtttgaagttcatgttgttcttggatcaggataaggtactcaagccgttaggcgctattactactgggagccaattcctagagcctgatggtaatatctgcaccttttcttcatgccggtagtctcgtcttgcctgtcattttacaaattacatattcaggcatgtttccaaatcacattccaaatcctgaggacaaaactgcaatgaaagccattacacaagctgtggccgataacaaggcagacttgggcatcatatttgatactgatgttgacaggtataaaatatatagccattgaaattatacaggttcgtaatgcacaaccctaaaattgtgccgtttgcaggtctgctgctgttgattcaagtggtcgtgagttaaaccgtaacagattgattgctttgatgtctgccatagttcttgaagaggtaagatctcacaaggcaaagttggtcgtgtgactagttttgtgggcatttgctatgagacactctagaactgtggcatgattaaatggcactctgaaaactgtggctatatgccacaatacacttaggttattattttagtattatccttcgctgccacgacctcctcttaaactttatccccttcctacaaacatatcattgttattttgaatcctaatggcaagaaatggaaccaacattgaaaggaccaaatcagttggtgagtcacacctgcaagggtgatgcaataggcactgctgacaggacacatgtgctaggggctgggcagatgaattcatttgctcctgttcctacgaggatatttctcccatttttcttccactgtattgccttgagctgctgctgtttggccgaggctgacagtcttggtgaacgaagctgggggaggtgacagaaccatggaagccagcccctatccctgtatctccctcccgttctagttggttaccttccctgttttctctattgcatcgctgcggtgctctccagccccaatacgtctagttgtccagcctatgtcggttccacagccagccaccatctcactgctgacaagcctggtgaaggtccaaaaccattcaactctgctcagtgttggttggaaaagaaactagtgtgatgtagttgctgacatcttggcatagtttgtaaggttgaggggtgccacaagtcatttgtaaaaaattctcccatacgcaactgaaaatattattttaatagtctgaatgtcctgcagcaaaattttaaagattgtgatgtgtttcagcaaagacaattcagagtgtcctacaacatatgcgacagaataagagtgtcttacagctgattttacccacccaatattattcgatgctactgcagtgattgccactaacaaatccattgctctgatactagcacccaggcactacaattgtgacagatagcgtgacttctgatgggctgactacatttattgaaaataaacttggtaggtatttgttagattggtcctctgttctatttgtttatcggttgctcatttgttctatgataaaggagggaagcatcatcgtttcaagcgagggtacaagaatgtaatagatgaggctattcgtctggttagtttgtactgattgtataattcagattgtcttgaaatttgttctatttcacctggctgaataaaatgtaagtcattcctggtcaatctttcagaatactattggtgaggagtcacatttagctatggaaacaagtggccatggagcactgaaagagaatcactggctcgatgatggtgcatatcttatggtaaggaccccttttctgccaatttattgtccttcccaccatgaaatttgtccaaccaagcaaccatattggtatttcatgcataaggcatgcatttacctactcgagattattaaatctgtcaggtttgtgtttgccagttacatttgatctgataaaatatgttttgaacttcagtaccacattacagctgaatctgtcatgtcgtacattctgcttcaaaattgtagtaatatttctatcccagttatggggaatccccattggggatagttcctccctcttggaataattccaaaggaaatgtgcaaaacaatcttatttacagacattcaccttcatgtctttttgtcatcactcgtcaccactcttttatgggcatacccaaatgatatgggtgttctttttcctcaggttaaacttttgaataagcttgctgcagctagaatattgaatccaaacgttggtagtaaagttttgactgatttggtcgagggccttgaggaggcttctgtgacagtggagataagattgaagattgatcagaatcatgcagatttgaaaggggggtatgtccctttccaagagaagctatattaccagttatctaacactacacaattatcattgaaacaatgtcatttttgccatttctagttgagaaaattacatgaatgaatcaatttgattttttttttgtttaacatttgttgttccctaccaccttattctgcacaaatattattattttgatttgatatacaggaaatcaatgactgaatgattgattttgaaataagatatcatgtgatccctgtcagtttcctcttcataccctacattattttctaaatactgggaatggccatggtacagccactgctaactacagcatttttcacagccttttcctcccaatacactttttccaccactactctgctcccacttgtgaagagatgatcagcagatgttgaacaaattgtatcaaagtacatacaatacaattatgtctgctatagatatgcctcttaagccttttttactccagttgattgacatgcatgcttacataactgagggttatacatgtttgtgctgttagtgcagaaaaatagaggtgccctatttagaaaaatcagctaaaatttcgtggatgtaatttgtctttacaggtccttccgtgattacggagaagctgtcttgaaacatttggagaatgcaatcagtaaagatgaatatctgtgcaaagcaccgaagaactatgaaggcgtatgtcattattctttgcttgttttcacaagtttgagtatatatcttgatatatctaccttttcttgggtaaagtagctgggctttcttattgctgtatcatgctatatttttactacgcaggtaagagtttcaggatatggtggctggttcttattgcggttatccctccatgacccagttcttccccttaacatcgaggtcagcctccctttgccctatctgaaatcccaagccttccaatcatccatttaactgacatgtgaacatgtgcatgcacaggcgccgagcaaggatgatgccattaagcttgggcttgcagtgcttactgccgtaagtgaatttccagcattggacataacggcattgaacaagtttttgcagcagtgatggaagtattgcggcggcgacgataatctgcagccatcacatgcctttgttgagctgggatgagagaaacgcaccacagtactatacatagacgtacttgcattcaggcttacacataatattacatggttttgacttttcggctttacttggtctttgtttggtatggaaatgtcaaacaaggaagactaattttcgtgttttaaagaaaatatacaaagtagttgtcaggaatcttatataccatcgtcaatgtgttttcggattgctt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0447800, RefSeq:Os07g0447800