Os07g0671700

From RiceWiki
Revision as of 08:52, 24 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os07g0671700| Description = Similar to Arginine methyltransferase-like protein| Version = NM_001067135.1 GI:115474002 GeneID:4344248| Length = 7...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os07g0671700

Description

Similar to Arginine methyltransferase-like protein

Version

NM_001067135.1 GI:115474002 GeneID:4344248

Length

7220 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os07g0671700, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 7

Location

Chromosome 7:29062492..29069711

Sequence Coding Region

29062634..29062837,29063000..29063071,29063895..29064003,29064710..29064853,29064950..29065053
,29065138..29065236,29065319..29065388,29065864..29065960,29066180..29066234
,29067244..29067327,29067588..29067665,29067764..29067867,29067949..29068121
,29068215..29068372,29069048..29069083

Expression

GEO Profiles:Os07g0671700

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008400:29062492..29069711 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008400:29062492..29069711 source=RiceChromosome07 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggcgtcgccggacctgttcccgaacgtctccttctcccatgtctccgtccccgccgccgcgggcgcgtcgacggaggtcaccggcggcgccacggccgtgttcggcggggacgcgtccaccggggccccgcgcctcagcctcgtctggtccggggagacccaggcgaagcacacgctcgagatcgatctctctgacgcgcagatatttaagctggggccgacggagtggctgtgcgtgagcggcgagtcggaggctaaggacggtgtggaggagaagtcatattcaagagcaattaaggttgttcttaggacagaagctgagagcaaagccttctatttagcttttcaacaatggaaacaccgagtgattagtggaaaagctggtgaacctttggaaaatggattaataattggttctaaaagcaaatttgatacaaaaattgaggcctcatcagcaaagatgtatttccactactatggccagttattacatcagcaaaatatgttgcaagactttgtcaggacaggaacatactatgctgctgtaatggaaaatcgatccgattttgagggtcgagttgtggttgatgttggagctggtagtggcattctttcattatttgctgcacaggctggtgccagacatgtatatgcagttgaggcatctgaaatggctgaacatgctcagcgtcttatttctggaaacccatctcttggacaaagaataacggtcatcaaaggcaaagttgaggaagttgaacttccagagaaagctgacatacttatttcggagcctatgggaaccctcttggtgaatgaaaggatgctggagtcctatgttatagctagagacagattccttgtgccaggtggtaaaatgtttccaacaactggaaggattcatatggctccattttccgatgaatacctctatgttgaaatggcaaacaaggctctcttctggcagcagcataacttttttggtgttgatcttacacctttgcatggttcagcattccaggggtatttttcacagcctgtggtggatgcattcgatccaagattattggtttctccgcctacgtttcatacgcttgatttcactaccatgaaggaagaggagctttacgagattgacattcccctaaattttgtggcctctgttggcactagggtgcatgggctagcttgttggtttgatgtattgttcaatgggagcactgtccagaggtggcttaccactgctccaggctcccctacgactcactggtatcaactacgatgcatactttcacagccattatatgtcatggcaggacaagaaataacaggacgacttcatctggtagcccacagtgcacaaagctacacgatatacttgacgatgtcagctaaaatgtggggtgagggggcagaacaaggtggcatcctgcagacatccacagccaaacttgaactcaaggagccatactacaggctgtctcaaccacaaccatatgtgatgcaacaagaccagcagcagcagcagttaccatctttgcagccacagagtcctctctgggactatcactacggacaagattag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MASPDLFPNVSFSHVSVPAAAGASTEVTGGATAVFGGDASTGAP RLSLVWSGETQAKHTLEIDLSDAQIFKLGPTEWLCVSGESEAKDGVEEKSYSRAIKVV LRTEAESKAFYLAFQQWKHRVISGKAGEPLENGLIIGSKSKFDTKIEASSAKMYFHYY GQLLHQQNMLQDFVRTGTYYAAVMENRSDFEGRVVVDVGAGSGILSLFAAQAGARHVY AVEASEMAEHAQRLISGNPSLGQRITVIKGKVEEVELPEKADILISEPMGTLLVNERM LESYVIARDRFLVPGGKMFPTTGRIHMAPFSDEYLYVEMANKALFWQQHNFFGVDLTP LHGSAFQGYFSQPVVDAFDPRLLVSPPTFHTLDFTTMKEEELYEIDIPLNFVASVGTR VHGLACWFDVLFNGSTVQRWLTTAPGSPTTHWYQLRCILSQPLYVMAGQEITGRLHLV AHSAQSYTIYLTMSAKMWGEGAEQGGILQTSTAKLELKEPYYRLSQPQPYVMQQDQQQ QQLPSLQPQSPLWDYHYGQD</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>143..346#509..580#1404..1512#2219..2362#2459..2562#2647..2745#2828..2897#3373..3469#3689..3743#4753..4836#5097..5174#5273..5376#5458..5630#5724..5881#6557..6592#tactccacccacgcgtacaaacagcgagctcctccaccccgcgacgccgcgcgcctccgcccaaaaccctagccaccccgcgtcgcccgcctcggcgcgcccaaaaccctagggcatcccggatccgaagctcccggccccaatggcgtcgccggacctgttcccgaacgtctccttctcccatgtctccgtccccgccgccgcgggcgcgtcgacggaggtcaccggcggcgccacggccgtgttcggcggggacgcgtccaccggggccccgcgcctcagcctcgtctggtccggggagacccaggcgaagcacacgctcgagatcgatctctctgacgcgcaggtattcctccgtgatctcgatggtttatggggggaggtggagtgggagtggcgtgggctgtagggcgtggccgcgttggttcgattcgatttcatggtggggctctgagaggtgcctctgctgttgccgtgcgattggaggatgagattttgagttttgcagatatttaagctggggccgacggagtggctgtgcgtgagcggcgagtcggaggctaaggacggtgtggaggaggtactcttcagtaatttcgctgtttttttgagttattatgtgctttcgtttggtcataatgtacattcctctgttggatttcatatttctgatgtgcactgagccttccagtatataaccagtccaattccctgatataccacgccttgagctgtatgcctgtatggctgtatcatgctcaagccaattttaagatgatctcaaggtttaattgttgcacggtagaggcataccaacatttttcttttaaaagatggctcaaaagaagattcagtgacattttaaatctggggcgaagatgttgatattactagttgaataacatgacacagtttgcattcaagtttgttgtcggaacactctttcttttgggggtcatatcttcatccaaatccaacttagagtcttagacacatactagttgaaacacctaaagaaaaaggctggagtgtgatatgatctctctcgataccatcctatatgtactaaaagcaactttctgaaactgcaaaggatatgctctatgattgtgagatgcgagacataactagaattttcctgcctatctgaaagtctgacttatagaactcttgatagtctgctgcctattgttacgttataaaggtgaatttcctgctgactgctgtgtcacacttctttgttgccatctgctaaataactcatcgcatagactttctgataatgttgcctagaggtaaaggtaatatgacaatttgtagatcattgtttggccttttctgttggaactttcttgtagcacatattaaatggcttcatgttaactctcaattctttgaggcagaagtcatattcaagagcaattaaggttgttcttaggacagaagctgagagcaaagccttctatttagcttttcaacaatggaaacaccgagtgattagtggaaaagctggtttgtcctttcatttcttgtttcagataattccagtagcatattttgttgcattatttctgagtcatcggcccatgttctcaatgctaaatttcagattatcatgcatatagtcaattacagctctccatgtctgtttttctttaagtgccaatagctgcccttcaataccaagtgtttttaagactagataatgtttttcactttggtttgatatattctgctagctctagtgctctactatctaatgaaatgcataatgccatttaacttgcatatttggtcgtgcctggtctgataaaaaaataatgctattaggaatttgtagaagtagcatgtttactgctttatatctgcacatccagttttcttgaaggataactgtagttaatgaaatcaaattacatcatgcatgattatattaatgcatgttattttggagaacatacattaatactttgcatcatttctcttggtagaacttggttatgagatgctcattgtagcacacctttttgtgcttctctttgtattcgtttcctttttcaaaagtgttatttgtgacgaagcaaagtggcaactaagggacaacattgacatgttaatctcaaaacttatgccaacagtgaagccagagtcattagcccttttttttaatgtaaaatgccatagattcttatttcaacatattgctgcttcatggcaggtgaacctttggaaaatggattaataattggttctaaaagcaaatttgatacaaaaattgaggcctcatcagcaaagatgtatttccactactatggccagttattacatcagcaaaatatgttgcaagactttgtcaggacaggtcagtatctctggcctattgtcaaaagagttaaaataatggcatgaaggtctcctttctgtatatatgtaattagtttacaaccttttactccaggaacatactatgctgctgtaatggaaaatcgatccgattttgagggtcgagttgtggttgatgttggagctggtagtggcattctttcattatttgctgcacaggtacactccaacattctccatgacttttctaacttcttgttttttatacaaaataacagatgatgttttatatgttaatatcaggctggtgccagacatgtatatgcagttgaggcatctgaaatggctgaacatgctcagcgtcttatttctggaaacccatctcttggacaaagaataacggttcgtttatgtgccagtttggtttggaacttccaggcttcctttttgccctaaaattaatcagtgtccccatcataactaggtcatcaaaggcaaagttgaggaagttgaacttccagagaaagctgacatacttatttcggagcctatgggtatgcctcaatgataaactttctggagcatttcttttcccagagtcacctgtggtgttcctgctttacatcttatacccgttgcacaatctaataaccgattcattgtgtttgtatacatatggataactttcacactttgcagctaggtgacggataagtactaggttgcattgccatctgttaatcctgtcaagaaattggctgtcatatttgtagacaaactatccgttgttagcatcaatgttccttttaatggattgtatgggttaagcactggccattggccaaatggtgatagtatatgcggtatccacggtgtttattgaatagttgaatacccaatgtaaactagctaatatttgaaatgttatattgttgtttgaattttgaaatttggtataggacaataaacttgtttctgtatctgcttatatgtattatgtagtgacttgttttgtctataatattttaggaaccctcttggtgaatgaaaggatgctggagtcctatgttatagctagagacagattccttgtgccaggtggtaaaatgtttccaacaactggaaggtaatctgaaccactctggatatttattggaagttctgcttcacaaaatctttaggtgtttgattaggattgttcactaaatcatctgtgcttactaaaacgtcagaatagatctattggctaagttttccaaaaaataaactcagatgcatggctttttaagctacttttggcattcacaattactcactgatgcctgatatattaaatatttactaggattcatatggctccattttccgatgaatacctctatgttgaaatggcaaacaaggtacagtattacactccgatgaaatctttttcctaagtttactgcacaatcttactatccagtgcttctagtgaggctatactaaccttgttgtaaattactatgtgcaagtgggttgtgaaaacagttggaattgaatcgaaaatattcaaaactgttgtccgaaaccatactttttttttcttgaaatgagaatacaaaatggtaatgccagaaatggatatgacattggaacttgttggagcggaaatgtccagaacatcaaactgtaacaccatatgtttatgttcacgcgcttgacctagcaactacgtaagatgagttcagatacacactatacaacttgcaatttattgaacacaaagtaatgaaatactcccttcgtcccaaagtatagcaacctagtactcgactagacaccacttagtactatgaacctagacagtcttcatagtactaggtggtgtctaatcgagtactaggttgttatactttgggacagagggggtaactatcaatttattctcatctttggaccgttaccctatctctggatcaacgcccataacatctgacatcctatatatagatattactgtttcaaaatttccctggttctttaaataggagatattgagaaatgaattctcaacttgtccatgctttctgtcaactgtatagcacagtaccaaagtgagaatgtgtccatttcccccacttataccttgtcttaacacaaagataagcagctcttctgtgtattttctgaaaaaagaaaatgcacacttattcctagcttttatgtgtttttagcacatcatttgctctatgcgaaaatctcatattttcgtatgatgatgctggtggggggttaaagccaccttgtggtcacttcctatttattctcatgttgttgagcaagtatattatccttgctgaaagtatgttatttcaatcctaagtgtttctttagtttgacacattatattttggttgtgtgtctctgcaggctctcttctggcagcagcataacttttttggtgttgatcttacacctttgcatggttcagcattccaggggtatttttcacaggtatctcatcccttttcttttcaacttttgactagaaagtacctcaattcaaaaacaacaataaatagttcaatgcactcttactggcacctaatctttcaattagccacctgtattccagttccagtggttaatgccaagaattgaaccccgagaatggctattacttaagtaattctatataacccatgactgcattgttgatcagagtgactactgactagttatcaaatctaaacgcccctgcaattctcatgcagcctgtggtggatgcattcgatccaagattattggtttctccgcctacgtttcatacgcttgatttcactaccatgaaggtaaatatttctttattggtgatgagactgaaactacaggtaatttttctgtattgtttctccctgcaaaatgaagcattcttttctttctttgccaggaagaggagctttacgagattgacattcccctaaattttgtggcctctgttggcactagggtgcatgggctagcttgttggtttgatgtattgttcaatgggaggtcagtgctatatcggtttatttgagtctatattgtctcttgtctgcttctacccgctacaatctgtgtgttttactgcagcactgtccagaggtggcttaccactgctccaggctcccctacgactcactggtatcaactacgatgcatactttcacagccattatatgtcatggcaggacaagaaataacaggacgacttcatctggtagcccacagtgcacaaagctacacgatatacttgacgatgtcaggttgggcattttctatttcgtttgttatcagtttttttccctctattgcacttgaagctgatggttcttgctcttttggttattttctggaagctaaaatgtggggtgagggggcagaacaaggtggcatcctgcagacatccacagccaaacttgaactcaaggagccatactacaggctgtctcaaccacaaccatatgtgatgcaacaagaccagcagcagcagcagttaccatctttgcagccacaggtaagttgttttctattaggtatttgaagaacaacggggatgtttgtttaatatttattttcatgcagtacatcttatgcttatatctgcatcttgcataacactggcaacaccagaaaaatcaccatattatgtctcatttcctgcaaggcacataatcctgtacttgaagtacctatgttactgcctactgtatttgactgtatggagacggttagataattgcttactctgggctttttaatcttgttagtaatgtgcttacacaatacaacaaacgcgagataaatatacttcaagttcaagagttaatatggaaaaaataattattattcttaattttagaaattatatacatgaccacataaacaatgggggttgggcccaccattcgacacaaatgcaaagaatacatgttccacaaatactcagtatacacatgcaaagaaacacatgattacaaaatatattgcagataacacacatgtacatataactagccacagaatatcataatgggggatggtattggttttaaggagtaaacatcagaagtattggtattcttacctgaattacttgcgagatctaatcgaaacacatatatgcaaatgtgcgataataagttggtacaggtattttgattaccaatagttatgtttaattgcattacagagtcctctctgggactatcactacggacaagattagttgtctggcctcagctattgaacattggcaagaatagcaggtacacagtttttagggtgacatacatggaatgcttgtttgcaaggcttttcggaacaataaacttcattataaattgaattaaatttgaaaagagttttcaaagggcatttaaactttcaaactgtacttgttagcaaaattttactgctgatgcatggacttgattttatgtatttccttgatagatctaacattcgtactgcaaacagggatctgagcagcagatgcaagatggtcttagccctagtataacgattgaaccagaccaagactcggcggccttcactagatagctcgtaagccggagttgcttcaggcaaacaactccaggcctgtacaacagtatgctcctacctgatgttgctaggcgttagctgtcagtggctaacattgcattcgttgtgtacgagaggttgtgcagctgtagctaattgtgctcgtgtctgcaccgttatttaaagggggtcaaatacaataagtgtatctgtttgcaggaaaagctcaacgacaaaggcgtctaactagaacgattgttgtgtatgttcttatgtattattgttttatttaatttaaaaatggttggtcg</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os07g0671700, RefSeq:Os07g0671700