Os08g0175300
| Gene Name |
Os08g0175300 |
|---|---|
| Description |
PolI-like DNA polymerase |
| Version |
NM_001067647.1 GI:115475030 GeneID:4344789 |
| Length |
9708 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0175300, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:4390053..4399760 |
| Sequence Coding Region |
4390495..4390656,4390883..4390972,4391050..4391262,4391437..4391529,4392090..4392284 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:4390053..4399760 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:4390053..4399760 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcggtggcgccgccgctgccgccggcaccggcgcggcagctacggcggtggaaggggtcttcgccgcggccgccgccgtggctgtcctctcccttccgccgcacccgctacttgtcgcgcccggccttcgccgcgggaggaaggcaagattattctcctagttcaggcatgggggttagcaaaaccggtgctttcaggcttggattgtatggcaacttaaatgtacaaagtagtgtgcaagaatgggttgatgaaaccaagaggttatttttcctcaggaccacaaacagtgtcagaaacaacatcactaatggcactactcctctgcgggttggaaatctgcgtcatgatccctcagaagatatcaggagttcaaactatccttccttgtataatcaaagagaaagaggaccatctaattcaattgtaaatagacatgtcgatacagatttggctaagcatcgtgtgatgtatcagtcagcacatgctgtgcctgccccattcagtgttgttaataatgatatcaaaccactgaacatgcttgatggctccaaggaggaaattccttggcacgattccgttacgatggaatcttctctgcctaaagtttccaagtcagagaaaactttggtggttgataaagctatcccagacaaaaaggagcacaaacgcattacaaggaaggtgacgccaaatttcccggacaaagcttccttgtccactgagtcaaaaaatgcacggaagttgcttgctaccatctatgacaaagttttggttgtcgacaatgttgagtcagctaggagtgttgttaaattgcttactacaaagtacaaaggctttattcatgcatgtgacacggaggtggcaaatattgatgtcaaagaagagacaccagttggtcacggagaagtaatatgctttagcatctgttcaggaaattctgatggggaggctgattttggaaatggtaaaacatgcatatgggtggatgtgctagatggtggaagggatgttctaatggagtttgctcctttctttgaggacccatttatcaaaaaggtttggcataactatagttttgatatccatgtcattgagaactgtggaatcaaggttgctggatttcatgctgatacgatgcatcttgcacgcctgtgggattcttccaggagaactgatggtggatattcacttgaaggactaacaaatgattacagagtcatggatgctgttctaaaggacatacctaaaactgggaaggtgtcaatgaaaactatctttggccggaaaaaggttagaaaagatggatctgaagggaaaaccatatctatcgagccagtcgaaaagttacaaagggaggatagagagttgtggatttgctattcctcactagattcaatgagtacattgaagctttatgaaagcttgaaaaacaagcttgaagcaaaggaatggattttcgatgattgtcctagaggaacaatgtatgatttctacgaagagtattggcgtccctttggtgctcttcttgtaaagatggaaacagagggagtgcttgttgaccgtgcatacctttcggagattgagaaagctgctgttactgaacgagaattagcagcggataagtttcggaaatgggcatctaagcattgtcctgatgccaagtacatgaatgtgaatagtgataatcaaattcgccaacttttctttggtggcatcgaaaatagaaataagcgtggtgaaacttggccacaaagtaaaacttttaaagtgccaaatgatgaaggcatagctacagagggcaagaagactccaaagtctcgcacaatcaaacttttcactattgtggaagatcttaaaattgatatgttcaccccgactggttggccttcagtcagtggggacgttttaaggagtttggctggtaaaatacccacagatcatatatataaaattgatgatggccaagagtttgatgaagatgggagcagtttggaacttcctgagcaggatatagaagacacttccccatatggaactgcatatgaagcgtttggtggaggaaagaagggaagggaagcatgtcatgccattgctgctctatgtgaagtcttttctattgacaaattgatatccggcttcattgttccattgcagggagatcgtatatcatgcaaggaagggcgcattcactgttcattaaatatcaatactgaaacaggacgcttgtcagcaagaacaccaaacttacagaatcaacctgctcttgaaaaggataggtacaagattcgccatgcttttgtcgcagctccagggaacactcttattgttgctgattatggccaactggaactgaggatcttggcgcatcttactaattgtaaaagcatgctggaagctttcaaggctggtggtgacttccattctaggacagccatgaatatgtaccagcatgttcgtgatgctgttgaagaaaagaaagttctgcttgaatggcatcctcaaccaggtcaagacaaacccccagtgccattattgaaggatgcttttggcgctgagaggaggaaggccaaaatgcttaatttctccattgcatatgggaagactgctgttggtctatcttgggattggaaggtttctgttagggaagcaagggatacactcaaactttggtatagggatagaaaggaagtttcagcttggcaaaagaagcagaaagcctttgcgcttgaaaagtgcgaagtctacactttgctcgggcgatcacgccaatttcctaatatgactcatgcgggtcctggtcaaaagggtcacgtcgagcgtgctgctataaatgcaccagtgcagggcagtgcagcagatgttgctatgtgtgcaatgcttgagatagaaagaaacgctcgccttaaggagcttggttggagactcctattgcaggtgcatgatgaagtaatcttggaggggcctacagaatctgccgaggaagccaagaccatcgttgtggagtgcatgtccaagcctttctatggaaccaacatcctcaaggtcgacctagctgtcgacgccaagtacgcgaagagctggtatgctgccaagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAVAPPLPPAPARQLRRWKGSSPRPPPWLSSPFRRTRYLSRPAF AAGGRQDYSPSSGMGVSKTGAFRLGLYGNLNVQSSVQEWVDETKRLFFLRTTNSVRNN ITNGTTPLRVGNLRHDPSEDIRSSNYPSLYNQRERGPSNSIVNRHVDTDLAKHRVMYQ SAHAVPAPFSVVNNDIKPLNMLDGSKEEIPWHDSVTMESSLPKVSKSEKTLVVDKAIP DKKEHKRITRKVTPNFPDKASLSTESKNARKLLATIYDKVLVVDNVESARSVVKLLTT KYKGFIHACDTEVANIDVKEETPVGHGEVICFSICSGNSDGEADFGNGKTCIWVDVLD GGRDVLMEFAPFFEDPFIKKVWHNYSFDIHVIENCGIKVAGFHADTMHLARLWDSSRR TDGGYSLEGLTNDYRVMDAVLKDIPKTGKVSMKTIFGRKKVRKDGSEGKTISIEPVEK LQREDRELWICYSSLDSMSTLKLYESLKNKLEAKEWIFDDCPRGTMYDFYEEYWRPFG ALLVKMETEGVLVDRAYLSEIEKAAVTERELAADKFRKWASKHCPDAKYMNVNSDNQI RQLFFGGIENRNKRGETWPQSKTFKVPNDEGIATEGKKTPKSRTIKLFTIVEDLKIDM FTPTGWPSVSGDVLRSLAGKIPTDHIYKIDDGQEFDEDGSSLELPEQDIEDTSPYGTA YEAFGGGKKGREACHAIAALCEVFSIDKLISGFIVPLQGDRISCKEGRIHCSLNINTE TGRLSARTPNLQNQPALEKDRYKIRHAFVAAPGNTLIVADYGQLELRILAHLTNCKSM LEAFKAGGDFHSRTAMNMYQHVRDAVEEKKVLLEWHPQPGQDKPPVPLLKDAFGAERR KAKMLNFSIAYGKTAVGLSWDWKVSVREARDTLKLWYRDRKEVSAWQKKQKAFALEKC EVYTLLGRSRQFPNMTHAGPGQKGHVERAAINAPVQGSAADVAMCAMLEIERNARLKE LGWRLLLQVHDEVILEGPTESAEEAKTIVVECMSKPFYGTNILKVDLAVDAKYAKSWY AAK</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9105..9266#8789..8878#8499..8711#8232..8324#7477..7671#7304..7396#6395..6490#5429..5858#4323..4990#2143..2340#1007..1724#233..378#gccgcttaaaccctggtcccccttgtctcccaaaccctctctccttcccctcgcttccgcctccggccgccgccgccgccgccgcgaggccaccgcctgctgctgcagcggcctacccttgcgtcggtgcaagacggcgccctgcggcttcggttgcggggtgggtggtggcgttgcgggaggaggaggagggaggcgggcggggtccaagctgaggcggctcgtgaggtccatggcggtggcgccgccgctgccgccggcaccggcgcggcagctacggcggtggaaggggtcttcgccgcggccgccgccgtggctgtcctctcccttccgccgcacccgctacttgtcgcgcccggccttcgccgcgggaggaaggtagccgtactgtttatttgtgtgtattgcataagcctttttctttgctagtagttgttaagatgttccgtagtgcctaattcgtgatgaaaaataatacttcctccgtttcacaatgtaagtcattatagtatttcccacgttcatattgatgttaataaatctagataaatatatatgtctatattcattaacattaatatgaatgtgggaaatgctagaatgacttacattgtgaaacggagggagtaaatgatgttttggttaatggatgggtgtatgcatatttttcgcatgttctaatgtgatgatttatctagactgtgtaggacttcggatatgtctcctcatttgagctagtgtcgattagcattccttaatccttatatatatttttattttgttttaagagatctaagcattccttatgtagtcacattccacttcttatagccatacaattattactacagaagtacgaattgcccgataatagtaatctgccaaagagtaactaggttctactgtcactatcctgaatgccgcgcttttgccttattacttgatgatttcacattgcttgggatcttgggtgcttctgaactttgcaaatggttctcgttggcaggcaagattattctcctagttcaggcatgggggttagcaaaaccggtgctttcaggcttggattgtatggcaacttaaatgtacaaagtagtgtgcaagaatgggttgatgaaaccaagaggttatttttcctcaggaccacaaacagtgtcagaaacaacatcactaatggcactactcctctgcgggttggaaatctgcgtcatgatccctcagaagatatcaggagttcaaactatccttccttgtataatcaaagagaaagaggaccatctaattcaattgtaaatagacatgtcgatacagatttggctaagcatcgtgtgatgtatcagtcagcacatgctgtgcctgccccattcagtgttgttaataatgatatcaaaccactgaacatgcttgatggctccaaggaggaaattccttggcacgattccgttacgatggaatcttctctgcctaaagtttccaagtcagagaaaactttggtggttgataaagctatcccagacaaaaaggagcacaaacgcattacaaggaaggtgacgccaaatttcccggacaaagcttccttgtccactgagtcaaaaaatgcacggaagttgcttgctaccatctatgacaaagttttggttgtcgacaatgttgagtcagctaggagtgttgttaaattgcttactacaaagtacaaaggctttattcatgcatgtgacacggaggtatttcgccaaaccctgcttgagttctatcatcggtatatcagttttggctatgttatttaggttttccctcataattgtgagagtatcaataagaagtatatttctgataggtgatactatagtatcttgtttggtcatcaattattgctgacctcaagtgtttgttgttagattgtgcctttttttccctatgtatcttctctgaaaatgtaagttgcagagtttacaggagatgtcatgaagaatgtaaaatattaaatgctaatgctaattattggtttcttctagttacatggtttgacatgctcatagtctacttctgtggtagcaagctttgctcagaattatttacagttttattgcgtatcaagctccaaacatacattctaatttaggatagtacaatattatacaggtggcaaatattgatgtcaaagaagagacaccagttggtcacggagaagtaatatgctttagcatctgttcaggaaattctgatggggaggctgattttggaaatggtaaaacatgcatatgggtggatgtgctagatggtggaagggatgttctaatggagtttgctcctttctttgaggacccatttatcaaaaaggttcacttcgattcctcatttatcttggagtaaatttattgtggttatcttctccctttatgtgttggatgaaatgtattagtgccatagttccttttccctcttctattactactataattacattacttcttttagattaggccttagttgcagcaaactgcactaaacaccatttcctatcactcgtaaacttatgctaaacattgaaaataactagatatagttcactattttataattatgcatttcacctgattgtcagcaccataaagttgtgggtttataaccaaaaaatgaaaaacaaaatcctacctggctacctgctaaaccctacccaagagtgataatgtaaatggactaccttaagattgctgttttagacagacccttctgtgctctgacatactgtctttatatgttccatttttccctgcctagaaaaaattcctgtgcgttgcaacgagtgaaggcaacttgcaaataactgaacaaaattaactgtttaaactcggctgtagctaccggtccatcacctaatgaactatgaaatcatgtgggtatgatcgatgaatataattgtaacaaaaaaatgacatcatttctaacatggtgatggtgtttagttttgaagttatggagtgtatttctttcgtgcaatagcgcatgtgtgcttgcgtcgaccaacatgagtcaggtcataaaaaatcttggtatggtagtctatttgatttgtaggaggcttggagtaaatcttagttaatagtgaggacttggactacactaagggaagagccgaaagacacatggtagattgataccgtgtagaaggattgatgtgacatgtgactcattagtggtgtaccaggtccaaaaagtcatgaataaaatatttataaaaatgggaagagatggagaaaaaacatctatttttgaaaatcacaagggaacaactttcacctcagccactgttcacgcgggaactgttcatcaccagagaggtgaagagcttcatggctagcttgggacagtagacccatctgatctaagtaggccatgaattcacgatcggtcaatgcagccacagccggcccaggtagggtcagcaggaaaaagacctggctgggtggagctagaattccctcactcgtgtactgctgtactgaaaaagggcggacgtgcgctgtgtacaaagagtcaaagactaatgcggtaactgagtagaggatggacgaaaattttgagtacaaaatcatcttcaatttttataatataataggtaaagattgaatagattcacattttcgtacccgagccccatatttcctactacttcgcttagaaaaaagaaacatgttttagacattgacacagtccccaaaatacaactttgacaacttatttatgttatagtatatttgtagtatcaattgtatgaccctataaaattgtaatattatgatattctggtcacaaaaactatgttctattacaaaatgctaaaagaacccaatatagttctaatattgtggaagtattttttgagaaaaatctacaagtacaattttcatgtgtccaatctaattagttaaaagatattgataagaacatttttaaagtttgacttcaaacatgtccaaaacgagatgtttttttgtgactggagggggtagtaattttggtgacaaatatacacatatgagtttcatataccaagattaaatattttgaagatattgatggtcaaagttctgattgttcaacttaatgtatgtccaaaacggcatgttttcgtgactggagcccagagggagtatgaaattaatatgctaattagtagattcagtcttcaatcaatctttgaactgtgcagttcggaataaaactacagattggtcattacccatcaattattattatactacgtatttgtttcttcttggcttgtctgaagtgatctgttctttctcctcatcatgtaggtttggcataactatagttttgatatccatgtcattgagaactgtggaatcaaggttgctggatttcatgctgatacgatgcatcttgcacgcctgtgggattcttccaggagaactgatggtggatattcacttgaaggactaacaaatgattacagagtcatggatgctgttctaaaggacatacctaaaactgggaaggtgtcaatgaaaactatctttggccggaaaaaggttagaaaagatggatctgaagggaaaaccatatctatcgagccagtcgaaaagttacaaagggaggatagagagttgtggatttgctattcctcactagattcaatgagtacattgaagctttatgaaagcttgaaaaacaagcttgaagcaaaggaatggattttcgatgattgtcctagaggaacaatgtatgatttctacgaagagtattggcgtccctttggtgctcttcttgtaaagatggaaacagagggagtgcttgttgaccgtgcatacctttcggagattgagaaagctgctgttactgaacgagaattagcagcggataagtttcggaaatgggcatctaagcattgtcctgatgccaagtacatgaatgtgaatagtgataatcaaattcgccaacttttctttggtggcatcgaaaataggtattcctaccaccttgtataatctctttgatgtctgcttgatttgtatatactttatgccaggatatctttttgaatgcatgtcatttagaaaccactgtaaaaggatatcattaatatgtgttaaaaccaataattgcttgctgttcttatatgcattggtctatgcatggtttaaactggttagcaattgttcttgtgtgtccaacactccaagacatgaataattcttcatatcaacaagtggtggaaaacgagggaatctatctttgccttctatttgtgctaggtatttcctttatgtaatttcaaagaaaaagtagtaactgtgagttattgcttgtgcgtatttcctgtaaaaatgattgttttctttacatttacctgcttatcattgcttatgtataattcttgtcaacttcacaatctttgtcacagaaataagcgtggtgaaacttggccacaaagtaaaacttttaaagtgccaaatgatgaaggcatagctacagagggcaagaagactccaaagtctcgcacaatcaaacttttcactattgtggaagatcttaaaattgatatgttcaccccgactggttggccttcagtcagtggggacgttttaaggagtttggctggtaaaatacccacagatcatatatataaaattgatgatggccaagagtttgatgaagatgggagcagtttggaacttcctgagcaggatatagaagacacttccccatatggaactgcatatgaagcgtttggtggaggaaagaagggaagggaagcatgtcatgccattgctgctctatgtgaagtcttttctattgacaaattgatatccggcttcattgttccattgcaggtgagccaggatcttagtcatgctgattgaagttgccattcttaagacatcactcattgcatgtacttataaatgataatgcaaatcaatttgtgctggtgttatgtgtcctgagtcctgacagctccaatgttctttcacctcacgctcttgaaactttggggctgcagcatgcaccataaatgtggtgatttggtcagcatgcaatttttgtagggagagcatggaattcagttaaatgcattttcagtccatcaagtttgaaatttggttctttcgattagtgctgtttgatatcttaatttgataatttaatactttgtttataccatgatcacttggtctgttttgattatatattttgaggcttaatggtgctactactgtagtcttggtgctgatccaacttgtgttgtttgtgtgagggacaactatggtgtatacttggtgcatgataccaatagtctcagctaactgcacttaacttctaagttgcacctactgtttgagtcttgactgctctttatccatgatagggagatcgtatatcatgcaaggaagggcgcattcactgttcattaaatatcaatactgaaacaggacgcttgtcagcaagaacaccaaacttacaggtatgcctcttcttttgcatttgttggaatcttgcatcagtacctcacagttcacatttgggttgtcaataagcacatgatgatggtacaccacactattgtcaagtaaaggatgaaaaatatacaaaaggtctgtatgttctttcaagacaaaagtatgttggtgtcggctccttctcactgacttttgcctggtttgagtgtgctctaccactgtgtatgtaagcagtataagactgctgttccacagagtcactatatgagtgtttttcagagtatatgcttgcattcttatttgcatcaacttgccaccgactgctacagaagggagacttggactgcttagcaactaagttgcatatgctatcaatttcgatttttcgtaaagcacaggaactaatgttaccttcaaacttcagcattcaccagttgcaatataaataaaatgctctgtagaagtatgatactccataatcattttattcattcatcaatggatatgagaatgaaaggcaaaacaaacatggcaaattggcaatataaagtaggaatgatgaaatggctcaccggcaaacttattttgtgtagccaacctcaggcatcaggacacacatttgaattattcatttagtcaataagctgtctgctatttcgggatatttgattattaccatgcttcatcatcaagggtatttggacccttgctaaatttgttattacttctgacaaatgcttcagtttttattgttagagtggtgctatatcgattatgtaaattttatttttttttaaccaagtatatcttccttgcagaatcaacctgctcttgaaaaggataggtacaagattcgccatgcttttgtcgcagctccagggaacactcttattgttgctgattatggccaagtatgcttagtggttctcaatagtaagtttttttacttcacttagcagttccacctgataaaaggtctttttttatgtagctggaactgaggatcttggcgcatcttactaattgtaaaagcatgctggaagctttcaaggctggtggtgacttccattctaggacagccatgaatatgtaccagcatgttcgtgatgctgttgaagaaaagaaagttctgcttgaatggcatcctcaaccaggtcaagacaaacccccagtgccattattgaaggtacttgagtgtcactaacattttctgacagcagcttatctctcgaagttgtacttgatttcatttgaattacgtaagattttggtcctgtttgcttattgtgataagatggaatatgattaccttcatttgtagttcattcagtcaaattttaattattttagttattgagaaatatatctttgttgcatttttttttaaaaaaaaattgaacatgtgaattctgtgacagttgttcctagtggaaagccacataatttgtcggataacatgtctaaattacacaaaaaagtgtcggatttaatttaatcgaaagatacatggataattgataacctcacttgtcatacatttatatgttagggcctcgtgttttctttctgctttgaagaagttggcaagttgcatagagtgcttttatcaattgttattgggcatatatattccatatgtactgatttttttatatatatatctggacccctggtagaatggtataaggctatatactaataggcatggagttaaaaccaaacttgatgtttctatttctattttaggatgcttttggcgctgagaggaggaaggccaaaatgcttaatttctccattgcatatgggaagactgctgttggtctatcttgggattggaaggtatgggcttctatttgtacaggcttgtgcatgcatttatcatcttcccttgttcagtttttcttattgggtttcatcttgtttttgtacccaacatgatatcgcataggagtattattcagtaaaagttttgttacaatcagttccagagttgtagcttaattgtcctagcaggtttctgttagggaagcaagggatacactcaaactttggtatagggatagaaaggaagtttcagcttggcaaaagaagcagaaagcctttgcgcttgaaaagtgcgaagtctacactttgctcgggcgatcacgccaatttcctaatatgactcatgcgggtcctggtcaaaagggtcacgtcgagcgtgctgctataaatgcaccagtgcaggtaattcctattagttatatcacaatggttgttcttgttcagttttgggatgtctaaatcccttttgtgatacacagggcagtgcagcagatgttgctatgtgtgcaatgcttgagatagaaagaaacgctcgccttaaggagcttggttggagactcctattgcaggtttatgacaataacactcctacgtttacaaaagaaagtacttaggctggtatttgaaggcacagacgaagggggccaccattgtttctttctttcaaagaatttggcaaagcaaagatttacatcatatttaagagctactttttgtgttctttcagagtattttattttgatcccccgaatgaatttgtacattgtcctcaaatgttatgtctgcatttgccaggtgcatgatgaagtaatcttggaggggcctacagaatctgccgaggaagccaagaccatcgttgtggagtgcatgtccaagcctttctatggaaccaacatcctcaaggtcgacctagctgtcgacgccaagtacgcgaagagctggtatgctgccaagtagtagaatccgcactcggttcttctgccctatacatagccagatgagcacatttgtctgccccaaagttaggcgacaccaaagttatgtgtcgccgatgcgatgaagactctgcccatccgtcctgacgaaatacagcggactgaaccagcacagatagagatgcaagccgctcaagaagttgaagtgccacccccatcacccacaggaacacaagaccacacgtccatttttcggtggcagaggcagagcatccaagaaccgaataggctgaagactctttcactggcagtagctgaatgtacactagtagcctgtccgatagttactccattagatttggatttgactgtagagaccacagtagatactgacctgtatgagactttcagatacttgatcatgaaggaagtgcagaagcatgctgtcttcatatgacctgttc</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
