Os08g0202400
| Gene Name |
Os08g0202400 |
|---|---|
| Description |
Disease resistance protein family protein |
| Version |
NM_001067754.1 GI:115475244 GeneID:4344910 |
| Length |
3638 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0202400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:5963509..5967146 |
| Sequence Coding Region |
5963509..5965600,5966054..5966850 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:5963509..5967146 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggcagaaaccgcggtgagtgcatctaagggtgtgataggtgccctttttgagaagctcactaagctggtggaggacaagtgcaccaatctcgtaggcatgtcaaaaaatattgtgttccttaaagatgagctcccaaccatgagcgcgctactcgagaagctagaggatgcagatgaacttgatccagtggtgaaggcttggaggaaccaggtcagggagatggcatatgatattgaagattgcatcgatgactttgtgcaccacgtgggaggtggtgatgtggaagctggcttcatcgataaggtttctcactttctcagaactttgagggcccgtcttgagactgccgagcatatcaaggatctcaagattcagctaatagagataaatgaacggcacaagaggtacaaatttgatctagatgacactcctagttctagctttgtggccattgatcctcggttgccagcactgtacagtgaagccgctaatcttgtgggtattgaaggcccaagggaacaggttataaagtggttgacagatgcggatcaacaaataatggtcctaccaattgttggctttggaggtctgggtaaaactacgctcgccaaggaggtttatcaaaaaattggacagcaattcaacaccacggaatttgtttcagtttcccaaaggcctgatgtaacaagatttctcaaaggaatacaatcaaaacttccgataaggctgtcttctgaatattgtgaagttaaagacatcattgacaacatcagagcatatctacaacatagaaggtacctttttgttgttgatgacttgtgggatgcacctacatggaatattattcggtctgtttttccagaaaatggcatgggctgtagaataattgtgaccacacgatcggaagatgttgctagatgggtatgctgcaatcatcgacgattcatttacagaatggagcccctcagtgatgaaaactcaagatggctattctttaacaggatatttggctcggaagatggttgcccttcccaatttagagaaatttccgctcagattctgaaaaaatgtagcggtttaccacttgcaatcattaccattgctagcctattggctaatcagcctgcaccacacaagaaagaatattgggagagtattcgtaattctattggcacctgggggtctggcacaaatcccacgttggaagggatgaggcaaattttacaccttagctacaaggatcttcctcgtcatcttaggacatgcttcctataccttggtatttatcctgaggacttcaccatcaagaaggatgatttgattagacaatggctggctgaaggctttgtccatcatttccatggggggagttcagaggaagttgctaagagttatttcaatgaactgatcaatagaagcttaattcaaccagaagaaaccaaatatggggaggtagtttcttgtagagtacatgatatgatgcttgatttgatcttaagtaggtgtgcagaggataattttatctgcgtggcatacaatctagaagaattgtctggaaaacatgaattcaaagtccgtcgattattggtcgactctagagttggtgattcaggagataccaaaatatcaggaacacctgctcctagattgttgcaactcagatcacttcagctgtttggagtatctgtatccctgtctttgttgccactgtctaagtatatccgagtgttgatattacacttgggaaaaaccgggacaggaggcaatgaaagagttgatgtgaccgcaattgggcaattattccagttgaggtatttgaagattgtaagcctccatcatgcgctcgtactagagcttcctactgaaattcgaggacttcaatatttgtcaacattggaaatagattgcacaaatgagaacagtttgccatcagatattgttcatttgtcccgcttgtcccacctgattgttccaagtggtatagggttacctgatgggaagataggcagcatgaagtccctatgcactctccaaaaaattgagatattagatatcaagagcgccattggccttggtgagctgaccaatctaaaggaccttgagctgtacagtaaacaggctctgtcagagagagagattgatgcgctggtaacttcccttggaaaacttcataagctcatatctctgcgcatgtctaagtttgcagaatgtatctggtatgatgaggataaccggctcggttcattgtccaatcctcctctcaatattgagagactccacctgggaggatggaggttgcgtcgagttcctagatggatcaatggtcacctccaaaacctctgcttcctcgttcttgatgttacagagatgtcaactgatgaggttcggctccttggagagctaccttcactcagtgaactctgcctgagcgtgaagcgtttggctccatgcagcgcatccctcgtattcggtgcagggttcccagcattggagtgtcttgaattcttttgcggtggagatatatcacacctgtgctttgaggcaggggttatgcccaatctcagaaagatcattctgttttacatagatattgaatggagcggcaccgcaccagttggcattgagcacctactgaacaaacaactccgatacatccaattacatccggttactgacacagcagtggatgccgagcgtatcagcctcgcattcacagaagctataagagcacatacaagccgtggtggtgctgaaccttacctgcgcttcgcccggatccgaagtggtagcctcataggtgcaaactctttaatccggcacagttttacttgtcatagagtttctgctttgtttctcctgaatcacattcttgccattcttttttct</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAETAVSASKGVIGALFEKLTKLVEDKCTNLVGMSKNIVFLKDE LPTMSALLEKLEDADELDPVVKAWRNQVREMAYDIEDCIDDFVHHVGGGDVEAGFIDK VSHFLRTLRARLETAEHIKDLKIQLIEINERHKRYKFDLDDTPSSSFVAIDPRLPALY SEAANLVGIEGPREQVIKWLTDADQQIMVLPIVGFGGLGKTTLAKEVYQKIGQQFNTT EFVSVSQRPDVTRFLKGIQSKLPIRLSSEYCEVKDIIDNIRAYLQHRRYLFVVDDLWD APTWNIIRSVFPENGMGCRIIVTTRSEDVARWVCCNHRRFIYRMEPLSDENSRWLFFN RIFGSEDGCPSQFREISAQILKKCSGLPLAIITIASLLANQPAPHKKEYWESIRNSIG TWGSGTNPTLEGMRQILHLSYKDLPRHLRTCFLYLGIYPEDFTIKKDDLIRQWLAEGF VHHFHGGSSEEVAKSYFNELINRSLIQPEETKYGEVVSCRVHDMMLDLILSRCAEDNF ICVAYNLEELSGKHEFKVRRLLVDSRVGDSGDTKISGTPAPRLLQLRSLQLFGVSVSL SLLPLSKYIRVLILHLGKTGTGGNERVDVTAIGQLFQLRYLKIVSLHHALVLELPTEI RGLQYLSTLEIDCTNENSLPSDIVHLSRLSHLIVPSGIGLPDGKIGSMKSLCTLQKIE ILDIKSAIGLGELTNLKDLELYSKQALSEREIDALVTSLGKLHKLISLRMSKFAECIW YDEDNRLGSLSNPPLNIERLHLGGWRLRRVPRWINGHLQNLCFLVLDVTEMSTDEVRL LGELPSLSELCLSVKRLAPCSASLVFGAGFPALECLEFFCGGDISHLCFEAGVMPNLR KIILFYIDIEWSGTAPVGIEHLLNKQLRYIQLHPVTDTAVDAERISLAFTEAIRAHTS RGGAEPYLRFARIRSGSLIGANSLIRHSFTCHRVSALFLLNHILAILFS</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1547..3638#297..1093#ggaagtgaagagcacagaggatggtgattttgttcatccttcacggcgaattctcccaatttcttccatttaagttcttcttggttgtctgattattaggtttctgcttcgaaaatgctggtttgctctgctgctggctgcttgggttcaacctgatctggtgcttcctagtcgaattcaaggagagccggtgagctaagctccaaaccagttgcaatttgttaaagaaccagtcgattgtcatatgcttgctaacctgcttccgtatttgcagaggaaaatatttgggaggggcaatggcagaaaccgcggtgagtgcatctaagggtgtgataggtgccctttttgagaagctcactaagctggtggaggacaagtgcaccaatctcgtaggcatgtcaaaaaatattgtgttccttaaagatgagctcccaaccatgagcgcgctactcgagaagctagaggatgcagatgaacttgatccagtggtgaaggcttggaggaaccaggtcagggagatggcatatgatattgaagattgcatcgatgactttgtgcaccacgtgggaggtggtgatgtggaagctggcttcatcgataaggtttctcactttctcagaactttgagggcccgtcttgagactgccgagcatatcaaggatctcaagattcagctaatagagataaatgaacggcacaagaggtacaaatttgatctagatgacactcctagttctagctttgtggccattgatcctcggttgccagcactgtacagtgaagccgctaatcttgtgggtattgaaggcccaagggaacaggttataaagtggttgacagatgcggatcaacaaataatggtcctaccaattgttggctttggaggtctgggtaaaactacgctcgccaaggaggtttatcaaaaaattggacagcaattcaacaccacggaatttgtttcagtttcccaaaggcctgatgtaacaagatttctcaaaggaatacaatcaaaacttccgataaggctgtcttctgaatattgtgaagttaaagacatcattgacaacatcagagcatatctacaacatagaaggtcagtatccatttacttataatagtggtaggcattaattctttttccgttctatgttttcaagggttcatatggtttcaagaagttttctatctaaagtgcctgttttgctctacataattacttgtttggagctgacaggcatcctttgccagctttttggcttctagaaaagtaaagctcttctcttaaatgggtcatgtgccagagttgaggggcaaaaatatctaggtctatattagcatagcgcacagatgttggtgcgatttaggtttgagttctaaatgaatatcctaatttagcaatataattcatggttagtacaaggaaaaaaaaactcatgaatttccttgaaccaaatgtgcttattaattgttgaatttgttgatatatttcaattattcatcgcacataccaaagaattgtatggcacttgataatttaatttaacaggtacctttttgttgttgatgacttgtgggatgcacctacatggaatattattcggtctgtttttccagaaaatggcatgggctgtagaataattgtgaccacacgatcggaagatgttgctagatgggtatgctgcaatcatcgacgattcatttacagaatggagcccctcagtgatgaaaactcaagatggctattctttaacaggatatttggctcggaagatggttgcccttcccaatttagagaaatttccgctcagattctgaaaaaatgtagcggtttaccacttgcaatcattaccattgctagcctattggctaatcagcctgcaccacacaagaaagaatattgggagagtattcgtaattctattggcacctgggggtctggcacaaatcccacgttggaagggatgaggcaaattttacaccttagctacaaggatcttcctcgtcatcttaggacatgcttcctataccttggtatttatcctgaggacttcaccatcaagaaggatgatttgattagacaatggctggctgaaggctttgtccatcatttccatggggggagttcagaggaagttgctaagagttatttcaatgaactgatcaatagaagcttaattcaaccagaagaaaccaaatatggggaggtagtttcttgtagagtacatgatatgatgcttgatttgatcttaagtaggtgtgcagaggataattttatctgcgtggcatacaatctagaagaattgtctggaaaacatgaattcaaagtccgtcgattattggtcgactctagagttggtgattcaggagataccaaaatatcaggaacacctgctcctagattgttgcaactcagatcacttcagctgtttggagtatctgtatccctgtctttgttgccactgtctaagtatatccgagtgttgatattacacttgggaaaaaccgggacaggaggcaatgaaagagttgatgtgaccgcaattgggcaattattccagttgaggtatttgaagattgtaagcctccatcatgcgctcgtactagagcttcctactgaaattcgaggacttcaatatttgtcaacattggaaatagattgcacaaatgagaacagtttgccatcagatattgttcatttgtcccgcttgtcccacctgattgttccaagtggtatagggttacctgatgggaagataggcagcatgaagtccctatgcactctccaaaaaattgagatattagatatcaagagcgccattggccttggtgagctgaccaatctaaaggaccttgagctgtacagtaaacaggctctgtcagagagagagattgatgcgctggtaacttcccttggaaaacttcataagctcatatctctgcgcatgtctaagtttgcagaatgtatctggtatgatgaggataaccggctcggttcattgtccaatcctcctctcaatattgagagactccacctgggaggatggaggttgcgtcgagttcctagatggatcaatggtcacctccaaaacctctgcttcctcgttcttgatgttacagagatgtcaactgatgaggttcggctccttggagagctaccttcactcagtgaactctgcctgagcgtgaagcgtttggctccatgcagcgcatccctcgtattcggtgcagggttcccagcattggagtgtcttgaattcttttgcggtggagatatatcacacctgtgctttgaggcaggggttatgcccaatctcagaaagatcattctgttttacatagatattgaatggagcggcaccgcaccagttggcattgagcacctactgaacaaacaactccgatacatccaattacatccggttactgacacagcagtggatgccgagcgtatcagcctcgcattcacagaagctataagagcacatacaagccgtggtggtgctgaaccttacctgcgcttcgcccggatccgaagtggtagcctcataggtgcaaactctttaatccggcacagttttacttgtcatagagtttctgctttgtttctcctgaatcacattcttgccattcttttttct</dnaseqindica> |
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