Os08g0208400
| Gene Name |
Os08g0208400 |
|---|---|
| Description |
En/Spm-like transposon proteins family protein |
| Version |
NM_001067786.1 GI:115475308 GeneID:4344943 |
| Length |
5112 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0208400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:6318267..6323378 |
| Sequence Coding Region |
6318807..6321293 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:6318267..6323378 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:6318267..6323378 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggaaagaacttggatgaattgtaagttgtttagcaaggagcatcgggagggggtcactgagttcatggactttgtttgtaaaaatttgagtggcagtcagaagatattatgcccatgtcgtaagtgtttgaatcggttacatcaatataaaggacgtgtggaggatgacttacttatgtacgggatgtctaacacatacactcggtggatacatcatggagaaccattggtcattgtcactggaaatgttgagcatttgaatgaagatattggctgcaatgttgagcatttgaatgaagatgttagctgcaatgttgaatttgagacgaatgagcctccggatgacccagaagatgatcaaatgtaccgtatggtacaggatctgtacccagatcaaaatcatggaccaagaacaaagtcaaagtttgccaccatattagaagagatgaaacaggtgctacaccccggtggtccctatactaggttttcttttgtggtgaagttgctccacatcaagtcattttacagaatcagcaatgttgcattcagtgctttttttgaccttttaagttcagcatttccaaattgttctctccctgcatcctatgctgaagcgaagaattttattcgtgcattaggacttggatatgagtcaatacatgtgtgtccgaataactgtgttcttttccgaaaggagttggctaaaaaggatgcatgcccaatatgtggtgcttcaagatggaaggatgcagatagccgaaggaagattccagaaaaggttctaaggcattttcctttgattccaaggttgaagaggatgtttggatcgaaagaactttcagctgaggcacaatggcacaagttgaagaggaaaccagtggacaatgagcttagccatcctgctgatggtgaggcatggaaagattttgatagaaagtatgaatggtttgcaaatgatgcacggaatgtccgacttggcctcgctactgatgggtttaatccatttgggaagatgagctcctcatatagcatgtggccagtatttcttatcccttacaactttcctccgtggcaatgtatggagcaatccaacttcatgatgtgcctacttattcttggtccgacatgccctggaaaggatatggatctcttcctgcagccactggttgaagaattgttaaatctttggagtggtgtccctactttggatgcattgaccggcaaagaatttgatcttcacgctgcaatcatatggtgcattcatgattatccagcattgagcacactttcaggtagagtaactagaggctactatgcttgcgtttgttgtgataaaaatccttgctacaaaagacttaggaacaagatttgctacattggccatcgccgttttcttccagtggaccatatttggaggagaaagaaagattttaatggtcagactgaagaacgtgcgcaaccggaagaatttactcaggatgagttgatgcagcaattggcgagggtggaacatgtaagacctgggaaccatcctaataacaaaaagagaaagagggtagaagaaggtcaatgctggaagcgcaggtcgactctgtgggatttgccatattggtctaatttaaagctacgacacaatcttgatgttatgcatatcgagaaaaatatatgtgaggcccttcttggtacatttctcgacatcgcaggcaagtcaaaggactctgttactgcgaggctcgatttagaagatatgggcataaggaaaaatttacacttgaaggatgatgggaattcaacatgcactgctccacatgctccatatgtgatgactaaagcccagagaaaagctttctgtgctttcataaaaaatgtcaaattcccagatggatatgcctccaacttagcaaggtgtgttagtgttgatgaatgcaaagtacaggcattgaaaactcacgactgtcatatccttctgcaaaggatattaccagccggtctccgaggaatcatgcataaggaaatatatgaaacaattgctgaattaggtaactttttccagcaaatttgtgctaagaaattgaagttagatgctttgaacaagatgagaggtgaaatcccaataatattgtgcaagcttgagaagattttcccgcctgccttttttgatgtgatggtgcacttatgcattcatttaattgatgatgcaatcctaagaggtcctgttcaatatggatggatgtaccctgtagagcgtaggttgctgaccttgaaacgctttgtaaggaacatggcaaggcctgagggctccattgcagaggcatatgtcgcaaatgagtgcttgactgcttgctcaaggtattttgctgatgttgacactaggcacaatcgtgagggtaggaacaaagagcgtgttcctatgagtagatgtggtttatctattttccagcatggagcaaatctgttgggggcaccaaggcttacatatgagtag</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MERTWMNCKLFSKEHREGVTEFMDFVCKNLSGSQKILCPCRKCL NRLHQYKGRVEDDLLMYGMSNTYTRWIHHGEPLVIVTGNVEHLNEDIGCNVEHLNEDV SCNVEFETNEPPDDPEDDQMYRMVQDLYPDQNHGPRTKSKFATILEEMKQVLHPGGPY TRFSFVVKLLHIKSFYRISNVAFSAFFDLLSSAFPNCSLPASYAEAKNFIRALGLGYE SIHVCPNNCVLFRKELAKKDACPICGASRWKDADSRRKIPEKVLRHFPLIPRLKRMFG SKELSAEAQWHKLKRKPVDNELSHPADGEAWKDFDRKYEWFANDARNVRLGLATDGFN PFGKMSSSYSMWPVFLIPYNFPPWQCMEQSNFMMCLLILGPTCPGKDMDLFLQPLVEE LLNLWSGVPTLDALTGKEFDLHAAIIWCIHDYPALSTLSGRVTRGYYACVCCDKNPCY KRLRNKICYIGHRRFLPVDHIWRRKKDFNGQTEERAQPEEFTQDELMQQLARVEHVRP GNHPNNKKRKRVEEGQCWKRRSTLWDLPYWSNLKLRHNLDVMHIEKNICEALLGTFLD IAGKSKDSVTARLDLEDMGIRKNLHLKDDGNSTCTAPHAPYVMTKAQRKAFCAFIKNV KFPDGYASNLARCVSVDECKVQALKTHDCHILLQRILPAGLRGIMHKEIYETIAELGN FFQQICAKKLKLDALNKMRGEIPIILCKLEKIFPPAFFDVMVHLCIHLIDDAILRGPV QYGWMYPVERRLLTLKRFVRNMARPEGSIAEAYVANECLTACSRYFADVDTRHNREGR NKERVPMSRCGLSIFQHGANLLGAPRLTYE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>541..3027#gcaggctgtagccccaccctgtccccaacgtagcgcccggctgttggagctcgacgccgtcgcccttcgcccaacgcggcttctggagcccggcaccgccggctggatcccaagccccaccccatccccaggagctcgatgccagcttgctgcagctccaggacgccgggcttcatgggcacaactgctgggaacgcccccaagagcccgacgccgacgacagtagcccgcccccgcctctaggatctcgacggctgggccggctggctgcagatcctggccgctgggcttcacgggctcaaccgctaggaagcccccaagagctctagcctgggatcactgccgacggcgggtgaggtcgaccagagactgccccatccccttcaattaggaaggaaaggtacatatgagaagaacttatgttttggttttaaattttgaactgaaaccatagatttgaagtgatagaaataggaaaatagcagtctgggcaatgatcagtcattgattcaatgcttgtcttatttcaatatgtaacagatggaaagaacttggatgaattgtaagttgtttagcaaggagcatcgggagggggtcactgagttcatggactttgtttgtaaaaatttgagtggcagtcagaagatattatgcccatgtcgtaagtgtttgaatcggttacatcaatataaaggacgtgtggaggatgacttacttatgtacgggatgtctaacacatacactcggtggatacatcatggagaaccattggtcattgtcactggaaatgttgagcatttgaatgaagatattggctgcaatgttgagcatttgaatgaagatgttagctgcaatgttgaatttgagacgaatgagcctccggatgacccagaagatgatcaaatgtaccgtatggtacaggatctgtacccagatcaaaatcatggaccaagaacaaagtcaaagtttgccaccatattagaagagatgaaacaggtgctacaccccggtggtccctatactaggttttcttttgtggtgaagttgctccacatcaagtcattttacagaatcagcaatgttgcattcagtgctttttttgaccttttaagttcagcatttccaaattgttctctccctgcatcctatgctgaagcgaagaattttattcgtgcattaggacttggatatgagtcaatacatgtgtgtccgaataactgtgttcttttccgaaaggagttggctaaaaaggatgcatgcccaatatgtggtgcttcaagatggaaggatgcagatagccgaaggaagattccagaaaaggttctaaggcattttcctttgattccaaggttgaagaggatgtttggatcgaaagaactttcagctgaggcacaatggcacaagttgaagaggaaaccagtggacaatgagcttagccatcctgctgatggtgaggcatggaaagattttgatagaaagtatgaatggtttgcaaatgatgcacggaatgtccgacttggcctcgctactgatgggtttaatccatttgggaagatgagctcctcatatagcatgtggccagtatttcttatcccttacaactttcctccgtggcaatgtatggagcaatccaacttcatgatgtgcctacttattcttggtccgacatgccctggaaaggatatggatctcttcctgcagccactggttgaagaattgttaaatctttggagtggtgtccctactttggatgcattgaccggcaaagaatttgatcttcacgctgcaatcatatggtgcattcatgattatccagcattgagcacactttcaggtagagtaactagaggctactatgcttgcgtttgttgtgataaaaatccttgctacaaaagacttaggaacaagatttgctacattggccatcgccgttttcttccagtggaccatatttggaggagaaagaaagattttaatggtcagactgaagaacgtgcgcaaccggaagaatttactcaggatgagttgatgcagcaattggcgagggtggaacatgtaagacctgggaaccatcctaataacaaaaagagaaagagggtagaagaaggtcaatgctggaagcgcaggtcgactctgtgggatttgccatattggtctaatttaaagctacgacacaatcttgatgttatgcatatcgagaaaaatatatgtgaggcccttcttggtacatttctcgacatcgcaggcaagtcaaaggactctgttactgcgaggctcgatttagaagatatgggcataaggaaaaatttacacttgaaggatgatgggaattcaacatgcactgctccacatgctccatatgtgatgactaaagcccagagaaaagctttctgtgctttcataaaaaatgtcaaattcccagatggatatgcctccaacttagcaaggtgtgttagtgttgatgaatgcaaagtacaggcattgaaaactcacgactgtcatatccttctgcaaaggatattaccagccggtctccgaggaatcatgcataaggaaatatatgaaacaattgctgaattaggtaactttttccagcaaatttgtgctaagaaattgaagttagatgctttgaacaagatgagaggtgaaatcccaataatattgtgcaagcttgagaagattttcccgcctgccttttttgatgtgatggtgcacttatgcattcatttaattgatgatgcaatcctaagaggtcctgttcaatatggatggatgtaccctgtagagcgtaggttgctgaccttgaaacgctttgtaaggaacatggcaaggcctgagggctccattgcagaggcatatgtcgcaaatgagtgcttgactgcttgctcaaggtattttgctgatgttgacactaggcacaatcgtgagggtaggaacaaagagcgtgttcctatgagtagatgtggtttatctattttccagcatggagcaaatctgttgggggcaccaaggcttacatatgagtagaaggagtatgataggatggtttggtatgtcctcaacaatactaaggaggtcgagccatttatagagtatgtccttgaatagcgcacctgtttttatttgtgtatcatataaaattttagctcttacatgggagttgtgcacctgtttgtaggatttacatgaaggatttacaaactgctggcagtcatgatgttgaggggaaccttgctaaggaatttccaggatggtttaggaaacatgtgagtcattatttaagtattttcagttttgactctgtgataatatatcattatttaagtatttccagtatattgcaaatgaatatatctcatacatatctcatttactgaagtgagaatgcaaatgaaatttacatatgtacatgaataaaatgcagctgtgctatcatgcatcattgcttctactgttgaaaaccttgcttggcagaatgaagcacatgagaggaatagagcatcgtgtgcattttttgtttttttacaacaaatgattttattagcagcatgtttagttttgagattagatgactaaattaagtgcagctgcctcttctgccatgatgacattcctgatagctccctgtatataagtctgataggatgattgttgttgcgtattggtgatggagattcccagtccagcgtccttgttcatctgtggggtgttgtcaggctgtgtggctacatccacatagcattttgttcctgtcaaaagagctggtagggctatggtgctgtgtggagtttcatgcacatgctagtgcaatagttggaggaagctgcagttttcagtgatgaccatcacacgaggaaatacggtatattaagtagagaagtcacaccattttttttctctaattgtaagaaatatcaggttcatgctagtgttacctgaatcattttgagaaaatgtctttttctccctaaaaaacaagtagaccaatatggaagaacctgtgcataaaaaatggacctaaggaaaaatctatttacaaatttttagagttaagtagtctgctagtacttgcattatttctggtgtaccttgctaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatactgcagcttgctactcggaggtttgtgaatggagaacaaatcgatgaagacctatatgcattggcaagtctaccacttcttagagttcgtatattttcaggatgtattgttgatggtgtccgatatcacaccgtggaacgtgagagcagtagaagaacacaaaacagtggagttatggttgagggcacacataatggagaagatatagacttttatggtcagctaaaagaagtaatacagttgcagtacaactctgacgctgacagtcaaaggacagtggtgttattcaagtgtgattggtttgatacctgtagcaaaaagtctaggatgaagaatgatggatatttcaaaagcatcagccatggaagttgttggtacaaggatgatgctttcattcttgccacacaggcaacaaaggttttctacttggatgataacaagcatggtgaaccctggaaagttgttcaaaaattttcgcatcggcacttgtggaatgtgaatgaggaggaaaatgatgacaggcaagagggaggggttgatctgacataccaagatgatgagcaggaaatatctcgagttgaaaccatggaaggatctctggtcgacaaacaaccagtcaacgaagatggtataagtgtaccaaagtccctagttgatcagattcgcaggcaacgggatctggaagttgaagaagatgacctgtacaatgatgatgacgatgatgataccttagggcagtatgatagtgaaaatgaatgtacaattatgatccctaatgatgatggtgagtatagtgatgtcgagtaattgagatatgtgaatctgagttgtgatgaaattgttgtttttaaacagctcctaatgtgttagccgtgaaataattatgaattgtgaactcaattgtgtaaactccttaattgagatatgcgaattccagctgttcttggtgcctggaattgtactg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
