Os08g0441200

From RiceWiki
Revision as of 13:02, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os08g0441200| Description = Conserved hypothetical protein| Version = NM_001188669.1 GI:297726468 GeneID:9267573| Length = 13423 bp| Definition...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os08g0441200

Description

Conserved hypothetical protein

Version

NM_001188669.1 GI:297726468 GeneID:9267573

Length

13423 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os08g0441200, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 8

Location

Chromosome 8:21562487..21575909

Sequence Coding Region

21566540..21566734

Expression

GEO Profiles:Os08g0441200

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008401:21562487..21575909 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008401:21562487..21575909 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgctgctgctgctgcaacgcggtggtgataaagctaggcagcgcgggacctcgtccttatcttgtactgcaggtttgggggtgagccctatacgtgccatgagctctctgaccgaggacaaggaggaggagggaggagacggctttggagactcttattttggcatgagctactatacatgggctttgccatag</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MLLLLQRGGDKARQRGTSSLSCTAGLGVSPIRAMSSLTEDKEEE GGDGFGDSYFGMSYYTWALP</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>4054..4248#atcgatcactgacaaccatcgtctttctctggttgagctagctagctaagctagccaggggagagctagagagatcgccggagatgagccagaagtcgtcgtggccggagctggtgggcgtactggcgacgctggcggcgacgcagatcggcaaggacaggccggacgtcgccgtcgaggtgctcccgccgggcgcgcccctcacgccggatttcaacgacaagcgcgtccgtgtcttcatggacgacaacggcatcgtcttcaaaattcccgtcatcggttagcttaaatgctccaatagctagcctatgggctatggcactagctgatctcccatggctgatgcatgcatatttctcctcgtcttatcacatctgttacatatgcagcgaaataatggaataaatggcgccgtgtacgttcatgtgtttttgctccttcatatgctccatctattccaaaataacttaatctaagatacaaaatgacacattctaaaccaacgaatttgaatttatcgttggtctaggatggatcacatcacatcctagattaagttatttttggaatgaaggaaggaaactttagctaaggatgtattcttttctttcctttctagtaacttttattccctcgttttttacatttacgctttccaaactgataaacgtcgtgttttttaaaactgctttaaaaaatatattaatctattttttattttttatttaatacttaattaataatacgctaatttttcgttccattttgcatgccaagaggaatgttgcgaccccaaaaaaaggcagcctgtatccagtgaatttttcgctgtaaatggtccaccttattcttttagctctacttttagtttcagaagcactagcccctctctccaaatagactagaatctaagaatatgcagttataaaacctagaatatggactagaacctggccgaacccaaacatttttgacaatttgacacgtacgtacggcccatacttattgggccggaatgtgtcgaccttctgacatggggacgtagtggctgggccagtaatagttgggctggatgcgcatagtgccgtagttatgcgcggatctgttgaaaatagacaggacgctgtttttgaggtattgaaactgttgcaaatagcgatttaattaatgttcttcactagttgagaataaagcattctgtcactgacagtgaatcggtaataggataattgctacagacaatgagacaagtaattttcagtggtggtgccttttactctgcgtgagtgagtccatatgcaactatgcatgcataactaaagattcctaatccgcttggattcttttagggttcatctagatgtacgctgcacttaggtcctgctttaaagattagcccaggtttaattttgagagctaatgtttagttttgaattggtaggctaaacattatgttcggatccataggctaaatcagcgctaaaagttggagagagagtagagagagaggggggagatagggctgtttttttatggtcctatagaaaattagcccaattagcatttcttggaggagctaatattttgaggggtgctaatttactttagccccagattagcccacctatttagattcttggggctaatttagggctaataattagcccatatatggaaccaaatagggcctcaggaactttttgatagccacaacttctctcttagaagagttgattctaagagagaagttgtagctattaaaaagttcttaaggccctgtttagttctatggactaattactaggaatattttcagtacttctattttatagttttgaaaaaaaactaaaagtttgaaactataaaacccaatgttttgagattctcaccaacaacttctcataatctcagactcctctaatcaggaccatgtggctagaccaacagtagatttaaccagaccgtggataaccaacagcccgtggagaacctagttagactctaattgacaatagtattgtaattcatagtctaaaataactaaaaagtacaaatgctacctgatgtcctatgcatcggggtagttctatggaggaaacttttttattgtttagactttttatttttctaaattttattaatagaccattccaaaaagtatttatgaaaactaaacctttcggcaacgccagccgagtagctggtgtggccaaccatggtggcgtggccgaacaacatggtcacgccaactgcgcgtggtgcgcgtggcgtgacaaagtttcagatttagaatttttttttgaaatggtctattattaaaaaataaaaattttctctatggaggaatgaccctgccatgtagcgccatgctaccgacgcaaaaaatgtttttttttaagtgcgcacatgataatgtgtatcgccacacaaatattcaccttgacattcaatatatatataaatggagatataaaaacatttaaacaaagaaatactgatgcgtgttgtttgtgtgcactattcagggtatgaatttgttttgttttctctatgtatatatacatgtacgtagaattttgagttggttttttgcgaggtctcgtacatgttatcgtgtccacagtatattttagtgtcgataccacagtagcaatgaacgcgctatgcagtagtacacatgagattctgttgctatggtttgagggctacttatgaatcccaaagtagtttttgtgtaatacaaagtgcatccggtcgtaatgcttccgcaataaaagattaaaataaaacaaaaaggatctctatatattattcatgtaaaagctatatttgcaaagaatatgtcttcttggtactcaacaatatgtgtgatttaattatcttccaaattatgtaaatcaagcagagttacacatgcatgaaaactaagtttcgaatttgtcataatagtacagaactatgttaaatgaaagctctctatatatctgcatgttcatataaagctatatatgcaaggaattttactttttcattagtagtatatgcatacataaaagatgtgatagataaaacattaaacaataaaatattgaataaccacaacaacccaatcaaacaaggaataaatacgtgtcgaccaatgattgaaccacacaataaaaaactatatctagccgtccctctcataaatgcaaacataacatatctttaggacagatcaatcatcgtccacacattgaaatgtggacctagtgacatcaatcaatccgtggataggtgttgccgacgggatgcgccagtaatgacggaaaggcattcggaaaatatttttttctttagaaagaaccccattccccacggtaaaaaaagctgacaacatgatatagcatgatattgtatcctctccgggatacggcagcggcggccggccaaaccctaagctagaacagcagccgtatatggcatatcatgagaaaagcaggaaaagagagatatggggtaaaggatttatgaaccatggtctcttcccccctctatatataatgctgcatccaccaggctatggtcacacaccaccaatcaatcaaagcacacagatctgagctagctagcgcccacctttcttctcccactccggcggcacatctccgccgccggccggtcagccggcagctagtggctctctcgctcctatgtggctatgtctgtctacctaatggttttctgttttcttggttttgggtggtggcagttgacagaagagagtgagcacacagcggccagactgcatcgatctatcaatcttcccttcgacaggatagctagatagaaagaaagagaggccgtcggcggccatggaagagagagagagagagagatgaaatgatgatgatgatacagctgccgctgcgtgctcacttctctttctgtcagctctccctgcagcatgcacgctgccacagccacactctctccattatctaactgctcctttaatttcctcttctctctctctctctctggactcgcatcgatctccgatgagataagagcatgctgctgctgctgcaacgcggtggtgataaagctaggcagcgcgggacctcgtccttatcttgtactgcaggtttgggggtgagccctatacgtgccatgagctctctgaccgaggacaaggaggaggagggaggagacggctttggagactcttattttggcatgagctactatacatgggctttgccatagtagtagtatactccttttgctcttctctgcttttgcaggtttttgtcttggtttcccagagatctgggggaggacgacgacactactacagccagccagcctcgggggaataagctagggagcatcgcgcgtgacgatttgattaattaacctgtataaattcgagtgctaatttgtcacgcgcgattaattaacctcgagtcgatgggttaatgatgctgctggtgagaaaattactagcggatcccaagatctgcacgccatatggtacttacccgctgtgtgttcttgctgctagctagctgctagctgctagctgcttcttttttacaacctctcttaagaaagcttcaagcttgtgtgtttttgtgctatcatctcatgtgtgctgctgcaaagggggagaaaggacggccatggcagcggctagctagctgtgattattggagaaggttgatgtacactgcagatctggcaacctgcgcacctgccccagaagagaggagagcgtcagtatagcggctggcccagatctggaaactgcgctgtaaacgtatgtatattggttcgtacttgttggcttcgagttggagatcgatcgatctgatcttatatgttgctctcatcgattgatttctgttgatagaagtttcttgaggttttctatttgcctatttgttgtgtactgattgttcgagtctgaaagtggttgcttgattctaactatgccaacattcatgtgcatgagtttttttttcctttttcaaatttatttttgaggaataatgagttttgctgttaattagtacttatttctttggatgttcttcgcacataagcagctgcttgttatgttaacaacttaagatgaataagattctttactgcgaaaaacaacctgttcttggttttaatgttctttattatagacaacactatatatgcacacaaatccctttactcgacctatagaggaccgcaatatatatgcacaaatcagctgggtgggagattcttattttatgagatgagatatgatcttctcagttacatggtgatgattattttctgcggatttgtatggtttttaatttgtgtggagatttaatttctagctaaccaatgtttaattaggaacccataagcaaccttagttaatttacacatgatgttattttcgaagccaattaagatcaaccatctatcttttttgctgcacactaattcaacttttctgtaggttctctcccccaatcaaagagtttttccaaaggttctttccccattcaaaagtaaattaagtaggaaagcaggtggtggtgtttatatatatcatgggcaaataaactaggggatttaataccgggagtataacatatatatttgtaaaacttagcttttctgaccatccctttatttcatattgacctttaaccatcctaattttctaatgcaataggcattttttttgcatgttcttcagaaaaaagatgtataagttctgctcatggatttaatttcatgtggtcccttggtcctgatttatatcccaactttacatcaggggttgagtagaattttcatttgtgttctatatactcaaattggacactttatacgagctcccatgttaaccaggaaatctggtcgttgatcgtctacacatattttcttatttccatctatacatatgtattttttcagtgctataacttctttgctcgaatttgaccaaatagtttgaagtcattaaatatagcatagctattaatgtgaaggtttgcatctaccagcgcaataagtaattttctatttaactcagtttctcattaatgttagttgctgaatagacttttacataaatcaattgagtgtttaattatctataacttctaacaaattaaaaacaatgaatgaaaagtttgtaagatttttttagtatgtgcggtagtgctgtaaaatactacttaagcaacatattgagtctaattaattgggctaattgagtacttcgaaagagctctcacatgcattaataaaaaatagatgtggccctttaatagttggatttatcatatattgtgaacgttgataatattaagaataaagcggtctattgaaaacatcatagattctctttagtttctactaccatgaatgctttaggattagtaattctttagaatcaatatattgaatatagagttacctatcttggaccttaatttgttaatttagtttcgaaatttaaattcaataatcagagtgttgtaattgacgtagctagtctcttctaattctaatctaactaatttattatatatataattagaatttaaataattataatataaaaaaaataatagctcatgcaatgccacgggatgctgactagtcattatatatgagccacttttgtggcctacccctccgtcccaaaaagatccaatcctaactacgaatctggacacatgcgtgtccagatttgtagctaaagtttatttttttttagacagaagtatgtgctaaatgttctgtggcattgtacctgtcgtcccgctgtatgtaatcgcgtgtatgtgcccctgtgtgaaccttgatttagaagtacactagcagtgttccttttgtacctagtctttctgcagtagtgattgctccatacaaatcaaattcacatgattggatgatgagtacaatatttgtacaaatattaaagagcaaattttgcaaaacaacaaaaatcttgacagaaactatgacataactacatcgtattaaagccacagtaccataaattaaactatagattaaaccctgaatatattatgactattttttcagccacacggtaccgtaaaactatatcttttagcatcagattttgtagcaaaactgcatattttggaggttagatccctggcactattgtcctgatatctatatattgttctgataaaactagcacttaatgtgtataattctttgatactatggcgtttatcagctgcgcctgtagtttgtatatgcgcatacaccatttacagaaataatgtagttttggttaatttgattttattcataaataatatacatacaggaaccaacagcaacactatatataatatatttctaaatgtagctagctaaatgcctcttatttagccaaatttcttggctgtgtgctctatgacatagatcggggatcatataaaccatcatttccattatttgaaatatatacttattaaatgccttgaaacataccaatttcaaagggttccgatatcgtagcatgtagctagtgattcgtacgtatacagcagtaaaattgtcttacgatcgaagttgaaatgttggtgctgaatgctcttacacctgagaccgatctctctgctgtgtttggcaaatctgtattttcttgttattactctcagcgtataaaacgttcttaacaaattgagaagtatatatgcacgatgatctctatgtatgcatctgtataagctttattaattgttctttctccgtttcgtattataagacgctttaacttttttctagtcaaaatatatattttaattttaaccaaatttatattaaactataataatatttctaacataaaataaacataataaaactaatttatatacatatatacacagacacacacactgctatatttatcgataaacaagatcaaactttaaaagaattgatttaaatcaaaacgattaaaatcaaagaaagtatcggtcaataaactggtttttgctgctacgttaacctgctaacactttgccgcagtacagataccgatcgccatgtggatgtggtcagcatgctaataacactttgcagcagtacagatatcgatcgccatgtgtggatcgatgtgtctcgctcgatctcagctatccatatgccccaacaacagacaatctggcacgtgttggaaattaagtctggagatggacatgtggagacaactgaaaactctgaatgcatgaaacatgagtcaggatcacctttaattttttggtccctaggagtatgtaatgtgaatgaatgattgaatgattgactgatttccaccatttgtatgccgacttttgtaatcagaagataatatacagtatgagtaatttgtagactaataatatatactactaaaccattgttcttttgttgcaatagtgtgtaatataaattcgcagcatgttctagctagcaaagttactaatacaaaaaaatttgtttccccttatcagtgaatatccgcgtgtctatatcaacgcatgcatcagtcgtcccatcacaagactccaggcgcatatagacgatgtatcatctatatgccataattgctgtgatcttaaccctacaaattattgtgcagtgggtaccgtaccatttcatattggcaatcaattgaccttttgatcgggcatgagtagtgacaagaagctgccgctgaaactctgtattaattcatcctggatcgatcctatgaatgtagcaggattatttgtgctgattctgcatcatgcattagcgtatcatatagatgtcacagtagcattactgttatgatcgatctttcttatataacggaaattaaatggtttaattacatctttgatctcgccgatagacatacgaccaaagtaatgaagcttgcaagtcttctgaaccccataaaattatcagacttcagagatacattcagagcatgtactaaacgaaagagaaaatttctttaatgcccttaaaattttagccgatcccttctatgtctctgaattttcttcactcgcttgtatacctctgaattttgatttggatctcttccatacccttgccgtcaattgatcgctagttgaccatttaataggtatagaaaagttagttttgcccttcaatacgtgaggaatatgtagaaatttgtaaactatattgttggaagcatagaaatttattgtgtgattataatattcataagcttgttgtacatagaaattttaataaatattaaaaagtatgtgtagcattttctttaaatcataaacatagttttgaaaagcattcctatataatatataggacaggaaaaaaatattgaactaccataaaaaaatgctacatataatcttttaataagtaaataaatattagtttttatgtcattatgtaaaaataaactttgtcatgaataataccttgtacaataaaatcatgaatataatagtcttatataacaaaattatacacttccaacaatatagctagtctacaatatccagatttccttcatgtgtaagggcaaaatggtcattttcataggaattaaacattcaaataacggtcaactaattgaatgggtatgaaagggatcaaaaccaaaattcaggggcatacaagaaaatggacaaaactcatagggatagaagggattggttaaacattcaggggtatagaaggaaatttctctaaacgaaatggggattctctacaggaggacaatgataaggaactaggtcccgatcttctgatatatatattgataactctcaattaaatggcggaaacttgacacacatgatccagcttccgatcaatataattcgaaccctacaatcaaagcaccacatctcctttggttatcaaccgtgccctgcccagttgacctcatcgagaagactaatccctacatgcgaatcgaagaacacgagtaagaacaaggtagattattgcaactcgattgcatatgaattattaagcactcgaatttagggttccacaaaccgaacaagcgacaaaactgcaatgccagaaataatctaagcaaaaccaagagatggcgtaaaaaatagagtagattagaaaaaaaaacttaaccggtaattaacacatgcgaaattacttctttaccatgcaaaattttccaaatctacccttggggaaataatactatccataatactcagtgtagtagtggcggatatgatccgttggatgcaacgaatggatgatccatgtttacccgagggtacagtaaaaaaatcctttttctgggcggactatgttgcaagatggccagttgcagtgagtgcctgaaaatgcatgatttttctttggttgcataggcttgaacaaataaacatgatgtttctctcattctgtgaatgaaaatatttaacctgtattatttgaattgatctctagtgcatgatagggacggatagactcaggtcagaatgaaatgacatacagtgcatataagagaaaggtctagtaggcttaactctgcccatgtgtccagctagctcattgcgacaagaaatcttaggctgtgttagagaaaggggagatagataagattgggaagatacgcaaaacgaggtgagctattagtgcatgattaatcgagtattaattatttcaaatttcaaaaatagactgatatgattttttaaaacaactttcttatagaattttttttgcaaaaaacacaccgtttaatagtttgggaagcgtgcatgcggaaaacgatgtgcaatctatctccaatctcctagaacgaacgctgccttattatctcttaccggtgacagtgtatctccatgcaaaacagaacaaatggagaaccttttcccagacaaaatgagatgcaccatccacaataatgtcatttttaaaagcatataatacataggctcactgtcccctaaaagacaaccctgattcatgcactgaacacagagcctgaatgtataatcataggtgcatttcatgttctattcagaaaatattttcttttgagaggaaagatgatattgtttagaaaaggactatcattggtgtccccttctaataggctcacacattgaatcttggttaactttttctaatcaaatacccattcccattgatgagaaactgttcaattattgtcctttgggtccatgcatgtgtcatcatctccacggtgctttcacctaccatggggatgtgacattggtcacgctctgacaagtaatgacttcgctgagtgttccagaactgcataactctgcttgattatgcggctaatatggcacgataatttcggtttaggatatggaattttgtattcggaataatcgaagtcgtggaggacgacactgacgcatccatccattggcagatagtaggaattaagatgcagccacatgataatgtggatgatggatgaatggtagcctagcctactgttgctagccagttttgggccatggcaggtgtaaagaggtcaggggtacaggacattcagattgatagtagacagataatccatatctacatcagcattatatgagcgcaataattggggaattctatctgtttttccgtggatcatgaatctctttcaattttttttaacaaaccggcacaatacaatgccaattttattgtatagcgtaggagtacaagtatttatctgaaaagaaaaaagatagtacaagtgtttttagagaaactagggtaatatttccacgagtcttttgctcctgctcacgcctaagttttcattcctcctttattttagtgacaagtgaagattgttgagagctctatatgatggaagactcgttggtttctttctttccaaatctcccaaaacgttagcaatataagtgaatctctttcgattggataatgaattcactactcatcgtagcagacataaaacgagagatgtgttgtgatgtaataatctcaccatgtttcggggagagtagccgatcctctcaactccctcttctcccgcgccgacaccatcaccgatgagagagaaaccagccttgttttgatcgagcgggagcagaaagcgtggacggcccaaataagatttggggcccaaattatctttacgttgggcgcagattttgggccaaatacggagggcccaagtactgtacggccctggacggacgaccgagattgctgctagctagagttttgctatccaatttccggtcattggaatgaacaatttaaattggctgtttaggtttataattttcgcggttaattcgttttatcacccctggaacatcgtgcgtatcacctagttgttcggcggacgtggttaccaacagaagccctaggaattagtgatcacttcgtcgcgcgcgatgaataattaacggatgaaccaattaaaacagctcgacgagacgacgactgcgagctctagctgtgcatgcatcagcaaacaagatagttatactgaccaaaacaagatttctatctaggattctggcaacgcagttggcgtttagatatagggacttaactttaatctctatatttagacactaatttagagtattagatatatactacttacaaaactaattacataaattaaagctaatttgcgagataattttttaagcctaattaatccataattagagaatgtttactgtagcatcacataggctaatcatgaattaattagactcaatagattcgtctcgcgaattagtccaaaattacggatgggttttattaatagtttacgtttaatatttataattaattaatgtccaaacattcgatgtgacctatctaaacagggtctcagacatgcagtttggcgcgcgctctctctctcttcgtcggtcgctttcgcatctctctgtctgatatggctattcgatgtacataccttcctataaattcactcatagatttagccgcagcatcgatcactgacaaccatcgtctttctctggttgagctagctagctaagctagccaggggagagctagagagatcgccggagatgagccagaagtcgtcgtggccggagctggtgggcgtactggcgacgctggcggcgacgcagatcggcaaggacaggccggacgtcgccgtcgaggtgctcccgccgggcgcgcccctcacgccggatttcaacgacaagcgcgtccgtgtcttcatggacgacaacggcatcgtcttcaaaattcccgtcatcggttagcttaaatgctccaatagctagcctatgggctatggcactagctgatctcccatggctgatgcatgcatatttctcctcgtcttatcacatctgttacatatgcagcgaaataatggaataaatggcgccgtgtacgt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os08g0441200, RefSeq:Os08g0441200