Os08g0451400
| Gene Name |
Os08g0451400 |
|---|---|
| Description |
AT-rich interaction region domain containing protein |
| Version |
NM_001068481.1 GI:115476699 GeneID:4345728 |
| Length |
9742 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0451400, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:22126941..22136682 |
| Sequence Coding Region |
22127136..22127264,22127361..22127451,22127536..22127636,22128640..22128738,22128863..22129000 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008401:22126941..22136682 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008401:22126941..22136682 source=RiceChromosome08 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggctcaaatccaaagcagctcactggtgaactgcacgctgcttgcggtgctatgtgggaaggttacagacaaacagcagaagccacctggtctggtgcccgaggtgaagcgaccacggctttcatatccattcccagagctgatctcgtctgggagattggaggtgcatacgctgatcaatcccacagttgatcaattccggaaagcgcaacaggctgtgcagcccaacttgatgtacctccagggtcagcagcttgagaatgaggaagaaattggtacacttgtctggggcgatgctgatgtatctgatccacagatatttagttcactcattagtccaccttttccgaccatagtttatttggaagttcctgctggggaaaagcttgctcaatctcttcagttaaaggggattccatatgtattatattggagaaattcattttcatcgtatgcagcatctcattttcgccaagccttgatatcagttgttcagagctcctgcagccatacatgggatgcatttcagcttgcacaagcttcttttcgactgtactgtgcaagaaataatgatgcgcaaagtgttaagcttgggcctcgtttactaggggatgctccaaagataaatatcttccttcctgagaatgaaatggttgaggaagaaggtagctctgaacattttccagccataaagatatatgatgaagatgtgaacatgaagcttcttatttgtggagcaccatgcatcttggatgctagtttgttgggctcactggaggatggtttgaatgctctgctcaatattgaaattcgagggtgtagactccagaacagagtcagtgctgctcctccacctcttcatgctgaaactcttccacatggggtggttacaatgcgttgtgatatcacaacatgcagttcttcacacgtgtcattgcttgtttctggcagtccgcaaacatgttttgatgacaagcttttggagaaccatattaaaaaggaaattgttgagaagggccagttagttcgtgctgtcttagttagggaggacgacaaaccatcttcagttgagcctttgacttcgatatctgtggcttctggagcttctacttttgaagtctggatgaccctacctaagtgggcaggacaggttttgaaatatcttgctccggaaatctcttacaaaagcctggttccacttggaattgcttgtgtaaatggaactccagtttcttcgtttgatagacaagatgtggatcggcttcttttcttttgcaaaaatgaagctattgtaaatggtctatattctcatctgccaagatggtcagcatcccttgttaaggacagactgaagggaactccagagtcaaaatcaagtacttttagtgcaaatggagttggagagtaccagaaacatccaatgaaagggacttccctagtagtcaaaccaaagctgaaatctgcaaaaatgaggcctattccacactcttcgaagcggcagatgcacccttttgtgggtatccctccgtcctttattcatgatgctagtcaagttaagcctagcttgccagcacctccggtaaggcataatgcattacctgttgctccaacaactcaaagaaaattatcatctgggacatcacgtgttgaaccagctgttccgttaaatcctctgccaatgaagaaacatgggtgtgatcggttgcctattggaatttgctctgaagaagacttcttaaaagatgtcatgcaatttctacttcagagggggcacacccgacttgttcctcaaggaggactagccgaatttcctgatgcagtactaaatgcaaaacgccttgatttatataacttgtataaagaggtggtatccagaggcggattttatgtaggcaatggcataaattggaaaggtcaagtcttttcaaagatgagcaaccatactgttacaaacaaaatgacgggtgttggaaacacgttaaagagacattacgagacatacttgttggaatacgaactttcacatgatgatgtcggtggggaatgctgcttactctgccacagtagtgctccaggtgattgggttaactgtgggttgtgcggtgaatgggcgcactttgggtgtgatagacggcaagggctaggcacattcaaggactatgcgaagacagatgggttggaatatatctgcccccactgcagcctcgcgaactataagaagaagccaccgcctcccgagagtgctaatggcttcagaatagcatctgcacaacggaatatttaa</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAQIQSSSLVNCTLLAVLCGKVTDKQQKPPGLVPEVKRPRLSYP FPELISSGRLEVHTLINPTVDQFRKAQQAVQPNLMYLQGQQLENEEEIGTLVWGDADV SDPQIFSSLISPPFPTIVYLEVPAGEKLAQSLQLKGIPYVLYWRNSFSSYAASHFRQA LISVVQSSCSHTWDAFQLAQASFRLYCARNNDAQSVKLGPRLLGDAPKINIFLPENEM VEEEGSSEHFPAIKIYDEDVNMKLLICGAPCILDASLLGSLEDGLNALLNIEIRGCRL QNRVSAAPPPLHAETLPHGVVTMRCDITTCSSSHVSLLVSGSPQTCFDDKLLENHIKK EIVEKGQLVRAVLVREDDKPSSVEPLTSISVASGASTFEVWMTLPKWAGQVLKYLAPE ISYKSLVPLGIACVNGTPVSSFDRQDVDRLLFFCKNEAIVNGLYSHLPRWSASLVKDR LKGTPESKSSTFSANGVGEYQKHPMKGTSLVVKPKLKSAKMRPIPHSSKRQMHPFVGI PPSFIHDASQVKPSLPAPPVRHNALPVAPTTQRKLSSGTSRVEPAVPLNPLPMKKHGC DRLPIGICSEEDFLKDVMQFLLQRGHTRLVPQGGLAEFPDAVLNAKRLDLYNLYKEVV SRGGFYVGNGINWKGQVFSKMSNHTVTNKMTGVGNTLKRHYETYLLEYELSHDDVGGE CCLLCHSSAPGDWVNCGLCGEWAHFGCDRRQGLGTFKDYAKTDGLEYICPHCSLANYK KKPPPPESANGFRIASAQRNI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>9419..9547#9232..9322#9047..9147#7945..8043#7683..7820#7008..7583#6366..6539#6146..6281#5711..5742#4657..4713#4311..4563#4132..4220#3612..3665#2444..2635#2207..2371#cgcaccaatctcaccacatcaatccacatggcgtcgcgtcgcacgctccccgattccccccacccaaattccttcctccgatcaccaccggaaccaaccaaacccaaatcgccaaaacaacatacgatcgcaactaggctgtgctgtggccaaaaaaaatctaaaaagcactcgtgcagcagcagagaatcagagagaaggaagaggaaaaaaaaaccgcagaaaaagaattcgtataatttcctcccaacttttcctcgcgatcccgctgcgaaaagaaaaaaagctaatttaatccgtgctctttgtttttattcctctccgcaggtaaatgaatcatcgccgcggtcgtcgtcgccgtcatcatcatcatcatcatcctcgccacgaggggaacaggaagcgcaggagggatcaagcaggagctgtggattccgcttccgtgcacggtacgactacgatctccagtggctcgagcggttcgtcccggccaatcaaaatatttcctggagattgctacttgctcggttatttattatttgaggggtttgcattgctaatccgcggagggattaagacggggaggagggttggtggatttaggttaaaattccagtggttttccttttttttggttagacagatagattctttttttccggagtggttgactggatttgattttgacgggatgggggtcggctcgcgtgcgattcaccacgcgtttattcccctctcgttctgtctgtattattaatgattcgaagagggggatttgtgcggcggctaaattagggttccatgctctctcgcctccacgcttttgccctagccgtcgccgcacaaatcgagcgcatcctgccgccggtgtcatagcggctcggagtcgcggggttttgggctgcgctcgtcgatttgggtctcctggtatggttgctcgattcgattcggttcggttcgcttggttcgatttggtgcttgtttgttctgattttggctggaaatttcgtgaagggagttgcagttttcagtcacctgaaatattcaattttttcagtcatttttttaagctgttcggtttgctttttggtccgtgcactggtttagtgatctcagcttcatgaacatctttacttgtcccattgtgccatgcagtatgttggtgaggcctgtatgtgaatcgattttggttcaggtgtcagttagttgattgcgatttgtagtttgtatgcttcgcgaagtgctcatcgttatgtcttgcagtttatatgtttgtgcaattttaaaataaaccaaatgcagttattagggaaaccataggtaaaagaaatttttttatgccctggtaaataaagataatcaattcaaaattgcacattgtgttgatatttttgaattgcacattatagtgctatttccactgcaggctaatgcaattattgtactgttggatgttcattcttctcttgtagatggttccagtttgcatttgtcgaatgcagaagcatgttaatttttcttgtatcaaattttacggtggtattggagttgtaaattgaaaattacatacacatgttatattttgcgattggcaatctatcacagtaaagtaatgtttgttcagctagcacagatttacccatacagttttaggaaagaagtatgaaggagtaacaaccaaaagtgttacacaaatatattctttcttcctgggctaaactagcagcaattaaatctcgccggaagagcggaaatgttcctgacacattaagccggtgtttaaagcccacagaacgaggaagccaatcctctggacacaagcaaaagaccaaactacttaccaaactgttctttttttttattattttgtaatgggcccacttggaattgtaaccattttgtttgattcaacatagcatggacaaactgctatcattggatgtgcagatccaaaggttgcaaatgtgactgacacattttaaattttcaggtgactgaaaactagacgaccaggaattgctagttctcagtcacccgaaatatttaacctttcagtcaatctcttaagctgttcagtttgctttttgatccacgcactggttcgggtgatctcagtttcatgaatgatttgctgttgctagtggtgttgcagggttcaatggtggagtgagctgaattggggagatgtgattttaccggttcagccatggctcaaatccaaagcagctcactggtgaactgcacgctgcttgcggtgctatgtgggaaggttacagacaaacagcagaagccacctggtctggtgcccgaggtgaagcgaccacggctttcatatccattcccagagctgatctcgtctgggagattggaggttagtaggcttttgctgtttactgtggtgatgcatttcttttgttgtgttatgaaccggctcgggatgcaggtgcatacgctgatcaatcccacagttgatcaattccggaaagcgcaacaggctgtgcagcccaacttgatgtacctccagggtcagcagcttgagaatgaggaagaaattggtacacttgtctggggcgatgctgatgtatctgatccacagatatttagttcactcattagtccaccttttccgaccatagtaagcaccaaactcttagctagcaacaatgttggtcagcgctcttagctttcaattaaatgataactgatactaccataagcttccgtttcattgtgctgttcgattttatttatgtgacagacatttatactccctccgtagaaaatgttgggcaattttcttagggcttctataagaatttgtgggacacacatatttcccgaaacactttttatgggttcttttcctctaataccttgcattaactgttgagatgcatgtcaatactggtgctggcatgcttaagaggcaaaagcaatgcttggtcacgtacttaagaggcaaaaaaatgaacaaatgtggatgaatcagaagttgtataatactctctttggactgataatacttgtcgctttggacaagggcacggtctttaaaaacaactttgaccactattttttattactatatatatatatatatagaaatatcaataaatatatgattttattgaagtactttttaagatcagtctatatatatggtcaccatacttctaagacaaatattttagatgttatttatagtcaaagtttttaaagtttgacaatagccttgtccaaaacgacaagtattatcaacctggagggagtaggatttatctaacctcagtttgattcctcaaacactccacaattaatttaacaatcgtattccgtcaacagcttaaacatgtaatcacaacacaaacgcaacacaacagctccaacttggttcttaaaactgatattccaatattttgtttttttaatgcccataacttgatttacatattccacttatatttgtctgacttgtagctactaacattttattttttaaaaccttatgctccttgtttttctgttttgtttcataaacggttttcttttccaatttttccatggtcgtcttccttctatctatttatcttactgtctaagcttttatacaggtttatttggaagttcctgctggggaaaagcttgctcaatctcttcagttaaaggtagtttgttttgtgatattttcaattagttttttttaaaaaaatttgtgaacaggttgtggattgttccatatgtctttttgccacagttgtgaatctgcttgttgggatgcatatatacttgtaaatatccaaatgattcctcatacttttttttaaaaaaaaaattgctctgatgtgtagcatgagcttagtttccataaacaattactatactcaaactgcatttgtttagtttattttgtctagcataggtgttgttctattgttggaatgtttatatcattatatgcttgtaagatgagcaattgctattcatttttcggcaagatgattgctaacatttacaaattttttttgcagttttactgagcttttttctttcaacaacaattcctactctcctattacttcagaatcttatttgtgattttggaatttgtgtttttgacactttcattcccaggggattccatatgtattatattggagaaattcattttcatcgtatgcagcatctcattttcgccaagccttgatatcagttgttcagaggtatcatattcatcatgtctttgttgtatgtatcgtaagtcccatttagttttgttttttcatccaataatcgagtgttcctttatgtagctcctgcagccatacatgggatgcatttcagcttgcacaagcttcttttcgactgtactgtgcaagaaataatgatgcgcaaagtgttaagcttgggcctcgtttactaggggatgctccaaagataaatatcttccttcctgagaatgaaatggttgaggaagaaggtagctctgaacattttccagccataaagatatatgatgaagatgtgaacatgaagcttcttatttgtggagcaccatgcatcttggtaagcgttagtggtcatgcctaaatttgtaatattttcttatatattattgcatttttcttatcccaaccaatacttccatctcttttacaggatgctagtttgttgggctcactggaggatggtttgaatgctctgctcaatattgaagtatgggtccattcttgtacttaccatgtgttgctttatttctgcatagaagtgctgagttctgaatagtataccccaacaatctagttcatggaaatgctagttgattggagtaatgaactatgagtctgttagcttacggattataagtatgcattattgcagccaacaagtattgtgacttgtaggcaacctatactggctggtggggctgggtcccaaagtccatactccatagtgccatggctatggagtagattgatgatacagcttggttgcaatctcattttctgagttgtgaatttgcattctagagtatgttgcacatcctatggtgaccggattcgtggttcaccgccacatcccacgaccctggttcatcatctcagtttgtggttcatggttgatctggttcatcatcccaatcaatggttgagtcacgaatggcatcactgttctctatggtttctggagaaggaatagtattggcagggttggagatataagtgggctgtctggttgacagcccacctagtatcttctttttgctttatgtcctttccacatcttttctttcattatacactttgtgttatgtattttatgcgcaatttacataaaaatagctgtagattgggtaatccaccaaaacaatttacataaaaatagctgtagattgggtaatccaccaaaaacttagtggtggtgatggtgactggtgagtctgccatcccatcacctcctatttagttggtaggatcttctggtttgtcaatttcaatttctggttgatgttggattgcgaattgtatatgtttttttttccaagaaatatatacgactttaaagtttagaacatatatttgttgattattgcaagacactggtattcagctagtaccgttgtatgttaatatttatgcaccatgaattttgtagcaagataatatggcacatactgcctgtttaatgtttgatttttcccctttttttccagattcgagggtgtagactccagaacagagtcaggtaccttcagctgcagtgtggcatatataatatatattcaatatctggcaacctgttgtgtcttataaatactagctcatgtgtgagtcatgttcttttaccacaaatttaataaagctcaaactggtggtatatcgaataaattaactaatcttgatttgtgctgcctataatttaaaggttaactgcggcgatatttccctaaagaaaaaactaaatggtagccagattaaatgcttccatcggtgtcttgtaaactatagtcacaatagagtatttaacactatctttttgtggtcatatttttaagtgatgctgctatccttattttgtagttccacgtcattacttggttgctagagatgtttagttggtttctactctcaacattttctcttttcagtgctgctcctccacctcttcatgctgaaactcttccacatggggtggttacaatgcgttgtgatatcacaacatgcagttcttcacacgtgtcattgcttgtttctggcagtccgcaaacatgttttgatgacaaggtatggtttctgtatttatggagcattttttagtcttcagtttgatatttacagtgtcatatgctgcttcatggaattttgtagcttttggagaaccatattaaaaaggaaattgttgagaagggccagttagttcgtgctgtcttagttagggaggacgacaaaccatcttcagttgagcctttgacttcgatatctgtggcttctggagcttctacttttgaagtctggatgaccctacctaagtgggcaggacaggtttgttttcttcaaaaagttgaagtagtgtgctgaacacaacttggtaatatgtgtaaaaaaatacccactaatttccccatggtcttttgtgtcattttttttggatatcatgttgtccttttgtggacgataaatcctgtcaagtatctcgttcttcctctgcagttgtctgtactttggtttcatcagtaaagctgggaacaccttttgtttgttaaaaaaaatgggctaaaaacacatgtatcaggaaacagaagtggtttggacattttaatacataatatgactaccaagacccctatgctctttaattgtatcaccaatctttcttgacaagtcaaacctcaatgtgtgaactcaaccatatggtgttttataccattgtggattctaattatctttccttacatggttatgttcaatggatcattcatcactaactgaagattgttttctactgtctaggttttgaaatatcttgctccggaaatctcttacaaaagcctggttccacttggaattgcttgtgtaaatggaactccagtttcttcgtttgatagacaagatgtggatcggcttcttttcttttgcaaaaatgaagctattgtaaatggtctatattctcatctgccaagatggtcagcatcccttgttaaggacagactgaagggaactccagagtcaaaatcaagtacttttagtgcaaatggagttggagagtaccagaaacatccaatgaaagggacttccctagtagtcaaaccaaagctgaaatctgcaaaaatgaggcctattccacactcttcgaagcggcagatgcacccttttgtgggtatccctccgtcctttattcatgatgctagtcaagttaagcctagcttgccagcacctccggtaaggcataatgcattacctgttgctccaacaactcaaagaaaattatcatctgggacatcacgtgttgaaccagctgttccgttaaatcctctgccaatgaagaaacatgggtgtgatcggttgcctattggaatttgctctgaagtactctcatttaccatctctcctattcttttttattgttttatgctgaaatgctctctaaagttaaggtcaaacatattttccccttgtcctttgcaggaagacttcttaaaagatgtcatgcaatttctacttcagagggggcacacccgacttgttcctcaaggaggactagccgaatttcctgatgcagtactaaatgcaaaacgccttgatttatataacttgtataaagaggttggtcttcactgctgctattttcatgcattaattatgggcttatcgccttgtggggttaaatatggagagagaaatgctgatttaatcatttatctgatgaaaatgatgattgatcattcaggtggtatccagaggcggattttatgtaggcaatggcataaattggaaaggtcaagtcttttcaaagatgagcaaccatactgttacaaacaaaatgacggtatgcatgtagttgatatttgtttcaatcttgttagatttgctgcagtgaattggttattttctgtggtaccatttatcacacttcagttgttatgctacttagatttactctactatatgggtcagcctgtaagagggacatgttttggcacatagtcagctttgaacgttctattcctggaaaatttgctgcacaggtggagccaggaatcctaagatttatttgtcaagcgacgggtcaggagtgctaatttcattttaaaatcacttaagatacagcttttagcattgaaaatctcagaaattatgggtaggccaagctcctgctcgcgcctccccctctctctgccactgggcctgcctgcaataatttgctgacaaaattcactatggaacactaaatgtggtcttggctagaacgcactctaatgggcttcagaccatctaggattggtgatccatcatgtggttattccttaaatttggtggagtgactccattcttcatttctctacctagtgtgtgcttttagagatgagctgatgatggacaaacacattccattcctccaaacaaataacatatttagaaccatgtcatcaattgtccatcttattcctcaaaccacacaacccatgtattcgtggtatttgctagcagacactctgcccactgaaataatatgcccgctgaatgagaaatatttgaaaatgaccttgctatcttcgtttcttctatttaatttaaataattaaaaggtgggcctattaggcagtgatggggcttaggggtgttacgaaaagccttgatcttggagtcctttgtgccgtacacgagcctctgcggttaatgtacagatagttgctatgagcggttaaccacaaatcatagtgtctgtaacacatttattcttttttgtttccttttgttatcttttatttacggtatgttagctgccatttcatttgcctgtttctgatgtgctaaatgtgttgcaatagggtgttggaaacacgttaaagagacattacgagacatacttgttggaatacgaactttcacatgatgatgtcggtggggaatgctgcttactctgccacaggttcgaggacacgattttagtatggtgctgttgcaactgtttcctgtcggtataatctaacatattccttccaactatttccagtagtgctccaggtgattgggttaactgtgggttgtgcggtgaatgggcgcactttgggtgtgatagacggcaagggctaggcacattcaaggtagaaatatttcctgatctgtatctaacgttttatattcctttcaataatttcattatttaggttgtgcattgatctgggctgctgctgtaacaggactatgcgaagacagatgggttggaatatatctgcccccactgcagcctcgcgaactataagaagaagccaccgcctcccgagagtgctaatggcttcagaatagcatctgcacaacggaatatttaatttttgttactcttttttagcctactgtcccacttttgggtaagacagggctggtagatagcatgttttaaacaatgtagtgtttagctgtattatgtcattaacatcatttatttagtgaaaggttttatattgattgtaatcagtgaagtgacaactcagaaaggctctaattaattgctgggttcaatcgtg</dnaseqindica> |
| External Link(s) |
