Os08g0499200
| Gene Name |
Os08g0499200 |
|---|---|
| Description |
Similar to Chloride channel protein CLC-f (AtCLC-f). Splice isoform 2 |
| Version |
NM_001068682.1 GI:115477101 GeneID:4345939 |
| Length |
6607 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os08g0499200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 8:24727015..24733621 |
| Sequence Coding Region |
24727163..24727495,24729347..24729749,24730035..24730229,24730631..24731085,24731165..24731269 |
| Expression | |
| Genome Context |
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| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgatggcgcaggcgagcgacctggagccgctgcggtcgggggcgggggcgctgccgtcgtcggcggacccggactcgccgtcgacgccgaggaggagccgcgtgcgcgagctgctgcggagcctggaccgccggctgtccagccgggggcggcaccaccgccacgcagcggagggcgcggcggcgtcccccaggggcggcggcggcggggagcccgggtccgaggacagcgacgagctcggggacggcgcgccgcccgagtgggcgctgctgctcgtcggctgcctcctcggcctcgccaccggcatctgcgtcgctgcgttcaaccgcggggtgcatatcatacatgaatgggcatgggcaggcacacccacagagggagctgcttggcttcgcctccagagacttgctgatacatggcataggatattgttaattccagtgactggtggagttgttgttggtatgatgcacggattactggagatatttgagcagataaaacaatcattatcatctcaaagggaaggtgttgatttcatggctgcgatttttcctacaatcaaagcaatacaagctgcaattactctagggacgggatgttcattggggccagaagggccaagcgttgatattggtaaatcttgtgcatatggatgtgctgaaatgatggagaacaatagggaacggagaattgctcttgttgctgccggatcagctgctgggattgcttcaggttttaatgctgcggttgctggatgtttttttgctattgaaacagtactgaggccacttcgagcagagaattcaccgccatttaccactgctatgattatattggcatcagttatatcatcaactgtgtccaatgttttgctaggggagaaggcagcttttattgtcccgacgtatgaactaaaatctgctgctgagttaccactctaccttatcctaggcatgctttgtggggtagtgagtgtggcattcagacagttggtggtttggttcacaaagacttttgacttgataaggaagaaattcagcctccctgctgtagtatgccctgcgttagggggtcttggagcaggtttaatagctctaaggtaccctggaatactgtactggggcttcaccaatgttgatgaaattttacatactggaaaaagtgcctcagcccctggaatctggctcttagctcagttggctgctgcaaaagttgtagcaactgcactctgcaagggttctggtcttgttggtggcctttatgctccaagcttgatgattggtgctgctgttggtgctgtatttggaggctcagcagcagaactaataaactctgccatcccgggtaacactgctgttgcacaccctcaagcttatgcactagtgggaatggctgccacactagcatcagtctgctcagttccattgacttcagtactactactattcgaactaacaaaagattacagaattttactgcctctgatgggagctgttggtttagcaatatgggtgccatctgttgtaatgtctggcaacaaagaggcgtttgaggctacatctcctcggcatggttattcttcactattacctcctacagataggaatgagacagaccggagacgaccagacagagatgacgttgaacttgcaattctagacgatgatccctaccgctatggtattaacaatgaggatatgcttcttgatgatttaaaggtatcacaagcaatgtcaaagcaatttattaaggttacacctacagtgactatcaaggaggcaacaaggcttatgcatgataagcagcaaaattgtgttcttgtagtagacagtgaagattttcttgaaggaattgttacgattggtgacattcgccgtaaaggatttgaatctgaattaagtgaagatactccacggaatggggcaaattcatctactttggatgcaaattcttctcttgtttcatcatgcctcactagagggtttcagtaccacggcaatgaaagaggactagtgacctgctttccagatacagatctgagcactgctaaggtgctcatggaagtgaaaggtatcaagcaacttccagtggtaaaacggagggctggccgtaggaatgatggaagacgtaaggtccttggccttcttcattatgattcaatagggtggtgcttaagggaagagcttgagcggtggaaagccatttatcaaagagagaatttccagcagtcagctgttaatggccactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MMAQASDLEPLRSGAGALPSSADPDSPSTPRRSRVRELLRSLDR RLSSRGRHHRHAAEGAAASPRGGGGGEPGSEDSDELGDGAPPEWALLLVGCLLGLATG ICVAAFNRGVHIIHEWAWAGTPTEGAAWLRLQRLADTWHRILLIPVTGGVVVGMMHGL LEIFEQIKQSLSSQREGVDFMAAIFPTIKAIQAAITLGTGCSLGPEGPSVDIGKSCAY GCAEMMENNRERRIALVAAGSAAGIASGFNAAVAGCFFAIETVLRPLRAENSPPFTTA MIILASVISSTVSNVLLGEKAAFIVPTYELKSAAELPLYLILGMLCGVVSVAFRQLVV WFTKTFDLIRKKFSLPAVVCPALGGLGAGLIALRYPGILYWGFTNVDEILHTGKSASA PGIWLLAQLAAAKVVATALCKGSGLVGGLYAPSLMIGAAVGAVFGGSAAELINSAIPG NTAVAHPQAYALVGMAATLASVCSVPLTSVLLLFELTKDYRILLPLMGAVGLAIWVPS VVMSGNKEAFEATSPRHGYSSLLPPTDRNETDRRRPDRDDVELAILDDDPYRYGINNE DMLLDDLKVSQAMSKQFIKVTPTVTIKEATRLMHDKQQNCVLVVDSEDFLEGIVTIGD IRRKGFESELSEDTPRNGANSSTLDANSSLVSSCLTRGFQYHGNERGLVTCFPDTDLS TAKVLMEVKGIKQLPVVKRRAGRRNDGRRKVLGLLHYDSIGWCLREELERWKAIYQRE NFQQSAVNGH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>149..481#2333..2735#3021..3215#3617..4071#4151..4255#4352..4582#4690..4914#5124..5356#6132..6204#cttctcctacctcacctctcgccatcgccacccccaaccgccgacgagatcgaggccaccggcgagatccgccgcgagatcctccccttcccctactccgatgcgatcgcctcggttctagatccccctcgctcgcacgcggcggggcatgatggcgcaggcgagcgacctggagccgctgcggtcgggggcgggggcgctgccgtcgtcggcggacccggactcgccgtcgacgccgaggaggagccgcgtgcgcgagctgctgcggagcctggaccgccggctgtccagccgggggcggcaccaccgccacgcagcggagggcgcggcggcgtcccccaggggcggcggcggcggggagcccgggtccgaggacagcgacgagctcggggacggcgcgccgcccgagtgggcgctgctgctcgtcggctgcctcctcggcctcgccaccggcatctgcgtcgctgcgttcaaccgcggggtaagtgagagatctgcgtggggaaagttgcgggaaaaaaaaaacgttaattaccttagactaggaaaagtctggtattcttgcgagatctatatctttaaggtgattgcttgggatgggatatatgagcaggggatttctactggacagtttaggttgcaatgaataaacgcaatgctgtatatagcacccttcaatatgtaggtacactttgttttggaggaatttcttgtctgatttgtgtgagaatgagaaaatggacatttagccacgttcaaaacagggtttcgctagaatgcaatcttgaaaacgtgtttcgctaaaataccaatataaagcgtgtgctcaccgccactttgccattttggcccttttgtgtattttcgaaatcattttcgcttcttcagtgggtaatgagacgaaaatgcccttccatccaccatccttccccttccgtagccgccgtcgacgagggcgggatggccggcaacgccgctggatgagcccaccgccactgccgacgagggcatttgggtgtgcgggtgcgcggagtgatggaaccaccggcggctgcccctggccgccgccgccggacagcaccaacaaggcggaggcggaggcggaggcgaggtcgtcaaggaggcctcgcggcggcggaggcttgcgctccatctcaccagcaactgctgctgcctctccaccgcgtccccctccgcctccatcgccggcgaggctcgccagcaactgctgctgcctttccaccgcgtccccctccgcctctgttgccggcgaggctcaccagcagctgctgctgcctctccaccgcatcccccttcgccttcgtcactggcaaggccatgggccgccccttcgcctccgtcaccggcgagaacatggggccgcctcgaaaccctagccgccgtcgtcaaccgcagtgaagcgacctcgtcggagaccgtcgtcgaccgcggcgaggtagtcggcggaggtggcgaggtcgagggagaggaagatgtcggaagactcgccggccacctcgccgtctgggaggaagacggtgagctgcttgtggtggacatggagattggccagcgaggacgagctcctcttcctcaacagcggcgacggaggacatgaagggcaattttgtctcatcgcccggtggaggagcaaaaatgatttcgaaaatgcacaaaagggctaaaatggcaaagtggcagtgagcacgcgtttcatattggcattttagcgaaacgcgttttcgggatggcattctagcgaagccatgttttgaacgtggctaaatgtccattttctcgtgtgagaatatggactgtacatttactttatcctgccgtttagggtgtttcgtggagatgataatgtattttcttcatgtgaaatttgatgccacggggatagttgatacaaacatgaggtctttgctagttaaagtcttcctcttatggcatgggtttaggtgaaaacgaatcttgcgtggtattataatctgctgaggtttactagattatgtctacttgctggcaattttggtgcattgtttgtgttctctgaatacttcatagatctgaattgatcagatagaaactcagaaaagtcctaccgggttaatacagtatgtgcctattttactttgactgaactgcaattaatcgaacccccatttcttaaagttactagaaaaggctctttccttgaaataacttagatctgttaagcgggagctatccaatcaagtttagatgatcatttctaaaccaaaagtttcctgtttgtacttttctcatataccaatctgctggttcaatagtggctaactattcttttcaggtgcatatcatacatgaatgggcatgggcaggcacacccacagagggagctgcttggcttcgcctccagagacttgctgatacatggcataggatattgttaattccagtgactggtggagttgttgttggtatgatgcacggattactggagatatttgagcagataaaacaatcattatcatctcaaagggaaggtgttgatttcatggctgcgatttttcctacaatcaaagcaatacaagctgcaattactctagggacgggatgttcattggggccagaagggccaagcgttgatattggtaaatcttgtgcatatggatgtgctgaaatgatggagaacaatagggaacggagaattgctcttgttgctgccggatcagctgctgggattgcttcaggtaattttaaataatcatcatctgtttgatttttttacattcatctgggaattgcaacagattggaatcgtttcccactgccttttagcattataagatgttagtacaagttaacaagaaaaggaagataaactaattctgcaagcaactggaactacaaatacaatactatagatctttgttgtaccacgtatctttgcaatttcatctctttaacatccagtatcttcaggccaatgcttttttctttattctctcctgacacttgtgttgctttgtctttaggttttaatgctgcggttgctggatgtttttttgctattgaaacagtactgaggccacttcgagcagagaattcaccgccatttaccactgctatgattatattggcatcagttatatcatcaactgtgtccaatgttttgctaggggagaaggcagcttttattgtcccgacgtatgaactaaaatctgctgctggtattttatcttattctgatcaaacctggtattactgaaggtggattttgcttagttaggtattgaacttgagtagatttttttttgttcttactactatagcagaggactcgtgatatcctgcctttataatctattttatatatgcatcacgcatttatacacttgtatatgctcatggttttgaagttttgtggttggttcccttaccatcaacacgttagttttagcagcttcttattgttccgatcttgttttcttgccattcacaattgaatagtttgaagttctggtatatctgtgacgtgaacgccgaactgtgtatctattactgttttcatgttgatatgtctaactggtaaatatgcaaccaactaaatcactaatgttatattctgcagagttaccactctaccttatcctaggcatgctttgtggggtagtgagtgtggcattcagacagttggtggtttggttcacaaagacttttgacttgataaggaagaaattcagcctccctgctgtagtatgccctgcgttagggggtcttggagcaggtttaatagctctaaggtaccctggaatactgtactggggcttcaccaatgttgatgaaattttacatactggaaaaagtgcctcagcccctggaatctggctcttagctcagttggctgctgcaaaagttgtagcaactgcactctgcaagggttctggtcttgttggtggcctttatgctccaagcttgatgattggtgctgctgttggtgctgtatttggaggctcagcagcagaactaataaactctgccatcccgggtaacactgctgttgcacaccctcaagcttatgcactagtaagtttccttttttgagctaggaaggtagcctaaagtttgatagaaacgaagtatactgactgtctgcttaattcaggtgggaatggctgccacactagcatcagtctgctcagttccattgacttcagtactactactattcgaactaacaaaagattacagaattttactgcctctgatggtgatgtctcatcccatatatttgctattttgcttctaagcatgaaagtttgcacactccttgtgacataagctcacccttatttttaatttacagggagctgttggtttagcaatatgggtgccatctgttgtaatgtctggcaacaaagaggcgtttgaggctacatctcctcggcatggttattcttcactattacctcctacagataggaatgagacagaccggagacgaccagacagagatgacgttgaacttgcaattctagacgatgatccctaccgctatggtattaacaatgaggatatgcttcttgatgatttaaaggttccatgcctcttttctacattctctttattattttgtcaagttcatccttagtaaatttgatatatttttgtggtcattcagctttctaacaacgagtgttccaggtatcacaagcaatgtcaaagcaatttattaaggttacacctacagtgactatcaaggaggcaacaaggcttatgcatgataagcagcaaaattgtgttcttgtagtagacagtgaagattttcttgaaggaattgttacgattggtgacattcgccgtaaaggatttgaatctgaattaagtgaagatactccacggaa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