Os09g0252800

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Gene Name

Os09g0252800

Description

Similar to E3 ubiquitin protein ligase URE-B1 (EC 6.3.2.-) (Upstream regulatory element binding protein 1) (Fragment)

Version

NM_001069222.1 GI:115478183 GeneID:4346522

Length

7440 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0252800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:4592240..4599679

Sequence Coding Region

4592241..4593479,4593565..4593882,4594465..4594663,4594837..4595102,4595188..4595474
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,4598522..4598661,4599439..4599545,4599639..4599679

Expression

GEO Profiles:Os09g0252800

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>tcagatattcctttttacatgttagatgctgggttgccacctgaaacttctgctccggtttttggcgagcgtgttgtaagtactgctcccccacctttgattgatttctctcttggtatggaatctctccgaattaggcggggccttggagataatttatggactgatgatggtcaacctcaggcaggtaatcatgcagctgctgttgcccaggctttggagcatcattttattacagagttgaatgtgtctacttttctaaataatgcaattccatacactggcaatcgtgtgcttgatatgcaacctgaccaaactggcgatgatgtagatgacgatttaccatcacaggatgatgacatatcagaacatgtgacaactgattcccctgctttgcctactagtagccctcaacaatttggaactaccaaccaagcaaacggtaatgtctgtcctatgaatgatctaatttgtcaacagtcagctgatgttgcagatgttcgtactgaagaagagatgcatcaaatagctgatgacatgaatgttatacctcagagtaatgaggatactgctgacagacagcatgttgctcatcctgatagggactcactgtctggtaatctgcaaagttatgatcatgttatgcaggatgaggtagaaatacctcaacgtggccagattggtaatgatattagggacccatctgatctggagtcaagttgtcatgctcttctcacttccacaagtgcagctcctgagctgagcgatgctcatgttgattccaccactatgaatacagatgttgacatgaatagcattgatatttctgagaaccaagtagaaaactcagctcctggtttgtatggcaatgttgtttctgttaggctagacgaaggagctcctcaagagactatgcagcctgatcaattgaatgctaacaatgaggcatctagtacaaatgaaatcgatccaacatttcttgaagcattgcctgaggatctccgtgcggaagtccttgcttctcaacagaatcgcgctgcaccaactgcttcctatactccaccagctgcagtagaaatagatcctgaatttttggctgctctccccccagaaatacaagctgaggttttggctcagcagcgagcacagcggatcgctcattctcaacccattgggcagccagttgacatggataatgcttcgattatagcaactttcccccctgatctacgcgaagaggtgcttttgacctcgtcagaggcagttttgtctgccttaccttcagctttacttgctgaagctcaaatgcttcgcgacagagagttgagtcgttaccgtgctaggggaagcctttttggaggaagttacaggcttggagcgaggaggttaccaacagacaatcagactgctgttatggacaggggtgttggtgtgactgttggtaggcgggttatttctactgtgtcggcaggcgctaagggtaaagatgtggaagggaccccacttttggattctagcgctctaaaagcacttattcgtcttctgcagctagctccgccactcagcaaaggccttcttcaaaggcttatgttcaatctttgcgcgcacagtgttacgcgtgctacattgattggccatttactcaacattattaaacctgaagctgaggggcttaatggatgggactgcatgactacatataggttacatggatgtcagtggaacattgtttatgcacaaccacaatctgcaaatggtctacctccgctggtgacaagacgacttcttgaagtgcttacataccttgcttcaaaccatccatctgttgcaggtctcttggtctactttgacccttcaacaagttcaaactgtatgatcctaaagcatggtaaagaattatctcaagaagggctacaatcggatatgatgaaaacgtcatctgagggttatacccctatcctgctattccttaagctcttaaacaagccgttgtttctacgaagtcgagtatatcttgagcaggtgatgtgtttgcttgaagtagtggtcagcaatgctgcttccaaagtcgattatccacctcattcagggcaaatggttagcacttctgtggatgaaaacagggcaccgattgaaacacatggagaaccatctactatggagcaagttcctatccaagaaaatagtcaaaataaagatgtggtggtgccagcatcaggtccccaacagtctattaatgtgcatgacattcttactcaacttccagactctgaattacataatctgtgcaatattcttgcacttgagggtcttccggataaagtctatacgcttgctgcggaggtggtaaaaaaattggctagtgtggcggtatcccaccggaaattcttctctatggagctagccagtgctgctcagagcttaagttcttcagcagtagaggagcttgtaacattgaagaacacacaaatgcttgggctcaattcttgttctatggctggggctgccatcctgcgggtcttacaggtcctatctacattgacctcagatatgagtggtaatagccaggatcaggctgtgggacaggaagaacagtctattttgtgggatttgaatatatcacttgagcctttgtggcaagaactaagtgactgtataagcactacagaggcaaaacttgttcataattcaagtttcaatccccaggttcctttgatggatgcaatagaagttggtgcctcatcctctacttccccacctcttcctccaggcacacaacgccttttgccatttatagaatccttttttgttctgtgtgagaagcttcaaacaagccaagcagttgtgccatctgattccaatgtgactgctacagaagtgaaagaacttgctgggagttcatcgtccccatcactaaagactggtggagtatgcaatattacttttgtaagggtggcagaaaaacatcggcgcctcctcaatgtgttcattcgacagaatccaagtttgctagaaaagtcactttctatgatgttgaaagtaccaaggctgatagactttgacaacaagcgtgcttactttagatcacgcattaggcagcaacatgatcagcatctttctgctcctttgcggattagcgttcgtcgggcatatgttttggaggattcatacaatcagttgaggttacgtcgtagccaggatcttaagggccgcttgactgtgcaattccaaggagaggaggggattgatgctggtggactaactagggagtggtatcaacttctatctagagttatttttgacaaaggagctctgctcttcaccactgttgggaacaatgcaactttccagcctaaccccaactcagtttatcaaacagagcacctttcctatttcaagtttgttggtcgagtggttgccaaagccttatttgatggccaattattggatgttcactttacccgttcattttacaaacacatacttggtgttaaagtgacttatcatgatatagaggctgttgatcctgattactacaaaaatttgaagtggatgctagagaatgatgtaagtgatattcctgacctgacattcagcatggaccctgatgaagaaaaacatattctttatgagaaaaatgaggttactgattatgagctcaaacctggtgggagaaacatcagggtcactgaagaaacaaaacatgagtatgtcgatcttgtggctgaacatatattgaccacagcaattcgccctcaaattaatgctttccttgaaggattcacagaattagttccaagggagctcatttccctatttcatgataaagaacttgaactcttgatcagtggacttcctgaaatcgactttgatgacctgaaagcaaatgcggagtatattgggtattcgcctgcatctccggtcatcctgtggttctgggaagtagttaatggtttcagcaaggaggacatggcaagatttctacaatttgtgacaggaacatcaaaagtaccattagaaggtttcaaagcgctacaaggtatttctggtcctcagagattccagattcacaaggcttatggagctccagagaggcttccatctgcccatacttgctttaatcaactggatttaccagagtattcctcaaaggagc</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>SDIPFYMLDAGLPPETSAPVFGERVVSTAPPPLIDFSLGMESLR IRRGLGDNLWTDDGQPQAGNHAAAVAQALEHHFITELNVSTFLNNAIPYTGNRVLDMQ PDQTGDDVDDDLPSQDDDISEHVTTDSPALPTSSPQQFGTTNQANGNVCPMNDLICQQ SADVADVRTEEEMHQIADDMNVIPQSNEDTADRQHVAHPDRDSLSGNLQSYDHVMQDE VEIPQRGQIGNDIRDPSDLESSCHALLTSTSAAPELSDAHVDSTTMNTDVDMNSIDIS ENQVENSAPGLYGNVVSVRLDEGAPQETMQPDQLNANNEASSTNEIDPTFLEALPEDL RAEVLASQQNRAAPTASYTPPAAVEIDPEFLAALPPEIQAEVLAQQRAQRIAHSQPIG QPVDMDNASIIATFPPDLREEVLLTSSEAVLSALPSALLAEAQMLRDRELSRYRARGS LFGGSYRLGARRLPTDNQTAVMDRGVGVTVGRRVISTVSAGAKGKDVEGTPLLDSSAL KALIRLLQLAPPLSKGLLQRLMFNLCAHSVTRATLIGHLLNIIKPEAEGLNGWDCMTT YRLHGCQWNIVYAQPQSANGLPPLVTRRLLEVLTYLASNHPSVAGLLVYFDPSTSSNC MILKHGKELSQEGLQSDMMKTSSEGYTPILLFLKLLNKPLFLRSRVYLEQVMCLLEVV VSNAASKVDYPPHSGQMVSTSVDENRAPIETHGEPSTMEQVPIQENSQNKDVVVPASG PQQSINVHDILTQLPDSELHNLCNILALEGLPDKVYTLAAEVVKKLASVAVSHRKFFS MELASAAQSLSSSAVEELVTLKNTQMLGLNSCSMAGAAILRVLQVLSTLTSDMSGNSQ DQAVGQEEQSILWDLNISLEPLWQELSDCISTTEAKLVHNSSFNPQVPLMDAIEVGAS SSTSPPLPPGTQRLLPFIESFFVLCEKLQTSQAVVPSDSNVTATEVKELAGSSSSPSL KTGGVCNITFVRVAEKHRRLLNVFIRQNPSLLEKSLSMMLKVPRLIDFDNKRAYFRSR IRQQHDQHLSAPLRISVRRAYVLEDSYNQLRLRRSQDLKGRLTVQFQGEEGIDAGGLT REWYQLLSRVIFDKGALLFTTVGNNATFQPNPNSVYQTEHLSYFKFVGRVVAKALFDG QLLDVHFTRSFYKHILGVKVTYHDIEAVDPDYYKNLKWMLENDVSDIPDLTFSMDPDE EKHILYEKNEVTDYELKPGGRNIRVTEETKHEYVDLVAEHILTTAIRPQINAFLEGFT ELVPRELISLFHDKELELLISGLPEIDFDDLKANAEYIGYSPASPVILWFWEVVNGFS KEDMARFLQFVTGTSKVPLEGFKALQGISGPQRFQIHKAYGAPERLPSAHTCFNQLDL PEYSSKE</aaseq>

Gene Sequence

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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0252800, RefSeq:Os09g0252800