Os09g0497100

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Gene Name

Os09g0497100

Description

Similar to Pumilio RBD (Fragment)

Version

NM_001070093.1 GI:115479928 GeneID:4347460

Length

7049 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0497100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:19874229..19881277

Sequence Coding Region

19874596..19874642,19874749..19874920,19875300..19875494,19875687..19875797,19875881..19876093
,19876890..19876997,19877171..19877312,19877409..19878757,19879488..19880117

Expression

GEO Profiles:Os09g0497100

Genome Context

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Gene Structure

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Coding Sequence

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Protein Sequence

<aaseq>MATESARPLSGGTGAGKWPPSKDTGSYDSIPASLSEDELAELAF MPNSGGIFGKWRGSVLERSGSAPPTMEGSLVALGHLTGQPSGNLGAILPNLGTEANNS ESKENIYYDSACVKYYMSKVNLNPRFPPPLVSRNQFGKSEERKPFSLDDSSSRSLLLG HPTLPTHKEEPEDEKSPSLDSSSADDAQCDSAQSTSNLGGHSPNLVDSIKENFHRSNG LYDNSSDLLNANSGDGGSIYSGISSLKNSSLYVVQSSDLNGFPPDAHQRSPRPIRTPV STKLTSDSLPASSPPTSSCSDYSTITEACQQRNPSMAVKPGEPVGTMLDSSDFSLKNL NISPDILSSSYVMQQWQKNAPVWNGLSNVVHGDHVPMIPPGINLPQVPFVDNSGFGHM KFPGDVQLMSQIGMATPFCTPNSFGIPCYPNLQSPSVWVPPFGIGGYGLPGPFVPPVI TNFTPQLPGFPSAVNLAAATDLFHPYKMYEHLGVPMPSPVPDQSLTHYFQQPPIHPYG VGNPYDTMVSSNNFVGNPAGVFGSPIIDPSEQKFQIPVTTVAANASTPIKGGKPIGNY ETASPYFGVPMPYPAGPTLHGQPASGTSPRDKRNDVKGFQPPRKNMPVSSEIQGQKGR EKFDDPKAHFSVEELISSRTHRVELADIKGQIVKYSSDQNGSRFIQQKLENCTIEEKD LLFAEVLPHALELMTDVFGNYVIQKFFEKGSPQQKREIANKLAGHVFSLSLQMYGCRV IQKALEVIDLEQKIVLVGELDGHVLRCVHDQNGNHVIQKCIECIPLEHIGFLVSSFQC QVAKLSMHTYGCRVIQRILERCSNNSECLCIIDEILQSACILAQDQYGNYVVQHVLEK GNEHERGQIITKLAGQVVPMSQNKFASNVIERCFEHGGSAERELLVKEILKQTEGNNY LLVIMKDQYANYVVQKMLTTCNEQHKEILLSRVKIHLPLLKKYTYAKHIVSLVERLCG DGAVQSESKKTVTKGC</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6636..6682#6358..6529#5784..5978#5481..5591#5185..5397#4281..4388#3966..4107#2521..3869#1161..1790#gactcaaagcagagagaggagaaaaaacacaaaaggcagcgaagcggccgcgaaaagctcgactcggagataaaagggaaagcgagcgagaaagagagaggagaagcattggtggcgtgaggcggttggagcggggcacgcgcgcggccgaaggggggagaggagagaggaggcggggtggcgccgacgccggcggcaaaggttggttgtcctagggttcctgtcgttgctcgcgggaagggtcagcgaaggtgagggcctttggttacccctaactcaattatgtgtgaacagtgcttctccgtttgtgctctgtttatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttattgaggctttgagtttttttttcttgagggggttgcttttgctgtacaggagaagatgatgtttaagtttaatttaatttaatttattttttttactcgctgcggtttgagcgttcgtggagtggtatgtgttgcgagcacacgggtgggtttgtggttatggatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgattctgtgcaatgcttgatcaggtggcgagttcctcacttcggtatgttttaaatttatcctttttcgggcttcgtttgatgttgctctgcggtctgcaccctctagcttggtttaggcatgagattgtatgcaaggtgttttctttttaaccaatttcgtgatttttgggctagttggagacttgtttctgttcagtaataagtatttggggcagtaaacttttcttttttggaagatgtaatttctgttttcgatgggcgaatgtgtgcgtgatctcaccagcaagtccccgcctttggtgtgcttcacgtggtgtcctccatggcctcatggggcaggtttctctaggcggtggattttatctgctgtgctggatcacaaaaaccatgggtaaaaactaaaaaatcgcatttatttggcattttgctatgatgatttcgatggttaaagttcttgagttttttttttctttttgggtaatggagcttgcatatttgcttgctttgtagcattacatgtgtagttagtctgtactcgtataggttctaaaattgaactgaacttacagaattcagttgagaaattatcactaaaaatgatcaccttttgttgtccagcaaaatggctacagagagtgctcggccgttgagtggaggaactggagcagggaagtggccaccaagcaaggacacgggttcctatgattctattccagctagcctttcagaagatgagttagcggagttggccttcatgccaaatagtggcggcatttttgggaagtggaggggttctgtcctggaacgcagtggaagcgctcctcctaccatggaaggttctttagttgcacttggtcacctcacaggtcaaccgagtggcaaccttggggccatactgccaaacttgggcactgaagctaacaattcagagtctaaggagaatatatattatgattcggcatgcgtcaaatactatatgtccaaggtgaatttgaacccaaggtttcctccaccactcgtttcaaggaaccagtttggcaagtctgaagaacgaaagccgttctcccttgatgacagcagcagcaggtccttacttcttggtcatcctactctgccaacacacaaggaagaacctgaggacgaaaagtcaccaagtttggattcaagttcagcagacgatgctcaatgtgattctgcccaaagcacatctaacttagggggccacagtccaaatcttgtagattcaattaaggtaattcccgtattaattcaagaactagctctgattgttttttccacatgcactcaaacaaacttcgtggcgctgttcggttgtgggttttgcagcagctgcacctggtttctgcggctgtggtgcacagctgtggctactagtagcagctgcagccgcagccaaaaaaatggcagccggagaaggctaatgttttcatccgtgacataactccatctttgtatcctcaaatattaaagtcaagaaatctttatgcacggctatacagtagcagtcggcttcacagaccacaagaatggcagtcagctaagacttagtaaggtgaaataatacagtacaacatatgattaatgccccctgtgatatacaaacaaacatttccaatattcagtggctaagacgttttccaaaaactcacttatttgaaatagtaactggaaattctgatttaaactaattgatctttattatgtagtatctgctaaataaaatcaaaacatgtttttgtttcaaggaaatgtgatgggaatcgcactaaaccttgcaattccttaatacaagtacgacaagaaaagaagtattgattgtactcctccataaacattgttatttaccaactctcatgcatgcagatgaactccctaatatcttataatcatgttctgttttgctacagagtttgttgctgcagtctgcagatacttattgataatgatttctttttgtttaggaaaactttcatcggagcaatggtttgtatgataattcttccgatcttttaaatgcaaactctggtgatggagggtcgatttattctggcattagttcattgaagaattcctcactttatgttgtccagtcatcagacttgaatggatttccaccagatgctcatcagcgttcccctagacctattaggactccagtcagtacaaaacttactagcgacagtctgccagcttcatctcctcccacttcatcctgttctgactacagtactattactgaagcttgtcagcaaagaaatccaagcatggccgttaaacctggtgaaccagttggtaccatgcttgatagttcagacttcagtctgaagaatttgaatattagtccggatatcctaagtagttcatatgtcatgcaacagtggcagaaaaatgccccagtgtggaatggcctatcaaatgtagtccatggcgatcatgtgccaatgattcctccaggaattaatcttcctcaagttccatttgtggacaattccggttttggtcatatgaagttccctggtgatgttcaactgatgtcccagatcgggatggcaacacctttttgtacaccaaattcttttgggataccatgttatcctaatttgcagtcgcctagtgtttgggttcctccattcggaatcggcggctatggtttgcctggtccatttgtcccacctgttataactaacttcactcctcaacttcctggttttccttcagcagtaaatcttgctgcagcaactgacttatttcacccatataagatgtatgagcatcttggggtacctatgccatcccctgttcctgatcagagccttacgcattattttcaacagccccctatccatccgtatggtgttggaaatccatatgatacaatggtttcaagtaataattttgtagggaatcctgctggcgtttttggttcaccaatcattgacccatcagagcagaagtttcagataccggttactactgtagctgctaatgcctctactcccatcaaaggtggaaagcccattgggaattatgagactgcctcaccttactttggcgtaccgatgccttatccagcaggtccaacattacatgggcaacctgcttctggaacatctcctcgtgacaaaaggaacgatgtcaagggattccaaccccctcgaaaaaatatgcctgttagttccgagatacaaggtcagaaagggagggagaagtttgatgatcccaaggcacacttttctgttgaagaactaatatccagcagaactcatagggttgagctggctgacatcaaaggacagatagtgaaatacaggttagttttgattttggttgtttcattcactatctagatgcacataacccaatgaaaagcttgagatattaattgttattatgttcttgtcctcagctcggaccaaaatggtagccggttcattcagcagaaactggagaattgcaccattgaagaaaaggatttactttttgccgaggtccttcctcatgctttggaattgatgactgatgtattcggaaattatgttattcagaaggtatagtatttccttttcttatatgattcattttatggtaatttttttatgaatagtacacctattgaacttgaacaattgtacccccttttaagatattacagtatcatagcagcaattatgaaaaataatttatatttgtatgaaatgaaaataacatgtagtacatgcagttcttcgaaaaggggagcccccagcaaaagagagaaatagctaataagcttgccggtcatgtgttttctttgagccttcagatgtatggatgcagagtaattcagaaggtagtcttgacttctttatgggaagtataactttatttctgcttaatgttttggataccatatcatgaaaaccttttcagtggcacactatagcatgtattgtctgaggcggtctgagcaaattttcttcacactgttatgctatccatagacttatttattctcaatatcagttggcaaagtattatctgagtaaaatttcttcagactgttattctatccatagaattgtttattctgaacatcagttggtaagttttaaagtggttagcctgtgggacatcatttctcatattatgcatggtaatcagcatacattcttttaataagttgcaatcccactgtagccagctattcatggattagcatgtgttggaaatgaaaaataatgtgacttataagttgcaatcccattatatcccgttattcacacattttacttgctatattcctggagaactcattttcagatgagttttgtgttattctcatatataat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External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0497100, RefSeq:Os09g0497100