Os09g0527100

From RiceWiki
Revision as of 07:33, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os09g0527100| Description = Similar to RNA-binding protein| Version = NM_001070264.1 GI:115480270 GeneID:4347640| Length = 12336 bp| Definition...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os09g0527100

Description

Similar to RNA-binding protein

Version

NM_001070264.1 GI:115480270 GeneID:4347640

Length

12336 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os09g0527100, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 9

Location

Chromosome 9:21445030..21457365

Sequence Coding Region

21451060..21451095,21451168..21451336,21451463..21451524,21451618..21451696,21452131..21452234

Expression

GEO Profiles:Os09g0527100

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008402:21445030..21457365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008402:21445030..21457365 source=RiceChromosome09 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atgagccccctctatagccatcacttgaatgatcagttgcagatgtcttatgttgctggtactaaccaaagtgcgattccacttggtgggatggccagatattcagtgggcatggacagtggaatccatggcgctacaagaactgaatcaagaactctctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacatatttttcgccccttttctggttttcgtgaggtgagattggtcaacaaggagtctaggcatgctggaagctgtaacctcttgtgttttgttgatttttcatctcctcctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggctataagtttgatgaacatgaccatgagtcttccaacctgcgcacacaattctctctcactcctcgcaggaggtcaattggtgggccttgtgttagaaactaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSPLYSHHLNDQLQMSYVAGTNQSAIPLGGMARYSVGMDSGIHG ATRTESRTLYVEGLPSNCTKREVAHIFRPFSGFREVRLVNKESRHAGSCNLLCFVDFS SPPEARAALETLQGYKFDEHDHESSNLRTQFSLTPRRRSIGGPCVRN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>6031..6066#6139..6307#6434..6495#6589..6667#7102..7205#acgtgacacgtcatacgccgcatccttcgttcacgccgccgccgcctcgcgctcttgccgacggccaccgcgccgcctcgccggtcgccgctcccacccttccacggcgaccggagccaaagacggtgaccggcgggcgcgacgacctaggggaatgtgtacctcacctaccccacatcgtccccgcacccgcattccctaaacccccaaaccctagcccgctcctccgttgtcggatacgccaacctgctatatgcgagagaagggcatccacaactgtttgatgatctccaccggagccgccgtttaccggagtaaccgtgcttacgcgtcagctggaggggtgacctcggattcggtggagggctgatggctccgacccagctggtcgatcgctgcggcggcggcgcccccgcgagtcgctgctgtgagcctgtgatcgcctgtgatgggggtgtccgtggtggcgcaggcgccatgggggaagtaactcatgagatgggatgtggccgcaggcgcgattgtcgctgtgatggcgcccttggctatgcttggggcgacgatggtggcactgatgcccctgcaagcggcttcggtgcccacgattggtggttcattcgtgatggtggacttgtgaccttgccaccgcctcctccgcaagacgaatttgtgatgatgatgcagcctatgatagtatgatagcacattcatcgatgactgcgatgtcgctgtgatgccgtacccacatgccagagctgcgatggagctgctgcctttgtgcgcaggccttccaccttattgacatggtattgcagccccaacaagctggacctatgatgccattgttggcacagccgcctttggccatggcactcctctactcaagcttcaacatctggactactttggttcgttctaacactccacctcccctgtactttacattggcaacataagacatgagatatttttaatgttgctagtcgtagctattattattgtcaggttgatataagcttcttttgtctaaaataaataaataaataaataaataagcaagaaatgaagtgagctgcatagcacatcagcgattagcctcttatattccttgtaatgttaagatgtaacccagtgattggatgtagtttcaacatggaggtatgcaatgttttgttcgttgttttgattgtagcttttcttaagcatgactgcaattgcttggtgttatctactgatcatcattgatctgtgatctttggctttgttaatgaactttagaatataagtgatcactgatcattgatctgtgatctctaatctatgtttttctggtaagcttcaagataatcttaggaacagttgttgttttagaattgaggttatgccttttccttttatgctttggcttgtacagtttttaaacatttgttcagtgtagcctacccttttcggttgttaagcaaaatggcacataaggttttcttgtagagtttcaattttgggttagggaaatgttttcaactgctcttgtgaagaaatttggaatgtctgtttggaccaaagagacgatgcaatttataatctgttgatggcgatttcacgtagatctgatcggttagcttaggatttgcatgatactgcattttttgccgctcttacttcatgcagttattgaaagtgcagtaatgcaatctcctgtttccttttaatattggagtatcatttatcgataggatgttttcttgttacacttgctatctcgaaccgagcaagagcattagtaattgccattttggcaattgtttggaaatttgtgtgtacacaattatagcgctgctgacagcatgatggttcaaataacttgccattctcagatggccatctattaatttttcaactcaatagccatatgcttatgtgataaaaatgaaccatacatattcgaaagaaatggttgtggttttcccaatactagtcaatgcctgtgtattgcaatggatttgtgaaagattaattgtgcatgtttctgtttttagcccattgggatggttttttgggttgtttttaaaaccttttttttgtggtgggtgggggagggggggggggaggcaaggatgtgccctgcatgtttatttcttcttgcattgcatgcggtggaggaaggggagggcggacgaacgattgcccttttaagtagtttagagagaaatttcagaatttgccaccgaatacgtaggcctttaaggatttgccacccaatccgcactcctttcaaaatttaccactgaggatgcgaatttcttcattccgtgccgcttcgtccacttgtgcagctgagccttctgtccttccgctggctccatcctcgtccatccgccatacacgcgaacccagctcggcgccaacgtcatccatccgctgcctgtgtcagcgtaatctgtccgcttcgagggtgtcgcgtgggcggacgtcacgggcaaggtggagctgacacgctcgtgttccctccttctctaacggctctcacctcccagcatccaccgcaggagaaaccaagctgcgacgcatggggtcccatcctccctcttccctctcgtcgatcccatcccccaaaacactcgagttacgacgcgggagagcacacatccgtggtgcaccgcgggaataggaagcggcagcggcggtgcacggactcccctcacccccattctctggctcctcacatgtgaagtgcggcgtatatgtccctcccaaaccctagaaattcgacgggctggtgcttcttccacacagttggctagcttgggatcggttgtggtcatagatggtggcgatgcacactgggctcgcaaagtacgttggtggcagatggaagatgatggagccaatgcaaaagatagacggcatgacttcacgggcaaacggagtggtatggaacgaagaaattggtaccctaagtggtaaattttgaaaggagtgtggattgcgtggcaaatccttagaagcctgcatattcggtggcaaattctgaaatttctcgtttagatatgcaccatacacattcttaccatgatttgcagagaacctaggccattggcgaagctaggatttaaacttgagggggccaacttaagctcattaccgagtgacaatgaccataaaaaagttgcatcataatacgcacaaaattgaaacattttgacatggataataaatcatatgaatatatttgttagttttgaccatacaaaaggatgttttcctgcctattatttagtcattggctacatacatattttttgttttgaagattttagtatttcaaattaaagtgaagaggtaaataaaaataaagtattagggcttacaaaaaaatgcatatttagaacacggtatgcggacattggaacaactgagctgtccaagtgtgttgtgttcttcgtgttagcttgttaggtctgcttagcctaggaagcagtcatcaccatctaaaaacgatatactgctatgtctcccaaataacttgtttgcatgcaatcctagctggtagtggtagcattggaagcctgaatacgccaatgcaccaagtacatgacataatcatgtatttgatgattaattagccggtacttaagaaaaaaaattcgccgttgggggaggcctgacctccctccacccctccctggctctgcccttgacctaggctttttctccacattaatgtatatgcactttcatgatgtattatttgatcacctccatcttgatggacacactctaaccccatgtcatgcaacaccacccggcacatgtaactgacaaacaacacatgaatagtaactgccaacaaatcactacatgtttttgcacaattaagcccattcaatccacaccaacacacctctatcaaagaaacatccaccgtatacgaatatggattaaaaaacatataccaccggtaaattgtgactcacctaatgcctccccagttactgaccacaccactgtccccatctcagtctcatcttatctgtgcctttttatgtgggcatctggtagaggtgctctcttcatctgcatccaccatttcattcaccaactaagtaggcctttttgagctaggtggttggttggccttggccttattaatttttcatgtggtactacaatatgccattatgtccctaagttgtgtccttcacattttatttagtatctatgtagttatgtcttttacatttatttacatagttatgtcttttacattttttttacatagttatgtcttttacttttttttacatagttatgtcttttatgtggttatatgatggagaagaagcttccgatttgtctttcttgccgttttgagtttcttttcttgtggtcagagcagaatgcaagaattaaaaattaggtgagaaatggaacagaaattttggatttaaactttgtttcttctcttgttgttatgccctctgatatttggccatggccacacctcaatgttttccaccactgcttctaccatgcacctgcagtttgatctctcattgttctgcatttgatgcgtgcgtttgtagcagttgttgccttgttggtactaagttgttgttgttgttgttgttgtttcttcaatgctcaaaattgcaacttgggagataaagtttggcggagaaagagaagtgtgagaagaaatatcgatcctaataacaatggatgatgcaataccggcaattttttggggcatccaaaatagttttgactaatcaacccatgttaccctgaaaattatgtggcctatatctgcattaagtcacctgtttatacaacatttctggtttcttatcctttttctttcttagtgtaaatgttgtatgctgattgttattgttagctgggcctctgttgcttcgtgtaattattcttgctttattgaggtgttacgtatgatggaaagttatagtgtagtttgtactttggagtaacatgtaatccagtgaattatcagttcttccttcataagacactatttagcattcattttacctgtcattgtttgtgggcaattcctacctatttgtttgtttttatataatggcaattccccagtacaacactaacatttctcactaatggctttcaatctttgttgttctttaaaatgaatggttacctcaattgcctgatttcataacccagacaaagaaatttctcttgtattttttttctttgctttttttagttgtttcacaaaattatattggtgaacccgtcaatttttataaatagatgccatggtaactgctatgtacaaaatataggatcaacctgtcagagatttccctaattctctagtaatctggtgcgtcttactggctggctggctggtggttgatctgctcgctggtggtgttgcagtcttgcaggattcatcagtggtgtgagctgaagtgggggttctgtggttttttgtttctccgttaaggtttctctttccgtttcccctctcgcttgaggggactgttcacatgtttgtttctgttgcactcccatttattgtaacttcttaaatggaaagggaaaaaaatgttaatgacactttacactagtttctgcctaatgcattttctccaagtgggatgtacactagtttagcattgctcgaggagagaggattgacgtgtcctttcatgtaaacatttctattactgtatttttgcaaatttagtgcatctgatatctaggaatgtgtttttcaattcacatggattgctccttttctgtgctgctaaactaagatcatatttgcctataattagtctaggtaaaaatatatcttttgcgatgtaattcatattgcacctcgttggtgcttttgccctcagaaaaatattgacgagactgttcactaatttctgcctaatgtattttctccaagtggaatgtgcatttaaatattttagcactttacacgtttgtttgtagatatgccttctggaacagggaaatggcctcttccatgaatgaatgagccccctctatagccatcacttgaatgatcaggtagcatattgattataagtttgttgatttgaggctagcaacttttttaccaacatagtaattatcttccagttgcagatgtcttatgttgctggtactaaccaaagtgcgattccacttggtgggatggccagatattcagtgggcatggacagtggaatccatggcgctacaagaactgaatcaagaactctctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacgtatccttttctatgcttgtaaactaaaatcacattttcctagctataattagtctaggtatcttttgcgacgtaattcatattacacctcctaggtgcttttgcccttaactctttcttctgcagatatttttcgccccttttctggttttcgtgaggtgagattggtcaacaaggagtctaggcatgtaagttaaatgctacctgtgatccaaattttccctgttattttttgcaaagccaagcatgcttacatgtcaaatcccctctctgttttgcaggctggaagctgtaacctcttgtgttttgttgatttttcatctcctcctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggtaattataacatcatattttctgcatccatatgcattgtacttatgttgccaatttcgttagatagtgcttgcgcacagtttcattcttttatgtttgtgtgcctttagtctttttaaaaatctgtttatttttctgaatatttttccctttgtcccacatccagtaggttttagtgtgatgactgaactaaaactaagattgttatttcgaaatatcatattttttccttgttccactttgaaaccagcttactgtcattctatgtgtgctatatcatatgtaataatatttgtgtgcacatcaactttagtgctttccatcataaaactagacgtttcattggtagggagagaataaactttgagcttctaatacttgttcaggttataagcttgaatttggctctgaaattatgacgttttactttgcaggctataagtttgatgaacatgaccatgagtcttccaacctgcgcacacaattctctctcactcctcgcaggaggtcaattggtgggccttgtgttagaaactaagtttcttgggtggagttgaattaataatgcagagcaaaatttgtggagaatctctagggagacttgtatacaatgctagaccaaacttgactctagggaaacagcctcttccacgaagcaatgagcccccattatgtccatcgcttgaacaatcaggtattatatcaattataagcttgttaatttaaggatagcaactttcttactaacatagtgctggttgcagatgtcctatgctgctggtgctaaccaaagtgctattccacttggtgggatggccacatattcagcgggcatggacagtggaaaccatggcgctacaaggaccgaataaaaaactctatgtggaaggactaccttcgaactgcacaaagagagaggttgcacatatcctttttatgcctgtaaactaaaatcacattttcctagctataattagtctaggtatcttttgcgatgtaattcatgttacacctcctaggtgcttttgcccttaaccctgtcttcttcagatattcttcgcccctttctggtttctttgaggtgagattggtcaacaaggagtctagatatgtaagttaaatgctacttatgaaccaaaacttccctgttcatattttgtaaagcctagcattgcttatattttgttctcttttgcaggtggaaggtatataatctcttgtgttttgttgattttgcaactccttctgaagctcgtgctgctctggagactctgcaaggtaattacaacatcatttttacctatgaaatttatgattgtctgcatccatatgcattttcttatgctgccaatttctctagttaatgtctctgcacctgcattagatgcttttctttgctgtgctttaacatgcattgaagtatagcagtttagttttcataggcacccatttcacccgtcatacactttcagccaaaaattgccacagttgtgccagccacacttttcatggcaaaaaagtgtggctgccaactaaagtgctatatacaatgattaatgtatgccatcttcatttgtggttagtacattttttttctgtcattttgtttcaccctatatagaccattgttgcatgtctacgactattaaaggatatgcttgctattctgaacaacttagtagcaagctcttctatcttaaaccacatgccaacaggcttatctactttcacgattttttgtgaaaccaggcactattttgtcatttcagtaattcagttaaaatataattatacaatgtcagtgcgcttttggagttgctatggaaaccattgttggaaacaggcaggggcatatgtacagtagtatcactggtctcagatggatgccatccaaccaatccagtgtattgctagcatttgtacgcatttacgcacttacccccggcagtgcaactgtgcaagcttgttgaccccagccgctaaattgcagcagctcagaggctaaacaatatagctccatctttgaaaacttaaacagtttaactggtgtggtaggtgctggagcccgaatctattttccaacatccttcctctttcatattataagatgttttagattttgaatagattcattcatgcatccatcatccttcctctttcacattataagatgttttagattttgaatagattcattcatgcatccacatgcgctacatatatatgctcaacttcatatgtatgttagtgaatttagacaagagataaaaagaccaaaactttttataatgtgaaacggagggagtatatgttttggtaccatcagccaccactaatgtcgcagtttaaaatatttgatctgttgactataattatttcttttagctaatgtttctatccatgtaattaggccaataattctattatcaactattaaaagttaaccatatttttagctattagtaaaaacaacttcaataacttgcttgtctgaccaaaagaataaaggatttgtatgtcttattaggttctaactctcaaagtattgctcaatacagaattaagtctaaaattaagtgattcaaaccttaaactttaattagtctcaaatgaacatgctcattgaaacaacagcaatattctaccgacaactctagctaaaaagatcagctcaaggacaccttagcttagaaatatttagaaatggagcccttccaaacaccgcataagtataagtgagtggtgacaccggtgccccaaaatcctggatacacccctggtaacagggaaaccaccaagttttggttggatcggtgtctgcatggcaaaacgatatttgaattagctccaaacttgtgctagctgatctctaagtgcacctttaaacaatgcactgtggctcaagcgctgaataacagaagatggttggctgccacatggtgcttttattgttcaagtgcttatttcacttgagaaggcatctacatcaggaagttggcctataatgcttatttcatgtggtctatcaagtttgctccttggaagtgaatttggaaaagttgggctagcttcgctgcaagttattcacttggttagctgtttaacaactggtgttggatggttgacaggcttgctaagcgaggtttatcgcacccgaatgcttgtcccttctgcgaccaggatgatgaatctattcggcactttctcatctcatgtgtatttccccgccatgtctggacatgtattctacagaagctgaatatgttggcctccgtgcctcggtctaccgcgtgtctctctagttggtggtaagttaacagaggtgttcctaaagaccaaagaaaggggctcaactccttgatcattctagtaagctaggaaatatagaagcaccggaatgcatgtgtgtttgagggaacaaagccccaatgttcaggtggttctgcattctattgcggaagagagcagcctgtggtgctgggctggcacctccgcacttcgtgagctacttgtttggtcgctcacaatagtcacctagtccgtccttatggtgttatcctcctttgatcttgttcccattggcaataggcaattgtttttagtccttttgatcttggggggggggggggggagaagggggtttatcctcctttataactttctaaaacaatcgtctaatttgcatctcatatttccccaaaggtacatcaaccatttctacgcatcagtaaaatttgtcaattggccgttgaaatggcaaaattactactacatttttctattttgttactaaattatacattcaataccctttaaattctacaacaacctgtaaccccttccaaccgtttgtaagtcagcagggtctagatttgtttttgttttttttggcccccatggtatatttctgttaaaaaaagataaaagtaataacctttttttaaaaaatcttagttctgtcacttgttcccattggcattgactgtatacagcttctaccaatgcatttgtgttttgaggaactgctaattaaagtactggagttttttatgtggtagcacgcccttagtagtattgcaaacttgcgattcttggtgagtagaagcatgatgttgttacataggctcatatcagttgctggtgtgattagacaaatcatgctctttgacatgaatgaacctatcctaatttatcctttgagcttcattaccaggaacagtagttggttgtgctgtatacttttaatcttgcgtggatattcacctagtctcaatgtttcatgaacgtgagaaccacatatggctgccaaaacatgcaagcgtgattccagtttattgaatcgtgcatgctagataaagggcctaattacctttatagatgtgttggcaagcaggagtagaaatcagtgtggttgtgtgagtttaatgatcttttgtattttactattgcaataaattgaaagtttaagttgggaagaaaggccgttctgaacattgttgttagaggtttaaacaaacgagatggtattagaaagggggtcctggttatcctgcaaccttaaccacctttaccacctgttatcattatccattacttggctgtatcttcgtaggctgatgctaggttattcaacctctggctgtttgtagcaacagggtaatagaacatttattgatttatactcactgactaataaatgaaacgccggtttccttctttgtcaagagagaagaattttgtccttcctattagacaagataaacacggcatattacttttctagcaattaactgtgggtagtgatcgtttcttctttctgattgtcgaaatggccattgccatccagctttccaccataaataaactgacatggatattgcggtaaaagaactgccattgatagcaaaattctaaaatctatcctgcaacattaatttctgactagaagaataaggcaaatttatttttttgctcctgctgcattatttgcttcttcaagttccagcatgacaatataaattcattcgactagacaaacttgaaatgtttaatggacgtagtgtaataatagtactaccatttatagcacagttttgtcactacctgcagcaattttgaaaaaaaatcaacactaatgtggttgtaactatcagacatgttgatacgaaatctattcataggatgtgacctcaacttctgcctgatacgctcaaaggtctgtgtgttttgcagtgatcaccagttactactaaggaaaggtgttcggtgatgccactaagatcatggttccagggacgatgcaaaggcaatggaacatgtttcactgaggttctcattcagggcaaaggggaattgctcttcggagctatgtgaatttggtaagtggtacccttcttagagtggtctattccatggtgcaacagcttatgcatcatacagattttggaatggttcttatgttatgatcgttttgatgtactccattcatcctaaacatatttaagcttgtctatctacttttcttttttcagtttggcagaaacactgcttcgtatggttgcaagtgtattctagcgtgaattgtattttctcaaggtctaaactgtaactgaatttaaattgtaatgcttggagtgaatgtcttaagttaaaaacttttgctttttgtt</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os09g0527100, RefSeq:Os09g0527100