Os10g0337600

From RiceWiki
Revision as of 08:34, 21 June 2012 by 127.0.0.1 (talk) (Created page with "{{JaponicaGene| GeneName = Os10g0337600| Description = Got1-like protein family protein| Version = NM_001189159.1 GI:297727448 GeneID:9271603| Length = 4651 bp| Definitio...")
(diff) ← Older revision | Latest revision (diff) | Newer revision → (diff)
Jump to: navigation, search
Gene Name

Os10g0337600

Description

Got1-like protein family protein

Version

NM_001189159.1 GI:297727448 GeneID:9271603

Length

4651 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os10g0337600, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:9973047..9977697

Sequence Coding Region

9973866..9974012,9974091..9974182,9976601..9976631

Expression

GEO Profiles:Os10g0337600

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008403:9973047..9977697 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008403:9973047..9977697 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggtttcctttgagatgaatgaccttcaaaagattgggatagggctgacaggctttggagtattcttctcatttctggggatcattttcttctttgacaaggggctacttgcaatgggcaatattctcttcctgtcaggcttaggtttgactattggattgaaatcgactctgcaattcttcactaagcccaagaactataaggtttgtaaatttactgtagcttatcagagcttttgcccatggactatatgttatttaatcaactaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MVSFEMNDLQKIGIGLTGFGVFFSFLGIIFFFDKGLLAMGNILF LSGLGLTIGLKSTLQFFTKPKNYKVCKFTVAYQSFCPWTICYLIN</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>3686..3832#3516..3607#1067..1097#agtcaagggccaacaaggatcggatccctcgccgccgcggcggacgacggcgaggcctccgaatctgactaggtactccacctgcctcttctctccctgttcgtgtgtgctgcccgtgtctgcgtgtggcggggtctccatttcacactaggggttgcggctccgcgaatcttgggggtgagtttcttttcttgtgtgcaagaacttttgggatttatatgcttttgaatccacactgagatgtgtagaccactcgatatagtcgctgctggattctgattgaggtaagtttgtgcaatggggggcaagagcgtttttttttttttttggatatgattggagcgtccttttccagttaggttttggattagtgctctggtgtgttgttggtgaaacgaactctgtagaatcctacaaccttggacactgtaaatcagctcgcctgtaatcctgttagaatgcacgcacgagtaggtatgtgtgatgtgtcggtattgtgtttgatattcttagctggcatttgctaattagaaacaccagtatgtgctgattagaagcaccagtatgccaatttaagagagattgttgtgagagcatggcagcatgagttatacaacattagcacatatttttgtaccgcatgtttaattaccttcaatctgatttagaattacaaaattgtacagagtttgcgtccctatataatttccagttcttagagtttttctttttttggtgttgcttgttgatatcaaagttcctcactaggctgcattgagttctaatgcaataggtgcatcagaaaccggagggttttacattaacttctgcccttttacatgttattaatgaatattgagttgaactggacttttttttcttctaaaacactaaaacaatgctaaccggtagtccggtatttctaatgcatttgtaatggtttattgctcttccgatttttgtttgaactattagatttggtttgctggtttgcatctaatgcaggtgatgttctgtatttcaggcttttcatatcttcctaacagaagttgtccttgtcagcaagatggtttcctttgagatgaatgaccttcaaagtatgaacatcatctatccctgtttccatcatctgaaatttccattgaacactaaaatagcaatatattgttctatgcatcattttcctttcattgaggttgaacctttcaatggttgcagaaattatatttctctaattatggtagtaaccttgaccatgtttaaagatgtttgaacttttgaagttcacagtaattttgtaaaagttgtcctttcttgcatatgctttgtgtttatttggcttttgacgatcccagaattgacaaccttctcttgcatactgtacaatatgctctgcttgccatttaagttgttactctgcttcttgttatgttagaatttaggaatacgttataccgcagcagagaagcaaatcctttgctgttgtggctatctaagtataaaggcacacttttgccgttccttcatcacagccagtaattttctttcgacggttgagattcctagtctttcaatgccctaccaggcccattcctagcctttgcacggttgtgacaaaaccttgcatgctcacacttgctgtgtttgtgttttcctgctagattttctactaatgcagtcaaacactactgttggtaacttgatcatgctgcttgtcaccgctcttgcttgctgtgtagccagagctgtgcacaacaaatgtctgtactattatgaacaataaaaaagtatatgtgagctgtagttatatttaggacctgttcgaatgtgctattggataaagattgtcactggcacgcaaaatgagacgagccattatattaactattacgaacttgaaaatggatttatttggtttttaaaagaaacttgtacttagaaactttttgcacgaaacacaacatttaacagacaatttgggaaacgtgctaacggaaaacaagggaaaagctccatccagatgctacatcgaccgcagccttagttgacatgatctagttgaagagttgcatacttgcaatcattagatacagaaccttgttctatattgttctgtattagtcgtggcttgtaaggaccttgggtagtgtaatgggattaatctcatagaggttgtagccagtgtccaaatgtggcaccactacaagattaagcagaatggggaagaaactttaagagaaaattccctgtgtacccctgaaactttctctaatcctgtccatgccccaaaattttgctcattcccttgtatacctctaaattttagtttggatcccttccataccctttttgttagttgaccgtgagttgatcgttaaattcctatcaagtagtccattttgccctttggtatgaacaaacatataaaattatggagtatattgttcaagggtagaaatttgctatatgagactattatctcaatgagtttgttatgcgagatattattaatcataaaatttatttatagatatgaaacaaaaaattaatattaatttattatttattaaaaaatatttatgtataaatagatttgtcttatacaacaaatatgttgtacaatactatctacaaaataagctacacatacaatgtttaattattaaaaaataaatattaatttttatgtcatatctaaaaataaactgtcataaataatatcttgcattagaaactcataaatataaaagtctcatacaacaattttctaatactccattaatatatatgtttttcataccatagggcaaaatggactttttcataagaatttaacggttaactaactgtcaactaacagaaagggtatggaagggatccaaactaaaattcgggggtatacaaggaaatgagaaaaattcaggggcatggaagggattgggcaaagttttaggagtacactaggaattttctcaacgtttaagcagtgtgttatatgcaattatgcatcatataccactccaatagagttaggcatagagcagattttggaagctaggatgctagtatgttacaatgtattacttgtggcaatcaatttttcatgaaggaatacattttttctgtcaaatattttcgtcagtattttttttccctgaaaatctatactttcctggcacgatcttgagttgaatttaattgattgcctacctcatgccattggcaattggcacttcgttgctcatccccctgtagctattctggagcatttttctatttttgcgataacaaatgcattatgcaccctgctacattttttcaatttttttcatctcatgcttggaactatgctcttcagggcatagagcactgtttatcctggatgggatcacatttcccatccccacaaggtattattccattggttggattttcttttatgctttcttgctatgccacatcatcgttatacccatacccacttcaattggtaatttgtgaatctcatcttgcagagattgggatagggctgacaggctttggagtattcttctcatttctggggatcattttcttctttgacaaggggctacttgcaatgggcaatgtaagcttgcttgaaacttttgctgaattttttgaagatctaagccaatgaaatgtgtatgcatgtggaacatttcagattctcttcctgtcaggcttaggtttgactattggattgaaatcgactctgcaattcttcactaagcccaagaactataaggtttgtaaatttactgtagcttatcagagcttttgcccatggactatatgttatttaatcaactaactgtaactggcagggtactatctcatttggtgctggccttttgcttgttctaattggatggcccttttttggcatgctattagaggcatatggttttattgtacttttcaggtttgtttctcattgcttgtccattgaccaatccttcttttccactatttaatgctgagataataaagaatgtcttatatttgaaaagatttctgcacagtgcatgcttgacaattgtcaggtttaacatttgtcttgtatgtgacactgaaattgcagtggattctggccaactcttgtggttttcttgcaaaagattcctttcattggttggatatttcagcagccatttgttgcatcggtacagattttcccaacagaaaaatattctctatatggacactgattactgcatgtgctaactgaaaaaaatattttatttgcagtaccttggaagctatcgaggaaaaagagttccagtgtaggtcttaccccaagtagtgacacagcaattcgaggtttacatggcaacctcaattggttttgtaacgcgccttccacatttctgcccttctctaccttttcaatcaccaaatctttacaaatgcacatgaatcagggtctttttttttttgtaaattgattttgcctccccttggcttttaatgacacaatactctctttagtaagccagattctaggaaaattcatgtttagaaccgccttgttgaagcagaaactgcatgctcgttgtgcttctgtaatatagttccagcaaatggcctctgatatagaaaatcttgctatgggcacacatttttgtgccag</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os10g0337600, RefSeq:Os10g0337600