Os10g0415900
| Gene Name |
Os10g0415900 |
|---|---|
| Description |
Similar to General control of amino-acid synthesis 5-like 2 (Fragment) |
| Version |
NM_001071139.1 GI:115482021 GeneID:4348629 |
| Length |
6189 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0415900, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:15006565..15012753 |
| Sequence Coding Region |
15006605..15006668,15007372..15007513,15007624..15007717,15008439..15008554,15009418..15009472 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:15006565..15012753 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008403:15006565..15012753 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>atggacgggctcgcggcgccctcgccgtcccactccggcgcgacgtccggcggcggcgcctcccaccgcaagcggaagctcccgccgtcgtccctctccgacgccaccgccgacgaggacgacgacaccaccgcgccgtcgtcgccgtccacctccccgtcgtcgccctcacgcccgtcctccccgtcctcctcccactccgacgatgacgacgacgactccctccacaccttcaccgccgcccgcctcgacggcgcgcccccgtcctcatccggccgcccgccgaagcccgagtcctcgaccgtgtctgccgccgccgcggccgcggctgcagcggccgctcccaagcccgattccgcttccgctgccgccggcgacggcaaggaggacccgaaggggttgttcactgacaacattcagaccagtggcgcgtatagcgctcgagaggagggcctcaagcgtgaggaagaagcagggaggctgaaatttctatgctattctaatgatggagttgatgaacatatgatttggttggtaggcttgaagaatatctttgctcggcagcttcctaacatgcccaaagagtacattgtccgtcttgttatggatagaactcacaaatcaatgatggttatcaggaataatattgttgtaggaggcattacttaccggccttatacaagccagaagtttggagaaatagcattttgtgcaattacagctgatgagcaagttaaaggctatgggacacggttaatgaatcacctgaagcaacatgcccgagatgctgatgggctcactcatttcttaacttatgcagataacaatgccgttggctattttgtaaagcagggtttcacaaaggagatcacattggacaaagaaagatggcaagggtacattaaagactatgatggaggaatattgatggagtgcagaattgatcaaaagttgccatatgttgatctggcaacgatgattaggcgtcaaagacaggcaattgatgagaaaatcagagagctttcaaactgccatattgtttattctggaattgacttccaaaagaaagaagctggtattccaagaagaacgatgaaaccagaagacatccaaggcttgagggaagctgggtggacgccagatcagtgggggcattccaaatcaagatcagccttttctcctgattacagtacttacaggcaacaacttactaatctaatgcgttcattgttgaagaatatgaatgagcatcctgatgcttggccattcaaagagccagtggattcacgtgatgttcctgactattatgacattatcaaagatcctattgatttgaagacaatgtcaaaaagagttgagtctgagcagtattatgtgacgctagagatgtttgtagctgacatgaagagaatgttcagcaatgcaaaaacttataactctcccgatacaatctattacaagtgtgcctcacggctcgagagcttcttctcaaacaaagtagcatctcagcttgcccaagcctcaacgaagaactga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDGLAAPSPSHSGATSGGGASHRKRKLPPSSLSDATADEDDDTT APSSPSTSPSSPSRPSSPSSSHSDDDDDDSLHTFTAARLDGAPPSSSGRPPKPESSTV SAAAAAAAAAAAPKPDSASAAAGDGKEDPKGLFTDNIQTSGAYSAREEGLKREEEAGR LKFLCYSNDGVDEHMIWLVGLKNIFARQLPNMPKEYIVRLVMDRTHKSMMVIRNNIVV GGITYRPYTSQKFGEIAFCAITADEQVKGYGTRLMNHLKQHARDADGLTHFLTYADNN AVGYFVKQGFTKEITLDKERWQGYIKDYDGGILMECRIDQKLPYVDLATMIRRQRQAI DEKIRELSNCHIVYSGIDFQKKEAGIPRRTMKPEDIQGLREAGWTPDQWGHSKSRSAF SPDYSTYRQQLTNLMRSLLKNMNEHPDAWPFKEPVDSRDVPDYYDIIKDPIDLKTMSK RVESEQYYVTLEMFVADMKRMFSNAKTYNSPDTIYYKCASRLESFFSNKVASQLAQAS TKN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6086..6149#5241..5382#5037..5130#4200..4315#3282..3336#2626..2694#2337..2436#2121..2164#1503..1671#1043..1114#857..937#726..790#116..580#ggttcgaaccccgtgccgcgtcggaagcttctggatcccagatctcggccaaaaaccctaaccctctcgaagcttctagaatcacgccccctcccccctcccccctcccctccccatggacgggctcgcggcgccctcgccgtcccactccggcgcgacgtccggcggcggcgcctcccaccgcaagcggaagctcccgccgtcgtccctctccgacgccaccgccgacgaggacgacgacaccaccgcgccgtcgtcgccgtccacctccccgtcgtcgccctcacgcccgtcctccccgtcctcctcccactccgacgatgacgacgacgactccctccacaccttcaccgccgcccgcctcgacggcgcgcccccgtcctcatccggccgcccgccgaagcccgagtcctcgaccgtgtctgccgccgccgcggccgcggctgcagcggccgctcccaagcccgattccgcttccgctgccgccggcgacggcaaggaggacccgaaggggttgttcactgacaacattcagaccagtggcgcgtatagcgctcgagaggagggcctcaagcgtgaggtgaagtatttggtttgcactgtttcgatttgataggccgtttgtagggtttagacatcggagcagtcaaattggagtagcatttcgtactgtttcttgaattttagaatgtgacttctgctaaaattggtggattgttctgcaggaagaagcagggaggctgaaatttctatgctattctaatgatggagttgatgaacatatgatttggtttgtatgctaaaattattgttccaaacaacctcagatttgttagtgactgatgtttttccccaggttggtaggcttgaagaatatctttgctcggcagcttcctaacatgcccaaagagtacattgtccgtcttgttatggataggtaattctcagtgtaatgtgcctactacgtattttggaagcagaggacaagaatatctctcttcgttagtgcttataaaagaaattattgtgatgtgtcttgcagaactcacaaatcaatgatggttatcaggaataatattgttgtaggaggcattacttaccggccttatacaaggtaatatttccaccttggtgctagaacttgtatgatgtattgacatctgttatatgtatttgcacttgcatgaatgatcaagttgtggtacttttttgtttagatatctgatagttattgataatgaaatctaatggaagctatgagctgttcttttaagtttttgtagctaacgttgatttttgataatgagattgtgttataggattctactatttattgttcagtgatctcaaagcagtaaaggttatgttgtaggacagcatgcacacttctgtttgtctggcaattgattatttctgttgcgtcatgccatgcaccatgccagagatgttccttttctgctgcagcataagtttctgtcctaatataggttttgaaattgtagccagaagtttggagaaatagcattttgtgcaattacagctgatgagcaagttaaaggctatgggacacggttaatgaatcacctgaagcaacatgcccgagatgctgatgggctcactcatttcttaacttatgcagataacaatgccgttggctattttgtaaagcaggtttgactatttgactgaactcttttatatgctttctttcttaaaatttcattgttttgtgattgttctcaagtggcagctacgaaatacacttgaacctaacgaaatagtgacttcatagaattagcgacaaaaagaatgtttcaatgcatggtttataaagttatttctaaacatgttgtgtccaacattgtctagcagtctttgtaagattgtatcaggtgactaactttgaatctttaatagttcaacttatctcctaagtcctacagttttgtttcagctataaattagttcccttaggcatatgttcagcaacagtttctgtacttagtagtttcttgatcataagaattcttgacgatttaaacaaaagagatcaattagcatatgtcttgcaaacaataatttggtttattttattgtcctttgctgctggcaatttgtagggtttcacaaaggagatcacattggacaaagaaagatggcaagggtaagcaatttattgtcaattatattgttttatcatttccttgaagtataaagtgagtcagtaactcctaataaaagtgtaacaatgataacactacttgttgtctgagagtattattgtactaggctacagcaggtttttatctgttgaactcaatagttgctgattccaggtacattaaagactatgatggaggaatattgatggagtgcagaattgatcaaaagttgccatatgttgatctggcaacgatgattaggcgtcaaagacaggtgacataaaaggctaattgctgcttaaacataaactggaagcaatattactccttttcagctgtcctgactcctgagcacttgataactttatgtgcaaatcattagtcaactgggatattcatatcattataagccaattgaagttttctttttgttttggcaactgactgtattttgactgaacaggcaattgatgagaaaatcagagagctttcaaactgccatattgtttattctggaattgacttccaaaaggttagttgttccttcttattttggaatctatttctgtcaaatattatcagtttgatatgtgcaatagatgaacctgctgttggagaaaaaactgctagtcttaggtaaaaaaggattgttttagttgatatccttgtcaaacatgccttgtctctattatatgttagacttcaattcaattttgtgccaatgaatccattgcaaaaagttttggtgtgtcacttgcacattttatttctcaaaaatggaataactaatcatgttagtaaaatttgaggcacaccttggtatgattaacgaggaatccatccagtgtgcatcttgttaggtaatggcatcatctagggaaataaaggaatttttttaaaaaattttactggcaaccagtgcccgtcacatttatcttgttcattttgggtttgtactagataggacagaaacaaatggactataactggtgtaagtcacatataatgtattttgcattgttgtttctgaccctgctgtacacaatcttggttaaccttatcgatcaaaacatggcatttaacaggtttattcctgttattctctttttttatttgtagaaagaagctggtattccaagaagaacgatgaaaccagaagacatccaaggcttgagtaagtaaaacacttctatattaacataagtttggttatcttcaatgctgttcgcacagttctctctttctaaattcttgagccatctgctccagctgatctcattgaaaggcgttgcatttgcattagtggtagtttgttttgaaaacacacagataacaaccgaatgtgctagtagatgattggttacactggacattctttatggacatggacagatgcgtgagaagtatgacacgtagggccatgcatgccatccaaatattctatcaaatttgtcatcatcccccattcaggtcctatttggcagggctcttaactcctaaatctaactctaggagcagtgtgtggagtggagctgtggagtggcctgaaccccgctccacccctttacttcatttttttcagatcactccagcccgctctgctccctttttgggtggagctgaaaccgtttggttgagctctagctccagtagaggtggagctggagctgtagccctgccaaacagggcctcagtcaggatgcaaggagttgtccagagtgtgataccatgcattctgacattcatgagttcagtgcactgctatcccattggagtgctgcggactgcggtgctgcctctcagctatcgatgatgattgcttctaccgcattcctgtcctctcccaaggatgttttccttagagccaattgtagaaatgatcatatggcaactggagattgttaaatatacagaacagaattctaaaataagatgttcatccatctgtcttattcgaccatatttgttttgccgccttgttaggtttactggtttagctatgatgcaagcctgatcagaacaatcaatgtgatgcaggggaagctgggtggacgccagatcagtgggggcattccaaatcaagatcagccttttctcctgattacagtacttacaggcaacaacttactaatctaatgcgttcattgttgaaggcaagtcttttatcttcgcaaatctttttatatgacatgcaaccatttggtttgacctcactggataaacctgtactttgcttgctcccttttgaattttttgcaccctttctgtttcaagcatattttctaaagccagaccagctggatggtctgttcaatggttcaatgattgaaatggccacattttataagtttaatattcaaatatttctggtatacttcactgtgaactctacttcatatggtcagacattagtcatatttatcctttgaaacgttaagctgattgtcaggtgagccactagtgattctcaaccatcagtccagtgtggtttagaaattaggcaaaactggctacaccaatgtaacactaaggatccatgtcattactcaaaacacaccttaaagtcatgtgcatatgctactatgctaatggattgcaatggccaccagcaaacaaaactatgggcaaacagacctgatcttttagtgtgtatcggcaacaaaagagtatctgccagcagatatagctaattttgttttgtgattgggagttaacatgacaaccaagtacagtgctctatagacaattttttcaaaggattatgttccaaagatgttgtagatctgcaatgacctgatgtgttggatctactgttgtcttacgaaagatacttcatacttttatcaattctgatataagagctttgtcttgtagaatatgaatgagcatcctgatgcttggccattcaaagagccagtggattcacgtgatgttcctgactattatgacattatcaaagatcctattggtatgctggaatgatttaggggattattttcccttcttttcccagcttggcgaagctatgttttgtgccatctaagctattcagtttctgaacactaagcttgtctgcagatttgaagacaatgtcaaaaagagttgagtctgagcagtattatgtgacgctagagatgtttgtagctgacatgaagagaatgttcagcaatgcaaaaacttataactctcccgatacaatctattacaagtgtgcctcacggtgagcaatgaacttcaatcttgtgtttgcatattcatctacctgtaagtcaggcatctgtcaatgtttctttgaaaatatttagcctaaccattaatagaaacgtgggtggttacatctcatgttggatttatgtgcactcaataatgtctttctatcataaccagtagaagattcaccttgggggaaatctggcattaattatttatcgtccgtgtttgaaacgtaggccttatttagttcccaattttttttcccaaaaacatcacatcaaatctttggatacatgcatggagcattaaatatagataaacaaaaaaactaattgcacagtttgcatggaaattgcgagacgaatcttttgagcctaattagtccatgattagccataagtgctacagtaacccacatgtgctaatgatggattaattaggcttaataaattcgtctcgctgtttcctatcgagttatgaaattagcttttttcattcgtgtccggaaaccccttccgacatccggtcaaacgtccgatgtgacacccaaaaatttttttttcgcgtactaaacaaggccatagtcacttggttgtctaactaagtgattggttttgttccttttttgcatactcgagagttcaaagaaagtagcatctcagtcacctggttgtctaattgatttggttttattccttctttttgtgcaggctcgagagcttcttctcaaacaaagtagcatctcagcttgcccaagcctcaacgaagaactgacatggtctttggtacatctgatatagtcaattgttgttgt</dnaseqindica> |
| External Link(s) |