Os10g0479200
| Gene Name |
Os10g0479200 |
|---|---|
| Description |
Tetratricopeptide-like helical domain containing protein |
| Version |
NM_001071402.2 GI:297610665 GeneID:4348913 |
| Length |
5052 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os10g0479200, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:18437505..18442556 |
| Sequence Coding Region |
18437505..18437889,18438238..18440232,18442480..18442556 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008403:18437505..18442556 source=RiceChromosome10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
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| Coding Sequence |
<cdnaseq>atgcccttccgaccgcgcctcccgctccccctcctcctcctcctcctgcctcacctccggcgccgccgctcctccccccgcccgcccgtgcccgcgtggagaccgctctcgtattatccctcggcggcggccgcggcggcggaggtgacggagtccgaggaggacgcggcggctgttggcagggacacccgagcccctccctccatcggcgggattgcacggggagcgcctagggttggctgcaatggcgggggggctgccgatgacgaggaggtcgagaggaaggcccgcgctgtcgcgcggatcaagctctgccatgagcttctgcgggagaggaggtggcgcgcgatgcgggcagccttggcgcagctggtgactgagcaaggatctgggtctgcagctgctctctgtgacatcttatggaacagattcagagagtgtgattccaacggttgtgtatgggatgctctagcgaacagttatgctagagctcagatggttcatgatgccctttacgttcttagtaaaatgagcagcctaaacatgcaaatctcggtgttcacctatgacagtttattgcacggcttaaggatgacagacgtggcattggagctttttgaagaaatggagtcttgtggtgtctctcccagtgaatattcgcatagtattattattaatggcctctgtaagcaagataaggttggagaagctttatctttccttcaggaagctaggaaggagggaaagtttaaacccttgggaatgacctttaacattcttatgtctgcattgtgtaattgggggtttgttcagtctgcaaaatcatttttatgcctgatgctgaaatatggattagtccctgacaggtataccttttctacccttatacacggtctatgtaaagtaggttcaatggaggaagcattggatcttttcgagagagtgacaaaagaaggaatggaacttgagattgtgacctacaatagccttatcaatgggtaccgattgcttggtttaacaaaagaaattcctaaaatcatccagatgatgagaggccaaggtgttgaacctgatcttgttacatatactatacttattgctggtcactgcgaaagtggtgatgttgaagaaggaatgaaggtaaggaaggatgtcctagaccaaggtttgcagttgaatattgtcacatatagtgtccttctcaatgctctcttcaaaaaaggcatgttctgcgaaattgacaacctactcggcgagatctacaatattggtttggatatggatgttatcgcatattccatccttatccatgggtattgcaagctaggggaaattgaaaaggctcttcaagtatgtaatgcaatgtgcagttctcagagggtaatgccaacatcactgaaccatttttctattcttctaggactttgcaagaaaggattgttagttgaagcaaggtggtatttggaaaatgtagctagaaaatatcagccaactgatgtagtgttctataatgtcgttattgatggttatgcaaaacttggtgatattgtaaatgctgttcgtttgtatgatcagatcactgtagctggtatgcacccaaccattgtcacatgcaattctcttctatatgggtattgtaaaattggggatctgcaacttgccgagagctattttagggctattcagctaagtggacttctaccaacagcagtgacatacactaccttgatggatgcactctctgaagctggagaagttaataccatgctaagtctttttgatgaaatggttgcaaagaggatcaaggcaaatgcagtaacttacagtgtcattgttaaagggctttgtaagcagctcagatttgatgaggctatcaatgttctcaaagatatggatagcaaaggtattaatgctgacccgataacttacaatacccttatacaaggtttctgtgaatcagaaaacgttcagatggctttccacatacatgacatcatgttatgccgtggccttgtgccgacacctgttacttataacttgcttattaatgtgctgtgtttgaagggaaaagttattcaagcagaaatacttttggagtccctcagagaaaatggcattaagttgagaaaatttgcgtacacaacacttatcaaagctcagtgcgcaaaaggaatgcctatcaatgctgttttgttagttggtaagcttctagatgcaggatttgaagcttctattgaagatttcagtgcagcaatcaatcgactttgcaaaagacaatttgccaaagaagcctttatgtttgtcccgattatgctatctgttggtatttacccagatactcaaatatattgtgtgctaggcagagctctgcagaaaaatagaacagggaagacccaggatttggaagctagatggagtataaagtgtgtgcattcatggcatggcgccaaaatgtga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MPFRPRLPLPLLLLLLPHLRRRRSSPRPPVPAWRPLSYYPSAAA AAAEVTESEEDAAAVGRDTRAPPSIGGIARGAPRVGCNGGGAADDEEVERKARAVARI KLCHELLRERRWRAMRAALAQLVTEQGSGSAAALCDILWNRFRECDSNGCVWDALANS YARAQMVHDALYVLSKMSSLNMQISVFTYDSLLHGLRMTDVALELFEEMESCGVSPSE YSHSIIINGLCKQDKVGEALSFLQEARKEGKFKPLGMTFNILMSALCNWGFVQSAKSF LCLMLKYGLVPDRYTFSTLIHGLCKVGSMEEALDLFERVTKEGMELEIVTYNSLINGY RLLGLTKEIPKIIQMMRGQGVEPDLVTYTILIAGHCESGDVEEGMKVRKDVLDQGLQL NIVTYSVLLNALFKKGMFCEIDNLLGEIYNIGLDMDVIAYSILIHGYCKLGEIEKALQ VCNAMCSSQRVMPTSLNHFSILLGLCKKGLLVEARWYLENVARKYQPTDVVFYNVVID GYAKLGDIVNAVRLYDQITVAGMHPTIVTCNSLLYGYCKIGDLQLAESYFRAIQLSGL LPTAVTYTTLMDALSEAGEVNTMLSLFDEMVAKRIKANAVTYSVIVKGLCKQLRFDEA INVLKDMDSKGINADPITYNTLIQGFCESENVQMAFHIHDIMLCRGLVPTPVTYNLLI NVLCLKGKVIQAEILLESLRENGIKLRKFAYTTLIKAQCAKGMPINAVLLVGKLLDAG FEASIEDFSAAINRLCKRQFAKEAFMFVPIMLSVGIYPDTQIYCVLGRALQKNRTGKT QDLEARWSIKCVHSWHGAKM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..385#734..2728#4976..5052#atgcccttccgaccgcgcctcccgctccccctcctcctcctcctcctgcctcacctccggcgccgccgctcctccccccgcccgcccgtgcccgcgtggagaccgctctcgtattatccctcggcggcggccgcggcggcggaggtgacggagtccgaggaggacgcggcggctgttggcagggacacccgagcccctccctccatcggcgggattgcacggggagcgcctagggttggctgcaatggcgggggggctgccgatgacgaggaggtcgagaggaaggcccgcgctgtcgcgcggatcaagctctgccatgagcttctgcgggagaggaggtggcgcgcgatgcgggcagccttggcgcagctggtgactgagcaaggtgagcatgctatgaattttccccattctgattatcaactctactcatgtggtatctgaataactatggtgattggtgtgaggaggcgtaggaatggcatcggtagttttgaacttctgatcgatatgaatgtgtgacacaggatatattgtttttccagaggcattatcaattgatcattaccatataaaaaacagtaagaaaagggtcgaaagcaatgcatacatagttgtatttggtgtagtattattactgtaattcgttttttactagaaggtctctgcaagtatgacaaactagtaacataaaaattgttcgcgtttaatcttattgcgcttcctgctgtaggatctgggtctgcagctgctctctgtgacatcttatggaacagattcagagagtgtgattccaacggttgtgtatgggatgctctagcgaacagttatgctagagctcagatggttcatgatgccctttacgttcttagtaaaatgagcagcctaaacatgcaaatctcggtgttcacctatgacagtttattgcacggcttaaggatgacagacgtggcattggagctttttgaagaaatggagtcttgtggtgtctctcccagtgaatattcgcatagtattattattaatggcctctgtaagcaagataaggttggagaagctttatctttccttcaggaagctaggaaggagggaaagtttaaacccttgggaatgacctttaacattcttatgtctgcattgtgtaattgggggtttgttcagtctgcaaaatcatttttatgcctgatgctgaaatatggattagtccctgacaggtataccttttctacccttatacacggtctatgtaaagtaggttcaatggaggaagcattggatcttttcgagagagtgacaaaagaaggaatggaacttgagattgtgacctacaatagccttatcaatgggtaccgattgcttggtttaacaaaagaaattcctaaaatcatccagatgatgagaggccaaggtgttgaacctgatcttgttacatatactatacttattgctggtcactgcgaaagtggtgatgttgaagaaggaatgaaggtaaggaaggatgtcctagaccaaggtttgcagttgaatattgtcacatatagtgtccttctcaatgctctcttcaaaaaaggcatgttctgcgaaattgacaacctactcggcgagatctacaatattggtttggatatggatgttatcgcatattccatccttatccatgggtattgcaagctaggggaaattgaaaaggctcttcaagtatgtaatgcaatgtgcagttctcagagggtaatgccaacatcactgaaccatttttctattcttctaggactttgcaagaaaggattgttagttgaagcaaggtggtatttggaaaatgtagctagaaaatatcagccaactgatgtagtgttctataatgtcgttattgatggttatgcaaaacttggtgatattgtaaatgctgttcgtttgtatgatcagatcactgtagctggtatgcacccaaccattgtcacatgcaattctcttctatatgggtattgtaaaattggggatctgcaacttgccgagagctattttagggctattcagctaagtggacttctaccaacagcagtgacatacactaccttgatggatgcactctctgaagctggagaagttaataccatgctaagtctttttgatgaaatggttgcaaagaggatcaaggcaaatgcagtaacttacagtgtcattgttaaagggctttgtaagcagctcagatttgatgaggctatcaatgttctcaaagatatggatagcaaaggtattaatgctgacccgataacttacaatacccttatacaaggtttctgtgaatcagaaaacgttcagatggctttccacatacatgacatcatgttatgccgtggccttgtgccgacacctgttacttataacttgcttattaatgtgctgtgtttgaagggaaaagttattcaagcagaaatacttttggagtccctcagagaaaatggcattaagttgagaaaatttgcgtacacaacacttatcaaagctcagtgcgcaaaaggaatgcctatcaatgctgttttgttagttggtaagcttctagatgcaggatttgaagcttctattgaagatttcagtgcagcaatcaatcgactttgcaaaagacaatttgccaaagaagcctttatgtttgtcccgattatgctatctgttggtatttacccagatactcaaatatattgtgtgctaggcagagctctgcagaaaaatagtgagcttgtctatctacccatattaaatgcacttgctgttaaaactggtatttaataccttgagcatgtgagtgcgactgtgttatcacttttacttatagtgtacattacattgaataactaattcatactttaccttttggttgatgtttggtgttgtacaggttttataggcactatgcccttgactccttgtgtctcgataatcgacaattgaggacaatattggcccagggaatcacaggatccatatgttgtgccaaagagtaagattaaatcaactcttttatattaaatcactttataagaatatctgaatcaagaattttaagagctcaagactatatttaaaattctgtttctcctcttttggcagtgcccggactgagcgcatgtcatttggtgatctttttagctgaatctgcaatggtgaatatttcttaggtaactggagtctgaccattcagtcattgtagtgttttgtttaaaagataaccatgtagttgttatatcttttgaattttgctaagttttgttggtttctccactattggaacttggttgttgcgtttttcatccctgtttgcatgcttatatcaatatatttaaagtacatgtttaggaggatatttaaaatatccaaagcaggtgggccctggatacagacaagtacttatttgctcttgcccaatcaacaaaacatatgtgtgaaatggcttgttttgttcaaagcacttaatgtggcttggtcattctttaaaccataaatcatggaatttgtgcaaccgtgaagccgtgcactcactgttttggagatccaagaatactattttgcttactctaggtgtatgtcaaatagatttgttcttgtttcatctgagtttcatgattgttgcttggtaggattgctacaatttcttggtgatgaagacttgttttataaataccatcaacattactatacaaaagctcagttggttcattgtctatatctaaactcacaactcaatatctaagatcctgtcatatcttgtcataaataagctccatattcttgtttggctattataatgtgtacagacaacaaaatttcatttatgtgttcttgcaatcaaaagaatgatgaaataatgctaggtgtgtcactttgtgtcttgtcattttattctcactcagagtcgaatatatgtccactatggcactgtcagtaagcagagtttaggagtcctgtcatgctttctgaagaatgctttgttctctcattcttagatccatcaatgaggcagataggcagatggcattaaggtgagccatcaccatcagccatccgtggctcgtcggtggatggagcaacaaagcaatcaagaaagtaacatgaatgtcattagtagttgcagagaggccatgtaaccaaaattaagtgtcactcggtgctgactggaggtacggattcgttaactgtttcaatctatcgtgtgctggtataacattgagaaaatgacttgcccatggtacaggtcatggaatgtgaaattccaacgtatcaacagagatgccaccccaattgaacttcatccatgtaacgacgaatttttggtcattgaagggtcactgtgtgggcatcactgaaaaccaagttgatcagaggggatccatgaagcatgaaaacctcctacttgtcggatggaagaggacaaggatgaggctagccatcccactctcctactgaagagcatcttgtcaggtggcccccaggatctctagtctaagccccaaagatctcttctaccaagctagcatctcctgagatctctgttagtatctgttgtatgaccgaaagccacaacttcagggcttggtggaatggtagatgaccacccttgttctgttgttttttgtccttcatgtgctttagtcattgtccatcctgggattccagcgtttccctctttatgtagtttgtctaacatgcatttcacagttacacgtttgtaatcagatcatgaatatttagtcagaaacaatagcactttgtattaagatgtacagcattcatgatgtagccaactgcatgtatatatccaggtgaatagacaacagatcaggtttgccgtcaatccttaagagagatgacactgtgtctttacttgagaacattgtaaacctggtcaccacttttgtgattctttagctgagtgaattgatgtcacttacagtctgcaccccaac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