Os03g0752800

From RiceWiki
Revision as of 19:43, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

Os03g0752800

Description

MADS14 protein

Version

NM_001057835.1 GI:115455398 GeneID:4334140

Length

9793 bp

Definition

Oryza sativa Japonica Group Os03g0752800, complete gene.

Source

Oryza sativa Japonica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Japonica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:31794912..31804704

Sequence Coding Region

31795239..31795347,31795837..31795955,31796061..31796102,31796313..31796354,31796489..31796588
,31796677..31796741,31798900..31798978,31804233..31804417

Expression

GEO Profiles:Os03g0752800

Genome Context

<gbrowseImage1> name=NC_008396:31794912..31804704 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=NC_008396:31794912..31804704 source=RiceChromosome03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>atggggcggggcaaggtgcagctgaagcggatcgagaacaagatcaaccggcaggtgaccttctccaagcgcaggtcggggctgctcaagaaggcgaatgagatctccgtgctctgcgacgccgaggtcgcgctcatcatcttctccaccaagggcaagctctacgagtacgccaccgactcatgtatggacaaaatccttgaacgttatgagcgctactcctatgcagaaaaggtccttatttcagctgaatctgacactcagggcaactggtgccacgaatataggaaactgaaggctaaggttgagacaatacagaaatgtcaaaagcacctcatgggagaggatcttgaatctttgaatctcaaagagctgcagcagctggagcagcagctggaaaattcgttgaaacatatcagatccagaaagagccaactaatgctcgagtccattaacgagcttcaacggaaggaaaagtcactgcaggaggagaataaggtcctacagaaagaactggtggagaagcagaaagtccagaagcaacaagtgcaatgggaccagacacaacctcaaacaagttcctcatcatcctccttcatgatgagggaagcccttccaacaactaatatcagtaactaccctgcagcagctggcgaaaggatagaggatgtagcagcagggcagccacagcatgttcgcattgggctgccaccatggatgctgagccacatcaacggctaa</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGRGKVQLKRIENKINRQVTFSKRRSGLLKKANEISVLCDAEVA LIIFSTKGKLYEYATDSCMDKILERYERYSYAEKVLISAESDTQGNWCHEYRKLKAKV ETIQKCQKHLMGEDLESLNLKELQQLEQQLENSLKHIRSRKSQLMLESINELQRKEKS LQEENKVLQKELVEKQKVQKQQVQWDQTQPQTSSSSSSFMMREALPTTNISNYPAAAG ERIEDVAAGQPQHVRIGLPPWMLSHING</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>9358..9466#8750..8868#8603..8644#8351..8392#8117..8216#7964..8028#5727..5805#288..472#ctcgatcgatccatccatcgatcgatcggtcccccccatcgcgcgcgacgcattccgccgccgtctcgccgtgtccacgtgatgggggccggggctaggggataggcggatagccagcagccaccaccaccagtagttgccgtgtggggataggtgtggctatagggctagtggtcgtcgctgatagcgaggtgggtagggttaattttggttggaggtagagagagagagagagggagggagggaggaggaggaggaggaggaggaggaggaagaacaggaggaagatggggcggggcaaggtgcagctgaagcggatcgagaacaagatcaaccggcaggtgaccttctccaagcgcaggtcggggctgctcaagaaggcgaatgagatctccgtgctctgcgacgccgaggtcgcgctcatcatcttctccaccaagggcaagctctacgagtacgccaccgactcatggtacgtacgtacgtacgtgtgcttgattaaatttcatcctcatcgcttgtctctaagctttcagttcttttcgcttaatcgagcaatccttgcgctacatgatgtgttcccgtttccgttctgttcgtatcgatcgattgcctttgaattctgtgtgtgattaattcgatctgtcctgattgctcgaattaattttgttgcgtgtgtttcggggttatccccaataatctgtttgaatttctgctgcgattgttgattgcttgccggcgatggaggaggcagcgtgttttgctatttcaggctttgagctgacggcgtgaggtgagatgcgttgcatctgtgcactgtagctacagtgcccgtacgagggtaattttatgctccgctttcgctggagagggcgttgctgctgcgctatttggggaatttttttttggccctgccgatgggtgctgcttgcttggcgacaagctagctttgcacccaaaggggagaggggtgattagctaggaactctagtacgtagatttgatggacctgggattatttggggattaaaatggtcttggcttgtgttcatctaaaattctactgaacttgctgcttgtgttgtgtgtgcctcttctttcttcactattccccatattaattctgggctcgtttagatcttctttctctctccctggccatctctttctcttgaggcaactaagcatattaagggagaagatgaaacgggatgcatcgggagatggaggagttcatatcttaagctgctggtgacttgttggaacccttttcgctggttcgtctgcctctagctttcttggactctttgctgatgcatgccatgcttttcagaacgaaaagattttactagaacaaacttataagctagggctggcctttaatctttacttcttaattcccggctgtcattagttcaatctaatggttcattagttgctgggttctacctttcctataaggttctttttgagatgtacatggtttctgaagaaacatccatgcttctagctagcctgattacagactggtttcatgctgcttcttttttatcgaaaagtcaccttgggggagagtttcccacttaactcattcgattttcttagttcagaggggaggtacaaaggttacaacattacatcggaggtctgttaagatgttaagacttagtaagaggtagagaggagttaacaggaaaaaaaagaacttataagctaaaggttcatcctagttagcgctttagttgctgggttctaccttttctgtcaggttcttcttgggatgtgcatatggttcctgaagaaacagacattagaaatttagaactaagaagcaaaacgttggatgcttccagtataccatatcatctgaaggatatttatccttcttgatgttttcgacaatgatttactattaatgcattgttatgcaagctttgttaagtcaacatgcaaatcttagagtttgatggttaattccagttcttatatattttttaagttaaaaattttcttatctctcctttttcctcactacatacgaatagagtttgatctggctgttataaattttcttcagttttgtgggcatccttatatctactaatcagactccccatatgatcagtgattatcagcttatactctattctaattctatgaatgaacgactaattaacttaattaactcctcgctgatttaatccaataagggtagtgtgttgggcatccccataatgctagcaaccacatctctagataagagtcattagtatcacatattttgaaatccttctcactctaaccattgatcagtgagttaagacataggagtagagcttcacgtgaggtaacagtgtttggatttcaaggtatcaagtttggggtgggagtacacgagccgatggattaatctgatttttttttcgtttctcgtacgtcattaaacgtcttatttggaaatcaactccattaggttcctgcagggtactgtagttatgctaattaatccttcttaagacttttccaagatttagctttaaacagatgctttcatgaacctagttgggaaacatgacaaatcctcttcgaactttaattaagatgttactttaattagcatgccttaagctggcatacgtagcggcaaatgcaaccacttacaattcatcacaaggcaatagatcgactggctttcttgttaaagctaagcaagtagttacctactgcgccaataagaatattgagcctactccattggtacgatgggtaatatttataaatgcttgtcgtttaggagtagcaagacactagttctttcatatttgtttgggtgccaatttagaaaactctccgtacttcaaatgtagtaaaatactctcctactgctctttggacgatgaacgtctacacagacaaacagtagtcatatttgaagtgactcgggagatattttaattctttttaactataagcagtagaattgtaaagttggtttcctccatcttaatccaatgcacgaagttcagaactctgctttgattaatagagctcgcagcgacttgcatgctgttttcacaacaagactcttgtagtattgcatctagccgtatatagatgagtcggcaatgagttaactctggctctcactgtctcacacgctattagggttccagacttccagtctacttgattcagaaaaatacaaatattctcttataagttagcccaaaataataaaatggatatatatttgcgggcattaattggtctaactatgctcggaggcctactggtccaactcgcgtaggacatacaaactcataaccgcataatatacctgttcagctatttggttatacagtattgagttgattcctgctgttgactgaactgtagcaacgtctgtatatatccgggactaatgataaattttcagtttggattgcattattcacaatatcttttaagcattaatactgtattaattctcttgacacttcatttttgtaataattttgttaattttccataggttgattaatttcaagttatcctatatacttatatagttcatctccactaagtgtagttaatgatatttctctcctcttattagactacattaccccaattatttctagccattggataatagatatatggttcaaattttctcttctttcttctctcattacaccaagtaatctcaatcatttttaggccttaaactcataagtatcaatttgttttagttttaatattcatatttcatcttatttgtacatattatgcaacttaatttcccgcagcaacgcggcagagtattcatttagttaatgtagacaacccaatatcacatgtgatcttacttgattatcattgattagaccctgtctaggaataagaagcaaatatgttctctttcaacaaagttatgtttgcttaagagtctagggtgttgtatttccccttaattctttctatagatagttatacttgctatcctgtttcatttctttttcttaacgaaaatgagatacagttcagttgcttaagcttttcttgacatgtatgcttgtattacatgtttaccttgactttgccccagaagtataccttctatatatatgcatattatctttccccaaaaggttatacagacccttttgaaaggttgacattttagtatgccgtagaaagtatatatcctttggttataaagtgaacttgttcaaagtgcctcaagaacatggaaatactttagcaaacaatgaagctactccctccatttataattcatttcatattataagttactttgaatttatttcctagtcaaactattttaagttcgactaaatttatagaaaaaaataaaaatatttctaacacaaaataaacattttatcaaatatgttcaatattaaatttaacgaaactaatttggtattgttgatgttgctattttttttctataaattggtcaaatgtaaagatgcttgacttgggaaaaagtcaaaacgacttgtaatatgaaacggatggagtaagacttaataatgtttcagaacttgaaccatatcagtgctaccaccaaaagctgatcattctgatatatgaaaatgtttattgttagctttgcccaaaaaaccgttttcatgaactgcataaatacaacaatttattgtttttttagggttctgtgtgtgggggggtggtgtgttaatccaactcttgtgttagaagtagattggcaaatctattctgtattatatcttacataagttcttataagaataaactgcaaaatgtaggtgttgttatttacaccactacgaagtacccccatttaaattttgaatgtataacaccgttgacttttatacatatgtttgaccgttcgtcttattaaaaaatacgtaattgtcatttattttgttgtgatgtgttttaagcatcaaaggtagtttaagcatgacttttttttacataattgcaaaaaagaatttgaataaaacaaatggcattttattatgggttacgcatttacatgtcataatatccactgtgacatttgagaaacctattcatgttttgaactagagattattagtagttgagggcctttgttagatgctgctagtcctatgattttggttagtacatgtatggcaagtgaaatcgtattgatattatattcccacacaatatgtaagttacttcaacacataaatatataacaatatctagttttgtattacttatatatatatattctcatcatagtgatagtcactaacttacctattaagacattcaaagaaatgggcatccttcagttaggatgttacagtgatacaccttttcgttttgacaatactgcatacgcagtttctaaaacaactccatgttaaaacataaggggttgcactcaagtagattttgaagtgtgtgtgcgcgcctgtgcaactttcttgttcttccttcgttttattttaaacctggaaactaaagtaggtttcctgttaaattcctatcctttcttaaaaaaatggacttcaagaaaaaacagaccagaatcataaatacagtgtatgtatctgacctgtatatgaaaaggtacagccatatgtgcatttgttgttgagatggaagaatatatatactgcttagttattattacaattatttcaaatgatgaaacgtatattcctcatttttcacagtatggacaaaatccttgaacgttatgagcgctactcctatgcagaaaaggtccttatttcagctgaatctgacactcaggtaaaaataaagagctctaattctgttgtttctcatatctcaatatcttgtttattttttgaacttttcactacacctgtttcggttgactcattcaagacgggtacatccaacattttagctctcctcaagttggataaatcaattaggcatcattttttatggcaattttccattgttatgtagatcaacttttaataaatattgctttacatctctttgaacagtaatctcttacttcaatgtacttatcaaatatgtagatttattctaaattagattatatccattttttattacatagcgtcctgaccttttggcatcccagcccaattgaacctatttgctgtctgaaatcttgaaaactcaaactgaactgttctttatattggtgcaattaattaggctctctctctcaggtcagatcattaaaaattgtggtattgttacatttcataagtgaaattttgttcacaaattagatcaaatttatcttccatgtttgtttacacgtatacagctttgccagttccctcttattcaaacattttttacactatgattcaatataccttttgtggattttactggaacaaaatcatagttattgcctaatgaaaaactataaaaaaaattttggatgcatgactacatcaacactcattatggaattttgtgtgccagagaatatcacaaaacatatttttcatcaaataaaacaaaataaacattttccagaacttttggcgtggctcatcagaagtttggaaccttaaataatccttgttttcatttagctgggacttactatagtcaattatgctattaaaaagatccattcgtctatttgttacgaataatctttactctttagttggggttgatggactaatggtgtactccaaaatcagaagttcttttatggctagatacatgtagaccggatttgaaaactttcaagtttagatttgacaaaaactttcaactcgcgattgaaaattttcaagtccacatttgaaaactttcaagtttagatttgaaaactttcgacccagatttgaaaactttcaactcgagatttgaaaactttcaagcctagatttaaaaactttcaagttcagattgaaaaactttcaagttaagatttgaaaattttcagctcaaatatttttgaaaacacgtatcctaacaattaaaaaaatcagaaaaaacacgaaagaatagcgaaaaaaagaaaaaaacgaaaaagatggaaaaaaaggaaacacaaaaaaaaaggaaaaaaatcgcgtgggaccgccagctggcgcgcgcgccagttccgtaactgacttgcgctcgccaattagcatcccccatgtagacatgcatattcttcgtttgcaatattttttgtaagaagttgctgtgtatgaacattgttgactgaactaatgtagttattatgcagacagtggtaagtcatatttccataccataaagagtgagactgagaattttctaatcaagatattacaaaaagctgaactagctaggcagactgtaaccctgttatcattcctagaaatgtttgctactttggagatagtagataatatagttatcacgctgatgaattgtcaaggaaacatacattatagttccctttcctaacatgcactatctgcttagagcttttctctatatagattttggatggcactattgtatactcttcagcacattcaatttctaaacttgtaatattagtgattctgtgcttagaattgtggaggtcactgtacatccaccagtaaatttagtttgatgagtgtcgagaagaaaaggtaagtgtggagtgggggacaaagttaatcatattttactgcaagcacactgaagtaaatccatttattcaatatacactgtacctaagcaattctccacggaggtatcttgcagttctaggtgtccacagttttagctatatgcagtgccaaaatcgattaaagttacacttgttaatatagaaattcaaggtactccaaagggcacaatcatttgcacaatcagttcttcctggcaatttttcaaatatcagctaatgtatgaatagtattgtgatacttcctatttactcaaatttattaatgtaaatcttctatgcttgcttgtatagggcaactggtgccacgaatataggaaactgaaggctaaggttgagacaatacagaaatgtcaaaagtaattggaaactactcacaactggtgccattatgacattatgtactatacactgttgacataaaattgttcgccttaaatcctgcaggcacctcatgggagaggatcttgaatctttgaatctcaaagagctgcagcagctggagcagcagctggaaaattcgttgaaacatatcagatccagaaaggtggtttttgtgatgagaattattcaaggctgatatcaacaatatgtgcaaaatttatatggtttttatacagctaaatatagatgtcctgtatgttttacgagctgacaattacaaatctcctttatgtgcagagccaactaatgctcgagtccattaacgagcttcaacggaaggtaatgatgtcaaccatgttagacctttaattgagtactgggacttgctagaaataaccttgtcaaaactcgagaaatctttggccggccaccagttgataccatcgcgtgttatgtttcatactcttattttaagttcccgccatgcttgcaactgcaagtgctgccacactttcattttctaacatgcacgccggattcttgctgcaggaaaagtcactgcaggaggagaataaggtcctacagaaagaagtaggctgctagccttgatgccccctagtttccatgcttcagctgatcttggtttgtttaacatcaatcaagttaaattgacagaacccttgctccttcctacagctggtggagaagcagaaagtccagaagcaacaagtgcaatgggaccagacacaacctcaaacaagttcctcatcatcctccttcatgatgagggaagcccttccaacaactaatatcaggtaagtaactagcagcctgaagttagtttcgtccttatgtagcacagacgaataaccttttggactaaagatcattagatccagctttattagaaaacaaaattaaatggctcgtttagttcactaccatatcaaaatattgacgatactaaaacctagacaaatattggaagtgctacatttttttgtcaacttatatatgttatcactatattttaatagcaaatcaaacattagctaaaatactattaaaaataccaacaacttaataggggcatattttggcaccaaccaccaaacaactgaaagttctaacaaggttgtataaaccaataactatcaaaccttttttaggcacctcagaattttacgcttttttttgtctgaaaacacgccaaatctgccccttttcccccaaaacgccagcgggctttttcttgtcattttggttggtgatgtagctaagaggtgtgcttattcgttccacagtaactaccctgcagcagctggcgaaaggatagaggatgtagcagcagggcagccacagcatgttcgcattgggctgccaccatggatgctgagccacatcaacggctaaggaggcttcagatccataccagtaatcacaagttgcaacctgacccggtccggtcgcctgctgctctggtttactactagtactattgtcatcttgcggttgcgagacgaggaaagcattttagccctaaattcagcattagtagcaagctgcaatgtgtatattttggcttcgtccagcaccgtcttcctcccaccagtaatttacccatgtaatatatgcgagtagcatgaacaaattttcccgtttccaaccatctccattggtgtcatgtgtgacttaaatagcgaaatttcagcattgtgcatagtgtgattactgtaagat</dnaseqindica>

External Link(s)

NCBI Gene:Os03g0752800, RefSeq:Os03g0752800