Os05g0557700
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Structured Information
| Gene Name |
Os05g0557700 |
|---|---|
| Description |
The start codon is not identified. |
| Version |
NM_001062826.2 GI:297604894 GeneID:4339579 |
| Length |
7625 bp |
| Definition |
Oryza sativa Japonica Group Os05g0557700, complete gene. |
| Source |
Oryza sativa Japonica Group ORGANISM Oryza sativa Japonica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:27821672..27829296 |
| Sequence Coding Region |
27823037..27823285 |
| Expression | |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=NC_008398:27821672..27829296 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=NC_008398:27821672..27829296 source=RiceChromosome05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>tttcttgtacagcagttatatgatgttctttctttctattacacagatggtattcatgttagagtttatgaagaaaggatggacctcctgagggcatgccttgtaggtgcagctggaacaccttatcatgacaatcttttcttctttgatattttctttcctcctgattatcctcatgagccacctgtaagttcttcatttttcattgctcttacctacatcttctattccagattttcttgctgctga</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>FLVQQLYDVLSFYYTDGIHVRVYEERMDLLRACLVGAAGTPYHD NLFFFDIFFPPDYPHEPPVSSSFFIALTYIFYSRFSCC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>6012..6260#gcagcagcagcagcagcagaagcagaagcagtagaagaagaagcttttcttgctttgcttgctttctctctctctaggctccatctcctccctccaccactgcgtctcgaaatatccggctttcttgttgtgcgatttggtgcgaggtggtggtgattgcttcgtcggctgttgatttcttcgaggaattggagctgtgttgggggattcaggggggcttcatggtcgaagggctcggggatggattgaggcgtgggagaagaggagcttagcttcctcttcttcttcggtgatcgggtttggggttcttggaatcgcgaggaggcgggacatggcgggagattgggcttgtcacagactcaggtatggattgcattctcctctcgaatttggtttctttccggctgccctccgcgcagcccctgccccggcgaggctggccggcggcgactgccaccccgccgccggtgatgtgcgtgcaagaattgcgcttcaatggcgaatttccttgtgttgtctcgattttgaccatcacgtttacatggttaaaaatggtagtagtctttagaaaaaatggaagattcaggtgttcatcgttagctcttgatagcaatgcgtctgatttttttttctttttttgggtcagtctttgagacttaggattgttggattgggggagatttgtcatatatgagtactttgtgggtgctacgaattgttttcgcgccattttttcttctggtttttgggagagcgtgattagcacggaaggtagtttgttggatttgattagttacgtcggaaaggttaaatattagctgcttatgtcgactacgatgttgaaatgtctgagatttttctgtactgttgtttcaatcaagaaggcacccaaactggcaattccaagtaaaaaaaaactatgttttataacctactaggttcgtctaatttatgcatgattgatcatttcttgcgttaataatatgggcatgattttctgttgatgttttgttttcgctcgtatgttaatcctttagatatggactttcagatgtttccttgtagtattagttttgatttgacccctatctgtatgtggtcttttaatagtaaaatctaaccatataaatgtgcagatatttggagtaaaattcttctatttacatttctttcaacgactgttatctgaatttttttgcgtgcagtttgattttatactctcttttgcaagtaacgttaataatttttttaatcttaatagttttttgtgtcagtttaaagccttaagctggtttgtaagtaccaatgatttagaattttagatacttttactttcgattgactgttacgtagcaggatcatactgcagaatgctcatctgtgagctttctataggctctttactctctcttttaacatctgctatgctgtattgcaaactagctattcattatgtttcctgaataatgaaaatgtgtgtctgccggtctgcccctgtttggataagaaaatttcaagtactggcatataaaggaaaatggactatttcaggcaaatattcatttttgcttgttatgagacttatattattttactttagatacctttactatcaacaagtggtggttgattcatatcctacccttttttgtgtgtagagctgtaaatgcttaaccatgagcattgtagtatgtacatgagttagttccttgtagaactcaaattatcgtcaaatcatcatactaaagtatccgtacaagattcattgtacaaaacctttttttttggtaaaatttttttcgataatgttttggtaaaatttgcatcctatcaacaagcaacatgaaaccatgcatatacatatatgtagagttgtaaatgatcctttttttttatatcctcaaaaagaccaaaacgcacgcatatgtccagcacaaacatttgtagcaacatataaatctttatgaggttgatctttgtgcctaataatgccttttgatgagagtgttctctaaagcatctaagatactaatatttttctcaatttggattgtcgtgaccaattggactgaagttctcaccacatgtttgcagggcctgctgatcaatgcaaatagacttgaaagaacattatattctcgtgatcttatcaagtgaagccatatctaatgaaagcttgttatatttgttgctttcttgatgagatttgttgcttatgaccacttgtgtcctctaatcatccaaagcaaaaaaaatcattcagccggtctttacctctccaggaattaacacctgtgacaagttattccttgttttagggcaaatctcctttggcaattgcaccttcctgtcgatcgattatcctgagcatattcctcttattgagagaacccttcagctgggcaaatctcctttggcaaaatacctatctatagtctgtctattcgggcaaatctcctttggcatttagcttagattgcttccgggcaaatctcctttggcactacctttagcttcagattgctctttgggcaaatctcctttggcactaggtactctactactatccgcattagatatttggatcaaatatcctctggaagttagtggtattacatcattatttcctgcaactatatatcgtggtaattctcctttggcattagcactgtacacacattggttctaccacaatatcgatctcagtgaaagactgaacaccaggaagtccagaacgattcaaggtaatttgtcctcttttatggtgtatattttttatgtgagccgtcattttctataatatttattcacttacaaaagctttcctattttgactcaattttcagaaataatttttggctggtggccgttgtattttagcatcttggacaggaagctttcagattctgattgttcagtctggaagattgttttgttatttatcaactctatacatcagtgcgcctatcctaagaaggtgagcatgtagttaatagtatatttcctttaaatatttctgtgtctattccattatctaaaaaatatatatttctgtgtctgattccatgtgaaaaatgacaacgtactttgttttagggctcggaaagatggatctatatgcaattgactcggacactgagtcatacgctgaaactagtgacagtgaagaagaccaagaagaatgtgaacttacatactgtggtcatgcccagaacatcttgtccagcttggacgagagcattggaaagatcgataactttctaagttttgaaagaggatttctgcatggagacatagtttgctctgcagctgacccatcaggtcagctgggccgtgtagttggagttgatatgcttgttgacttggaaacgagctctggtgacataataaaacatgtcaacagcaagaaactttcaagagttagatcctttgtctctggtgattgtgtggtgatggggccatggattggacgggtgatcagggcatttgacctggtcactgttgtgttcagtgatggggcaaggtgtgaaatgctcttaagagattctgaggtactgaagcccattcctccaatcctttttgaagatgcaccttatttttactatccaggccaacgtgtgagaattgttcatccttccatttctaagtcgggtacatggttgtgtggatcatggaaagctagtagagatgaaggagtagtgtctcatgtcgacgttgggctggtacatgtgaactggatcacctcagtaacaaatgtttggggaggtcaatcatcaagtcctccaaactttcaggacccaaagaagctcactttgctttcatgcttcccttatgccaattggcagttgggtgactggtgcactctttcggattgcgagggaagtctctgggaaaattctgacaaatcttgcttcatgagtatgacctggaagtccagctccgacactcaaacggctatcggaacttatggttcagattattctcaaacatatgttgttgcaaagacaaagagtagtgttgatgttttatggcaagatggaagtacatctcttggtttagaacctcaaagtttggttcctgtgagtactcttggtgatcatgatttttggcctgggcaatttatccttgagaaattgacagttgaggataatggtagatgccagcggactgggatagtgacaagtgtggatgcacttgaacggactgtaaaggtaaaatgggctgtttcagttgatagtgacactgtcagttatggagatggactcactgaggagactgtgagtgcttatgagctagtattacacccagatttctccttcttcactggcgaagtcattattagatctgctgtcaacatagaaaattctgaagcaaatcttaccaatggaaccgtggcagttagcagggagagcttggatacctcctctgccttcttatcatgtattggcaatgttcttggatacaatgatgaaggacttgaagtccaatgggctagtggtgcgatatctagggtaagcttaactttgagaaactttcttctcttttttttgttgctttgatttattttatttacagaagtgttgctttactttataccagttttatttccaaactttgatgaaacatggatcggtccctggtcagactaatgataacataacttatcttgtacaaatttcaggttcagcattttgaaattattgcattagataggattctagatgattctctagaatccatgatcgaggagcacactactgatgatttggtagacatggctgagcaggagaaaatgcaccttgaggatactaaggtccgcttctgtctacaaattccattgtacggttattaaacttatgggttgaaatttcatcgatgatttatcattttcattcagagtgcgctggaagaatctgctggagactgtacaggatccttgcgcaaagccactgctttcctcttttccaagacagca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