BGIOSGA018822

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA018822

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018822, complete gene.

LocusTag

OsI_18430

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018822-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018822-PA

Length

10195

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:2794015..2804209

Sequence Coding Region

2803868..2804209,2802960..2803001),complement(2802704..2802839,2802132..2802196),complement(2800247..2800441
,2800001..2800180),complement(2798968..2799366,2797680..2797939),complement(2797447..2797582
,2796517..2796606),complement(2796141..2796294,2795294..2795893),complement(2794015..2794682

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:2794015..2804209 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:2794015..2804209 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCTGCCTCGGTGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGCCCCGCCCGCCTCCGTGGGCGGTGACGAGGTCGTCGTCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCGTCGGAGCAGGCCAGGACGCTCATCGGCGCGCTCAACCTGCTCTCACGCAACCTCCCGCTGCCGCCCGCCGTCCTGCACGCCGTCTCGTCCATCTACCACGGCGGCGACGCGTGGGAGGGGGAAGGGGAGGAGGGGGGTGAAGAGGAGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCTGTCGGGGATGGATGCGGCGAGAGCGGGGAGGGGGAGGAGGACCGCGCGGATGCTTCTCCCGGTGCGGATGAGGGTTGTAGTTTCAAAGCACCATATTGTCACTGCGATGATTGGGGAGTCACCTTGATTCAAGAGCTTGAAGATGCTGTATTGAAGAATCAAGGACCGTATATGTCATACTCAGAGTTGACTGCTTTAAAAGAAGACCGCTTCAACACTTCCATTCAGCATAGGCTGACTGAACTTGAAGGATTACCATCTACTAGGGGTGAAGATTTGCAAATGAAGTGTTTGCTTGAATTGTACGGGCTTAAGCTATTAGACTTGCAGAAGAAAGTAAGGACTGATATCAGTGCAGAATACTGGCTACACAAAAAATGTGCACACCCTGATAGGCAATTGTTTGACTGGGGGATGATGCGTATACGGTATCCTTTTACCATGTATGGAATTGGAGATAGTTTTTCAATGGATGCTGATGATATCAACCGCAAAAAGAGATTCTCAGAGGACTCCCTTTTTGGTATTTGGGAACAACAGAGGATCTCAAGACTTGAAGAGGAGGAAAAGAACCAGGCAGAGATCAGGAAGAGGAAATTTTTTTCAGAAATTCTTAATGCTGCTAGGGAGTATCAGCTACAAGTACCGGCTTCCTACAAACGAAAAAAACAGCGCAATGATGGAGTTCTGGCATGGCATGTTCGTGCACGTCAACGTATAAATCGCATGGAAAAGAGTAGATTACAAGTTTTGAAGGCTGGTGACCAAGAAGCTTATTTGCGTATGGTTGAGGAGAGCAAGAACGAGCGCCTGAAACTGCTCCTTGGAAAAACAAATGAGCTTCTTGAAGGAATAGGGAAAGCTGTGCAGAGACAAAAAGATGCTGAGCATGTTAGTCGCCCTGATGGATCTGAACTGCCAAAAGGGTCAGAGTCTGATGATTGTTCTCAAATATCAGGCCTCAAGGTTGAATCCCCTGATGAAGAGTCCCCATCAGATGTTGATGCAGACCATCATAGTTCTGCTGATCATAGTAAATTTAATGCTGGCCATAGGCTTGATTCTACCGTCCACTCTATTGAAGAGAAGGTAACGGAACAACCATCAGCTCTTGAAGGTGGGGAGTTAAGACCATATCAATTAGAGGGCCTGCAATGGATGCTTTCTTTATTCAACAATAATTTGAATGGTATTCTGGCTGATGAAATGGGTTTGGGGAAAACAATTCAGACCATAGCTTTGATCGCCTATCTATTGGAGAAGAAGGAGGTTACAGGACCACACTTAATAATAGCACCAAAGGCCGTGTTACCAAATTGGTCTAATGAATTCAAAACTTGGGCTCCTAGCATTGGGACAATTCTGTATGATGGTCGTCCAGATGATAGGAAGGCTCTAAGGGAAAAGAATTTTGGACAACGGCAGTTTAATGTTTTGCTCACGCACTATGACTTGATACTGAAAGATCTGAAGTTCCTGAAGAAGAATTTTGAGGAATGGTTTAATGCACCATTTGCATGTGAAGTCAGCCTTAATGATGAGGAACAGCTGCTAATTATACATCGTTTGCATCAAGTGCTGCGTCCATTTTTGCTGAGGAGGAAGAAAGATGAAGTGGAAAAATATCTTCCTGTGAAAACACAAGTAATACTCAAGTGTGACATGTCTGCTTGGCAAAAAGCATACTATGAACAAGTCACTAGCAATGGAAGGGTTAGTCTAGGATCTGGACTCAAATCAAAGGCTTTGCAAAATCTGTCGATGCAACTTAGAAAATGTTGCAATCATCCCTATCTATTCGTTGAGCATTATAACATGTATCAACGGCAGGAAATTGTTAGATCATCAGGGAAGTTTGAATTGCTTGACCGGCTACTTCCAAAATTGCAGAGAGCTGGTCACAGGGTTCTGCTTTTCTCTCAGATGACAAAACTGCTTGATATCTTAGAAGTATATTTGCAAATATACCAGTTCAAGTACATGAGGCTTGATGGATCTACGAAGACTGAAGAGCGAGGGAGATTATTGGCAGATTTTAACAAGAAGGACTCAGAATATTTCTTGTTTCTTCTCAGCACCCGAGCTGGAGGCCTTGGGTTGAACTTGCAGACTGCAGACACTGTTATTATTTTTGACAGTGACTGGAATCCTCAAATGGATCAGCAGGCTGAAGACCGTGCCCACCGTATTGGACAAAAGAATGAAGTGCGTGTATTCGTTCTTGTTAGTGTTGGCTCAATTGAAGAAGAGATCTTGGACCGTGCAAAACAGAAGATGGGTATTGATGCAAAAGTTATCCAGGCTGGGCTGTTCAACACAACCTCCACAGCTCAGGATAGGCGAGCATTGCTGCAGGAGATCCTGAGGAGAGGAACAAGCTCACTGGGAACTGATATCCCTAGTGAGCGTGAAATAAATCGTTTGGCTGCTCGTAATGATGAAGAATTCTGGTTGTTTGAGAAGATGGATGAAGAAAGGCGGCAAAGAGAAAACTACAAACCGAGGCTCATGGAGGGAATTGAGGTTCCAGACTGGGTGTTTGCCAATGATACTTTAACAGAGAAGATACCTGCAGATGAACCCCAGAATGTTCTGCTAACTACGAAGAGACGCAGGAAAGAGGTTGTCTACTCAGACTCTTTTGGTGATCAGTGGATGAAAGCAGATGATGTAGTTGAAGAGACTCCAAGGATGGCTCCAAGAGCAAAGCGGAGCGCTTATTCGTCTGATGTACAAGAAGTCGATTTCAGTGAGAGGAGGAAAAGGCATAAATCTCTAGTGAACATTTCAGATGATGCCAGCATTCCAATGTGGACACCAGAAAAAGTAAGGGCTGGGGTTTCTTCATATAGCAAGGATGAGAATGAAGACGATGCCGAAGATGAATCCACCACAAGTGGTTTGCAGGGGGGCAGTTTTACATGGAAGACCCTTAGAAGGAAAAGGTCAAGCCACTTCTCCAATTCCTCAGATTCAAAAGGGCGCTCGGCATTCTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAASVEAAAAAAVVAPPASVGGDEVVVGGGGGGASEQARTLIGALNLLSRNLPLPPAVLHAVSSIYHGGDAWEGEGEEGGEEEVAAAAAAVGDGCGESGEGEEDRADASPGADEGCSFKAPYCHCDDWGVTLIQELEDAVLKNQGPYMSYSELTALKEDRFNTSIQHRLTELEGLPSTRGEDLQMKCLLELYGLKLLDLQKKVRTDISAEYWLHKKCAHPDRQLFDWGMMRIRYPFTMYGIGDSFSMDADDINRKKRFSEDSLFGIWEQQRISRLEEEEKNQAEIRKRKFFSEILNAAREYQLQVPASYKRKKQRNDGVLAWHVRARQRINRMEKSRLQVLKAGDQEAYLRMVEESKNERLKLLLGKTNELLEGIGKAVQRQKDAEHVSRPDGSELPKGSESDDCSQISGLKVESPDEESPSDVDADHHSSADHSKFNAGHRLDSTVHSIEEKVTEQPSALEGGELRPYQLEGLQWMLSLFNNNLNGILADEMGLGKTIQTIALIAYLLEKKEVTGPHLIIAPKAVLPNWSNEFKTWAPSIGTILYDGRPDDRKALREKNFGQRQFNVLLTHYDLILKDLKFLKKNFEEWFNAPFACEVSLNDEEQLLIIHRLHQVLRPFLLRRKKDEVEKYLPVKTQVILKCDMSAWQKAYYEQVTSNGRVSLGSGLKSKALQNLSMQLRKCCNHPYLFVEHYNMYQRQEIVRSSGKFELLDRLLPKLQRAGHRVLLFSQMTKLLDILEVYLQIYQFKYMRLDGSTKTEERGRLLADFNKKDSEYFLFLLSTRAGGLGLNLQTADTVIIFDSDWNPQMDQQAEDRAHRIGQKNEVRVFVLVSVGSIEEEILDRAKQKMGIDAKVIQAGLFNTTSTAQDRRALLQEILRRGTSSLGTDIPSEREINRLAARNDEEFWLFEKMDEERRQRENYKPRLMEGIEVPDWVFANDTLTEKIPADEPQNVLLTTKRRRKEVVYSDSFGDQWMKADDVVEETPRMAPRAKRSAYSSDVQEVDFSERRKRHKSLVNISDDASIPMWTPEKVRAGVSSYSKDENEDDAEDESTTSGLQGGSFTWKTLRRKRSSHFSNSSDSKGRSAF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..342#1209..1250#1371..1506#2014..2078#3769..3963#4030..4209#4844..5242#6271..6530#6628..6763#7604..7693#7916..8069#8317..8916#9528..10195#ATGGCTGCCTCGGTGGAGGCGGCGGCGGCGGCGGCGGTGGTGGCCCCGCCCGCCTCCGTGGGCGGTGACGAGGTCGTCGTCGGCGGCGGCGGCGGCGGGGCGTCGGAGCAGGCCAGGACGCTCATCGGCGCGCTCAACCTGCTCTCACGCAACCTCCCGCTGCCGCCCGCCGTCCTGCACGCCGTCTCGTCCATCTACCACGGCGGCGACGCGTGGGAGGGGGAAGGGGAGGAGGGGGGTGAAGAGGAGGTGGCGGCGGCGGCGGCGGCTGTCGGGGATGGATGCGGCGAGAGCGGGGAGGGGGAGGAGGACCGCGCGGATGCTTCTCCCGGTGCGGATGAGGTGCGTGCGCGCCCCTGTGCTTCATCAATTTTGCTGTGCGTTCCCCTTTCGGTTGGGTGTGCTTCGAGTTGCTCGATTAGTGCTAGCTGTTGGATTAGCTAGCATGTTCAGTAGAATTGGCGAGATGTAGTTAGGGTTTCCCGTGCTGCTGGATTCTAGAGTGGTTTACAGTTGGGGAATGTGGGCTGCACTTGTAGAACGCTCCTCCGGTGACATTTTTTGATGAATGTCTATACCTAGTATGGTTTTGGGTTTCATCGGGTGGAGGCATTGCAAGGCATACTTACCTGATTAATCTGGAGCTAGAACTGCTTTGTGGATCGGATGCTTGTTCCACCAAAAAAAAAAAGAGATGTTTAGTGTTTTAGGGATTTCTGATGATGTGGAAACATCATTTTTTTTTATTTTTTACAAATGCATATATGTTTGTGGTGTGTAATATTTTAGATGTCATTAATCATTTTTTTTTACAGTTGGTATGCCACCATGTTTGTGAAGTGTGTACTAGCGTCTAGGATTATATTAGTAAAAGCCTTATTGTCTTTAAGGCCTTGTTCGGTTTGGAGGGGGTTGAAGGGGATTGGAGGGGTTTGAGGGGGAATAATTGCACACCACAATAGGTGTGGAATAAATCCCCTCCAATCCCTCCCTCTTGGGGATTAACCGAACATAGCCTAAACAGGATATAAGTTCCAGAGAACTTGGTTAATACTGGGTCTATACAAGGATTTGCCCTCAGTAGATGTATTTACTTACGTACATTACTTCATATTGTTTTTATGTGATTGAAACAAAATTCTGGTCCAAAAGTTAGATTCATACTATTTGGGCCTTGTTGAGTTGCGTGCTGTTGATTTTGTTGTTAGGGTTGTAGTTTCAAAGCACCATATTGTCACTGCGATGATTGGGTGTGTCATTACCTCTTGTTCTCCTTTTTGGGTTATGGCTGAGGCATAGTGCTTATGAGTAGGCTTTTGAATGGCCTTCTCATTTGCGTTTTAACTGAGAATAAATCGATTGCCTTATAGGGAGTCACCTTGATTCAAGAGCTTGAAGATGCTGTATTGAAGAATCAAGGACCGTATATGTCATACTCAGAGTTGACTGCTTTAAAAGAAGACCGCTTCAACACTTCCATTCAGCATAGGCTGACTGAACTTGAAGGTCTGCTCATACATCACCTATTTTTACTTTCTGATTTATTCTAAGTTAAATTACTTTAACGGCAAGACTCCTCTTTGGTGTTTGTGATTATCCTGCTTTGATTTTCCTGTTCTTACAAAACTGGATGGGTTGGGATGTGTTTTCCCGGCCTACTACGTTTTGGTCTTACGAAGTTCCCAGGCCTGGCCTTGGTGTAAACTGCAAACCTTTTGCTTTTGGGCCTGTAAGCTTGCACTGTGAAAAAGTTGAATTATAACTGGCCTTCTGAAACGGTGCAAAAGCTGATGTTGTTGTGTTTGACTTTTTAAAGTCTATACATGTTTTATTGTCAACAGTTTAGTTTTTTCTGAAACTATTCTTAGCATATATTCCACCAATAGGATGCTGCCTACTAATATTATCATGCATAAGATATTTTTAATATTCAGCCTCTCTAAAACCTGCTTTGTTGTTGACTACTGTATTAGTTATGTACCACCACCAAACTCATTTCTGTTTATGTGCCAGGATTACCATCTACTAGGGGTGAAGATTTGCAAATGAAGTGTTTGCTTGAATTGTACGGGCTTAAGGTAAATGTGATATTAGAAGCAAATGTTACTTTGGAGGCGTTGATGTTTTCTGCTGTTACTGCTTTTCTTAGATGGTGCCTTTTGTGTACAGTGATGTCCCTAGTGGTGTGAAGTATACAAATTAACTTTGTTTGGAAAGCGACATTTGTGCAAACATGCATAATCTATTGCATTTTAGACTTCTAGTACATTTTATGGACGGGCAGATTTCAGACGTTACTACCCAATAATGTACTGCAGTAGTCTTGTCCAGGGAAAAACTGTTCGTCTTTTCTTTTGACTGTACCAAAAAACTTATTGTCTTTAACTAGCAGTTTGCCTACCAAATCTTGATGCATGTGTGAAGAAAACCATAACTGTACTATCCTAGGCAGTTGTTTTAGCTCCTAGAACAGAAACCAAGGAAACTATTGATGTGGCGATGATTACTATGTAAACGTCAGGGGCGCCTAATGGGCGAGGGAGTGTGTGGCACGCAATTTGCGCTCACGTTATCACGCGTAACATGCGTAGCATTAGGTACGAGCCATCTAGGAAGTTTTGATAACTTCCTATATGGGTTTAAATCTTTCCATTAGAAAAATCACTCTACAGATTTTTATTCTGAGAGAAAACTTCCCATAGTTATTATGGATACAAACTTTAATATGGTAAAACTGTCAATAGAGAGAAAAAAATCCAATGATCCATTGGAAAAACTTCCTTTTCTTGAAAATTTTATCTACTCAAAGATTTCTTTTTGAACCAAAATTGATAAAACCTAAAAAGAAGAAAGCTCATGTAGCCCTCTACCTCTAAAGCCCAGCGCTCTGTCAGTGGAATGACCACACATACGTTCGCGTAAACAGATTGTTTTATGCGGAACAGAAAACGGATATCACTCACTGGGAGAACGCTAAAATGGAAAGCGTGAGAACCATTCACACTGAACGCGCTTGCGAATCAGGAGTTCAAATATATATGTGGCCGGTTGAGGAATTCAGGGATGGAGGTGTGAAGCTACATCAACCGCAATGGTGATTTTGCAAATTATCTAATAGGCCCTCTACTCAATAGATAAATAAGCTTCACTACTAAAAATGTTCGAATTGGTGATTGTGATGGTGTGTTCTAAACCACATTCCTCCTCCCCACTCCCTCAGTAGTAACTAGTAAAGATGTTTGACTGCATGCTTTCTAAAATATCATATTTCTGAACGGATAGAATTTGTTCCTAAATTTGGGTCTTGAATGTACATGTAAATAACTCACGCCTTACTGATTTTTTTTATTTAATATGCCTCGGTACTTCTATAAAAAACCACAAAGGATCTCTGTAATTTCTCAACTGTACAATGATTTGCATAAGTAATTAAGTATTGTGCTTTTCCACAAAAACTGCTATGCACCTAGCTAGATCCAACTCCGTTTTGATCAAGGCATTGAAACAATTAATCAGTTGAGTAGTTGGTATGGAGGACGTCTTTAGGCAGGGAGTACTAGTACAATAGTAGTATCATCATATGATCTGTGCACTATCCTTTAGCGAGGTGTTAATTCTATTTTGTTGGACAGTTTGGCTATTTGAAAATTGAAACTATCTAGTGCAAAGCTCAACAAGTGTATGAATTCCATAGGTCTATATCAAGAAGTACGATATTAGAAGTGAGTTATCCTATCAAGCTCGCTGATTATTCATATACTTGTGCAGCTATTAGACTTGCAGAAGAAAGTAAGGACTGATATCAGTGCAGAATACTGGCTACACAAAAAATGTGCACACCCTGATAGGCAATTGTTTGACTGGGGGATGATGCGTATACGGTATCCTTTTACCATGTATGGAATTGGAGATAGTTTTTCAATGGATGCTGATGATATCAACCGCAAAAAGAGATTCTCAGAGGTTTTGTATCATGTATCTTTTGATTATTATATGTTTGGTTAATTTATATACACTTGAATTAATAAGGACTCCCTTTTTGGTATTTGGGAACAACAGAGGATCTCAAGACTTGAAGAGGAGGAAAAGAACCAGGCAGAGATCAGGAAGAGGAAATTTTTTTCAGAAATTCTTAATGCTGCTAGGGAGTATCAGCTACAAGTACCGGCTTCCTACAAACGAAAAAAACAGCGCAATGATGGAGTTCTGGTACGGTCAATATAATTTTCATTAGAGATTAACAGATAGCTTGAGATTGGCCTAATTGGTTCCTTCCCTATGGAGAAACTAACTCACCATATTTTGGACCAATTATTCCCTTTTTTTTGGTTACAAAGACTAGGTTGCACTGGTACCAGTACCTTATGACAGTGTTGTTTGCCAATAGTGCCTATAGGTATAAGAGAAAAGAAACTATTTTTGTTTTACTATGCCTTGGAATAATATTTTATGCCCTATGCCCCTATCTGTAATGGTCTCGCGCCTATAACTTATGATATGCCTTGGAATAATATTTTATGCTGTTGGTGATTATGGAAGATGAGAATTTTGATGGCACACACATTTTGGTGAGAAAACAAGTGAACAATACCTTATGGATGATGACTTAATTGTGTACCCTGCAAAAATAATGAATTAAAGATTGAGTTTTTGTGTGATAGTATGGATCAAGTCTCTATAAAAGATGTTTAAATTCTTGATTCTTGTTTGCTACTTCATCAATACATTATCGAGTTATCATTGTACTGCATTTCCTTTGTTAGAGCATATGTACTTGTTCCTAGATATATTCCTTTTGTGGATTGTTCAAATGTTTGTGACCTTTTTTTTCCTCTAAATGTAGGCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA018822