BGIOSGA019224

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA019224

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA019224, complete gene.

LocusTag

OsI_18547

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA019224-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA019224-PA

Length

13019

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:3650592..3663610

Sequence Coding Region

3650592..3650708,3651564..3651746,3652421..3652518,3652594..3652721,3653179..3653290
,3653718..3653898,3654123..3654305,3654542..3654724,3655471..3655540
,3655822..3655931,3656013..3656317,3656488..3656584,3657032..3657175
,3657627..3657713,3657797..3657883,3657976..3658116,3658215..3658340
,3658576..3658674,3659100..3659167,3659685..3659751,3660123..3660293
,3660369..3660458,3662803..3662876,3663190..3663261,3663331..3663423
,3663544..3663610

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:3650592..3663610 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:3650592..3663610 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGCTGTTAAAGGATGTAGGCAGGCACGGCGGCGACCTCGGGCTGGAGCGCAGGCTAGGGATGCAGGGAGGCACGACTTGCTGCCGGCGGGCTGGCGCTCCTAACCTCTTGCCGGCGAAGGGGAAGGGGGAGTCGGGGATGTTCTTCTCCGGTGACCCGACGGCGAGGAAGCGGGTGGACCTCGGCGGGCGGAGCAGCAAGGAGCGGGACCGGCAGGTGCTGCTCGAGCAGACGCGGGAGGAGCGGCGGCGGCGGCTGGGCCTGCGCCTGCAGAACAGCTCCGCCACGAAGATCCAGAAATGCTTCAGAGGGAAGAGAGATTTGGAATTGGCACGTTCGGAAGTTCGAGGGAACTTTTGCTCTACTTTTGGGGAGCACTGCCAGAGGGTTGATTGGAGCAGTTTCGGTGCTAATTCTGATTTCCTTCGTCAATTCCTGTTCTTCTTCAATGCAAAGAAAGACAGTGATATTGCTATACTCTGTCAAGTCTGCAATTTGCTGTTAGATTATGTCAAACATGGTGGAGATGTTCTAAGACTCTTTGGTGGTACAAATTACTCCTCACTGGAACCTCTTGTGATTCACAGGGTTAAAAAACTTGCACTCATTTGTGTGCAAACTGTACATCAGAAAAGGCATGATTGGGGCAGTCAGCTTTTGATGCCGCCAGAAAGCACACCAAAGCCTTGTGGTTCATTACTCGAAACTGCCGCTTGCTTGATAAATCCTAAGCTTGCATGGAACTGCAAGGTAGTTGGGTATCTTCAGCGGAAGAAGATCTATTGCTTATTTAGGGGGATTATTATATCCATACCGCAAACTGCAAGAAATTTGGAGCATAATAACAATACATCTGCTCTGGAGCAAGTTCTTATGCTTATTGCTTCACATATTGGCGATGATCCGTGTTGTTGTCCAGTAGTGGATCCAAGATGGAGTTTCTCCTCTCAGCTTCTATCGATTCCTTTCCTCTGGCATCGTTTATCACACTTCAAGAAGGTTTTCTCAGCTAATGGACTCAGCAAATATTATATCCATCAGATAGCTTGCTTTTTGCCTAGCTGCGCTGATGTTCTTCCAAATGATATATCATCTAATCATCCAGGTTATGCATGTGTTCTTGCAAATGTTCTTGAAGCTGCAACCTGGATTTTGTCCGAGCCAAAGTTTGCTTCTGAAACAGCGGCTGACATCATTGCAGTCTGTACATCACTGCTGGACGCGTTGCCAACCATTACATCACCTACCGGAAGGGCAGATGACGACGATGACACACCCATGGATGATGTCATTAATGGTCTTGATGCTGATTTGGAAAAACAAATTACTGCAGCAATTGATTCAAGGTTGCTTCAACATTTGGTGAATGCTCTGTTCAGAGGCACAATTAGTACAGACTATTCTTATCCAACTGGACCGTCAGATATTGAGGTGGAAGCTGTAGGATCTATATGTGCTTTTCTTCATGTCACATTCAACACATTGCCTGCAGAGCGGATTATGACTGGCCTGGCCTACCGGACTGAAATAGTTCCTGCACTATGGAACTTCATAAAGCGATGTAATGAGAACCAAAGCTGGCCACAATTTTCCAAGTTTGTCTCTTCTCCGCCTGCAGATGCCGTGGGTTGGCTCCTACCTGTATCTGTATTCTGTCCCATATACAAGCACATGTTGAAGATAATTGATAACGGGGAATTCTATGAACAAGAGAAACCTTTGTCACTTAAAGATTTGAAGTCCTTGGTTTTAATTCTAAAGAAGGCTTTATGGGAACTTCTATGGGTTATTCCTTCACATGCCTCTCCTGCTAAGAAAGTGCTACCCAACCCTTCTGGATTTAAGAAGTTGTCAATTGAGAATGTCAAGATTGGGGCAAGGATTGGGTTATCTGAACTACTTGCACAGTTGCAAGACTGGAATAACAGGCTCCCATTTACTTCTTCCAATGATTTCTATTCACAACAAGCAACTAGTGAAAATTTTGTCTCTCAGGCTCTTCTTGGCAATACTCGAGCATCTGAAATTATAAAGCTGGCTCCCTTTTTAGCACCTTTTACCAGCAGAGTTAAAATATTCACTTCACAATTGGCAAATTCTAGACAATCGACAACATCCCATTCTGCTTTGACAAGACACCGGTTCAAAATAAGAAGAAATCGACTTCTGGAAGACGCTTTTGATCAGCTAAGCATGCTTTCTGAAGAAGACCTTAAAGGACCAATTCGAGTGGTGTTTGTTAATGAGCATGGTGTTGAAGAGGCTGGGATTGACGGAGGTGGAATTTTCAAGGATTTCATGGAAAATATCACTCGAGCCGCTTTTGATGTGCAGTACGGTTTATTCAAGGAGACAGCCGATCATCTTCTCTACCCAAATCCTGGATCTGGATTGGTCCATGAACAGCATCTGCAATACTTCCATTTTCTTGGCAGTCTCCTTGGGAAGGCAATCTATGAGGGCATACTTGTTGATCTGCCATTTGCAACATTCTTCTTGAGTAAACTAAAACACAAGTACAACTTCTTAAATGATCTGCCTTCATTGGATCCAGAATTGTATCGTCATCTTCTGTCTTTAAAGCATTATGATGGTGATATCTCGCAATTGGAGTTATACTTTGTTATTGTGAATAACGAATATGGTGAACAATCTGAAGAAGAACTGCTCCCAGGTGGGAGAGATATGCGTGTAACTAGTGAAAATGTTATTACTTATATCCATCTTGTCGCCAACCATCGGTTGAACTATCAGATCCGCGCCCAAAGCACACATTTTTTGAGAGGCTTTCAACAACTAATACCGAATGAATGGATTAACATGTTCAATGAACATGAATTCCAGGACCATGAGCTTATTGATATATTCTGGGAGGTCCTAAAGAGCTTCAGTTCGCATAATCAGAAAAAGTTTCTCAAGTTCGTGACCGGATGTTCTCGTGGACCACTCCTTGGATTTCAGTACCTCGAACCAAAATTCTGCATTCAGAGGGCTGGTGTTCCTGGCATGGAGGAGGAGGACGAAGACCGCTTGCCTACATCGGCCACTTGCATGAACCTCCTGAAGCTCCCTCCTTATAGAAACAAGACACAATTGGAAAGCAAATTGTTGTACGCGATAAATGCAGAAGCTGGTTTTGATCTAAGTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MALLKDVGRHGGDLGLERRLGMQGGTTCCRRAGAPNLLPAKGKGESGMFFSGDPTARKRVDLGGRSSKERDRQVLLEQTREERRRRLGLRLQNSSATKIQKCFRGKRDLELARSEVRGNFCSTFGEHCQRVDWSSFGANSDFLRQFLFFFNAKKDSDIAILCQVCNLLLDYVKHGGDVLRLFGGTNYSSLEPLVIHRVKKLALICVQTVHQKRHDWGSQLLMPPESTPKPCGSLLETAACLINPKLAWNCKVVGYLQRKKIYCLFRGIIISIPQTARNLEHNNNTSALEQVLMLIASHIGDDPCCCPVVDPRWSFSSQLLSIPFLWHRLSHFKKVFSANGLSKYYIHQIACFLPSCADVLPNDISSNHPGYACVLANVLEAATWILSEPKFASETAADIIAVCTSLLDALPTITSPTGRADDDDDTPMDDVINGLDADLEKQITAAIDSRLLQHLVNALFRGTISTDYSYPTGPSDIEVEAVGSICAFLHVTFNTLPAERIMTGLAYRTEIVPALWNFIKRCNENQSWPQFSKFVSSPPADAVGWLLPVSVFCPIYKHMLKIIDNGEFYEQEKPLSLKDLKSLVLILKKALWELLWVIPSHASPAKKVLPNPSGFKKLSIENVKIGARIGLSELLAQLQDWNNRLPFTSSNDFYSQQATSENFVSQALLGNTRASEIIKLAPFLAPFTSRVKIFTSQLANSRQSTTSHSALTRHRFKIRRNRLLEDAFDQLSMLSEEDLKGPIRVVFVNEHGVEEAGIDGGGIFKDFMENITRAAFDVQYGLFKETADHLLYPNPGSGLVHEQHLQYFHFLGSLLGKAIYEGILVDLPFATFFLSKLKHKYNFLNDLPSLDPELYRHLLSLKHYDGDISQLELYFVIVNNEYGEQSEEELLPGGRDMRVTSENVITYIHLVANHRLNYQIRAQSTHFLRGFQQLIPNEWINMFNEHEFQDHELIDIFWEVLKSFSSHNQKKFLKFVTGCSRGPLLGFQYLEPKFCIQRAGVPGMEEEDEDRLPTSATCMNLLKLPPYRNKTQLESKLLYAINAEAGFDLS</aaseq>

Gene Sequence

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