BGIOSGA018554

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA018554

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018554, complete gene.

LocusTag

OJ1732_H01.8

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA018554-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA018554-PA

Length

13410

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:7924626..7938035

Sequence Coding Region

7936323..7938035,7933655..7933686),complement(7933085..7933148,7932873..7932980),complement(7932572..7932691
,7932381..7932474),complement(7931961..7932160,7931813..7931878),complement(7931497..7931730
,7930427..7930485),complement(7930280..7930346,7930054..7930101),complement(7928157..7928486
,7928016..7928084),complement(7927264..7927350,7927105..7927192),complement(7926521..7926642
,7926340..7926444),complement(7926187..7926230,7926022..7926091),complement(7925844..7925947
,7924626..7924779

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:7924626..7938035 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:7924626..7938035 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGACCCCGCCCCCCGACCCCGTCTCGCCTCCGCCGCCCGCCGCCGACGAGGGCTCGCCGGGAGGCGACGACGGGGCGGAGGACGCGGGGGGGTTCAGCGCCGGGCTGGATTCGCTGTGGACGGCCCTGTTCGGCTCCCCGGAGGAGCTGGAGCCCATGTGGTCCCCGCCGAGGGGGTTCGGCGTGGGGGCCGAGTTCGCCGCGGCGGAGGTGGAGCCCGAGATCATGGACGTCGCGGGGGGCCCATGGGACGGCGCGCCCTGGAGGTCCTCCGGGGTCGTCGCCGGCGAGGGCGCGGCCACCGCGCTCGTTCCCCCCACGGCCGCCGCGGGGTTCGCGGAGTTCGAGCCCGCGGCGCCGATCGATTCGTATCCGGCGGGGGCGGCGGCGGCTTCGTTGGGCGACGTTCCTGAGGTGAGTGCGCTCGATTCCGGCGTTGATTGTTCGCCTGACCCGCCGCCATCGTCGTCTCCTCCGGTGGATTTTGATGCGCGGGGGTTTGACCCCGTCGCCGACTCCGCCCCGGCGATGGAGTCTCCACTACCGCCGTCTGTCGCTTCCTCGGAAGCCAATTTAGACGGGAGAATGCTCGATTGTACGCTCAACTCCGTGCCATCGCCACCTCTTGCTTCCCCATATGAGGTCGGTTTGGGGGCTGAGGATCCTATCAAGGATTCTTCCCCTTCGGTTGCTTGGGGAACAACCATGGATGCGAAGGATCCCGAGGTGGATGCTACTTGTGCAAATGGTACAGCTCTGCGGAGATCACGGAGGATCATGAAAATCAAGTCAGCGGCGAGCTCCATGCCTTTGAATCAGAATGGAGACTCATCTAGAGCTTCCAAGCGACGAGTTGCGGATTCAAGGAAGAGTAGAAGCAGTGAAGGGAGCAAACTCCCTGCGTTCACGGGGCCAATTTCAGTAAACACAGTTGATTTGATTAACGGGGTGAAGGTTCAAGGATTGCAAGAAATTGTTGCCGTGGAAAACGTAAGTTCCTCTTACGACAATAATCAGAAAGCAGGTGGTCTCTACAATCAGGTTGTGGTGGCTTTACCAGCAGCGAGTAATAGTTTGTTGAAAGACAAAGGAGCTTCTGTTCTTCCTCGAAGGAAGACTAGGTTAGCCTCAAAGGTATTGGTGAATTCAGACAGGGTGTCAGCTATATCACCAGTGGTAAATGGTGGACCTCCTGTGCAGAAATCAGATGTTTGTATACCTACTAAAAAGCATAAGCTTGCTGTTGAAGAGTGCTTGACAAGTCTGGATGGAGTGGATGGTGGTGGTATTGTGTTGTGCAACTCAAAGTTGAAAAGTGCAAAATCACGAGTGGTCAGCAAGACGCCTCAAGGGAGAGGAAGAAGATCCCCTCAACCTCCAAAGACACAGAGGGCCAGGACGTTGTCGGTTAAATACTTGGAAAAATTAAAGAGGGCAGAAAACAATAATAATAATGGCTCAATGTCCAAATCACCAAGAGTTCCAATGATACCAGAAAATAATGGCTCAATGTCCAAATCACCAAGAGTTCCAATAATACCAGAACTGAGCACTAAGCACGAACTTGTTTTGGACAAGCACATGGTTGATTCAGTGATGTTGGAAACGGACGATGGTTCCTGTTTCTTTGTGGGGGATGCAGTTCCTGATGATGAGGCTAGGAAGCAGTGGCCTCACCGTTACGAAATAAATGATCAAATCATGAAAAAGGATAAGAGGACCAGCAGCCAAACATTTGCCAAACTAGTTACCGTATCTTTTTGTGGAGTCTTTATGTATGTTTATCTACAGATGCTTGATTTCAGGGGTCCAGAGGGAAAACCAAATTATATTGGCAGGTTGCTAGAGTTCTTCGAAACAAAAACTGGTGAATGTTACTTCAGAGTGCAATGGTTTTTCACAGCTGAAGACACGGTCATAGGAGAGCAAGCACAATCACATGACCCGAGGAGGCTCTTTTACTCAGACCTGACAGATGACAATTTACTGGACTGCATTGTCTCGAAAGTGACAATCGTGCAAGTTCCTCCTAGTGTAGATGGAAAATCAAAGTCAGTTCCTTCGTCCGACTATTACTATGACATGAAATACTCTATCGACTATAGTACATTCTCTACCATAGAAATGGAAGACACAGATGATTTAATGCAGTCATGTTACACTAGTAGAATCAATGACAAAATGAAGAAGATAGATGTCAATAAGAAGCACAAGTCTCCTGTGCTAGAGAAGATGGAGCTCTCTTTGCTAGACCTGTATTGTGGTTGTGGAGGAATGTCAACTGGACTATGCCTTGGTGCTCGTGGTGGTGGTGTGAATCTTTCAGCGAGATGGGCCATTGATGATGATGAAATTGCATGTGAAAGCTTCAGGAACAATCATCCAGAAACACGGGTTCGGAATGAAACCACGGATGATTTCCTTGAACTGTTAAAAGAATGGGAGAAATTATGCAAAACATATGTGAAACATAGTAGGACTAAGGCATGTGTTGACAGTACAACAGAATCCAATAATGAAACTCCAGATTGTTCTACCGTCCCACCTGAGGAGTTTGAAGTATGGAAGCTAGTTGACATTTGCTTTGGTGATCCAAATAAAGTCAGCAAACACGGCTTGTATTTTAAGGTCCGTTGGAAGGGTTATGGCCCTCATCATGACACATGGGAGCCAGTTGAAGGATTAAGGAACTGCAAAGAGGCAATTAGGGATTTTGTTATTGAAGGCCACAGGCAAAGAATACTACCACGCCCTCGAAGAAACATAGCTGTGTTCTTGCTTCGACCATCGAAGTTCCCTCTGGGTGATGTGGACGTTGTATGTGGGGGTCCACCATGCCAAGGAATTAGTGGCTACAACCGCAATAGAGAATTCGAGGCACCATTTAAATGTGAGAAAAACAAGCAGATCATAGTTTTTATGGATGTTGTGCAATTTTTGAAGCCCAAATATGTGTACATGGAAAACGTCCTTGATATATTGAAATTTGCTGATGCAACACTTGCAAGATATGCTTTAAGTCGGCTAGTTGCAATGCATTATCAAGCAAGGCTAGGGATCATGGCTGCTGGATGTTATGGCCTTCCACAATTTCGGATGCGTGTATTTTTATTAGGCTGTCATTCTAAGGAGAAATTACCCCCTTTTCCACTGCCTACGCATGAGGCGATTGTGAAGAATGGCTGCCCGTTGGCTTTTGAGCGTAATTTGGTTGGTTGGCCCAATGACACACCAATGCAACTAGCAAGACCAATTGTCCTTGAAGACATTCTTTCTGATCTCCCAGAAGTGGCAAATGGGGAAAGCCGTGATGAAATGCTGTATGTAAAGGGTCCTCAAACTGAATTCCAAAGATACATTCGGTCATTTAATGTTGAAGTGCATGGTCCCAGAGCTCATGTTACAAAAGATTCCAAATCCTCAAAATTGTATGATCATCGACCATTGGTACTGGATAATGATAACTACCAAAGGATATTGCAAATTCCCAAGAGAAAGGGAGCTAATTTTAGAGACCTTTCAGGAGTCATAGTTGGTCCTGACAATGTGGCTAGATTAGATCCAACGAAAGAAAGAGTACTTTTGCCATCTGGTCGTCCTCTGGTGCTTGATTGCATACTAGCTTATGAGAATGGTAAATCTTTAAGACCTTTTGGTCGAGTATGGTGGGATGAGGTAGTGGGAACCGTGCTGACAGTTCCAAATGCCCGTATGCAGGCCTTGATACATCCTGCACAAGACAGACTGCTTACTATTCGTGAAAGTGCTCGGTTGCAAGGCTTTCCTGACAATTACAGGTTTCGTGGAACAGTCAAAGACAGGTATCGCCAGATTGGAAATGCGGTGGCCGTACCTGTTGGACGAGCACTTGGATACGCCCTTGCGATGGCCTACCTGAAGAAGTCTGGAGACGATCCCCTTATGTTGCTGCCGCCCAACTTTGCATTCTCCCATGACTTAAGAGGGTTTGCCTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>METPPPDPVSPPPPAADEGSPGGDDGAEDAGGFSAGLDSLWTALFGSPEELEPMWSPPRGFGVGAEFAAAEVEPEIMDVAGGPWDGAPWRSSGVVAGEGAATALVPPTAAAGFAEFEPAAPIDSYPAGAAAASLGDVPEVSALDSGVDCSPDPPPSSSPPVDFDARGFDPVADSAPAMESPLPPSVASSEANLDGRMLDCTLNSVPSPPLASPYEVGLGAEDPIKDSSPSVAWGTTMDAKDPEVDATCANGTALRRSRRIMKIKSAASSMPLNQNGDSSRASKRRVADSRKSRSSEGSKLPAFTGPISVNTVDLINGVKVQGLQEIVAVENVSSSYDNNQKAGGLYNQVVVALPAASNSLLKDKGASVLPRRKTRLASKVLVNSDRVSAISPVVNGGPPVQKSDVCIPTKKHKLAVEECLTSLDGVDGGGIVLCNSKLKSAKSRVVSKTPQGRGRRSPQPPKTQRARTLSVKYLEKLKRAENNNNNGSMSKSPRVPMIPENNGSMSKSPRVPIIPELSTKHELVLDKHMVDSVMLETDDGSCFFVGDAVPDDEARKQWPHRYEINDQIMKKDKRTSSQTFAKLVTVSFCGVFMYVYLQMLDFRGPEGKPNYIGRLLEFFETKTGECYFRVQWFFTAEDTVIGEQAQSHDPRRLFYSDLTDDNLLDCIVSKVTIVQVPPSVDGKSKSVPSSDYYYDMKYSIDYSTFSTIEMEDTDDLMQSCYTSRINDKMKKIDVNKKHKSPVLEKMELSLLDLYCGCGGMSTGLCLGARGGGVNLSARWAIDDDEIACESFRNNHPETRVRNETTDDFLELLKEWEKLCKTYVKHSRTKACVDSTTESNNETPDCSTVPPEEFEVWKLVDICFGDPNKVSKHGLYFKVRWKGYGPHHDTWEPVEGLRNCKEAIRDFVIEGHRQRILPRPRRNIAVFLLRPSKFPLGDVDVVCGGPPCQGISGYNRNREFEAPFKCEKNKQIIVFMDVVQFLKPKYVYMENVLDILKFADATLARYALSRLVAMHYQARLGIMAAGCYGLPQFRMRVFLLGCHSKEKLPPFPLPTHEAIVKNGCPLAFERNLVGWPNDTPMQLARPIVLEDILSDLPEVANGESRDEMLYVKGPQTEFQRYIRSFNVEVHGPRAHVTKDSKSSKLYDHRPLVLDNDNYQRILQIPKRKGANFRDLSGVIVGPDNVARLDPTKERVLLPSGRPLVLDCILAYENGKSLRPFGRVWWDEVVGTVLTVPNARMQALIHPAQDRLLTIRESARLQGFPDNYRFRGTVKDRYRQIGNAVAVPVGRALGYALAMAYLKKSGDDPLMLLPPNFAFSHDLRGFA</aaseq>

Gene Sequence

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