BGIOSGA018256
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA018256 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA018256, complete gene. |
| LocusTag |
B1036C05.8 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA018256-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA018256-PA |
| Length |
11708 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:16950439..16962146 |
| Sequence Coding Region |
16962000..16962146,16960498..16960654,16960295..16960413,16960131..16960205,16959443..16959536 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:16950439..16962146 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:16950439..16962146 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCAAGCAAGTTCGGGCTCGCCGGGGGCATCCCGGAGAGGCGGGTGCGGCCGATCTGGGACGCCGTCGACTCGCGCCAGTACAAGGCTGCGCTCAAGCTCTGCACCGCGCTCCTCGCCAAGCACCCGACCTCCCCTTACGTCCTCGCTCTCAAGGGTCTTATTTTGGAAAGGATGGGAAAGCCTGATGAAGCACTCAGTGTGTGTTTGAATGCCAAGGAGCAGTTGTATTCTGACAACATCTTTCATTTTGATGATCTCACTCTTAGCACCCTGCAGATAGTATTTCAAAGGCTTGAGCGATTGGATCTTGCTACTTCATGCTATGAGTATGCTTGTACAAAGTACCCCAATAACTTGGAGTTAATGATGGGCCTTTTTAATTGCTATGTCAGAGAGTACTCATATGTGAAGCAGCAACATACAGCAATAAAAATGTACAAAACTGTTGGAGAAGAAAGGTTTTTGCTCTGGGCTATTTGCAGTATTCAACTGCAGGTACACTTTAGCATTGGAGGTGAGAAGTTATTACCACTGGCTGAAGCGTTGCTTAAAAAACACATAACTTCTCATAGTTTACATGAGCCAGAAGCACTGGCTCTCTATATTTCAATTCTGGAACAGCAGTCAAAATATGATGCTGCTTTGGAAGTTCTTTCTGGAGACTTGGGGTCTCTTATGGGAAGGGAGGAGGACAAGCTTCGTCTGCAGGGACGGCTTCTTGCTCAAGCATGCAACTACACTGCTGCTTCCGAGATATATCAAAAGATCCTTGAATCTTGTCCTGATGACTGGGAGTCCTTTCTCCATTATTTAGGCTGCTTGCTGGAGCATGATGTGAACTTGCCTAAATCAAGGACAAGTGAACACCCTTCTTCATTACCTGTAGATTCTGCTCTGGCCCTTAAGACTTCTTTAAGCGACGAGCTGGTAGAGTCTCGCCTTGCAAGTGCATTGTCATTCGTGCAAAAGCTACAGGTTAATGACACCAGCGACTGTGTCAGAGGACCTCATTTAGCCAGTATTGAAATTGAACGGCAACGGTGCCGAAGTGGAAACCCAACTGATAGAAAATTCATTGAAGCTTTGATAAATTACTTTCACAGATTTGGTCATTTGTCTTGTGCAGCATCAGATGTTGAGATATACCTCCACATGCTATCAAGTGATGAAACAACTGAATTGTTAGATACAATCTCCAGATCTTTTGATGCATCATCACTTTCAGTAAAAGGACTGGGTTTGGCAATAACCACTTTTAAGTTTCTCACACCTTCAAGTTTATTTAACAATCCAGAACTCCAGCACATTGCAAAAGGAATGGTTGAGGCATTTTATAAAAACTTGCCTCTCTCAAGAGACCTTGATCCTCAAGAAAGCATGCATGGTGAAGAATTGCTATGTATGGCCAGCAGTATTCTTGTGCAGCTATTCTGGCGTACAAGGAACTTAGGATACTTAATTGAAGCAATTCTGGTGCTAGAGTTTGGATTGACTGTTCGCAAGTATGTCTGGCAATACAAAGTTATGCTGGTGCATCTCTACTCTTACCTAGGAGCACTTCCATTAGCACATCGATGGTATGTAACCCTGGAGGTGAAAAACATTCTTCTTGAATCTGCGTCGCATCACATCCTGCCACAGATGTTGAATTCACCTTTACTGCAGCAAACTGCTGATCTTGTTAAGGACTATCTAAAATTTATGGATGATCATTTGAAAGAATCTGCTGATCTTACCTGTCTTGCATATAGACACCGTACTTACTCAAAGGTAATTGAATTTGTTCAGTTCAAAGAACGCCTGCAACACTCCATGCAGTATCTTTCTGTAAGATCTGATTCCATAATATTGAGTCTGAAGCAGAAGGCTGAGTCTCTTGATGAAGTGGAGTCTATTCTTGAAAATGTGAACCATGGGGCAAGGTTGGTTGAACTATCAAACGAAGACAACGTGAAACGCTTTACTTTTAACGAAGATCTTCAGGCACGCCCTTGGTGGACACCAACAACAAGTGTTAATTTTCTGTCAGAACCATTTGATGAAGGTTCTACACCTGCATGCTTTAGAGCCAAAGCGTGTGAACACAAATCTACTGAGAAGGATGACTCAAAGATAAAATATGCTGAGAGAAAAGCTCTTCTTCCTCGTCTTGTTTATCTTTCGATGCATGGTTGTGCATCTTCCCTCAGGGAGACTCAACTCAATGGATCTGGTTTGGATACTGATGCCACAGAGATGAAACCATTACTTTTGAAATATGCTAGGAGTATTGGATATTCCATTGATGATGCCCTTAGTGTGATTCTGGGTATGTCATCTGGCAAGAAGTCTGTCAAGGATTTTACCCCTGATATAGTCAGTTGGATGAGCTTTGCTGTATTTATCAATGCATGGAACTTGTGGTCTAATGAATCGGTAGTCCCCAGAGCTGATGAGAGCAGCCCAAGTTCCTGGCAAATTGTGGATAGCTTGGTAAAAATTTGCGTAGAGGAGCAGCTGATTGATGCCAACCGAATCCTAACTTCTCCTGGCAATAACATACCAGTCCTAGTGCAGATGATTACAGAACCCATTTCTTGGCATCTCGTGGTTATTCAGTCTTGTGTGAGGTCGATGGCTCCACAGGGAAAGAAGAAAAAGAAGGGTGGTCCATCGGAGCGACCAAATGTACCTCGGTTGCAGGCGATTCAAAGATCTGTGCAGTGCATGATCGACACACTCCGCAGTGTTCAATCCTGGTTATCTGACCAGATGAGGCCGGAGGAGCAAGCTTTGGATATTTTGTTGTCATATTTGCAAGGAGGTAATGAGGATGGGCCAGGACAGATATCCTGTATCTTGGAGGAGAATTCAGCAAGACATAACCCTGAACTCGGCGAACGGATTGCTCAATCTTTGGAAACATGGAGTTCTGCTGGTGTGGTCAGAAGAATCGTTGGAGCAGAGAAGGAGCTGTTAGTTGAGTTAAAGAAAATATGCGACTCAAAACTAAAGCTGCTTGCTTCAGTATCGGCTTCTCTATCATCGGCCTTACATTGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MASKFGLAGGIPERRVRPIWDAVDSRQYKAALKLCTALLAKHPTSPYVLALKGLILERMGKPDEALSVCLNAKEQLYSDNIFHFDDLTLSTLQIVFQRLERLDLATSCYEYACTKYPNNLELMMGLFNCYVREYSYVKQQHTAIKMYKTVGEERFLLWAICSIQLQVHFSIGGEKLLPLAEALLKKHITSHSLHEPEALALYISILEQQSKYDAALEVLSGDLGSLMGREEDKLRLQGRLLAQACNYTAASEIYQKILESCPDDWESFLHYLGCLLEHDVNLPKSRTSEHPSSLPVDSALALKTSLSDELVESRLASALSFVQKLQVNDTSDCVRGPHLASIEIERQRCRSGNPTDRKFIEALINYFHRFGHLSCAASDVEIYLHMLSSDETTELLDTISRSFDASSLSVKGLGLAITTFKFLTPSSLFNNPELQHIAKGMVEAFYKNLPLSRDLDPQESMHGEELLCMASSILVQLFWRTRNLGYLIEAILVLEFGLTVRKYVWQYKVMLVHLYSYLGALPLAHRWYVTLEVKNILLESASHHILPQMLNSPLLQQTADLVKDYLKFMDDHLKESADLTCLAYRHRTYSKVIEFVQFKERLQHSMQYLSVRSDSIILSLKQKAESLDEVESILENVNHGARLVELSNEDNVKRFTFNEDLQARPWWTPTTSVNFLSEPFDEGSTPACFRAKACEHKSTEKDDSKIKYAERKALLPRLVYLSMHGCASSLRETQLNGSGLDTDATEMKPLLLKYARSIGYSIDDALSVILGMSSGKKSVKDFTPDIVSWMSFAVFINAWNLWSNESVVPRADESSPSSWQIVDSLVKICVEEQLIDANRILTSPGNNIPVLVQMITEPISWHLVVIQSCVRSMAPQGKKKKKGGPSERPNVPRLQAIQRSVQCMIDTLRSVQSWLSDQMRPEEQALDILLSYLQGGNEDGPGQISCILEENSARHNPELGERIAQSLETWSSAGVVRRIVGAEKELLVELKKICDSKLKLLASVSASLSSALH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..147#1493..1649#1734..1852#1942..2016#2611..2704#2794..2912#3503..3573#4425..4572#4667..4842#5859..6015#6146..6310#6821..6897#7328..7402#7969..8161#8257..8376#8697..8835#8995..9041#10464..10724#11007..11708#ATGGCAAGCAAGTTCGGGCTCGCCGGGGGCATCCCGGAGAGGCGGGTGCGGCCGATCTGGGACGCCGTCGACTCGCGCCAGTACAAGGCTGCGCTCAAGCTCTGCACCGCGCTCCTCGCCAAGCACCCGACCTCCCCTTACGTCCTCGTGAGTGGACCTCTACCCTCCCCCTCCCTCGCTCGGTTTGTTTCTGGAGTAGCTTTGGTTGCGGTTTTGATGAATCTGGCGCGCCAATGGGCTAGGTCGGTGGTTGTTTAATCAGCAGCCGCGGTCACTGTCGCCGCGCCTGGTTTGTGCTTACATGGTTTATCGGAGTGTTTTTTTTTGGATCAATGGATACCTTACTAGTTTTAGAGATAGTAAGCTGGATGATTAGTTTTGCATTGCATCTGATTTATGGCTAGTTGACCAACTTGCTTGAACTAGTTTTTAACTGCTTGTAAGGACTTATGTTCTCATTTTGCCTACATTACAATTTGGAAGTAGCTGTGTAGTTCATATTTGATTGCATTAGTGTCTGGTTGGGACGAAAATCCAATAGCAGGAGCATGTGAGCAGTCCTATGAAACAAACAGTTTGGATCAACTGAAGAAACCACTGGCATTTTTGAAGCCATAGTAGCTCACATTAATCCTTGATCCAAATTGCATTGCCACAAGGTCTTCAACCCCTTTCTTGGTAGGAAGTTCGCTATCACTTTTTTTCAACCAGGTTGCTGCTTACAAGGTGATGAAAGGATATGATAGGCTAGGACTGGCGTAATAATTCATTTGGTTACGAAGTTAGGATACGTGGTTAAAAAGGTTCATGACCATTGGAAGGAACATGAGATGAACTTGACATGAAACCAGGAGGGTGCAGGCTAGAGGGGCAGGGAGCAGCAGAGTACTGTTAGGACAAGCAGAGTTAATATTTTCTTTGGAGATGTTATTAATTATCTTGTAGGAAATAACAAACAGGTTATTTCTAGTGACTAGTAAGGCAGATTTAATATCTCAAATGGCAGAGATTTCATATTTGGATTAATTCATAAATACCAGACAGCAGGTATTTGGGCTTGAATTTGGTTTATTTCATCATTTTCAAGCTGAGCCTAGCAGCAAACTGAAATTTTATCACAATTTCAAAGCAAATGGCCTATTCCTAGCAGTCGGCAAGGTGTTAGCTTTTGATTTGTGGCAAAAAGTTAATGCATTGTTTTGATAATTCAGAGATGTATAATCAGGCATTGAATGTTTTTTATTCTGACACTATAAATTCTTGATTCACTTTGGATGCTGAGAAACTGACAAATTATCTATTTGGTTTATGTGCCTAATGTAAGTGCCATTGATTTGTTCCCTTCGTGACTGTTATAGATCTGATATGAAAACCTGTCTTCTTTTGTTGCTATGCTTTTGGCCCAAGGGATTAGCTCAGGCTTTTTACAGGATTTTATGCTCGCTGTATAGAGAATGCGATTTAACTGTACTTTTGAATTATCTCATTTCAGGCTCTCAAGGGTCTTATTTTGGAAAGGATGGGAAAGCCTGATGAAGCACTCAGTGTGTGTTTGAATGCCAAGGAGCAGTTGTATTCTGACAACATCTTTCATTTTGATGATCTCACTCTTAGCACCCTGCAGATAGTATTTCAAAGGCTTGAGCGATGTACGTTTGCACTTGGTCTTTTGATTATATCTCCTTAGCATCTTATTTTTTTCCCTGAATTATTTATGCATATGTTTGTACCAGTGGATCTTGCTACTTCATGCTATGAGTATGCTTGTACAAAGTACCCCAATAACTTGGAGTTAATGATGGGCCTTTTTAATTGCTATGTCAGAGAGTACTCATATGTGAAGCAGCAACATGTATGATGATATTTTTCCTGCTAGTTTGTTAATTTTTTTTTGTGCTTTCTTGTTCAATTCTTGACCACCCTGTTTTGTATCTTCTGCAGACAGCAATAAAAATGTACAAAACTGTTGGAGAAGAAAGGTTTTTGCTCTGGGCTATTTGCAGTATTCAACTGCAGGTGGGACATTGTAGTTTGTTATATCTCGACTAATGATGAGATCTGCATCTGCATTTATAGATCCAGTACTGTATAAAGACACTGCTATGCTTTTTATTACGGAAAAAAAGGGAACACTCTAGGTAGAAACAATAATTTCCTTGAATATACGGGTAAAATGATTGTTCTAGATGCATGGCCCAAGCCGCCAAGGAGATGCTCTTCAGGGCAGGTGAGAGGGAGTATAGAGGGAGTGGAGATGGCTATTTGTGCAGGACAGAAATGTATGAGAGAGGGGGAAGGGAGAGATGGAGAGGGAGAGGGAGTTTTTCATCTGGTGCATTACAATTTACACTACCAGAAGTATAGAGATGACAATTCTTGAACATGTTTAGCACCTTGGTACTAACTTATCCCTGCCATGACCCTTGCTATTCATTGAAAAAGACATTGAATTAGAAATCTAGTAGCAGTACTTGCAATGCCGTAGGCCCGTAGCTACTAGCTTGAACAAGTCCATCGAGAATGCGTCTGCTGTATTATTGACCAGGATTATCTTCATTAATCTTCTTTATGTGTTATTGTGCAAGTAACTTATCCTTTTGCCCATGACAGGTACACTTTAGCATTGGAGGTGAGAAGTTATTACCACTGGCTGAAGCGTTGCTTAAAAAACACATAACTTCTCATAGTTTACATGAGCCAGAAGGTATTTTATATTTTTCTGAAGTGCTGCGTTCACCATTTTTTTTTGCATGCATAAATGCTCTCTTTTGACGTAATTTGAACTTCATGCAGCACTGGCTCTCTATATTTCAATTCTGGAACAGCAGTCAAAATATGATGCTGCTTTGGAAGTTCTTTCTGGAGACTTGGGGTCTCTTATGGGAAGGGAGGAGGACAAGCTTCGTCTGCAGGTAACTTACTTTTGTTCTTGTACATATCTGAAATACATATTAATGTTAAGTAGTTCATTACATATGCCTTTCCAAATTCAAAATTCTGTTATATAATTGTATATTAGAACATCTAGAAATTGCAAGTCATTGTAGTTCATGACTGAATTCTGCATTTATGTCATAGTAATATCTGAATTGAATCCTTAGCTTGCTCACTGCTCTTCATGTGCTAAAAATCTACATAAAGTTATCATGAACATGAAGTTAAACTGTTAAAGCAACTAATAAAAAAAGTGGTTTTTAGAACTGATCATGTGCAGCTTACTGCTCTGCTTGCATGGAGAATGTACGGTCTATTTATTTCTTGATAAAGGATAACTACATTGAACATGGGGTTAAAGCTGTTCATTAAAATGTGTTTTTAGCAAATAATTATCCCTTTTGTTTGCGTTGTTGAGTGTTGATTTCCAGAAAAAGTACTATTTGGCCAAGTCAGCTATATCTCCAGCACATTCATATGCTTGTGTAGAAAATACAACTTCAAATTACAATCCTTCGTTTTTTCCCTTCCTACCCACTTACATTATTACCTGACTTCAAGTTGACAGGGACGGCTTCTTGCTCAAGCATGCAACTACACTGCTGCTTCCGAGATATATCAAAAGATCCTTGAATCTTGGTAATGTTTCCATAATTGGCTTTGTACAATTTTCATTTACTCTAGTTCTTTTGATTGGCCATGCATTGTTGCTTAATCATAGTCAATCAATAAATATGTTCTGTGAATTGTAGTAATATATGTATCTCAGGTTCTACCCACAAACACTTGTTGAGATGCACTTTACCAAGTATCAACTATTTGGTTCATAAGTACATGTTTCGATATGCATAATATATTGGTGTCCTGCAAGCTCACCGTAGAAATTCTTATGTAGGGGTTTACACAATTTCATTTATATCATCAGAGTCTTTCGATCTACTGCTGCCTTTTTTCCTTTAAAAATGGTAAACTTTGTTTTTGTACACTAGCCCCTCAGAGCTTTAGAGCCTGATCACTTCAATATATGTTTTACTAGAAAAAATGCCCGTGCGTTGCAATGGGCGAAGGTTATTTTAACCTTGTTATTGTTATACTGTTTAGTTAAGGTGAAATTCACTATTGGAATTCGCTTGGATATATATTTTTCTAGAAAATCACGAGCTGCAATTAGGGTGACCATCTCAAGTTAGCATGTGAGTATTTTAAAGAGATATCTTATACAACTCCTGTATTTCCAAAAGCGAACGAACTGAAAACCCGACTCAAATACAGATTTGTATTTCCAAAATCGAACAAACTTAAAAACTGACTCATACACGGATGACGTACCGAAGTACCAGCAAAAAACATCTTCAATTTTTATAATAGTAGAGATTTGTTCCTCATTCCTCAATTTATTTAAGCATATTTCACCTGTGTTAATCAAACTATGGAAAATTGCTCTTGTGATTAGTTTTTGATAATTGTCCTCTCTTTCTTTGACTGGGCAGTCCTGATGACTGGGAGTCCTTTCTCCATTATTTAGGCTGCTTGCTGGAGCATGATGTGAACTTGCCTAAATCAAGGACAAGTGAACACCCTTCTTCATTACCTGTAGATTCTGCTCTGGCCCTTAAGACTTCTTTAAGCGACGAGCTGGTACTTGCTACACTTAATAATAAGTTTCTTTTAGTATATATTACTTATGTTAGTGATAACATGCATGTTATTTACTGAAATCACTTTTATGCAGGTAGAGTCTCGCCTTGCAAGTGCATTGTCATTCGTGCAAAAGCTACAGGTTAATGACACCAGCGACTGTGTCAGAGGACCTCATTTAGCCAGTATTGAAATTGAACGGCAA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