BGIOSGA017950
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA017950 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA017950, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_20152 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA017950-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA017950-PA |
| Length |
16442 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 5:23258913..23275354 |
| Sequence Coding Region |
23275090..23275354,23274680..23274841,23273157..23273221,23272047..23272120,23271807..23271946 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:23258913..23275354 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:23258913..23275354 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGCCGGAGTTCCCCTCACCTTCTTCCCCCGCCGGCGGCGGTCGGCGCCGCACGCTGAACAACGCCGACAACAAGCCGGATTTGCATGGCACGATGAACGACCCATACTATTACGATTGCCGGATCTTGGTGGATGCCACGCCGGAGAAGTCCAGCCGCAAGAAGAGCACATTCGTGAGGCACTTCTCCTGCACCTCCAGCCACGCCCTCGTCAAGATTGCTGCCGCAATCGTCGATCCGCGTGCCGTTGTACTGCACGGGCGCGAACCGCACGGTGAGCAAGGAGGTGGTGGGGCCACGGGGGAGCGGGGGCACTCCAGGTCGAGGGCGGAGCGAACTGACCCGACCACCACCGCCCCCTTCTTCTCCGGTTCAAACCGGCGGCAAGTCGCCGACCTCTTCCGCCGCCCACCGAGCAGCTTCTCCGATGTTTTTGGGATGCTAATTAGAGACCCTCGGTGCTATGTTTACTCTTGCATAGGATATTTGAAGGGGGAGCTCCAAAATGTATCGTGGTTTCAGTTTCTTCCTGTTGAACCAGATCCAAGTACAGCTTCTGAGAGAAGTTCAAAAGCTGAGCAGAAAGATGCTCTTAACAACATTGTGCTGTCAGCACATCTTCACTTACAGAGTGAAGGTTTCCTAAGTACTTGGACAAATTCCTTTGTTGGTCCATGGGATCCATCCCAAGGAGAGCATAACCCTGTTGTTTCAAATGGTTTATGGGTAGCCCCAGGCAACTTGGAAGAGGTTGCAGCTGCACTCTGTCAGGCCCTAAGAAATTCTTTAGAAAGAACACTACGAGGACTTTCCTATGCAAGATTTGGTGATGTCTTTACAAAATATTACCCCCCTACAAGAAATCAGAACAGCTTTAGGCGAGCACAGCCTACAATAGAATTTGTCTTTGCTGCCACCGAGGAAGCAATCTTTGTGCATGTGATAATATCTGCAAGGTACATGAGGAATCTTTGCAGTGATGATATAGAGAAAGTTCTCACACATTCTCCTCGCTCTGTTGGCGAAGGTCTTCCAGTAATAGTTGCTCCTAGTGGAATGCTGGGTAGGCTTGTTGGTTGTTGTCCAAGTGATCTTGTGAGACAAGTATATTCAAGCAAATTATCGGCAGCTACTTTACCTGGTTTTACTCAACCTACCATGTGCCAATTGAGAGGGCAAAGCTACTATGTTGAAGTTGCCCTTGGTTTTCCAGCTGCCACAACTGACAAAGTTCCTGAATCGGAAAATAATCAAATAAAAAAAGAATTAGATTCAGCGAAGGACCCTCAGTTAAGTGCTGATGAACATCAAAAGCTAGAATCTGCTGATAGTGTTCCAGTTCTCGAAAGGACATTTATATACCCCCCCGAGGCTGTTATGGTACCCATGGTCCATCAGGCATTTGTTCGCTTTTCTAGTAAAAGAATGTGTTCACAGGCCTGTGTGGGAAATTCATCATGGGAAGGATGGCCATTCTGGAACTTTTCTCCATCTTCTTACTTTCGGAACAGCTCTTGCCTTGGATCATCTCGTGGACTTGGAGTGAACTCTAATTTTCTAAGACTAAGGAGACAGAAGAACAGCAATTACAGCAGCATGGCCAGTAGTATCAGTAGTGTTAGTAGCACTTCCAATGGAAGTGAACATGCAGTTGCTGCTGAAGGTGGTGACCTTTCAGCTGATGCAGACTCTATGGCATGCCATCAGTCTGATCTGCCATCCAACATTGCTGGTAGCAAGATGGTATCCAAGCGGCCTCGTTCTGAAATACCAGAAGTTTCTTCTCGTGCTGGTAAAGAATCCGTGGATAACAATCAAGGGGTAAATGGTCAAGGTAGATGTTCTTGGGGCTGGGATGAGGAGGGGGTTGCGATGGACATCAATTTACTAATATCAGAGTTTGGAGATTTTAGTGACTTCTTTCAAGAAGAGGAGTTAGACTTTGGTGAGCCTCCAGGTACTGCTGAATCACATTCTCTGGTGATCCCCGGTCCTGACTGTGGGGATGCCACATTCACAGATAGTCCGTCGACAGCTATGGATATACCTGAACAAAGATTTTCTCCAGTTGGTCTCTCATCTTTGGAGGTATTTAACCACCAAACTGTAGCACCTATTCATGATGTTGTTTCTAAGGTTCAAGAGCCTCAGAAAGATATTGCGTCGCCTACAAGCTCCCAATCAGTTGTGTTATCGTCTGGTAGATCTAGTCATCTGACCAGAGCTGAAGCATTGCTCACTTATGCACCCGAGTATGCAGCTATTGAAATTTCCACCGGTGAGACACCAACATCGTTGTTTACAAATCCTTACCAGCCCAGATCCATAAAACCAGGGAGTTCTAGTTTTAACTCAAGAGTTTATTCATATGATGCTGCACAAAGTTCTCAAATGGAGTCTGGAGAAGACAAGCCTGAGAAGTCTGTTAGACTAGCATCTGGTAATCTTTCACGTGATATTGGTTCAACAAACTTATACACAGTTGTCCAAGTTGGGAAAAAAGAAAGTGACAAAGGATTAAAAAACACTGACATACAATCAGGCAAGGAGGAAGCATCAAGACCTATTTCTGGTGAGACTTCACTTGATTCTTCTGTGGTTTCTCAAAGGAAGAGTGACAGCATGTTTAATGCTGGATACTTCCTACTATCTATGAAGACTGCTCTTGCAACTGAAATGGAATGTATCAAGTTCCAGGCTGCCATGTGTAGAATAAGGCATACACTATTGTCTTTGAGTAGCAAAGCATCTGCTGAGCTAAAAAGTGCATTATCCAGTCTTGTGCATACAGATGTCAGCAACAAGTTAGATCTTGTCCCCAAATATGACATAAAAAGGAAAGAAAATATACCAGCTAGGCTATCTATTGATGTTGATCATGAAGTATATGACAGATCATTAGAAAATGTTGGAGTTTGGAAGCCTGTGGGGACACCTAAAGGGCCAACACATCTAGAGTCTTTTTCTGCTAAAACGTATACTGGTACAAGCCAAGGTCTGCCTGTAAAAAGACAGCCTATTGTGGATCTTCTCAGCGCCATGGCTCTGATAGTTCAACAATCTACTTCGTTTGTTGATATCGCACTTGATATGGATGATGGAGATGGCTCTTTTTTCTGGCTTTCCTTGGATGAACAAAAGAGACGTGGATTCTCTTGTGATCCTTCAATGGTTCATGCTGGCTGCGGCGGAATATTAGGAACGTGCCATTCAAAGGATTGTGCTGGTGTTGATTTAGTTGACCCACTTTCTGCAGAGGTTTCAGACTCATCTGTGATTAGCTTGTTACAGTCTGATATAAAAGCGGCTCTTAAAACTGCCTTTGCCAACATGGACGGTCCATTATTAGTGACTGATTGGTGCAGGGGTCGAAGTAATGCAGCTGAATATGCATCTATGGGAGATGCATACTCTTTTCAGCACCCAACTGGTGATATCCGGGAGTCCTCAAGCAGTATATCCATAGGTGGAGATTCAATGAGCCCACCCCAATCAAGTCATGTTATATCTAATGACCGAGGCACTTCGGAGCTGGAGCACCATAGGGGATATCACCGTGTTAGACCAACCGTTGCTGTCCTCCCTTTGCCTTCTCTGCTTGTCGGTTACCAGGATGATTGGTTAAAGACCTCTGCTAATTGTCTTAGCTTGTGGGAGAAGGCTCCTCTGGAACCTTATGCTTCACCAAAGCCTGTTACTTATTATGCTCTGTGCCCTGATATTGAAATGCTTACTTCTGCGGCCACTGATTTTTTCCTGCAGCTTGGAACAAGGCTCGTTCTCACCGAGTGTCCTGATCAAGTGAAGATTGGAAACGGCCACTCAAGTTCCATCAGTTCAACAAGCGAATATCTTCAAGCTCTTTCAAGAAACTGGACTGTGAAAAGCTTTGTGACATCTCTGACAAGGGTGATAAAGGACATAAAACTAAATTCAAGCATCTTGGCAAATCAGAAAGAAAGCACTAGTGGACCTTGCACTGTAATATATGTAGTCTGTCCATTTCCCGAACCTTCTGCTGTCCTAGAGACACTGGTAGAATGTTCTGTTGCTCTTGGGTCGGTAATGTTATCCCCAGAGAGAGAAAGGAAATCATTCCTATATTCTCAGGTTGCCAAAGCCCTAAACTGCAATGCTTCTGTTGATGAATCATCAGCATCTAATGTTGTGATGCTCTCTGGTTTCAGTATACCTAAGCTTGTCTTGCAGATTGTTACTGTTGAAACTTTATTGAGACTCCATAAGCCAAACAATGAGCTTGCTGTTTTGAAGGACATGGCATTCACTGTGTACAACAAGGCTCGCCGAATTCCAAAGGCCATTAGCACAAGTGACATGTTTCAGTCACCTGCGTACATGGGCAGGTCTCAGTCCACCATGATGCATGCTACATCTCCTGGTCCTACCCTTTGGAAAGAATGTTTAGTTCCTCGAATGTCCGGATCAACTCTCTCTAGAGAAACAGAGTTTGATGCATCCATGAGGTCATCAGTAACATGGGACAACTCATGGCCTGGTCGTGCTGGAGGATTCATGGACCCAAATAAGATCCCAGATGTGTGTGTTCAAGATGACAGGAAGTATGCCTTTGAGCCACTTTTCATACTAGCAGAGCCTGGATCTGTCGATTACAGTAGTGGAATGGAATCTTCAAAATCTGGTGTTGATGCTAGTGGCAGTGGAATTTACAGCTCAATTTCAGGTGGTGGCTCTGATAGTGGAGCAAGTGCAAGTGCTTTACTGGAAGGATCTGATAACGACAATGCTGCAAGTCTTCATTGCTGTTATGGCTGGACTGAGGACTGGCGATGGTTAGTATGTATCTGGACAGATTCTAAGGGAGAGTTGTTGGACAGTTTAATATTTCCTTTTGGTGGTATTAGTAGTCGCCAAGACACGAAAGTTCTCCAAAGCCTTTTCATCCAAATTCTGCAGCACGGTTGCCAAATAATGTCATCTGCACCTGAGTCTAGCAATACAAGACCGAGAGA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|
| Protein Sequence |
<aaseq>MPEFPSPSSPAGGGRRRTLNNADNKPDLHGTMNDPYYYDCRILVDATPEKSSRKKSTFVRHFSCTSSHALVKIAAAIVDPRAVVLHGREPHGEQGGGGATGERGHSRSRAERTDPTTTAPFFSGSNRRQVADLFRRPPSSFSDVFGMLIRDPRCYVYSCIGYLKGELQNVSWFQFLPVEPDPSTASERSSKAEQKDALNNIVLSAHLHLQSEGFLSTWTNSFVGPWDPSQGEHNPVVSNGLWVAPGNLEEVAAALCQALRNSLERTLRGLSYARFGDVFTKYYPPTRNQNSFRRAQPTIEFVFAATEEAIFVHVIISARYMRNLCSDDIEKVLTHSPRSVGEGLPVIVAPSGMLGRLVGCCPSDLVRQVYSSKLSAATLPGFTQPTMCQLRGQSYYVEVALGFPAATTDKVPESENNQIKKELDSAKDPQLSADEHQKLESADSVPVLERTFIYPPEAVMVPMVHQAFVRFSSKRMCSQACVGNSSWEGWPFWNFSPSSYFRNSSCLGSSRGLGVNSNFLRLRRQKNSNYSSMASSISSVSSTSNGSEHAVAAEGGDLSADADSMACHQSDLPSNIAGSKMVSKRPRSEIPEVSSRAGKESVDNNQGVNGQGRCSWGWDEEGVAMDINLLISEFGDFSDFFQEEELDFGEPPGTAESHSLVIPGPDCGDATFTDSPSTAMDIPEQRFSPVGLSSLEVFNHQTVAPIHDVVSKVQEPQKDIASPTSSQSVVLSSGRSSHLTRAEALLTYAPEYAAIEISTGETPTSLFTNPYQPRSIKPGSSSFNSRVYSYDAAQSSQMESGEDKPEKSVRLASGNLSRDIGSTNLYTVVQVGKKESDKGLKNTDIQSGKEEASRPISGETSLDSSVVSQRKSDSMFNAGYFLLSMKTALATEMECIKFQAAMCRIRHTLLSLSSKASAELKSALSSLVHTDVSNKLDLVPKYDIKRKENIPARLSIDVDHEVYDRSLENVGVWKPVGTPKGPTHLESFSAKTYTGTSQGLPVKRQPIVDLLSAMALIVQQSTSFVDIALDMDDGDGSFFWLSLDEQKRRGFSCDPSMVHAGCGGILGTCHSKDCAGVDLVDPLSAEVSDSSVISLLQSDIKAALKTAFANMDGPLLVTDWCRGRSNAAEYASMGDAYSFQHPTGDIRESSSSISIGGDSMSPPQSSHVISNDRGTSELEHHRGYHRVRPTVAVLPLPSLLVGYQDDWLKTSANCLSLWEKAPLEPYASPKPVTYYALCPDIEMLTSAATDFFLQLGTRLVLTECPDQVKIGNGHSSSISSTSEYLQALSRNWTVKSFVTSLTRVIKDIKLNSSILANQKESTSGPCTVIYVVCPFPEPSAVLETLVECSVALGSVMLSPERERKSFLYSQVAKALNCNASVDESSASNVVMLSGFSIPKLVLQIVTVETLLRLHKPNNELAVLKDMAFTVYNKARRIPKAISTSDMFQSPAYMGRSQSTMMHATSPGPTLWKECLVPRMSGSTLSRETEFDASMRSSVTWDNSWPGRAGGFMDPNKIPDVCVQDDRKYAFEPLFILAEPGSVDYSSGMESSKSGVDASGSGIYSSISGGGSDSGASASALLEGSDNDNAASLHCCYGWTEDWRWLVCIWTDSKGELLDSLIFPFGGISSRQDTKVLQSLFIQILQHGCQIMSSAPESSNTRPRDVIITRIGGFLELEIQEWQKAIYSFGGNEVKKWPVQLRRSIPEGIPSNSNGPALQQQDMGLMQDRNMPSSPSPLYSPHAKSSFMKGALGQSGNKKQILVEQAGMDSSKGSLHLVRSISLVAISQDHSLHLTCQADLLTRPTPGEGNQTSSGPSSYLEGFTPVKSIGSMSASYLLVPSPSMRYLSPATLQLPTCLTSESPPLAHLLHSKGTAIPLAMGYVVSKAVPPVRKDSARLANEDRPSVLSVSIIDHYGGSIAAVQEKMSRGSGKQTRNFTQEAAGRDHETEMHNVLEAVAAELHSLSWMTVSPVYMERRSALPSHCDMVLRLRRLLHYADRHLSQSTEKGDVA</aaseq> |
| Gene Sequence |
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