BGIOSGA020481

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA020481

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020481, complete gene.

LocusTag

P0663C08.8

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA020481-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA020481-PA

Length

8263

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 5

Location

Chromosome 5:30853142..30861404

Sequence Coding Region

30853142..30853245,30853575..30853623,30853722..30853781,30853872..30853963,30854476..30854527
,30854668..30854730,30854841..30854890,30855400..30855475,30855903..30856115
,30856222..30856328,30856425..30856533,30856948..30857148,30857232..30857447
,30857746..30857856,30858837..30859112,30859190..30859464,30859899..30860247
,30860453..30860737,30860823..30861404

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome05:30853142..30861404 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome05:30853142..30861404 source=RiceIndica05 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCGTGTGGAACTACGTCGTGACGGCGCACAAGCCCACCAGCGTCACCCACTCCTGCGTTGGCAACTTCACCGGCCCCAACCAGCTCAACCTCATCGTCGCGAAATGCACCCGTATCGAGATCCACTTGCTTACTCCTCAAGGCCTCCAGCCTATGATTGATGTACCTATCTATGGAAGAATCGCCACACTAGAGCTCTTCCGCCCTCATAATGAGACTCAGGACTTCCTTTTCATTGCGACTGAAAGATACAAATTCTGTGTTCTGCAGTGGGATGGAGAAAAATCGGAGCTTCTCACTAGAGCGATGGGAGATGTTTCTGATCGCATTGGTCGCCCTACGGACAATGGACAGATTGGGATCATCGACCCTGACTGTAGACTTATTGGTCTTCACCTCTACGATGGATTATTTAAGGTTATACCGTTTGATAACAAAGGGCAGCTGAAGGAAGCTTTCAATATCAGGCTTGAAGAACTTCAAGTATTGGACATCAAGTTCCTGTATGGCTGTGTTAAACCTACTATAGTTGTCCTCTACCAGGATAACAAAGATGCAAGACATGTTAAGACATATGAAGTTGCATTGAAGGACAAAGACTTTGTTGAGGGTCCTTGGTCGCAGAACAATTTAGACAATGGTGCTGGTCTGTTAATACCTGTACCAGCTCCTCTTGGTGGTGTCATAATTATTGGTGAGGAGACAATAGTTTACTGCAATGCCAACTCTACATTTAGAGCTATACCAATCAAACAGTCAATCATAAGAGCTTATGGACGGGTTGACCCAGACGGTTCGCGCTATTTACTTGGTGATAATGCAGGCATATTGCATTTACTTGTCCTTACCCATGAACGAGAGAGGGTAACCGGTCTGAAAATCGAGTACTTGGGAGAGACTTCAATTGCATCATCAATATCATATCTCGATAATGGTGTTGTCTACGTTGGTTCTCGATTTGGTGATTCACAGCTTGTAAAACTAAATCTCCAAGCTGACCCAAATGGTTCATATGTTGAAGTTCTTGAGCGATATGTGAACCTTGGACCCATCGTGGACTTCTGTGTGGTTGACCTTGACAGGCAGGGTCAGGGTCAGGTTGTCACTTGTTCAGGAGCATTTAAAGATGGTTCCCTTCGGGTGGTTCGGAATGGGATAGGTATCAATGAGCAGGCTTCAGTAGAACTACAAGGGATCAAGGGTTTATGGTCGTTGAAATCTTCCTTCAATGATCCGTATGACATGTACCTAGTTGTGAGCTTTATAAGCGAGACAAGATTCTTGGCTATGAACATGGAAGATGAGTTAGAAGAAACTGAGATAGAAGGCTTTGATGCGCAGACTCAGACTTTGTTTTGTCAAAATGCCATCAATGATCTGCTTATACAGGTTACTGCTAATTCTGTTCGTCTGGTTAGTTGTACCTCTCGGGAGCTAGTGGATCAATGGAATGCACCAGAAGGATTTTCAGTCAATGTTGCATCAGCTAATGCCAGTCAGGTTCTGCTGGCAACAGGTGGTGGCCATCTTGTTTACCTCGAAATTAAGGATTCTAAGCTGGTTGAAGTGAAACATATACAGTTAGAACATGAGATCTCCTGTGTTGATTTGAATCCAATTGGGGAGAATCCACAGTATAGCTCTCTGGCTGCTGTTGGGATGTGGACTGATATAAGTGTTAGAATACTTTCACTTCCGGACCTTGAATTAATCAGGAAGGAAAACTTAGGTGGAGAAATTGTTCCTCGGTCTGTTCTGCTTTGTACCTTGGAAGGGGTTTCATATTTGCTCTGTGCTCTTGGAGATGGTCATCTGTTCAGTTTTCTGTTGAATGCAAGTACGGGTGAATTAACTGATAGAAAGAAGGTTTCTCTTGGTACCCAACCGATAAGCCTTCGTACATTCTCATCAAAGGGTACAACCCACGTGTTTGCTTCATCGGATAGACCGACTGTTATTTATAGCAGCAACAAGAAGTTGCTGTATAGCAATGTCAATTTGAAGGAAGTCAACCATATGTGTCCTTTTAATACAGCTGCTATTCCTGACAGCCTTGCAATTGCTAAAGAAGGTGAACTCTCAATTGGAACCATCGATGACATCCAGAAGCTTCATATCCGTACAATCCCCTTGAATGAACAGCACGTCGCATTTGCCATCAGGAACGTCCAGGACACTAGCGTTCTGCAGCTTCAACACAACCAGACTAGTATAGAGGAAAGCGAGACACATTTTGTTCGTCTTTTGGATCATCAAACTTTTGAGTTCCTGTCAATTTATCAGCTTGATCAATATGAGCATGGCTGCTCCATCATTAGCTGCTCATTCTCAGATGATAATAATGTTTATTATTGTGTGGGAACAGCATATGTTTTACCAGAGGAAAATGAACCATCAAAGGGCCGGATCCTTGTATTTGCAGTTGAAGATGGCAGACTGCAATTAATTGTAGAGAAAGAAACTAAAGGAGCTGTCTATTCGCTGAATGCATTCAACGGAAAATTGTTGGCAGCTATCAACCAGAAGATTCAACTATATAAGTGGATGCTACGGGAGGACGGTTCACATGAGCTGCAGTCTGAGTGTGGGCATCATGGGCACATATTGGCTTTGTACACTCAGACTCGTGGCGATTTCATTGTAGTTGGAGACTTGATGAAATCAATATCCTTGCTCGTGTACAAGCATGAGGAAAGTGCGATTGAAGAGCTTGCTAGGGATTACAATGCAAACTGGATGAGTGCAGTTGAGATGCTTGATGACGAGATCTATATTGGAGCAGAGAATAACTACAACATTTTCACTGTGCGGAAGAACAGTGATGCAGCGACAGATGAAGAGAGGGGCAGGCTGGAGGTTGTTGGAGAGTACCATCTTGGAGAGTTTGTGAATAGACTCCGGCATGGTTCGCTGGTAATGCGGCTTCCGGATTCAGAGATGGGCCAGATCCCGACGGTTATCTTTGGCACCATCAACGGGGTTATTGGGATTATTGCTTCGCTTCCACATGAGCAGTATGTATTTCTTGAGAAGCTCCAGTCGACTCTGGTGAAGTTCATAAAGGGCGTGGGGAACCTGAGCCATGAGCAATGGCGGTCGTTCCACAACGACAAGAAGACGTCGGAGGCCCGCAATTTCCTGGATGGTGACCTGATCGAGTCATTCCTTGATCTAAGCAGAAACAAGATGGAGGAGGTGGCCAAGGGTATGGGGGTCCCCGTTGAGGAGCTATCCAAGAGGGTGGAGGAGCTGACTAGATTGCACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSVWNYVVTAHKPTSVTHSCVGNFTGPNQLNLIVAKCTRIEIHLLTPQGLQPMIDVPIYGRIATLELFRPHNETQDFLFIATERYKFCVLQWDGEKSELLTRAMGDVSDRIGRPTDNGQIGIIDPDCRLIGLHLYDGLFKVIPFDNKGQLKEAFNIRLEELQVLDIKFLYGCVKPTIVVLYQDNKDARHVKTYEVALKDKDFVEGPWSQNNLDNGAGLLIPVPAPLGGVIIIGEETIVYCNANSTFRAIPIKQSIIRAYGRVDPDGSRYLLGDNAGILHLLVLTHERERVTGLKIEYLGETSIASSISYLDNGVVYVGSRFGDSQLVKLNLQADPNGSYVEVLERYVNLGPIVDFCVVDLDRQGQGQVVTCSGAFKDGSLRVVRNGIGINEQASVELQGIKGLWSLKSSFNDPYDMYLVVSFISETRFLAMNMEDELEETEIEGFDAQTQTLFCQNAINDLLIQVTANSVRLVSCTSRELVDQWNAPEGFSVNVASANASQVLLATGGGHLVYLEIKDSKLVEVKHIQLEHEISCVDLNPIGENPQYSSLAAVGMWTDISVRILSLPDLELIRKENLGGEIVPRSVLLCTLEGVSYLLCALGDGHLFSFLLNASTGELTDRKKVSLGTQPISLRTFSSKGTTHVFASSDRPTVIYSSNKKLLYSNVNLKEVNHMCPFNTAAIPDSLAIAKEGELSIGTIDDIQKLHIRTIPLNEQHVAFAIRNVQDTSVLQLQHNQTSIEESETHFVRLLDHQTFEFLSIYQLDQYEHGCSIISCSFSDDNNVYYCVGTAYVLPEENEPSKGRILVFAVEDGRLQLIVEKETKGAVYSLNAFNGKLLAAINQKIQLYKWMLREDGSHELQSECGHHGHILALYTQTRGDFIVVGDLMKSISLLVYKHEESAIEELARDYNANWMSAVEMLDDEIYIGAENNYNIFTVRKNSDAATDEERGRLEVVGEYHLGEFVNRLRHGSLVMRLPDSEMGQIPTVIFGTINGVIGIIASLPHEQYVFLEKLQSTLVKFIKGVGNLSHEQWRSFHNDKKTSEARNFLDGDLIESFLDLSRNKMEEVAKGMGVPVEELSKRVEELTRLH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..104#434..482#581..640#731..822#1335..1386#1527..1589#1700..1749#2259..2334#2762..2974#3081..3187#3284..3392#3807..4007#4091..4306#4605..4715#5696..5971#6049..6323#6758..7106#7312..7596#7682..8263#ATGAGCGTGTGGAACTACGTCGTGACGGCGCACAAGCCCACCAGCGTCACCCACTCCTGCGTTGGCAACTTCACCGGCCCCAACCAGCTCAACCTCATCGTCGCGTCCGTAATCTATTCCCCCTTCCTCCCCCCTCTCGCCCTCCAAATCTAGGGTTTTGCTGCGTCACTCCCACTCCCGCCTCCCCCTCGGGGTCGGGATCGTTCTAGGGTTACAACGCTGCTCGCTCTTTTTTCCTCTGCCACCTCCACGCCCTTCGTTTAAATCACTGTGGGATGACACATTATTTGACGGGCCCTTGTTTTCTTTCTTTTGTTAAAACTCACTGTCTTTCATCTCTTTCTATATGTTCTTCAACTTAGATTCCCTGCTTGTTGGCTCTATGCATATTCATTCCTTTACTAACTCTGCGCATGTGCTGCAAATCTTCCAGGAAATGCACCCGTATCGAGATCCACTTGCTTACTCCTCAAGGCCTCCAGGTCGGTGGTTCATGATATTTATTATTATCTACTACTTGCAAATGATTATGTCATGTGCTGCTCTAATAACGTCATAACCTCTTCCCTTTTGTAAGCAGCCTATGATTGATGTACCTATCTATGGAAGAATCGCCACACTAGAGCTCTTCCGCCCTCATGTCAGCCAATTTACTGTTCCTCGACTTGCCATTCTGTTGTTGCCGTGCACTGGATGGTAAAACTAACACTATTTATCTTACGCCTTTCAGAATGAGACTCAGGACTTCCTTTTCATTGCGACTGAAAGATACAAATTCTGTGTTCTGCAGTGGGATGGAGAAAAATCGGAGCTTCTCACTAGGTTTGGTCACTTGCACTATTCTCTTTAGCTTACAAAGCAATGAGACTGCTTTTATAACCGTTTATAGACATAACATTGGCTTGTCAAATGGTTCAAATTGAATGTACTGTAAAATTATGGATCACTAGTCCCACACAATGCTATCCAGTCGTTGTCTAGCTGATTCCATGTAGCATGGAAGGTCCTCATGGCCACCAGCTGCTCCTTGATAAAGGAAGATTGAGACTTCAAGAGTTAATCCTTGCCAAGCCAATGTTATGTCTACGGAGTCACTGCTCTCTGTGTCTATTGAGCCTCTACGCTGATGAGAGGGTCAACAGAGTGCAGATGGGGGAGGGAGATGCAATGACAGCTAATTTTGAGAGTGCGAAAGATATCCAGAGTAAAACGCCTCAATAACCATGGTCTCACAGTCTGTTTATAGAAGAAAATAATATTGCTACTCTCTGATAAATTTCAATAACTATTAGTCTTTTAACTGATAAATGATAAGTGCTATTTGCAATATGTAGAGCGATGGGAGATGTTTCTGATCGCATTGGTCGCCCTACGGACAATGGACAGGTGTGTGGTATTTCCGAATTGAAACTCCAATGTTGGCTTGTAAAAATTGTGAAACTACCCCTTCTATGTAGATCTATATGCAATATATATAGGAATGCATTCTTTTGCCCTCTTATATTTGGCCAATTACTATAATGTAGATTGGGATCATCGACCCTGACTGTAGACTTATTGGTCTTCACCTCTACGATGGATTATTTAAGGTAAGTGTGCACCTTCTTTTTTAAAAAATAAAATAAAATGGGATTTGTCCTTGATAGCATGCTTTTTTTACATCTCCACTGAGAGAAGCTTTTACACCCTTGCCATCCAGGTTATACCGTTTGATAACAAAGGGCAGCTGAAGGAAGCTTTCAATATCAGGTATCAGGATGGCAAAACGTATAATCGAACATATTGGTTGATGGAAACATCTGTGTAGTGACTTAGTCAGGAAAAACATGTGCCACTAGTAATCGGCAACTAAATTGTTGGAGCATTTTGTGCGCTTAATGTGGGAGGGTCTTTCCTATCGTTTCTCTAGTTTGCTTTTGTTGGTGACATTCAGACAACCAAAATGTACATAAAGTGAAGCAAGCTCTTTTTTTGCTTTCTTTGTTTTTGTATCTGTGTTGCCTGATCTGCTTAGAAAAAGGAAAACCAAATGATTGGTGAAAATTTATTACTATAGTTTACATCTTTGCTGGCTAACACAAAACCTAACATTTCTCCTGGTAGACTGAAAGCTGTGTTGTGGTTGGAATGTATTTTTATGCTTTACATCTTCTGTTAAATATAACATTACCATTCGGGGGTTAATATTTCATTAAGGATGATGCATATTCGTACATTTGACCTTACCAGAGAGTAACACTTGCATTTTCTTTCTTCAGGCTTGAAGAACTTCAAGTATTGGACATCAAGTTCCTGTATGGCTGTGTTAAACCTACTATAGTTGTCCTCTACCAGGTTTGCTCAAACTTCACTATATTTTTTGTACCCTGCAATTGAAGTCTGAATCCAATGGGATAGTTTTGAACTACAACAATTGCCATGGTGCCTTTTCTTTGTATGTATTGTTATACTATTATTTTTTTAGTGTACAGTTGTATTAATCAATCTACATTTCACTGGACTTTGGATTTGCTATTGTGCTCAAGTGGTGCAAAGATTACTTGCTGTTACACACCTATAATCCGCTGTGTTTATTTTGACTTAAGTGTAGGCATTTTACATAATAGGTTACTGTTGGTTTTCACAGGATTGAGAATTGAGATTGGTAGAATGCTGTTCTTTATTTACTTTTGATTTATTCAAAATATCTGCTGGTTCTCAGATCTTTATTTGACCATTGTGAGATAGTAAAAGATCTGATTTAATTTGCATTCTTTACCAGGATAACAAAGATGCAAGACATGTTAAGACATATGAAGTTGCATTGAAGGACAAAGACTTTGTTGAGGGTCCTTGGTCGCAGAACAATTTAGACAATGGTGCTGGTCTGTTAATACCTGTACCAGCTCCTCTTGGTGGTGTCATAATTATTGGTGAGGAGACAATAGTTTACTGCAATGCCAACTCTACATTTAGAGCTATACCAATCAAACAGGTAATATATTGTTCTCTTTATGGTTCTTAGATTTGTGGTGCCTACTGTGTGTGCAGGTATGTTGGCACTCCATAACTAATTGTTTTTGTCTTCCATTCTTGTACAGTCAATCATAAGAGCTTATGGACGGGTTGACCCAGACGGTTCGCGCTATTTACTTGGTGATAATGCAGGCATATTGCATTTACTTGTCCTTACCCATGAACGAGAGAGGTACCAGCTATGCACTGTTTTGGAACTAAAAGACTCTTGATCCATTTCTCAGTACTCACAAATATTCCCTTTTGATGTACTGGTTACTTTTTTAAGGGTAACCGGTCTGAAAATCGAGTACTTGGGAGAGACTTCAATTGCATCATCAATATCATATCTCGATAATGGTGTTGTCTACGTTGGTTCTCGATTTGGTGATTCACAGGTGAGTTAATAGCAGTTTGAATTTGAACTACAATGTACTCCCTCCATCCACAAATGTTACACATATTACTTTTGACACCAAGACCAAGGAGAAATTAAATCATCTTGGATGTTACAAAATCAAGGAGTGAATGCAAGCATGCAACCAATGACTATTTAGATGACTCCTTGGGTTCTAATAAAACATTTAATTTATCTCTTCATTTAAGTCTTGAACACATAAAGACTACAAATAGGAATAACTTATTTGGAAAAATTCAAATGTGAAATAGGTGTAACTTTTGTGGATGGAGGGAGTAATGTCCCTTTTTGGGGGTGGTGGTCATGCCCTAATTTCAATGCATGCGTGTGCTTTATGCAGAAAAAGTAAATTTCAATTCGTTCTGTATGTTGACACAAATATTGTTGTTGACAGCTTGTAAAACTAAATCTCCAAGCTGACCCAAATGGTTCATATGTTGAAGTTCTTGAGCGATATGTGAACCTTGGACCCATCGTGGACTTCTGTGTGGTTGACCTTGACAGGCAGGGTCAGGGTCAGGTTGTCACTTGTTCAGGAGCATTTAAAGATGGTTCCCTTCGGGTGGTTCGGAATGGGATAGGTATCAATGAGCAGGTATTGAATTAAGATCTATCCAATATTGTCCAATTTTAGTTCTGCATAAAGTTGAGCTATATTATCTCTTATCATGTAATTAGGCTTCAGTAGAACTACAAGGGATCAAGGGTTTATGGTCGTTGAAATCTTCCTTCAATGATCCGTATGACATGTACCTAGTTGTGAGCTTTATAAGCGAGACAAGATTCTTGGCTATGAACATGGAAGATGAGTTAGAAGAAACTGAGATAGAAGGCTTTGATGCGCAGACTCAGACTTTGTTTTGTCAAAATGCCATCAATGATCTGCTTATACAGGTGCCTTTTTTAATCACTGCTTCGTTCATTTTTGTTGCATTTCTTGTAAGTAATACATCCATGAATTTGTGGGGTATGGAATTTGAAGGAACCCTATTTGAAATGCCTGAATGAATCCTAATTAACTAAAATAATTATTTTGAAATGATTTTGTTGATATTTGAGAGGCAAAAAGTTGTCTCGGTAAGTTGTATGTTCTGTGTTTTTATACATTCACTGATTTAGGTGGTTTCATCACTGTTGTGAACTGTTTTAATAAATACTTAAAAAGGGTGTGATTTTTTACTTTCAATGACAGGTTACTGCTAATTCTGTTCGTCTGGTTAGTTGTACCTCTCGGGAGCTAGTGGATCAATGGAATGCACCAGAAGGATTTTCAGTCAATGTTGCATCAGCTAATGCCAGTCAGGTAGGTTTCCTGGGACCCCTTTTTTCTCTGGGTAGTTTCATCTCGTCAAAATGCACCTAGAAGTTACAGGCA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