BGIOSGA036634

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Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA036634

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA036634, complete gene.

LocusTag

OsI_37467

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA036634-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA036634-PA

Length

11230

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:2542074..2553303

Sequence Coding Region

2553106..2553303,2552521..2552682),complement(2552339..2552428,2551731..2551867),complement(2551560..2551650
,2551308..2551390),complement(2551117..2551223,2550278..2550430),complement(2549327..2549391
,2549061..2549148),complement(2548832..2548910,2548632..2548740),complement(2547035..2547153
,2546817..2546910),complement(2546003..2546443,2544208..2544663),complement(2543985..2544113
,2543205..2543289),complement(2542862..2543037,2542074..2542508

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:2542074..2553303 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:2542074..2553303 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGCGGTGGCGGAGCCATCGCCACCGGCCGCGGTGGCGGCGGCGGCGGGTCAGACCCACGCGGGGAGGGTGGATGCGCTCGAGCGGATGCTGACGAGGCTGGCCCTCACCGAAGACTCCGTCGCGTCGCTGCTCTGCCGCTTTCTCCCCTACACCACCATTTCGCTCGTCTCCCCTGGCGCGTCTGTCCGTGAGCTCCTTATGGAAAATGGCAGTCTCTTTGACAAACTGGTAAAGCAAAGGCCTGATATTTCAATGATGATGGATCTATGGAGGATCTACACTGAATCTACCTCAACAGTTGTTCAAAACTATTGCATTGTTTATGTTGAGATGGGCTTTGAGCGTCTACTAAGTGAGGATAAGGCAATCATAGCACCTGATCTTTTAATCAACATATCAAATGTTCCAGAGCAACATCAAGGAATTATCCTGAGACTTGTGTTGAAGGCTATTGGTGAATGGGATACACATAAGGTGGATCAGACTGTTGCTTCAAAGTACAAATCCATAAGCGCATCTAATGATGGCCTAGTCTTTGCTGATTTCTGTCTGCACATGATACTGTATCAAACACCACCTCAGGGAATCAGATGCCCGGCAGGGCTTTCAGTTGCTCAATCGGATGGTGTTACTGGAAATTTGCCACTAAAAGGCGATACACTTGCATCAAGAAAGTTAGGAATCTTGGATGTCATTGAAACTATGCAGTTCAAACTAGAGATCGTCTACCCTCTTTATTTAGCGGCTGCTTCAGATAGTCAAGAGGCAGTTGCTAAGAGAGGAGAGGAAATGCTAATACTCAAAGCTTCAGCTGTGAATTTAGAAGATTCCGACCTTATCAAGAGATTGTTCACACTATTCAATGGTACTGCAAGCTCAGAAAATATAGCTTCAGAGTTGGAAGTTGCCCCAGCACATAGTTCATTGCGAGTCCGCCTTATGGGTGTTTTCTGCCGATCGATTGCTGCAGCAAACGCGTTCACACACACATTTCAGTGCATTTTTGGTTGCATCTATGGAAATGGAACCACTTCAAGATTGAAGCAGTTAGGGATGGAGTTCACCGTCTGGGTTTTCAAACATGCAACAAACAAACAGCTAAAGGCAATCAGTCCATTTATTCTCAGTGGAATATTACATTCACTTGATGGTTCTTCCACTACAGAAGCAGATTCTTCCAGTAGGGATATCAGAATATTTGCATACCAGGCCATTGGTTTGCTTGCCTTTCGCATGCCTAATTTATTCTGCAACAAAACTGGCATGGCTATACGGCTGTTTACTGCTTTAAGATTGGAGGAGCAATCTCTTCGTTCAATAATTCAGGAGGCGGCTACTGCCCTTGCTACAGCATATAAGGAGCAAAGTGAGGTCCGGTTTTCTGCTGTAAGATGGGCAGTGACGTTATACAATATGAAGCACTGCCCAAGCCGATACATTTGCATGCTTGGTGCTTCAGATGTGAAGCTAGATATAAGGGAAATGGCTCTAGCAGGTCTAAATCTGTTAAATGATGAAAGGCAGTCATCTACAATGGCCACGGATATAAGCTATCCTGATATTGCGGAAATGATGGTATCCTCGTTCTATGTCAATCGATTAGATTGGCCAAGAACTTTACTGCATGCTGATACTCATGAAGAAGCCCCACGTCTGCTTGGTATTGCTTCAACCCTTTTAAGCATTGCTGCATTGTATGTTCTCCCTGAACTCACTTCAATATTTGATCAAAATCCTCCATCAGGGTATGGAAGACAATGTCAAAACACAACTGACATCAATGAGGAGCTTGGCAGCTGCTGCAATGGCAGGACCAACCATAGCCTGGAGCATGAGGTTTGTGGGGGCGGGAACAACAGTGACAATTTGGGTGGGGATGGCTGTGATGAGGAGCTCGTCACTGGCTGCCATCACCGGCATGGCAGGATTGACCACAACCTGGAGTTCTTGATTGACCGGATGATGTCCTGGTCAGTGCGAGACATCTTGAAGGTGCCACCTGTGATAAAGAAGAGCACAACAAAGATGATAAAGGTCTTGGACGAAATAGAGGATTTGCTAGGAAATCGTAACCTTAGTGATGGCAGCATGAGGAAAGCATTTGAAGTTGAGGCTGTGCAAACGTTTGATACTGGAGATTGTGGTATTGCTGAAGAGTTAAATGATAAGCGAATGAAATGTGCACAACTGCTGAGAAAGTTTAAAGAAGATCTCCAATCAATTGATTTGCCGACCTTCAAGACTAGAGAGGATCTTGAGGAGTTCTGTATGAAGAACTCCAGCATTATATTCTGTTCAACAAACAATTCGTTTCATTTGAGGGAAATTCAGCTCAAGATTGATTGTCTTATAATTGATTCTGCGAATCTTTTCAATGAGTATGAAACCCTTGTCCCATTGTGTCTACCCTCGCTACATTCTATTATTCTTGCTGGAGATGAGGCAAAGAAGCCTACAGTAGGAAACCAGGTCTATCAACAAGATGCATTCTGTGTTTCTCTTTTTCAGAGATTACTGGACCTTGGATTCAATCAACATCTGTTGCTTGATCAATATATTACTGGGCAGCATGGAAGAAGAGTGTCTAGCAAATCAAAAGTACTAAAACCAGAGTTTACTTGGATAGCAAGACCTCACAACAGAAAGTACATTTTAGCACCTATTCGTGATCAGGGACCAAAAGATTTTAATGTTATTCTTGACATACAAGACATGCTCCTTCAGTACAAGGAGGAAACTGGATATACATATGGAGACGAATTGAGAGGGGAAAGGGGACAGATACGGCTTGAAAAAGCTCTACAAACTCTGAAAAAGCGTGGTGTCAGAGGCATTGATGGATGTGATAATGATAAGAAGATGGAGCAGATAAGGATATCATCGTTCAGGCGCATAGACATTGAGGCAGAGGGCTTTGAACAAATATTTGAGCGTTTGCTTCAAGGAAGAATGCTTGTGGGTTCTTTCAAAGTTTCTTGTAATTATTTCGAGCTCGCTGAAGGAGAGGTGTACCACTACGATTATGCACGCCCAATTGTCAGGGATGGAGTAACCTGGTCCCATGCGGTCATGTTCGTTGGTTTTGGTGATCCTGCTGGTGATGTCCTGCTCGACAACCACTTAGCAGCGATTGATACTTGTGATTTTGAACTTGAGCGGATGAAGCACAACAGCATTGGCCATCTTGTCTATCAAAACAGCTATGGGAAGCTTTTTGGGTTCCCCCACTTCCGCTGCGGTTATGGTAGGGTCGGTCTGCAATCGATCGTGTCCGTGTGGGAAGTTACTGTGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MAVAEPSPPAAVAAAAGQTHAGRVDALERMLTRLALTEDSVASLLCRFLPYTTISLVSPGASVRELLMENGSLFDKLVKQRPDISMMMDLWRIYTESTSTVVQNYCIVYVEMGFERLLSEDKAIIAPDLLINISNVPEQHQGIILRLVLKAIGEWDTHKVDQTVASKYKSISASNDGLVFADFCLHMILYQTPPQGIRCPAGLSVAQSDGVTGNLPLKGDTLASRKLGILDVIETMQFKLEIVYPLYLAAASDSQEAVAKRGEEMLILKASAVNLEDSDLIKRLFTLFNGTASSENIASELEVAPAHSSLRVRLMGVFCRSIAAANAFTHTFQCIFGCIYGNGTTSRLKQLGMEFTVWVFKHATNKQLKAISPFILSGILHSLDGSSTTEADSSSRDIRIFAYQAIGLLAFRMPNLFCNKTGMAIRLFTALRLEEQSLRSIIQEAATALATAYKEQSEVRFSAVRWAVTLYNMKHCPSRYICMLGASDVKLDIREMALAGLNLLNDERQSSTMATDISYPDIAEMMVSSFYVNRLDWPRTLLHADTHEEAPRLLGIASTLLSIAALYVLPELTSIFDQNPPSGYGRQCQNTTDINEELGSCCNGRTNHSLEHEVCGGGNNSDNLGGDGCDEELVTGCHHRHGRIDHNLEFLIDRMMSWSVRDILKVPPVIKKSTTKMIKVLDEIEDLLGNRNLSDGSMRKAFEVEAVQTFDTGDCGIAEELNDKRMKCAQLLRKFKEDLQSIDLPTFKTREDLEEFCMKNSSIIFCSTNNSFHLREIQLKIDCLIIDSANLFNEYETLVPLCLPSLHSIILAGDEAKKPTVGNQVYQQDAFCVSLFQRLLDLGFNQHLLLDQYITGQHGRRVSSKSKVLKPEFTWIARPHNRKYILAPIRDQGPKDFNVILDIQDMLLQYKEETGYTYGDELRGERGQIRLEKALQTLKKRGVRGIDGCDNDKKMEQIRISSFRRIDIEAEGFEQIFERLLQGRMLVGSFKVSCNYFELAEGEVYHYDYARPIVRDGVTWSHAVMFVGFGDPAGDVLLDNHLAAIDTCDFELERMKHNSIGHLVYQNSYGKLFGFPHFRCGYGRVGLQSIVSVWEVTV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..198#622..783#876..965#1437..1573#1654..1744#1914..1996#2081..2187#2874..3026#3913..3977#4156..4243#4394..4472#4564..4672#6151..6269#6394..6487#6861..7301#8641..9096#9191..9319#10015..10099#10267..10442#10796..11230#ATGGCGGTGGCGGAGCCATCGCCACCGGCCGCGGTGGCGGCGGCGGCGGGTCAGACCCACGCGGGGAGGGTGGATGCGCTCGAGCGGATGCTGACGAGGCTGGCCCTCACCGAAGACTCCGTCGCGTCGCTGCTCTGCCGCTTTCTCCCCTACACCACCATTTCGCTCGTCTCCCCTGGCGCGTCTGTCCGTGAGCTCGTAAGTACACCACTCCTCAGGCCCTGTGTCGATTCGGATTAGTATGCATACGTATATGTTGAATTTTCCTGCTTCGATTGGTTTAGTTGATCGTTTGGTTGGCGATGATACTGCTACAATTTGTCCACACGGCGATGAAATTTGATTAATAGCGTCTATGAAACTATCTGAATAATTCGCGCATGTACAAATAATCTTCTATTTATACACTATAATTAGATTAGAGAACTTTGTGCTTTAGGTTGCGAGATTTACTTGCATTTGTTTACATAATCTGAACCTGTTCAGGGGGTGAAAAGGGCAGTACTAGTACTATTTTCCATCTGTTCTTTGCATGCGTTATAACATAGTAATTTTCATGTCAATGAGGCGATGAGCCGATGATATTTAATAGAAACGATTTTTATTTTTTGGTTCCATCAGCTTATGGAAAATGGCAGTCTCTTTGACAAACTGGTAAAGCAAAGGCCTGATATTTCAATGATGATGGATCTATGGAGGATCTACACTGAATCTACCTCAACAGTTGTTCAAAACTATTGCATTGTTTATGTTGAGATGGGCTTTGAGCGTCTACTAAGTGAGGTATCCTATTCAGTTTCATTTATGTCTCATTTTCTCAGCTGTTTTAACTTTTCTGCAAAAGCCAACAACATAAAGTTAACATTATGTAACAGGATAAGGCAATCATAGCACCTGATCTTTTAATCAACATATCAAATGTTCCAGAGCAACATCAAGGAATTATCCTGAGACTTGTGTTGAAGGTTAGTCACACCTTCTGTTGCTTTATAAATTTTACTAAGACTGGTCTCCAGTCTCCGCTGACTTTATACAATTACACATGATCATAAAAAAAAGGCGGAATGGCTAAATGGTTTCCATTGAACAATTCAGGGAAAGGACCTGACAATTATGTAGGTTAGGTTATGCATGGACCCGGCAATTGCTAAATCTCACCCTTTCAGTCAAAATCTATAAAGTTGATGAATATACTTGGTTGTACATGCAAATATTGTTCAATACCTTATCTTAACAGAATTGCATTTTTTCTCTGGAATAAGAATCATTGTCAGCTTATTTTCTATCATCAGACCGATGGCATTGAATTTACTGCACTTTTAGTCAAGTCTACAATGATCTTCGATAAGTTATCCGTGGTTTCCTTTTCTTGTTCTGACGTACCTTCATCCTAAAAAACTTGCTAGTTTTCTTTTTTTTTTTTAAATTGTTGCCAGGCTATTGGTGAATGGGATACACATAAGGTGGATCAGACTGTTGCTTCAAAGTACAAATCCATAAGCGCATCTAATGATGGCCTAGTCTTTGCTGATTTCTGTCTGCACATGATACTGTATCAAACACCACCTCAGGGGTTGGTTTCCTTGCTAAACTTGGTATAAGTATGAAACATTTTTTATTTATTATGGAGAGTTGACATATATCAATCTTCAGAATCAGATGCCCGGCAGGGCTTTCAGTTGCTCAATCGGATGGTGTTACTGGAAATTTGCCACTAAAAGGCGATACACTTGCATCAAGAAAGGTAATAAATAAATGCATGTGTTTCACATTAGGTATCCCATATTCATGTTATGCCTGTGTGTACAATCATGTCAGCATAAGTCTTCACACATTTTTCTATTTTAGTCTTGAGTGTAGTACTGTAGTACCAGCAGCTTCTTACAGTTGAACCTCACTTGCAATATCTTCAGTTAGGAATCTTGGATGTCATTGAAACTATGCAGTTCAAACTAGAGATCGTCTACCCTCTTTATTTAGCGGCTGCTTCAGATAGGTACTTTTTTAAAAAAAAGAAAAGATTCAATCTGCTAAAATGTTTGTATGGATCAACAATCATGCGGATCCCTGTTTCATGAAGTCAAGAGGCAGTTGCTAAGAGAGGAGAGGAAATGCTAATACTCAAAGCTTCAGCTGTGAATTTAGAAGATTCCGACCTTATCAAGAGATTGTTCACACTATTCAATGGTATGCATAATTTGGAGGATTCTAATTCAATCAATTTTATTTCAGTATTTAACTGTCACTTTGTTCTTATGTATTATCATTTTTGTTGTGTGGCATAAGTTATTCTGTCCTCGAGGTTGGCAACCTGAGACATTTTTTTTTTCCTTTGCTGAGGTGACTATGCCCTCATTCTCATAGCCCTAACTAGGGCAAGTTAGGTACATTTCACGTGTATATTCCATGAACATATTTCGTCTAGCCTACTCCCGATGCCATAGGGGATATAGGTGTCTATCGTCCAACAAGTTTCATTTAAAATATAAAGCAAGCATGATAATTTAGTGATCCTTTTTTACGCTATCTTCTCTATCACCTTACAATTATAACTAATGGTCTCATATTTTCAACATACAAGGTCATGTCCTCCTCTTCTTCTCTTGTTTTCATACCCTTCTTAATCCTTGTTCTCATCCAAACTAAGCCTTATATTTTGTAAATGATTTTGTATGTTAACAGGCCCTGCATTTTCACATTGCACTCTCATATACCGACATGTGCACATGCTTCTCTTTTCTTTTTCGCTTTTAGATGTCAGATTGTCAGTACTTGTTTTGTCAAAATCTTTTGCTTGTTTTTATCAGTACCAATCTAAATATTTGTGGTTTGGTTTGGTAATTGGTATATGATATTTTTCTCTGGTGCCGCAGGTACTGCAAGCTCAGAAAATATAGCTTCAGAGTTGGAAGTTGCCCCAGCACATAGTTCATTGCGAGTCCGCCTTATGGGTGTTTTCTGCCGATCGATTGCTGCAGCAAACGCGTTCACACACACATTTCAGTGCATTTTTGGTTGCATCTATGGTATTCTGTTTTTATATATTTTATTTACCTTATTCGTCGTCATGACATTAACGAATGTATTTTTATCCTAGTTTTGATTATTATATCATCAATGGACTGCATCTTTAAGTAGGACAGAGAAATTGACTATGTTTGTCATTTTATATTCAATAGTTTTTCTTTTAAGCATCTTCTAGAGTTTTATGGAAAGCTAGCAACGGTACAGTAGAGTATGACCTTCTGGAAAATTGCTAATATCAACAATGTACAATATACATTATAAGAAAATGATAACCGATCAAGCATCGGCCTAGAAATTGATATTTGGCACAAGTAAGAGAGCTCAAAGGGATGGGCTAGGGTTCATGGAGGATGAACACCATCAGGAGGATTGCAAGATGGCAGTGGCTCCCAGGGATGAGAGGTAGACAGACAGGGAATCTGGGTTGAAGAACATTGAGGAAGAACTTGATTGACATTTTTTTCTCACTCAATGACTCAATGGTATTGTTAATATCATAATAGTGACCTCCTTATGTAGAGGTGCTCGAACCCAAATGAAAGAAACTAATTAAAAAGCAAACCTTGAAGATTATAGCAATCAACTTCAATGAAGCATCTAATGTAGAAACTAATAATCCTTACCCAAATCAATGGTGCAGCCCATAACACATATATGCATCACTTCCTTAAAGAGGGAATTGCAAGATAAACACATCAGTTCCTTTTAAGTGTCTATTTTCTATTATATGGAACACAAATTCTCTGATATTTGATAGTTCTAAGTGGTATTTTTGTGAATCTATCATCAACTCTCATCCCATCTGAAATTTTATCTGTTATGTTGCTCATGCTATGCATTGTTGGTAAATTCTCATTTCTACCTCCTGTGTTTACATACCTGCAGGAAATGGAACCACTTCAAGATTGAAGCAGTTAGGGATGGAGTTCACCGTCTGGGTTTTCAAACATGTAGGTGCACTTCCTTTGTTTTCACCATATATTGATTACTGTAGCTTCTAGCATTAATTGCTTGTGCCATTCCAAATTTAGTTTTTTTTTTTTCACTCTTGGCAGTTCTCCCTTTCTGTCAACCTTTTTTCATGGTCTCAAACTTTTATCAATTATCACTGTTTCCTTATTGATTTAGGCAACAAACAAACAGCTAAAGGCAATCAGTCCATTTATTCTCAGTGGAATATTACATTCACTTGATGGTTCTTCCACTACAGAAGCAGGTTTTACATTTCATCGACTCTACTTGTTAAGACGTGCATGTGGTTTATCTTGGCACTCTTTTCGTTTACATTACTTGTTGACTTCCCATTTTGCCATGTCAAATAAGTTTAGAAAACAGTGAATGATTTATTGATTTCCTTCATGTCCAGATTCTTCCAGTAGGGATATCAGAATATTTGCATACCAGGCCATTGGTTTGCTTGCCTTTCGCATGCCTAATTTATTCTGGTATGCGCTTTTCTTACTCTTCTGCTTTCTCAATTCATGCTTCATTTCTGTAGTGGAGACTGAATTTTTCTACTTGTTATGATCATTGCAGCAACAAAACTGGCATGGCTATACGGCTGTTTACTGCTTTAAGATTGGAGGAGCAATCTCTTCGTTCAATAATTCAGGAGGCGGCTACTGCCCTTGCTACAGCATATAAGGTATTGTGGATGATATGCTAATTTCTCCAAAAGGGTACTCTCCTGTTGTCTGATCTGTTAAAAATGTTGGCAAAGATGATTGTGAATTGCAGTTCA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