BGIOSGA037249

From RiceWiki
Revision as of 18:33, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA037249

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA037249, complete gene.

LocusTag

OsI_38012

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA037249-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA037249-PA

Length

7814

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 12

Location

Chromosome 12:8687951..8695764

Sequence Coding Region

8687951..8688158,8688242..8688577,8689172..8689422,8689837..8689924,8690159..8690334
,8691479..8691569,8691680..8691799,8692087..8692134,8692231..8692307
,8693260..8693348,8693615..8693726,8694287..8694389,8695535..8695764

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome12:8687951..8695764 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome12:8687951..8695764 source=RiceIndica12 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAAGCCGCCGCCGGCGGATCACGCCGCCGTCCAACCCTCCTCCGCCTCCTCTGCCCGAAGAAGTCCCTCGTCTCCCCACCCACCCCTTCCCTCCGCTGGCTCCTCGGCTCCCCGCGCTTCCTCCCCGCTCTCACCGTCGCCGCCGCCCTCCGCTCTCTCTCTCTCCCCGACGACGCCTCCTCCCCCGATCTCCAGCGAGAAGCAGAGGAGATCAGGGGATTGCTCGTCAGGGGGTTCGACATCGTGGGGGCGGTGCACGTCGGGAGCGCGGATGCCGGCGGGGCGCTGGAGCTTGCACGGGCGGTGAGGGAGAGGCTGTACGGGGAGAGGGCGAGCCATGGCATGGTCGGGGGCTGCGTGGAATTGGGCAGCGGGGAGATTCGGTTTGTTGTTTCTGAGGGGGACGGGGTGGAGGCGGTGGAAGTGACGGAGGTTGTGTGGGAGGATGATCCCGGGAGGTTGCTGTGGGAGAAGGGATGCCTTCTCCGCTGCGAGCTGCCGCTGAAGCTCCCGCTCTATGTTCCTTCGGATGATACGTCTGGCATTGAAGCAAGGTTTTATTCACTCATTGAATCAACAGCTTCTAAGCTCAGAGATCCTCATGTTTCTTACCTAATCGAAGGCCCACGAACAACTCCTGGTGAATCACATTATTCTATTATCTTGCATGGCAATGATCTGAATTCTGTTCCCCATTTATCTCGAAATGGAAGCACAGAGGAGTATGATGCAAATATTGTATCTTGTTCAAAGTTCTTCCCAGCAAAGAGGAGCCTCTCATTGACAAGAGAGAATGCAGATGCAATTCAAATAACCATATTGTCCAATCAGTCATTCAATAGCTCAAAGGCTAGCACCCCAGCAGTTGAGTACTTTCCAGCACCTGCATTGGCTAGCCTGAGAGCAATCAACTTGAAGCTAGATATACTTTGCTACACTTCAGTAGATTTCCCTGTAGCTGCTGCTGTGTCTGAGCTTGTCATTCCAGGATTAGCTGATCAGCTGAGCATTATGAAGAAGGCTATTGTGTCAGAGCTCACAACTCAACAACCCCAGCTTTCTCCGTACCATTTTGTTCCTCCTGGATTGTTAATCCCAGTAACAACTATATATGACACAAGATATGGGGAGATTGAGGAAAAGCAAAGTGAACTGAGAAGAAATCTGCACTTACGGCTACAACTTCCCTTAGATCGTCCTTTATTACGAATTTCAAATGCACTAAATTTTTCCATAGGAGGGACAGATAAGAAAGCATCAAAAAGTGGTTCATCATTGCTTCGGGATGTCCACAGAGAGATTCCATCTAGTGGTGTATCTGGAGGAATTATATCATTGATTGATGGTTCCTATGAGTACTACCATTACCTTCATGATGGTATTGATGACAATGGATGGGGATGTGCTTATCGTTCTCTACAAACTATCATGTCTTGGTACAGATTGCAACAGTATTCATCTATAAATGTTCCATCACACAGGGAGATTCAGCAAGTCCTTGTTGAAATCGGTGACAAGGATCCATCATTTATTGGATCTCGAGAGTGGATTGGAGCAATTGAACTAAGCTTTGTCCTTGACAAACTGCTTGGAGTTAGTTGCAAGGTTATTAATGTGAGATCTGGTGATGAACTTCCTGAGAAATGCAGAGAACTTGCAATCCATTTTGAAACCCAGGGAACTCCTGTGATGATCGGTGGTGGAGTCTTGGCTTACACCCTTTTAGGAGTTGACTACAACGAAGCCAGTGGTGATTGTGCTTTTCTCATCCTTGATCCACACTATACTGGTGCTGATGATCTCAAGAAGATCGTGAATGGTGGATGGTGTGGGTGGAAGAAATCCATCGACAGCAAAGGCCGTAGCTTCTTCCTGAAAGACAAGTTCTACAACCTTCTTCTACCCCAAAGGCCTAATATGGTGTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAAAGGSRRRPTLLRLLCPKKSLVSPPTPSLRWLLGSPRFLPALTVAAALRSLSLPDDASSPDLQREAEEIRGLLVRGFDIVGAVHVGSADAGGALELARAVRERLYGERASHGMVGGCVELGSGEIRFVVSEGDGVEAVEVTEVVWEDDPGRLLWEKGCLLRCELPLKLPLYVPSDDTSGIEARFYSLIESTASKLRDPHVSYLIEGPRTTPGESHYSIILHGNDLNSVPHLSRNGSTEEYDANIVSCSKFFPAKRSLSLTRENADAIQITILSNQSFNSSKASTPAVEYFPAPALASLRAINLKLDILCYTSVDFPVAAAVSELVIPGLADQLSIMKKAIVSELTTQQPQLSPYHFVPPGLLIPVTTIYDTRYGEIEEKQSELRRNLHLRLQLPLDRPLLRISNALNFSIGGTDKKASKSGSSLLRDVHREIPSSGVSGGIISLIDGSYEYYHYLHDGIDDNGWGCAYRSLQTIMSWYRLQQYSSINVPSHREIQQVLVEIGDKDPSFIGSREWIGAIELSFVLDKLLGVSCKVINVRSGDELPEKCRELAIHFETQGTPVMIGGGVLAYTLLGVDYNEASGDCAFLILDPHYTGADDLKKIVNGGWCGWKKSIDSKGRSFFLKDKFYNLLLPQRPNMV</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..208#292..627#1222..1472#1887..1974#2209..2384#3529..3619#3730..3849#4137..4184#4281..4357#5310..5398#5665..5776#6337..6439#7585..7814#ATGGAAGCCGCCGCCGGCGGATCACGCCGCCGTCCAACCCTCCTCCGCCTCCTCTGCCCGAAGAAGTCCCTCGTCTCCCCACCCACCCCTTCCCTCCGCTGGCTCCTCGGCTCCCCGCGCTTCCTCCCCGCTCTCACCGTCGCCGCCGCCCTCCGCTCTCTCTCTCTCCCCGACGACGCCTCCTCCCCCGATCTCCAGCGAGAAGCAGGTAAAACCCTCTCGCCTCACTCACCACCTTCCTCTATCTATCCGGTGCGCTCTCTCGCTTGACAATCTCGTGGTTCCGTGCAGAGGAGATCAGGGGATTGCTCGTCAGGGGGTTCGACATCGTGGGGGCGGTGCACGTCGGGAGCGCGGATGCCGGCGGGGCGCTGGAGCTTGCACGGGCGGTGAGGGAGAGGCTGTACGGGGAGAGGGCGAGCCATGGCATGGTCGGGGGCTGCGTGGAATTGGGCAGCGGGGAGATTCGGTTTGTTGTTTCTGAGGGGGACGGGGTGGAGGCGGTGGAAGTGACGGAGGTTGTGTGGGAGGATGATCCCGGGAGGTTGCTGTGGGAGAAGGGATGCCTTCTCCGCTGCGAGCTGCCGCTGAAGCTCCCGCTCTATGTTCCTTCGGATGATACGTCTGGTAATTGTTCGATCCTCTCCTTGAGCTTCAGAGACTGAAATCCTTTTTGATAGTTGCAGTGCAAGCATGATGGTTCTTACTTTGCATGCATTATTTGAAATATGTAGCACGAATGCACGATCATGTTGTAAATATCTTAAGACTTAGGTACAGCACGATCATGCTGTAAATATCTTGATGTCATCAAGCAAATTGTGTTTGGTATGATTATCTTTCACATAGCAAAATGGTATAATAAGCTGCATGAATGGTTTTTTTAATAGGGAGTAGGGTATGTGGGGATTGTGAAGTGTTAAGGGTAAATTTCAGTAGGCAGGTATTTGCTATGATCAATATTCACATGGTTTGTACAACACAAATATCACCATGATAGTTTACTTGAAGACATTACATTTATTAAAACAGATGGAATACTTCCATTGGATGATATGAATAGAAGGACCTAAGTAAATTATTAGCAATGCAAGGACCAAATTGCTTCATGTGTTGTCAAAGTTGGAGATGTGCCTACTTCACCTGTATGGTTTTGATTCTGGCAAATGTTTATTCAAATGTTTCCAAATTGTTTATTATGTATTGTGTCACTTTTTGCAGGCATTGAAGCAAGGTTTTATTCACTCATTGAATCAACAGCTTCTAAGCTCAGAGATCCTCATGTTTCTTACCTAATCGAAGGCCCACGAACAACTCCTGGTGAATCACATTATTCTATTATCTTGCATGGCAATGATCTGAATTCTGTTCCCCATTTATCTCGAAATGGAAGCACAGAGGAGTATGATGCAAATATTGTATCTTGTTCAAAGTTCTTCCCAGCAAAGAGGAGCCTCTCATTGACAAGAGAGGTAAGCTTAGACTCAACTAAACCTGCTATATAAGTTGATACTTAACTTAATACTTCCATGTTGTGATTGGTTGTTAGTTCCAATTTGATACAAATTTATTTCTTGGTGAGCTTGTGAGAATATGTTTCCTGGAGCTCGAATGAGGAATGTGGAGTATGGACATTGTCAGCTTGGTTCACTTACCTTTCGCCTGTTCATGAAGGCATCAAATTTTAAGTATACCTTCAATATCTGGCAATGAAAGTTTATGTTTCAAATTGCCTGACTGACATGTATAGAAATATGAAGTACATGAAGTTATATTGTTTTGAAAATGCCTAGTAATATATATCATATTTGGTGCATTCTATAGTAGGATGATGCAGACTTCTTGTACCATTCTGTGAGCACCTTTCTGAAAATTTTATTTGCTAGAATGCAGATGCAATTCAAATAACCATATTGTCCAATCAGTCATTCAATAGCTCAAAGGCTAGCACCCCAGCAGTTGAGTACTTTCCAGGTACTTGTTTTCTTGAACTTATTTTGCGCCCTCAAAAGTTTAAATCCCTCCATTGTACTGATTGTGGTGTGGCAGCTGGCATTCTGCCTAGTAAAGCAAATTCTTTGTGCAGAAGTACACTTAATTATTTATGCTTCAACATTACTTAATGTCATACAATTTTTTCATTGTCCACTTCAATTCAGGAAATGTTACTCTCCCTTAAAGTAAATATGCTCTTGTTCTTTTTGCCAGCACCTGCATTGGCTAGCCTGAGAGCAATCAACTTGAAGCTAGATATACTTTGCTACACTTCAGTAGATTTCCCTGTAGCTGCTGCTGTGTCTGAGCTTGTCATTCCAGGATTAGCTGATCAGCTGAGCATTATGAAGAAGGCTATTGTGTCAGAGCTCACAACTCAACAACCCCAGGTACATAATAAGTTAGCCCACACTTGGCAAGGCAATTAGCTGTCCAGCAGCAGTAATGGAATGCGAACCACAAGAACTTTCACCGCAAGGGCACCCAGCTCTTCCAAATTTTTTGGTGCATTTCAGGATGTTCTAAAATAGATCATAAATGTAGAATATGTGCACATGATTTTTTTTTTTTTGCACTAATATGATCACATGCACTGTGCAAAAGAAATAAAGCGATATTACAAAATTGCACATATTTTTTCCATGCAGTGCACGTGATTACATTTTTGCACAACTATTTGCTAGTTTACATGTTATAATCTAAGTGCAGTGTACAAAACAAAACATGGCTTCATGTGATTCTAGGAGCATATTTAATTTAGCCGTGCCTGCATGAAGTCACTCATGTGAGTTTGTGCGGACATTAGGGAATAATCACCTGTGCTTCCTTAGTAAGATTGAGCTCTTAGATGGGTGCACAGTGTTACGCATATGCTTCTTTTGATGAACCATGTTGACTGCATTGGAGATGCTCTAGCAGTAGTGTGAATGCTTAAAGATGGTGCAGTAGCAGCAGCAGCAGCATTGTTCCTTTGACTCCACCAATCCACCTAATAAAAGTTGTAGCAAGGATAATTTGTAAAATTCAAGGCCATGTTTAATTTGTGTCTAGTTTGAATATAATTCTCAGGTGCTAAAAGATGGTAGTCGTGTTCTGAATGTTTGACATCTTACATCTCGTGTCAGCTATGTAATGACTGCAAACACAATCAATCTGGAAGTTATCATAACATTCGCGTCATCTACTGATTTTGACTTGTCATGAACAAAACGTACAAGGCATGCCACAAGTGTGACATGTATGTAATCACATGTATTCCTTTTACCATGTGTGCTAATCCACATTTATATATCAAGGTTTTTTTGGAACATGGACTTTTAATACCAAATGAACAAGTAAAAGATAAAGGTTGCATGGATCTCTGTAGTAAACCTGAGAAAATATGTAGGATGTTGCCGTGCATGTATCTTTTGTTTTAATTTATTTGCATCATTTAATATGATTTCGCTGGTATTTTATATTAAATTGATTGCATGTGCAAAGTGTTTTTTTCTGAAGAATTTTTTATCAAATGGTTATTGCCCTTGTTTTCAGCTTTCTCCGTACCATTTTGTTCCTCCTGGATTGTTAATCCCAGTAACAACTATATATGACACAAGATATGGGGAGATTGAGGAAAAGCAAAGTATGCAATTTTCTTTATATGCTAATATTTTTTTGAGAATTCGTAATTACTTCCAGTGAGCATAGCGTGCATCGAGATAATCTATTTCATAAACTTTACCTAATTTGCAGGTGAACTGAGAAGAAATCTGCACTTACGGCTACAACTTCCCTTAGATCGTCCTTTATTACGAATTTCAAATGCACTAAATTTTTCCATAGGAGGGACAGATAAGAAAGCATCAAAAAGTGGTATGGTGATATGTATATGTTGTTAGAATGTTATACTCCCTCCATTTTAGAATGTAAGATGTTTTTGTTTTGCCCTAAGTTAAACGACTTCAAGTTTGACAAAGTTTATAGAAAAACATATCAACATTTCCAACAACAAAAAAGTATATTATAAAAATATTTTAAATGTTGGATTTAATGAAATTAATTTGGTGCTGTCTAATGTCTGCTTATTGATTTCCGTTTCTTGACACTTTTATTTTGAAAATAATTTTCTTTTTTTCATTATGATCCACCATCGAGTTCAGGTTCATCATTGCTTCGGGATGTCCACAGAGAGATTCCATCTAGTGGTGGTTTGTAATTTCTCTATATTTTAATTTAAACATAATAAGAAATCCTATGGATATTTTTTAGGGAGATAATGAGTTTTCATTTCTTATTTACTGCAGTATCTGGAGGAATTATATCATTGATTGATGGTTCCTATGAGTACTACCATTACCTTCATGATGGTATTGATGACAATGTAATGCCTGGGTTCCATCTATGCTGAATATTTTTACCTCAGTATCGTACAGTTTGTTTTTGAGTATTTTGTTCAAGCTGCCTATACAACAAAATATTGATGGTTTAGCTTCAGAACAGATTATAGATCCCTAATATGAATGTTGACAGGTAGTAAGTTGAGGTACACGTTACCAAAAAGATTGACATTGATGTGGAATATAAACGAAATATTAGAAATAAATTCAATAATAATGTTTTACAGAACTGTAATCATTCATTGGTGCACCACAGAATCGTAGTTTCAAAAAGATCATTGTAACCATTCTGAATCAAGCAGAACCAATACGATGACTTTGGCTCGACACATGACTGCTTGACTTCTTGTTTTTAAGTATCATCTCTTTGATTCTTACTTTCTCTTATAAAAATCTCTCTTCAACTCCTTGCATCGAAGAGGGACAAAGCCACCTTAAAATTTGCAACAATAAAATTAACTGTATCTGAACATGAAAACACTACCATACGTCAAACAGGTGTTAGTGGTGTTTCGGAGCTATTTTCCATGCCCAACACAGTATCTTTATAAACACGATACCTCCTAGACATGATCATGCTACATAGGCTTACATTCGAAGTTCTTCCACCTCAAACTATGATGTTAGGTTTCATGCACAACTGTCTAGTAATAGCAGAAGTATGGGAAGACACTTCGTAATTAGCACACTTAAATTTCGAAAGTAGATTCCATATTGGCCACAGTTGCTTGCCTTATCACCAAGCCAAAACTTTGGTATTACAGGATGAGACCTAAATATTGTTGTGCTGCTTTGGATTATCCAGTTAGCATTTTGCAGTGTATGCCTGGAGGACAATATCTAGAACTGTGTTTAGTGTCCTCTTCATATGTTTCTAGACTCTTTGTATCTGACCTACTGTTGTTCTGACCAGTCTTGGCCATTTTTCTATTTCAGGGATGGGGATGTGCTTATCGTTCTCTACAAACTATCATGTCTTGGTACAGATTGCAACAGTATTCATCTATAAATGTTCCATCACACAGGTTTGTATGTACTAATATTTTTCATGCCTACATTTCTTGTTGTTTACCGTCATTACATCTATATTTGTTCGATATAAGTATTAGTAATGTATTCTTGAAAACCGGAACAGAATTGTGGTATTTTTGGTATGCTTTACTTAAAATGCAATTAGTCTAGTGTTGTTGATTAATAACATAAATCTAGCTTGCCATATGTGCTTTCAACTGGAGAGACTTTTACAAATTATGACGTCAGACTGATTCATGTATTTGAGACTCCTATTCAGGGAGATTCAGCAAGTCCTTGTTGAAATCGGTGACAAGGATCCATCATTTATTGGATCTCGAGAGTGGATTGGAGCAATTGAACTAAGCTTTGTCCTTGACAAACTGCTTGGAGTATGTTTCTATTTTACTTCCATTTTGATGAACAATTATCTAGATCATTTTTTTTCTGAGAATGGGAGGGCTTTGTTAGTTAATACCTGAAGTCCATGTTATTAATTCAATATCGTATCTTGTATATTTTGTGATTCCAATGTCTATTTCAAATTGGCTTGTGGTGTTGCCTGTATACCTTTAAGCAAAAAAAATCAAATTATATCTCAAGCAAAAAGCAGATATAAATTTGTTATTGCTAGATGTTGGTTCTGTGGCATGTCATGCTATCAGATTACATGATTGTTCACAGTAAATGTAGCTTGGAATTAATTTCTCCGCAGTTTCTGTTGCCCCTGTTATATGTTAAATTAAACTGAATTTCAAATTGCTGCACATCGAAACCATTCTAGAATCTAACAATCTGATCAACTAGAAGCAGAACTTATCTGAGAACACATACCTTAAAGCAGTTTCCTGTGTTGGCACCAGGCAATTTGTTTCCATGTTAGCTTTATGTAGTTTTCTATGTTGATATCATGCCATGTACCATGTTAGCTTAACAGAATATGTGGCAACAGGTTAGTTGCAAGGTTATTAATGTGAGATCTGGTGATGAACTTCCTGAGAAATGCAGAGAACTTGCAATCCATTTTGAAACCCAGGGAACTCCTGTGATGATCGGTATGTGCTTTGTTCTACTTGTTTAGTATTATTGTTTGTATCAAACACAGAAACCTTCCTGCAATCTACCCTTATGGTGTAATCATACAATTTGGCTTTTGGTAGATGCACTAAATCAACATGAAAAGTTCCAAAAGGAAGATGATGGCATAGTATATCGATTATTGTAGCGTTCTTAACAATTTGACATTCAAATTCATATTTTGTTTGAAATACCCCAAAAAAAGTATTAAATTTTGTGATGAGAAACAGGTCCTTTTGTTCTTTCATTTTCCTTTTTGTTTATCAGCATTTCTTGTTCTTAATGTAGAATGATGTCAGCTAATGTCATTTAACACCTGATGTCGGCTGTGTTCTTAGGTGAGGGTTGGGAACCCTCACCTCCTGCAAGGAAAACGGAGCGATGGATTAGTGCACGATTAATTAAGTATTAGCTAAAAAAACTTTAAAAATGGGTTAGTATGATTTTTTAAAGCAACTTTCCTATAGAAAATTTTTGCAAAAATACACCGTTTAGCAATTTGGGAAGCGTACGCACGGAAAACGAGGGAGAAGAGGATGGGAACTAGAAGAGCCGAATGCAGCCTTAACCAAGCAAGATTGCATCTCTACTACTTTAAAAGCCAGTAGTGGTGGTGGCAGTGAGTCTGCCTCCACCACTACCAACTGACATGTGGGATCTAGCAATAGTACCAAATTATATTTTAATATAATATATGTTGGTATATCAAATTAGAATAAAAGAAAGGAGAGTGTAGGATAGTCGTAGAATATGGATAGTTTTGATCCATTCTCTGTATATATAATATAGGCTTTACAACAAATAATTAAGTTGTCTTTCTTAACTTCCGTGGCAATGCACAGACATTTAGCTAGTGCTTGTATGATGCAACCATCAGTGGACAGCAACATTGCTTGAGTCGAGATATTAAATACTAGAATGAATATTCTTGCCTTCCGTGCAATTCCACTTTTTTTCTAAACTGAACCCTGCACTTCCACTTGTTGAGACTAGAATGCATTCATCTCCTCCCTGCTCTTCACGTCAAAGAAACATTTGAAACCCTGACGTGATGTTATTCATGGTTGTCTTCAAATAGTTTTGGGTCAATTATGTGCTGAAATCCTGACCCAAACTAATGCAGGTGGTGGAGTCTTGGCTTACACCCTTTTAGGAGTTGACTACAACGAAGCCAGTGGTGATTGTGCTTTTCTCATCCTTGATCCACACTATACTGGTGCTGATGATCTCAAGAAGATCGTGAATGGTGGATGGTGTGGGTGGAAGAAATCCATCGACAGCAAAGGCCGTAGCTTCTTCCTGAAAGACAAGTTCTACAACCTTCTTCTACCCCAAAGGCCTAATATGGTGTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA037249