BGIOSGA034280
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA034280 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J023105K02, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034280, complete gene. |
| LocusTag |
OS11G0217500 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA034280-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA034280-PA |
| Length |
8740 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 11:5626945..5635684 |
| Sequence Coding Region |
5635568..5635684,5635056..5635191),complement(5634789..5634940,5634422..5634505),complement(5634285..5634347 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:5626945..5635684 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:5626945..5635684 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGATTTAAATGCCTCACCATTGCCTGAGGAAGATGAACAGCCTTATGAACAACAGGTCGAGGTTGATTTTGCACAGGAGGAGCATGTTGAGTCTGCTGTTGCTACAATGCGAAGGGAGCGTGAAGAGAGACGCAAAAAATTAAAGAGAGAGCAACAAGATGAAGGCTCAAGATTACATTCTCAGCAGATTAGGAACGATTATGCACCTTATAACAGAGCTGGTAGAGGTCGAATAAAAGAGGCACCTGATGGTTGGATGAATTGTCCAGCATTTGGTGAGCCAATAGACAAAATCATACCTTCCAAGGTTCCTCTTGATGAAACATTCAATGACTCGGTGCCTCCTGGGAAAAGATATTCTTCCAAACAAGTAGTTAATAAACAAAGAAAAGCTGGTCGTGAAATAGGTTTGGTGATTGATTTGACAAATACTACTCGATATTACTCACCTGCAGAATGGACAAGGCAAGGTATTAAGCATGTCAAGATTCCATGCAAGGGAAGAGATGCTGTACCTGATAATGAATCTGTTAATTGGTTTGTCTATGAGGTGATGATGTTTCTTGACCGACAGAAGCAGTCAAAGAATCCTAAATATATTCTTGTTCACTGTACCCATGGTCATAATCGTACTGGTTTCATGATTATCCATTACCTTATGCGAACACAAGTATCCTGCGTCGCTGAGGCGATAAACATATTTGCAAAAAGGAGACCGCCTGGTATATATAAGAGGGACTACATTGAAGCACTGTATTCATTTTATCATGAGGTTCCTGAGCATATGATAACATGCCCTTCAACACCAGAATGGAAAAGGTCATCCGATCTTGATTTAAATGGTGAAGCCAAGCAAGATGATGATGATGAGAATGGTGATCTTGCACCAGTACATAATGAGGTGGAAGATAAAGTTATCACTAATGATGATGTGCTAGGAGATGCTGTACCATATGATCAGCAAGATGCTCTGCGTGTCGTATGTTATCGCTTGCTGGAAATGCCCCCTGTGAGAGGGCATGCACAGTTTCCTGGATCACATCCTGTCTCTCTTAACAGTGAGAATTTGCAACTACTCAGACAGCGATACTACTTTGCTACATGGAAAGCTGATGGAACCCGATATATGATGCTTATAATGAGGGATGGCTGTTTCTTGATTGATCGGAATTTTTGCTTCAGAAGAGTTCAAATGCGCTTTCCCCATAGGAATCTTAATGAAGGACTACATGAGATGACTTTGATTGATGGAGAAATGATTATAGACACAGTACCAGATTCAGGATTGAAGAGGAGGTATTTAGCATATGATCTGATGGCACTTGATGCCGTGTCAAAAACCAAGTTGCCATTTTCTGAAAGATGGAGGCTGCTTGAAGATGAAATAATTCGTCCACGTTATTATGAAAAAAAACAGTTTGAGAGTGGCGTTAAGAGCAACCCAATGTACAAATATGATATGGAACTATTTTCGGTCAGGAGAAAGGATTTTTGGCTTCTTTCTACAGTAACGAAGCTACTTAAGGAGTTTATTCCATCACTTTCACATGATGCTGATGGTCTTATTTTTCAGGGCTGGGATGATCCATATGTAACTCGTACCCATGAAGGTCTTCTCAAGTGGAAATACCCTTCAATGAATTCTGTTGACTTTTTGTTTGAGGTTGGGGGTGACAATCGTCAGCTTGTTTTCCTTTATGAGAGAGGCAAAAAGAAACTTATGGATGGTTCCCGCATAGCATTTCCAAATGACGAAGATCCATCCTCTATCTCAGGGAGGATTGTAGAGTGCTCTTGGAATAAGGAAGAGGGCTGCTGGGTCTGCATGCGTATTAGATCTGATAAATCAACTCCAAATGATATCAACACATACCGCAAGGTAATGAGGAGCATCACAGATAATATCACCGAAGAGAAGCTTCTAGAAGAGATCCATGAGATCACGCGCCTCCCGATGTATGCGGATAGGATAAAGCAGGCTCAGGCAAAGATGGCCCAACATCGACGAAGATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MDLNASPLPEEDEQPYEQQVEVDFAQEEHVESAVATMRREREERRKKLKREQQDEGSRLHSQQIRNDYAPYNRAGRGRIKEAPDGWMNCPAFGEPIDKIIPSKVPLDETFNDSVPPGKRYSSKQVVNKQRKAGREIGLVIDLTNTTRYYSPAEWTRQGIKHVKIPCKGRDAVPDNESVNWFVYEVMMFLDRQKQSKNPKYILVHCTHGHNRTGFMIIHYLMRTQVSCVAEAINIFAKRRPPGIYKRDYIEALYSFYHEVPEHMITCPSTPEWKRSSDLDLNGEAKQDDDDENGDLAPVHNEVEDKVITNDDVLGDAVPYDQQDALRVVCYRLLEMPPVRGHAQFPGSHPVSLNSENLQLLRQRYYFATWKADGTRYMMLIMRDGCFLIDRNFCFRRVQMRFPHRNLNEGLHEMTLIDGEMIIDTVPDSGLKRRYLAYDLMALDAVSKTKLPFSERWRLLEDEIIRPRYYEKKQFESGVKSNPMYKYDMELFSVRRKDFWLLSTVTKLLKEFIPSLSHDADGLIFQGWDDPYVTRTHEGLLKWKYPSMNSVDFLFEVGGDNRQLVFLYERGKKKLMDGSRIAFPNDEDPSSISGRIVECSWNKEEGCWVCMRIRSDKSTPNDINTYRKVMRSITDNITEEKLLEEIHEITRLPMYADRIKQAQAKMAQHRRR</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..117#494..629#745..896#1180..1263#1338..1400#2696..2833#2909..3115#3402..3515#3728..3777#4397..4559#4645..4767#5774..5902#5996..6094#7499..7588#7690..7774#8094..8224#8606..8740#ATGGATTTAAATGCCTCACCATTGCCTGAGGAAGATGAACAGCCTTATGAACAACAGGTCGAGGTTGATTTTGCACAGGAGGAGCATGTTGAGTCTGCTGTTGCTACAATGCGAAGGGTACTACATGACACTCATCCTGCATTTACCTTTTGGTTCCATCTAGAAGGTTCCTAATGATAGCTGATTATTTATTACTGAAATGCAAACTGTACATTTTATCTTCAGCAAGTTCTCTTAGTTAATATCGTTAGATGATGGGAAACAACTTGGAAGTTGTTAATGTTGGTTTACATATGTTCCTTTTCCTAGTTTTACTGGTATGTCGCTTCCTTTGTTTGCATAGCATCCAAATTTTCTGCCTTTTGTTTTGGTCATGCTTCAGATAATCTATTTTGAGGATTGGAAAGTGGTGACTGTCTGTTTCAGTTTTTCTTAATGGCAAGCATGCAAACTTGCATGCCACCTTTTTATGTTAATCTTGCCATTGTTGCAGGAGCGTGAAGAGAGACGCAAAAAATTAAAGAGAGAGCAACAAGATGAAGGCTCAAGATTACATTCTCAGCAGATTAGGAACGATTATGCACCTTATAACAGAGCTGGTAGAGGTCGAATAAAAGAGGCACCTGATGGTATGAAATGTTGGAAAATGTTTCTAACTGTTATCAACTTTATATGGCAATTTCTAGCTATGAGCATGCGCAAAATGGATTTTGACTATTCTTGCTTTTGTCTATGTTACTTCAGGTTGGATGAATTGTCCAGCATTTGGTGAGCCAATAGACAAAATCATACCTTCCAAGGTTCCTCTTGATGAAACATTCAATGACTCGGTGCCTCCTGGGAAAAGATATTCTTCCAAACAAGTAGTTAATAAACAAAGAAAAGCTGGTCGTGAAGTAAGTATTGACTTGTTGATTATTTTTATAGTTTGTAGTTGTACTACGTACTTATTTCCCTTTTGTTAATTGCGAAGATGATGCTGTTTTCAATTGATATTATTGTATAAATAAAAGATTGCAATTCTGAAATTCTTTTGTGAAACATGTGCACTTACTGCTCCTCCTCTTGTTCGAAATGTTCATATTATTGGCATGGTACGGATTATCTCGTATGCGTACATTCCTAGTCAGCCCCCTTTTGCTAACAGAACTATACCGATTTTTTCCTATCCCTTTTCAGATAGGTTTGGTGATTGATTTGACAAATACTACTCGATATTACTCACCTGCAGAATGGACAAGGCAAGGTATTAAGCATGTCAAGGTGAGAGAACTTAAGCTTATCTGCATCCTTGAAATCAAAAGGGCCTTTCCTATGTTAACACATTTCTGTTTTAGATTCCATGCAAGGGAAGAGATGCTGTACCTGATAATGAATCTGTTAATTGGTTTGTCTATGAGGTAACACCTATATTTGGCTACATGTTTTGTATCAGCAGTATATTTGATTCTGGTGTTTATTTGTCCAAGTAGGAGTCTGTTGCTTAATTCTTTCACATTTTTAAAGTATTTCATTTGTTTTCCTATCCCATTGTGTTTGCAATTTGTTTCTCGTGAGCTGTTTTCTTTTTGTTCCTCAAGTGTTTGAGCTTATTCTCTAAGGGCATGTTCAGTTAATCCCCATGAGGAAGTGATTGGAGGGGATTGAGATTTGAAAGATGTGGAATTAATCCCCTCCAATCCTCTTGGGAAGGGATTAACTGAACCAAGGCCTAAAAAGTAGTTTTACCTTTTAATTAGGAGCTACATGTTTTTAACTTCATGTGATATTGATTAAGTTGTGCAATGTGTCAATATATACCTATTATGATGTTTTGGTCTGCACATGTTAAAGGTGCCATGACAGTTTAGTTATTAAATGGTTATGAACTGCAGATTTTGGCTTTGCATGTAACTACCGTGTGTCGTCTTGGAACACGTGAAGCCAAAATTTTGGAATTTTTTACCTTTATTATTATTTCTAAAAATAAATGTATTTGCCGCATGTAATTGTAAATTTGATAGCTCTCTTTTGTATTTTTTTGAAACATACATACAACTATAAAAAAAAGTGATGGTCAATGTGTCCATCGGAGACTCTCTGTCAATACCCGTGGCGGAGCTAGGTTCTCAACCCTGTGCGTTCAAAATGCATAAATATGTAACTATGTGGGGTCAATCCATACAAATTTTCATTGTTTTATGTATTTCTTCACTATTTTTCACATGATCAAGGTGTATGATGCAACCCCACAGTTTTAACGTGGCTCCGCCACTGGTCAATACGTATAACGAATTACAGTTTGCATCAGAGGGAGTACTTATTTCTTCGCACGGTAGTTTATACCTACTTTGTAACTTAAAAGGTGTTTGCACTTTGGCATCTTTCATTATCAAAGATCCTGTTACCTGTATGCATATTTCTTTGGATCATCAGTTCATGGGAATGGTGTATAGTGGTTAAATGATCTAGGTTTTTCTGCAACAACAATTTGGGCTCACCAAATTCAATGATATACCCGTTGAAGTATATAAACCATTATATATATATTTTCTGTTACATTATTTTTAATGACTTATTTCCTCATCTGCAACCAATGATTTTCTTTATTATTTTGTACCATAGAACAATAGATTCAGATGTATGTAGTTAGCAACCATATGTACAGACAGCATTCAATGTATATTTATGGAATGATTTTTTTCTGTTATTTCAGGTGATGATGTTTCTTGACCGACAGAAGCAGTCAAAGAATCCTAAATATATTCTTGTTCACTGTACCCATGGTCATAATCGTACTGGTTTCATGATTATCCATTACCTTATGCGAACACAAGTATCCTGCGTCGCTGAGGTATGCCAACTAGATTCTCAATGTTGTTTGTTTGACTTCGTTCTACTGTTCTTCTTGACCTCATTTTCATTCTAGGCGATAAACATATTTGCAAAAAGGAGACCGCCTGGTATATATAAGAGGGACTACATTGAAGCACTGTATTCATTTTATCATGAGGTTCCTGAGCATATGATAACATGCCCTTCAACACCAGAATGGAAAAGGTCATCCGATCTTGATTTAAATGGTGAAGCCAAGCAAGATGATGATGATGAGAATGGTGATCTTGCACCAGTACATGTAAGCATTTTCAGATATTCAAATCTGAAATTACTTCCAAGTAATTTGGTAGAGAATTAAGTGCCTGATTCCTTGTAATTCTCGAAAGGTTTTTCATTTATGGACATAAAGGTAGAGTTTTGAGTTCATACGACCTACTTTATTATTTGATTGGATTTTTGGACTTTACTTTGGATGTAATTTACTATATCTCCTGGCTCATATTGTTTTTTTTAATTGTCGTGAAGCAAACTTGCTTGGAATATTCAAAGCTATTTTCTTGCTTTTGAGCCCTTGTATCTTGCAGAATGAGGTGGAAGATAAAGTTATCACTAATGATGATGTGCTAGGAGATGCTGTACCATATGATCAGCAAGATGCTCTGCGTGTCGTATGTTATCGCTTGCTGGAAATGCCCCCTGTAAGTATAAATTTTATATGGTCAATTGAACATCCATATGTGCACATACAAATTATGTTGTCTGTTCATCTAGTCTCCTTTTTAGCTGTTATAATGCTTGTGCTATTTTCAACTGGTACTTATGTTCTGTAACTTTAATAGTTTCTGCATGTGTTGCCAACCACAACTTGTGTTTCTTACACGCTGCTATAATAGCATTTGTTTTGTTACAGGTGAGAGGGCATGCACAGTTTCCTGGATCACATCCTGTCTCTCTTAACAGGTGGCTAACAGTAATCTGGACTTCATGCATTGTTTGTAATACTAGTAACTTATTAGTATCTGTGTTAAGTCCATTATCTCTTACATGTTATCTGTGCGTTTTGATTTCTGATGTTCTTTGGGGCTTTGCAGAAAGCAAAACTGTAGAAAGTAGTTTATGAAAAATTTAAATCTCTGCCTCTAATATAAGGTTGGTAGGTAAAATTTGTGCACTTGATGGGTTGGAAATATGCACCCAACCCCTTCTCTTAGAAAGCTCCATTTCACATATGAACAACAGATTTCTGATTGCAGAAAGCCTTTCTTTTATGTCATTAAGTTCTTCAGATCTTTTCATGTAACTTGTCCCAAATTTTTTTATGTACACATATTAAAACTTAAATGCGACTCTTTTTTTATTAGTTAAGCCTTGAAACTATGAGATCGCGCCTGCTATGCTGAAGAAAATTATTGTTCTTTCAGGGGAGGAAAGAAATGCCCGGTTTTGATTTAGAGGTTTTTTTTTGTAGCGTCCTTTTTCTCGTATGAAACTATTTTGTTTCAAATGGTCCTTATTTAGTATTCATTTGATTCCCACTCTAACTATGTTCTTGTTCTAAATTCCTTTTTACGCTCCGCAGTGAGAATTTGCAACTACTCAGACAGCGATACTACTTTGCTACATGGAAAGCTGATGGAACCCGATATATGATGCTTATAATGAGGGATGGCTGTTTCTTGATTGATCGGAATTTTTGCTTCAGAAGAGTTCAAATGCGCTTTCCCCATAGGAATCTTAATGAAGTAAGATCCCATTATTGTTCTGGAGAAAAGGTCGTACTGCATTTCGTTTTGCAAAAAGTTAACCTTATTTCTTTTCCAATCCAAGGGACTACATGAGATGACTTTGATTGATGGAGAAATGATTATAGACACAGTACCAGATTCAGGATTGAAGAGGAGGTATTTAGCATATGATCTGATGGCACTTGATGCCGTGTCAAAAACCAAGGTAGAATAATTTTTTATCCAGTTTATGTTCTGTTATTTGA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