BGIOSGA034219

From RiceWiki
Revision as of 17:42, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA034219

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034219, complete gene.

LocusTag

OS11G0244300

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA034219-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA034219-PA

Length

5793

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:6770561..6776353

Sequence Coding Region

6775385..6776353,6774420..6774639),complement(6772702..6773265,6771192..6771912),complement(6770685..6770760
,6770561..6770593

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:6770561..6776353 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:6770561..6776353 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCACAGAAGGAAGAGATCATCTGGCTCCAGTAAATGTGCATATCTTACGAAGTCTTCCCAAGGCACGCCACTCTTAGATGATAGTTGTCATTTTGCTTATTCATCATTTGATTCAACAAGTGATGAAGTTTCGACCATCTTTGGAGAATTAGATTTGGAAGCTTTGAGCAGATTGGATGGCCGAAGGTGGTCAAGCTGTAAAAGTCAGGATGGGATTGCACTGCCTATGAGTGGAGCTGATCATGCAGTTTCGGACCAGAGAAGCTTGAGCCAGAAATACCGACCAAGGTCATTTAATGAACTTGTTGGTCAGAGTTTTGTAGTACAATCACTTAATAATGCCATCATAAGAGAAAGAATAGCCCCAGCATATTTATTTCATGGTCCTCGTGGGACAGGAAAAACATCTGCAGCAAGGATATTTTCAGCAGCTTTAAGTTGTGTTGCTATTGGGGAGAACAAGCCCTGTGGGGCTTGTATGGAGTGTACGGACTTTTTCACTGGAAATGGAATTAATCTAATTGAAGTTGATGCTAGCAATAGAAAAAGTATAAATAGAATTAGGCACTTGATTGAAAATATACCAGCATCTGCAACTTCTTCACGATACAAGGTCTTTGTAGTAGATGAATGCCATATGGTATCTTCTAAAGTGTGGTCAGCATTTATGAAATTTCTTGATGAACCATTACCTCGTGTTGTGTTTATATTTATAACAATAGACCCAGAAAACCTTCCTCGTGCTGTCATATCACGTTGTCAGAAATACATGTTTTCCAAGATCAAGGACATTGACATAGTATGTCGGCTGAGGAAAATTGCTGTGAAGGAAAATCTTGATGTTGAATTGGCTGCTTTAGATTTGATAGCACTAAATTCAGATGGATCACTAAGAGATGCAGAGACTATGTTAGATCAGTTGAGTTTGCTTGGGAAAAAGATTACACCTTCACTCGTAAATGATCTGGTTGGGGTTGTGTCTGAGGAGAAATTACTTGATCTTTTAGAGATAGCCATGTCAGCAGACACTGCTGAAACAGTGAAAAGGTCCAGAGAACTGATGGATTCTGGTGTTGATCCGATGGCATTAATGTCTCAATTAGCTGGGCTCATAATGGACATCATTGCTGGGACTTATAGGTTAGCTGACCCTACTTGTGGTGGAGAAGGAATTGGTGGTCGAAACATTACTGATGCCGAGTTGGAACGATTACAACAAGCTTTGAAGATTCTTTCTGATGCTGAGAAGCAGATAAGGCTTTCAAGTGAGCGTTCTACATGGTTCACTGCAGCACTACTCCAGCTTGGTTCTGGTCATAATTCAGAAATGATCCAGTCAAGAAGCAGCAGTAAACAAAGTGCTAAAGCAACCAGTGAGATTGTGATGGATGCAGTGAGAGAATCCTCTGCTAGCAGGACTACAGCTCATCCTCTATTCACTTTGCGTGGTTCAAGGAAAACACTGGACCTCAGAACAGCCAGTGGGCACTCCAGTCCTCAGGGTGTTGTTTCAGTGTCTTCCAGAATGAGGGCCAACGACAACTTAAAGCATGGAGAATGTAGGTCTGTTGATAGAGTTTTACAAGATTCTGCTCAAAGAAGTAATTCTTCTGAGCTTAGGCCTATGACTAACGTAAGCTCAGATAATCTTGCCCGAATTTGGAGAAAATGCATAGATAATTGTCACTCCAAGACATTGAAGCAGTTACTCTGTGATCATGGGAAGCTAGCATCTGTCAAAGACTATGGAGGATATTATATTGCTTTCATAGCATTTGAGGGCAGTGATATAAAGTCTCGAGCTCAAAGATTCACGAGCAGCATCAGAAATTCTATGGAGACTGTACTGAGATGCAATGTAGAAGTCAGGATCGGTTTAATGCCAGAGCTTCTTGCTGGAGGACTAAAACGTGAGGAGGACTTGGACGAAAGAGATGAGTTTGATGCGTTGAGTTGCTCAACAAACAGTGATCGACTAAAGGGAATTCGAAACCCATCAAGAAATTTAAATTATTCTGAAGAGATCGAGAAAAAACTGGAGAAATTCAGCTGTGCTTCTGCTAGTGGAGGTTTGCAGTCATGCACCACTGAAGGGAACACAGGAATGCATAGAACTAGAGGGAAAGAAGTCTCTGTTGAACAAGCGAAAGCCGTGACTGTTGAGGAGCAAAGGTTAGAAAGTGCATGGCTTCAGGCTGTTGAAAAACATGCACCTGGGATTTTGAATCAAATGAGACCTGAGAGAAATCAAGTTGTGCCACGAATTAGCGGTGAACAGTACCACAGGATGCCCGAAACGGACACTGTTTTTCCCTCAAGGCAAGTCGACAAGGAACTGAGCAATGGATTAAAATCCTTAAATATTGGCAGCCATGGTCTCCGCCAGAATGGACAAATGGAAAATGGATATGCCATTTCACCAAGCCTCTTGCATAGCAATAACCACTTGGCAAACTGTGACAATGAGAGTGTGGTCTCTGAGCCCGGAGCACCTGGCTGTCATGGTCTGTTCCCCTGCTGGAAAACTGAAAAATCAAAAAGAAGAAAGGCAAAAGGGCAAACTCGTTTGAAGTCATCTTAA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MHRRKRSSGSSKCAYLTKSSQGTPLLDDSCHFAYSSFDSTSDEVSTIFGELDLEALSRLDGRRWSSCKSQDGIALPMSGADHAVSDQRSLSQKYRPRSFNELVGQSFVVQSLNNAIIRERIAPAYLFHGPRGTGKTSAARIFSAALSCVAIGENKPCGACMECTDFFTGNGINLIEVDASNRKSINRIRHLIENIPASATSSRYKVFVVDECHMVSSKVWSAFMKFLDEPLPRVVFIFITIDPENLPRAVISRCQKYMFSKIKDIDIVCRLRKIAVKENLDVELAALDLIALNSDGSLRDAETMLDQLSLLGKKITPSLVNDLVGVVSEEKLLDLLEIAMSADTAETVKRSRELMDSGVDPMALMSQLAGLIMDIIAGTYRLADPTCGGEGIGGRNITDAELERLQQALKILSDAEKQIRLSSERSTWFTAALLQLGSGHNSEMIQSRSSSKQSAKATSEIVMDAVRESSASRTTAHPLFTLRGSRKTLDLRTASGHSSPQGVVSVSSRMRANDNLKHGECRSVDRVLQDSAQRSNSSELRPMTNVSSDNLARIWRKCIDNCHSKTLKQLLCDHGKLASVKDYGGYYIAFIAFEGSDIKSRAQRFTSSIRNSMETVLRCNVEVRIGLMPELLAGGLKREEDLDERDEFDALSCSTNSDRLKGIRNPSRNLNYSEEIEKKLEKFSCASASGGLQSCTTEGNTGMHRTRGKEVSVEQAKAVTVEEQRLESAWLQAVEKHAPGILNQMRPERNQVVPRISGEQYHRMPETDTVFPSRQVDKELSNGLKSLNIGSHGLRQNGQMENGYAISPSLLHSNNHLANCDNESVVSEPGAPGCHGLFPCWKTEKSKRRKAKGQTRLKSS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..969#1715..1934#3089..3652#4442..5162#5594..5669#5761..5793#ATGCACAGAAGGAAGAGATCATCTGGCTCCAGTAAATGTGCATATCTTACGAAGTCTTCCCAAGGCACGCCACTCTTAGATGATAGTTGTCATTTTGCTTATTCATCATTTGATTCAACAAGTGATGAAGTTTCGACCATCTTTGGAGAATTAGATTTGGAAGCTTTGAGCAGATTGGATGGCCGAAGGTGGTCAAGCTGTAAAAGTCAGGATGGGATTGCACTGCCTATGAGTGGAGCTGATCATGCAGTTTCGGACCAGAGAAGCTTGAGCCAGAAATACCGACCAAGGTCATTTAATGAACTTGTTGGTCAGAGTTTTGTAGTACAATCACTTAATAATGCCATCATAAGAGAAAGAATAGCCCCAGCATATTTATTTCATGGTCCTCGTGGGACAGGAAAAACATCTGCAGCAAGGATATTTTCAGCAGCTTTAAGTTGTGTTGCTATTGGGGAGAACAAGCCCTGTGGGGCTTGTATGGAGTGTACGGACTTTTTCACTGGAAATGGAATTAATCTAATTGAAGTTGATGCTAGCAATAGAAAAAGTATAAATAGAATTAGGCACTTGATTGAAAATATACCAGCATCTGCAACTTCTTCACGATACAAGGTCTTTGTAGTAGATGAATGCCATATGGTATCTTCTAAAGTGTGGTCAGCATTTATGAAATTTCTTGATGAACCATTACCTCGTGTTGTGTTTATATTTATAACAATAGACCCAGAAAACCTTCCTCGTGCTGTCATATCACGTTGTCAGAAATACATGTTTTCCAAGATCAAGGACATTGACATAGTATGTCGGCTGAGGAAAATTGCTGTGAAGGAAAATCTTGATGTTGAATTGGCTGCTTTAGATTTGATAGCACTAAATTCAGATGGATCACTAAGAGATGCAGAGACTATGTTAGATCAGTTGAGTTTGCTTGGGAAAAAGATTACACCTTCACTCGTAAATGATCTGGTGAGTTACTGCTCAGATTATTGGCTATCTTTTGAATTATCATTTCTGCTATTTTATTTGAAGTTGTGCTTGCTTCTTTAAGGATTTCGTCGCGATTTGCACATATCCAAATGGAGCTTGTATGTATTGAATATGTTTATTGTGTTCTAGTTTAACCAACAGGGAAGAGACCCTGATAACATGATCGATGAAGCTGAATAAAATTAAGCTAAGTTGAATGTCTTGTTTAATCAAAGCAGTGCAAAAAAATTAACATATACTCCCTATCAGTTTAGAATGCGAGTATTTGGTTAAAAAAAGACTTGGGTTCATTCAAACCTTGAAATCTTAACTCACAGATATATGCAAAAAACATTAAGAGTTGATATGATATGAGAAAATACTTTCATGTTATATTTTGATATTTTTTTATGGATATGATTAGGAAAGGAAATGATCAAACATTTATATAGGAGACTGTGTGTGTTGTTCAACAACAGAGAGAGTAATCATACCTTCAACAGTTGGCTTAAGTTCTCTGGGATGTGTACTGTCATAGTTAGCAGAGTCCAAGGATTCTCCATAGCAAATTTAGAGCCTGTAAGCACAATCCAATCAAATAGGCAATCCATCAGCTAGTTGCTTTTTAATTTAATTGTACTTATTGATCTGTTATTGGAATCCCGCATGAATGAATTGACCTATCTTTGTTATATAATATGAATTCACTATCCAAATTAGTTACAATGTTTTGAATAAATTTCAGGTTGGGGTTGTGTCTGAGGAGAAATTACTTGATCTTTTAGAGATAGCCATGTCAGCAGACACTGCTGAAACAGTGAAAAGGTCCAGAGAACTGATGGATTCTGGTGTTGATCCGATGGCATTAATGTCTCAATTAGCTGGGCTCATAATGGACATCATTGCTGGGACTTATAGGTTAGCTGACCCTACTTGTGGTGGAGAAGGAATTGGTGGTCGAAACAGTGAGTATTTCCAATTTACTAGTGCAATACTATCAAGTTATGCTGTTTTATTGAATTATTGCTCATCCATGCATAATTTTTTCCACAGAATATCAATATTATATCATTTTGATTAGCTAGATTAAACTGTTTTATGCTCTTTCTTCATATTTGTAACGTGGAATGTAGTTTTTGAAGTTTGTTCTCATTTATTATGGTGTGACACTGTGACTGTTTTGTGCTTGTGATTCTTATGCTCCCAGTCAAAGGTGTTGAATAACACAAAAAAATTGTGGTTTTCAAGGTACTATACTACTATAGAGGCCAATTCATGATGCATTCTTATTAGTATCACGATTTTTCCTGTTGTGCTACTACCGATGGAAGTTTTAAATTACTTTTGTTCAATACTTCAGTACTAAAAAGAAGGAAAAATGGCATGTCAGGTCCCTCAATTCTCAGTCTATCACTTTTTTAACTTTTACCTTAACTTAAAAAACCATTTACTCTACATCATCAAACTTTTAAACTGGATCAAATCCACTATTTCAATCCCAATGTTGGTATTGGAAGTGCTTTTGGCCATGTCAGTATGTCACTCAGTTTGCAGGGATAAGGTACCTTGGTGCATGATTATCGCTTACATGTTTACGGATTTGTCATCATTTCTGCCATTTGGATGCTACACCATCCAGTGGGTTTACATGGAAAAAATCACCATGAATACCACCATTAAGGTTGGACTTGGTCCTGTTGAGAAGTTAGAGGACATCAAGTTCATATTTTTATGTTTAGTTCATTAGGGTGAAAATTGTACTCCGACGATAGTTTAGGGACCAAAAAAGGATCTTTCATAGAACAATTGAAAATATGAATGTAACAATCACTTACTCAGTAGGCTATGTGTAAAAAAAAAGAAGATCAATAGTACATACTACATAGTGTATACTGGCACACCTTGTTATCTTTCTTGCTTGGAATTGCTGTTTGTCTGCCACTGTATCTATAATGCCCTACTTGCTGTTACTGCTATTGTTAAAGGGTATTTTTTGGTATTTCTCCTTAGCCTAGGGTTAGTGGGTGTCTCATGACCTCTTTGTAATACAAGCTACATGCAAGACAGCCATGTAGTGCTATCTACATGAAGTTCTCAAACACAATTTTGTTTTATGTAGTTACTGATGCCGAGTTGGAACGATTACAACAAGCTTTGAAGATTCTTTCTGATGCTGAGAAGCAGATAAGGCTTTCAAGTGAGCGTTCTACATGGTTCACTGCAGCACTACTCCAGCTTGGTTCTGGTCATAATTCAGAAATGATCCAGTCAAGAAGCAGCAGTAAACAAAGTGCTAAAGCAACCAGTGAGATTGTGATGGATGCAGTGAGAGAATCCTCTGCTAGCAGGACTACAGCTCATCCTCTATTCACTTTGCGTGGTTCAAGGAAAACACTGGACCTCAGAACAGCCAGTGGGCACTCCAGTCCTCAGGGTGTTGTTTCAGTGTCTTCCAGAATGAGGGCCAACGACAACTTAAAGCATGGAGAATGTAGGTCTGTTGATAGAGTTTTACAAGATTCTGCTCAAAGAAGTAATTCTTCTGAGCTTAGGCCTATGACTAACGTAAGCTCAGATAATCTTGCCCGAATTTGGAGAAAATGCATAGATAATTGTCACTCCAAGACATTGAAGCAGTTACTCTGTGATCATGGGAAGCTAGCATCTGTCAAAGACTATGGAGGTAAACCTGTACTATGAATGCTCTCTTGTTCTTGCACCATTTTTTGTGCTTTCACTAGTTTGTTTCACAAGTTTGCCGAGCTTTAGGACCTACCTTCTGGACTAGGGCTAGAGCTGCTGTATAGCTCTACCGCCTCCACTGAATCGGTCTAAAATTGAGTATTGATTAAATGCTAGTGTGATAGTAGTTGGATGCTTTGCATTTTGCATTCCAGGATGGTGTACAAACGTTTAATGAAGGTATAATGAAGGCATAGTTTATTGCTTGCCTCAAACAGAACGTGTCATTAACTTTTTATTAACTGTAGTTGGTCGATTTAGTGCCTGCAGATTAGGTGAAAGCTCATATTTGATTCTGTTCTAATGTTATCATGTTAATATTATTAATCCGATGGATATTATAACATTAAACCCTCTTTTCCTTGTTTAAGCGAAGTTCTGAGAAACTTTGGTAGTGTTTGAATCTTCTGAAGATGAAGATAAAGTGTTTCACGCAAAACGAGGTGGTAATAACGTGTGATTAATTGAGTTTTAATTATTACAAATTTAAAAAATGGATTAATCTTATATTTTAGAACAACTTTCATATAGAAAGTTTTTGCATGAAACGCACCGTTTAGCGGTTTGCAAAGCGTGCCACGAATATCCAAAATTTAATCCAACTTTTGTTGGAGAAAAGAACAGGGCCTTTATGAATTTCTTTCCCTTCTATACGATTTCCTAATGTTTCACTAATCTAAATTTGAGCTGCTAGCATGCCCAACATTTTTTTTGTAAACTTTATTTTCAGGATATTATATTGCTTTCATAGCATTTGAGGGCAGTGATATAAAGTCTCGAGCTCAAAGATTCACGAGCAGCATCAGAAATTCTATGGAGACTGTACTGAGATGCAATGTAGAAGTCAGGATCGGTTTAATGCCAGAGCTTCTTGCTGGAGGACTAAAACGTGAGGAGGACTTGGACGAAAGAGATGAGTTTGATGCGTTGAGTTGCTCAACAAACAGTGATCGACTAAAGGGAATTCGAAACCCATCAAGAAATTTAAATTATTCTGAAGAGATCGAGAAAAAACTGGAGAAATTCAGCTGTGCTTCTGCTAGTGGAGGTTTGCAGTCATGCACCACTGAAGGGAACACAGGAATGCATAGAACTAGAGGGAAAGAAGTCTCTGTTGAACAAGCGAAAGCCGTGACTGTTGAGGAGCAAAGGTTAGAAAGTGCATGGCTTCAGGCTGTTGAAAAACATGCACCTGGGATTTTGAATCAAATGAGACCTGAGAGAAATCAAGTTGTGCCACGAATTAGCGGTGAACAGTACCACAGGATGCCCGAAACGGACACTGTTTTTCCCTCAAGGCAAGTCGACAAGGAACTGAGCAATGGATTAAAATCCTTAAATATTGGCAGCCATGGTCTCCGCCAGAATGGACAAATGGAAAATGGATATGCCATTTCACCAAGCCTCTTGCATAGCAATAACCACTTGGCAAACTGTGACAATGAGAGTGTGTAAGTAACAATCCATCTTAGTTCTATGGTTTCCTTCTACATAATAAACAATCGCATGCAATCTTTATAGAGCAAACCTAGCTTCATACAACATGCAAATGTTAGTAAGCGAACCAAGCTTTGATTTTTTAGACTCATTATTTGGAACAGTGTAGAAAGTGGATATTGACATGGAAGCTACTTTGGTTCCCTGTCATATTGGTCAATTCTGAATTTCTGATACACTAGTAGTTTTGGAGTAGAGATTTTTAGGCTACCTTTGGATTTGGAATATTCTTCTCCATTTGGTGGTTCAGAAATATTTCAAGTTTTTGATCAAATTCCCTGTGTAGGACACTGAGTTCATTGCTCAATAGGAAATGTTTTTCTTTCAACTTGTTATGCTTACTATTGATCTGCCTGAGCTTAGGGTACCTATATGTGATTTGCAGGGTCTCTGAGCCCGGAGCACCTGGCTGTCATGGTCTGTTCCCCTGCTGGAAAACTGAAAAATCAAAAAGAAGAAAGGTAATACTATAATTTGGTAACTTCCGTATAGAAGTTTGTTTTGATTGTCTCACCTCACAACTTCTCTTTTGATCACACTATGTATTTTCAGGCAAAAGGGCAAACTCGTTTGAAGTCATCTTAA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA034219