BGIOSGA035089

From RiceWiki
Revision as of 18:19, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA035089

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA035089, complete gene.

LocusTag

OS11G0265000

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA035089-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA035089-PA

Length

8647

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:7533927..7542573

Sequence Coding Region

7533927..7534027,7535018..7535202,7535338..7535429,7536703..7536772,7536860..7536975
,7538054..7538150,7538969..7539048,7539202..7539396,7539552..7539635
,7539713..7539773,7540534..7540594,7541026..7541119,7541191..7541263
,7541577..7541659,7542242..7542432,7542564..7542573

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:7533927..7542573 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:7533927..7542573 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGAGCAGCAGCAACAAAGCTAGGAAGGAGGAGGCAGCAGCAGTGGCAGCGCCAGATAAGGAGGCAGTGTTGACGACGGCGGGTGAGGAGGTACGCATGCGGTTCTTGGATCAATATATGGGTTCAACTTCAAGGCCAGTTGATGATGAAGTTCTTGATGCCGCCACCGGGGTACACTACTCTGCGCTCCGTTTGGAAGAGCTTAACATGAATGGCTCTGTGTCAGGGGAGGACCAACCGACAACCTCGGGCGTGGAGAATGGGCACCAGGAGCCATTTGTCATTGGTGTCGCTGGGGGTGCATCTTCAGGTAAAAGTACTGTATGCAAGATGATAATTGATCAGCTACGTGATCAGCGTGTGGTTGTTGTTACTCAGGAGTCCTTTTATTATGGGTTATCTGATGAGGAATTGGTCCATGTTCATGATTATAACTTTGATCATCCAGATGCATTTGATACGGAGTTACTACTCTCTTGTATGGAGAACTTGAAACATGGCAAGGCTGTGGACATTCCTAATTATAACTTCAAAACATATAAGAGTGTAGCAAGCGCAAGAAAGGTCAATCCTTCAGATGTAATTATTTTGGAAGGTATTCTGGTTTTCCATGATTCACGTGTCCGGGACTTGATGAACATGAAGATATTTGTTGATACAGATGCTGATGTGCGATTAACAAGGAGGATTCGACGTGACACCATTGAGAAGGGTAGAGATATCAAAACTGTGCTAGATCAGTATTCAAAGTTTGTTAAGCCTGCTTTTGAAGACTTCATCCTCCCAACCAAGAAGTATGCTGATATTATCATCCCACGAGGTGGAGATAATGATGTTGCGATTGACTTAATCGTTCAGCATATTCGCACTAAGCTTGGTCAACATGATCTCTGTAAAGTACACCCCAATTTGTATGTCATTCAGACTACTTATCAGATACGAGGTATGCACACAATAATACGCGATGCTGCCACAACAACACATGATTTCATATTCTATGCCGATCGGTTGATTCGATTGGTTGTCGAGCATGGTCTTGGTCATCTTCCATTCAAGGAAAAACAGGTCATAACTCCAACTGGATCTGTTTACACTGGGGTAGAGTTCTCTAAAAGATTGTGCGGTATCTCAGTGATTAGAAGTGGTGAGAGTATGGAGAATGCATTGCGGGCATGCTGTAAAGGTATAAAAATTGGGAAGATTCTTATTCACAGAGAAGGAGACAATGGCAAACAGCTAATCTATCACAATGTACCAAAAGATATAGCAAACAGGCATGTTCTATTGTTGGATCCCATACTGGGAACAGGAAATTCAGCTGTTCAAGCTATATCCCTACTCTTGAAGAAGGGTGTACAGGAAACAAACATTATCTTTCTGAATCTTATATCAGCTCCCCAAGGAGTGCATGTCGTTAGCAAGAGATTTCCGAGAGTCAAGATCGTGACATCAGAAATTGACTTTGGTCTGAACGATGATTTCCGCGTCATCCCTGGAATGGGTGAGTTTGGAGATAGGTACTTCGGAACAGATGATTATCAGTCATCAACACCATTCTTTTGCGACGAGAAAAATCGTGTCAGGCTTTTGTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MSSSNKARKEEAAAVAAPDKEAVLTTAGEEVRMRFLDQYMGSTSRPVDDEVLDAATGVHYSALRLEELNMNGSVSGEDQPTTSGVENGHQEPFVIGVAGGASSGKSTVCKMIIDQLRDQRVVVVTQESFYYGLSDEELVHVHDYNFDHPDAFDTELLLSCMENLKHGKAVDIPNYNFKTYKSVASARKVNPSDVIILEGILVFHDSRVRDLMNMKIFVDTDADVRLTRRIRRDTIEKGRDIKTVLDQYSKFVKPAFEDFILPTKKYADIIIPRGGDNDVAIDLIVQHIRTKLGQHDLCKVHPNLYVIQTTYQIRGMHTIIRDAATTTHDFIFYADRLIRLVVEHGLGHLPFKEKQVITPTGSVYTGVEFSKRLCGISVIRSGESMENALRACCKGIKIGKILIHREGDNGKQLIYHNVPKDIANRHVLLLDPILGTGNSAVQAISLLLKKGVQETNIIFLNLISAPQGVHVVSKRFPRVKIVTSEIDFGLNDDFRVIPGMGEFGDRYFGTDDYQSSTPFFCDEKNRVRLL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..101#1092..1276#1412..1503#2777..2846#2934..3049#4128..4224#5043..5122#5276..5470#5626..5709#5787..5847#6608..6668#7100..7193#7265..7337#7651..7733#8316..8506#8638..8647#ATGAGCAGCAGCAACAAAGCTAGGAAGGAGGAGGCAGCAGCAGTGGCAGCGCCAGATAAGGAGGCAGTGTTGACGACGGCGGGTGAGGAGGTACGCATGCGGTGTGCGCGACGTCTCACGTTTTCACAACTTGGGAGCAGAGACGAAGAGAATTAATCTTTTTCTTACATGAGGAACGTGAAAGGATGCCATTGCAAATGAATTTCGTGAAGTATCAATAAGATATTACTTCCTCCGTTTCAGGTTATAAGACTTTCTAACGTTGTCACATTCTAATGAATCTTGCATTCATATATATATATTAATGAATCTTGAATGTGAACATCTATAGGTTATAAGATTCATTAACATCTATATGAATGTGAACAATGATAGAAAATCTTATAACCTGAAACGGAGGTAGCAGATATTTTGCCAATAGGATAAATCGAATGGTTAGAGTAATCTAAAAGGGAAATCGAACGCTCCATAGTTTATTGATTACGTAACGTTGTATTTTTACTGAAAGAGTTTCACCTTTTATTTATTTATTAGTAATCGGTGTGAAAAAAAAAGAAAAGAAGAAACACCCCAAGCTAGCGTTGCCCCTGTCTCCTTGCGCCCTTTGCGATCTCTCCCCATCGTCGTCTCCTCCGCTCGCCCCGCCGCCTGCGCCGATCTCCGCCCATCCCGCGAGCGAGCAGCGGTGGCGCCGCCCCCTGCTGCTTCCTCGCCGCCCCCCGCCGGTGAGCAAACCCTACCTACCTATCTCTCTATCTATCTATAGCGCCCAGGATCCTCTCCCTCTTCCCTCTCTTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGTAGATAGATCTGGAGGATCCCCAAAAGTATGGGGGAGGTTCAACTCAACACTCGTTAGATCCGTCCCTGCCCAAATAGGCTACGGTTCTCTTCGAACAAGAATGTTTGCCACTAGTATTAGTATTCATTCTATATCTGTATTGTTACAAGCAAGAATTTTCTATGGTTGCCAAGAACATTGTTGTTTACTCTATATTTCTGTTTGGTAGCTGCTGGAAATTTATAATCAGAGGCTAGGTTTGATACCTTGGTGCCATTGTGGATTTGTGGTAGGTTCTTGGATCAATATATGGGTTCAACTTCAAGGCCAGTTGATGATGAAGTTCTTGATGCCGCCACCGGGGTACACTACTCTGCGCTCCGTTTGGAAGAGCTTAACATGAATGGCTCTGTGTCAGGGGAGGACCAACCGACAACCTCGGGCGTGGAGAATGGGCACCAGGAGCCATTTGTCATTGGTTAGTACCTGTCGAGTGCCGTCGTCTTACCTATTTGTTTTGCAAGTAATCAGGGAGTATCGATCGCTGAACATAATGTAGCCCTTTTGCCCCCCAAATGTGTCATGTCGTTCCATGATTTTGTTTGGATTGCAGGTGTCGCTGGGGGTGCATCTTCAGGTAAAAGTACTGTATGCAAGATGATAATTGATCAGCTACGTGATCAGCGTGTGGTTGTTGTTACTCAGGTTTGTCAATCTGGCCTTGTTTTGCTTTTGTGATTGCCCCCTTTGCCTTGTGGTATTTGGATCACCCGATTTTCTTTTAAATACCGCTAACTAATACTAGTACATTTCTTTTCTTCGATTTATGTGGTATTAAGGCGAAATACATCCATGCAACTTTCATTTATACTCTGTTCCATACATGCATCACAAATGAAATAACCTAGCATTTATTATTGAATAGAACCTGGAGATTGGTATGTCTGAAGCCATTCCATGGGTCTAGGGTACTATAGGCCTATAGTACAAACCATTTTAGCCCCTAAATGCTATTATCTTTTCCCTGGCTTCATACTTTAGCATCATGCGCACAAGATGAAGAAACAATTGTGGTTGCAAATTTACAGATTTAGCACTTCATTGATTTTTAAGTATACAAATACACAGTGTTTAGTATCTGTTTTCTAAAAATTGTTGCTCTATAGCTTAGATATGTTGTGTAACATCATACTTGATATATACTGGATTATTGGCACTTTAGTCTTTTGAGTGTGAAGCCATTCCATGGGTCTAAGCCTCTAAGGTACTATAGGCCTATAGTACAAACCATTTTATCCCCTAAATGCTATTATCTCTTCCCTGACTTCATAGTTTAGCATCATGCGCACAAGATGAAGAAACAACTGTGGTTGCAAATTACAAATTTTTCACTTCATTATTTTTAAATATACAAAAGACACAGTGTTTAGTATCTGTATTCTGAAAATTGTTGCTCTAGCTTAGATATGTTGTGTAACATCATACTTGATATATACTGGATTATTGGTAATTTAGTCTTTTGAGCGTGAAACTGTTGGTGTACAAAAAATATAACTACGAATGCCATTATGATAACAAATTGTTAATAAAATACTTTTTCTTGTCTTTCTTTCAAAGGATTGTGATCATACTACTTATATTGCTAACTGCTTAACAGAAGTCATTTCTGTGATCACCGGTCAGTGGTAGGCTTGCGGCCATGACTTATTGATTGTGATCAATTAGTGCCCCACATATTTCCAAAGCAAGCTTCTATTTTATCCTTAATTATTTTTCTGTATTGGTTGACCTTGTTACTTTTGTCATTTAAAGACACCATTATGTGTTTATTGTATACTATTGCCATTAATTACTTATAGTTTGTCAAATATGAAAAGATAGCCTTTTCTGCAAACATTCCAGTTACAGATTGTACAAGTTGGTATATCATGCTAAATGTCAAATTGGGGCATATGTTGTTTCCGATTTTGCATTGCAGGAGTCCTTTTATTATGGGTTATCTGATGAGGAATTGGTCCATGTTCATGATTATAACTTTGATCATCCAGGTATGATGCGTATTCCTAAGAAGTTTGCCTTAGTATGCCAGTGGCTAGAGCTGTGCACTGATTTTGCTGCCGCTGTCCTAATTTCAGATGCATTTGATACGGAGTTACTACTCTCTTGTATGGAGAACTTGAAACATGGCAAGGCTGTGGACATTCCTAATTATAACTTCAAAACATATAAGAGTGTAGCAAGCGCAAGAAAGGTACTACTCTTTTACACTGCTGTTCATAACTTACTCACCTGATAAACTGAATGTTTCCTCGTCCTGAGCTTCTAATACAGCCTTAAGTTTCTAATCTATGCCTGCCGAATGAACCGAGAAATCTACAAGTTAGTAGAGACTCTCCATATAATAACAATTATTTTGTAAAAGGTGTTATTTAGATACAGCGATATAGCTACTAAGGATTGTCATAAGAGTAATCCTTAGCTAACCCTCAATATTTTTGTCTTCTTGAGCATCATTCTGTTTTTGCTCATATCTTGTGAGTTGTCCAAGAGAAATGTAGATGGAAACTGGGTGCTGGTCTGCTGGATAAGTAGTAGGGAATCAGAAAACATGGGTTGCATTTCATTCTGTTGGTGATTAAGCTTTGTTTAGGCTTTAGGAATTCAATATGTTGATTAAGACAATCTGCCACCTGAAATTTTCCGTTGAAAAAGGACGGGTTTGAAATGACAGATCCAAGAATTTGATATAGTCTAGTGAAATGAGTAGCTTAGCTGCATTGTTTTTGTCGGGCTCCGTAAAGCATGTAACCATGGCACATAACATTGTTACATATATCTTACAACAAATACCCAAAAGAATCCAAGGCAACAAGCCAATTGTAGGCCTAGCTGGTTCAACCATTATTGGTGAAAGTTATTTACTGAAGTACATACCTTCACCTTCCCAGTTGATGAGGGAGAACTGGGGATGGCAGATATTGAAGGGACGAAGGGAGAAGACAAGGGAATTGTGTACAGTTTAATTCATAGTGGCATCGTTTTTTTTTTAATTTAGCTGTGGCATATCAAAGTCAACTTTGTAGTGGCATATCTGAAACGTAGCAAGTCTATGGTTGCATATATCTAAATAAACATTGTAAAATATGGTGTAGTTAATTTTAGTTGCACAGTTTCTACTAAGTACTAAGCGCCTTATTGTTTTGCAATTTCATCTTGTAATATTTTATCTAAGAAAATTAGATCACTGCTTATAGTTTGTTCTTCACTTTATTTATTCATATTTGTTTTACTTTATGTTTCAGAGACCCTAATATTTTGACTGCTGTCAGGTCAATCCTTCAGATGTAATTATTTTGGAAGGTATTCTGGTTTTCCATGATTCACGTGTCCGGGACTTGATGAACATGAAGATATTTGTTGATACAGGTATCAATGTTTGCACACCAAACTGATGATAATCTCAAACTCTTGCCCATGACCAGCAACCATCAGTTGTACTTGTGGTCAGTGTGTTTAATTGTTTATTTCCATATTTGTGTTGATAGTTTCTACATGTTTGCAATGTAGCTTTATTGCCTCCTATTTCATTTGAATCAGAAGTATATAAATCACTCTTAATATCTCACACTTGTATATTTCTCATTTTTTCTCTGGAAACAGAGTTACACTCTGTGCACTCATGCTTCAAGGAGGCACTAGTGGGTTGGCAGGGCTGACGCTTAGCACCTAGGACAAACGAACTAGTATAAATCTGAGAAATTAGCAATCATATTACACAAAATTTAGACAATTTAACACTAAAGTTGTAACAAGAGCACCCAAGGAAAAGGTTTAGCTGCCCACACCATCTCGTGGCTACCCAGTGCCTAGCGCTGACTATTAGGACACTAATTTCATTGTTTGTTTATTAGTTCATTTCTATCAGCTCACAACAATTGTTTATTCATTTCCATATTGAAATACTGCTCATTTAAATTTTGACTAAGAGTTGTTTTTGAAGTCACAAATGTCTCCAAGTGTGTATTGCATAATCTGCTTTGAAGGAAACTGCCAAGGCAGCACTTTGCATGTCCCCTAGTTAAACAACTTGAGAGACATCCTTAATCATTGTTGTGAATTTCCTAAACCTATAGACAAGGGCTGTAAATTTACAAAAAAGAAGGGTTTTGTAAGGTGCCCTGTCCATTTAACCCTGTGAGTGTATTGTCCTTTATATTATTATATTCATCCTATTGATTTTTCAGATGCTGATGTGCGATTAACAAGGAGGATTCGACGTGACACCATTGAGAAGGGTAGAGATATCAAAACTGTGCTAGATCAGGTAACATGGTCACATCTATTACTGTTTTTGTTTTTCACTAGTTCTGTTTTTATTTAACATGTTTACAAAATATTAGTTGTTACTTGTTAGGTACAGACTTCCTTGATGATTCATTTTTGAAATTAACCATTTAATGCTATTCCTTTTTTACAGTATTCAAAGTTTGTTAAGCCTGCTTTTGAAGACTTCATCCTCCCAACCAAGAAGTATGCTGATATTATCATCCCACGAGGTGGAGATAATGATGTTGCGATTGACTTAATCGTTCAGCATATTCGCACTAAGCTTGGTCAACATGATCTCTGTAAAGTACACCCCAATTTGTATGTCATTCAGACTACTTATCAGGTACCTGATGTAACCATAAATGTTCTGCAGTCTTTTCTTATATAAGAACAATTGTCTGTCTTTTGATAGTCTCATAATATTGAATGTAATATGCCCTTTTTCAGGATTTTTGTAACATATATAAATATTGACATTGCAATGCTGCTTTCTTTCAGATACGAGGTATGCACACAATAATACGCGATGCTGCCACAACAACACATGATTTCATATTCTATGCCGATCGGTTGATTCGATTGGTCAGTATGAACATGCAATTGACATGTTTTCTTTTGTATGAATTTCCATGGTAGCTTGAATTTCCTGTGGAATATAGGTTGTCGAGCATGGTCTTGGTCATCTTCCATTCAAGGAAAAACAGGTCATAACTCCAACTGGTAAGTAGTATTGCACAGTCGCCATTCACGCGTGTTCCTTGCATTGTTCAGGTGTTACAAATTATCTTAATGCAGAGGATCTTGCTCGCTACTAGTTTGTATTAAGATGGTGAATTTGTACCATTACATGATTACACATAATGTCCTGTGTTATTATATTCCATTGAATTCAAGCTATATTTTCATAGTAATTTATTCTATTGTTTCCAATGATAATGCTTGGATATGTGCTAATGTGTTGCCTCAGAAAATACGTGCTAATGTGGCACCTCATTCTGCTACAAGTTTGTATGTGTTGCAGTATCATGGTTTGCTTTTGTTACGCCGCATTTTATAATTGAACATTGCAACAAGCATCTATTTGTTGTGTTCATGTTTTTCAAAGTCTTAGTTCATTATTTGCTGCTCCATCTTTTCCCCAAACAAGGGTAGTTGCCCCTGTTTTCATTTCATAGTAGCATTACACAGACAGAACCAAGGTAAATCTTGAGAATTTCTATCTGAATGAACCTCACAATCTTAAAATGAGAAACTAGTTACATTTGTTTAGGATTGTTTCTTGAAAAGTCTGTGGTTAAGTACTTCAGTCTTATAGGAATGCGAAAGCATGGTCGCTACAAACAAGCAACACATTATTATGTATAACAGGGACTGTAGATTATTTACCTCCATTGTTCTGTTCTCTTGTAGAAGCATGGAGTTACCTGCAATTGTTTTCTCCTGCAAGTAATTTATATCTTTGCTTTATTTATGTGTGCAGGATCTGTTTACACTGGGGTAGAGTTCTCTAAAAGATTGTGCGGTATCTCAGTGATTAGAAGGTAATAGCATCTTTATATTTTGAGTTTGTACTTTCTTGAGACTAACTGTTATACCACTTGGCACTCAAGGGAGGTTGGAAGGTTCTTTTTTTTTACCACTCTGCTATCATGTATGTCAGTGATACCGTTATGTTGCTTCTTTGCTTTGCCTGATAGCTTGTGCAGAATGATATAAATGGAGCACCATGGCCATTTACAAATGCTCTACTAGAAAATATTGGAAACTTTGATTCAGTTTCCTTCAGTTGCTTTACGGGCTTCACATACCCAATACTGCAATAATTTATTTAGTGACTACTAAGCATGCTTTCTTGAGCACTCATAAACTATGATTCAATTTCTTGTTAAAGATTCTGTTAATAAAGCTCTTCATACATCCTTGAGTATAAATACATAACTAGTGTCAATTATTTCTTACAATTGCTTTCCAGTGGTGAGAGTATGGAGAATGCATTGCGGGCATGCTGTAAAGGTATAAAAATTGGGAAGATTCTTATTCACAGAGAAGGAGACAATGGCAAACAGGTTTGGTTTAATCTACTTTTGTATTGTTTGTTGGAGTTAAGTCACATTACTGAGCTCTTGATTCCTTGCAGCTAATCTATCACAATGTACCAAAAGATATAGCAAACAGGCATGTTCTATTGTTGGATCCCATACTGGGAACAGGTTTGTTGATGCTTCTCACATGTATTTTCTGTCGTCAGTCATCACTTTTTTTTTCCTGCTCACTGGAGCCCTTCTGCCTTTGCCTATAGCATGTAAAAGACAGCAAGCAATGTGGGGATACTGTACTTCTGCAACAAAATTAGTTTGGCATATTGTCCATTTTCAGACTAATTCACATGTCATCTGTAGTGTCATCGATATATTTTGTGCATATAGTGTACATTATCTTTTGACTTGCTGAACTTCTGTGCACTTGCTTAACTGTTGGATGCTCATTGCATCTCATCTAGTCTTACCCTCTTCATCATATCAGGAAATTCAGCTGTTCAAGCTATATCCCTACTCTTGAAGAAGGGTGTACAGGAAACAAACATTATCTTTCTGAATCTTATATCAGTAAGTCTACTGAAGTGCTTTGGTTTCATTTGTTTTGAGTCTTAATTTATTCATTTGTATGGATTGTTGCTTTTTTGAAGCTCATAATCTGATGATTTGGCTACTCTAATAGATATTCCATTACTTCTCTTTTCCCAAAAGATCGTGTTTTAGACAGTGGTAGCTATTTCAGCCTTGCTAGGTTTATAATATTATTTACTACCTCCATCGTGTAATATTTGATGTTAGTTATTTCAAAATTGAACTTTTTTTTCTCGAATACGCATGAGAGCTGCGTAGCATTGCATTAATAGAAGAGAGACGCCCAAGACGCATATACAAAGAAAAGTTTATATTTTGACTAATATAGATCTGCCCACTTAATTACTAGCTAATAAGCATCTCTACTGCATCTGGTAACTTTTGTATCTGTTGTTTTGCAAATTGCTGAACAGTTAATATAGTTACTGTGACATACGTGTTTTTGTTTTTTGTAGTCCGGAACCTGACTTAATTTATATCACCATTGCTGTACATGCTCGTTGTATGTGTGATGGTTGAGAACTACCGAGCTTACCACGGAAACTTTTGTTATTGTTGCAGGCTCCCCAAGGAGTGCATGTCGTTAGCAAGAGATTTCCGAGAGTCAAGATCGTGACATCAGAAATTGACTTTGGTCTGAACGATGATTTCCGCGTCATCCCTGGAATGGGTGAGTTTGGAGATAGGTACTTCGGAACAGATGATTATCAGTCATCAACACCATTCTTTTGCGACGAGAAAAATCGTGTCAGGTGAGCCTCTGTCTTTGTTCCTAACGTCGTTGATCGGATTCATGCTTATTGGCATAATGATTTATGCTTATTAGCATAATGATTTGCTAGCCCTGCGAGAAGCTAATCTGTTGTTATAAAACTCGTTGCAGGCTTTTGTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA035089