BGIOSGA034083

From RiceWiki
Revision as of 17:41, 22 July 2012 by 124.16.129.48 (talk)
Jump to: navigation, search

Please input one-sentence summary here.

Annotated Information

Function

Please input function information here.

Expression

Please input expression information here.

Evolution

Please input evolution information here.

You can also add sub-section(s) at will.

Labs working on this gene

Please input related labs here.

References

Please input cited references here.

Structured Information

Gene Name

BGIOSGA034083

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA034083, complete gene.

LocusTag

OS11G0429600

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA034083-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA034083-PA

Length

8844

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 11

Location

Chromosome 11:11099846..11108689

Sequence Coding Region

11108329..11108689,11102972..11103195,11102084..11102155,11101864..11101985,11101104..11101217
,11100920..11100965,11099846..11099929

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome11:11099846..11108689 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome11:11099846..11108689 source=RiceIndica11 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGGCGGAGGAGCTCTCCACGGTGGTGGTGGAGGCGGTCGAGAAGGAGACCTCGCCCTTGGCTCGACTGGCCTGGCCCCCCCGACTCATCGGCTGCCTCCGCGTCCTCATCCTTCACACTCAGCACGGGGGGACCCGTCTCGGCCGGCGTCCTCCTAGGGCAACGCAGGCGACTCCCATGCCCCAGCCACTGCCGCCACCCTCCTCCTCCCATCCGCCTCGCCGCCACCCAAGTGGCCCACCATCAAATCATCTAGCTGTAAGGATGACGGTGGCGAGGCTCCTTATCCCCCCAGTAGCATTGTGGTTGGGGCACCTAGGCGCCCAAGGTGGAGGTTGCCTAGATCTGGGTCACCATGTGAGATCACGAAATAATTACATACTTACATACCTAGCTAATGAAGTTGGCATCCATATTGATGTTTCACTGCAGCTATTCGATGAAATCTCTGCGCCCCACATTCTGCATAACAAGTGCATCGCGGTGTCTCCAGGACCAAGTGATGTAAGTAGAAGAAAGATCTTGAACGAGGAGGTTGACTTACTGCAAAAGCCACCACCTCGTCCTCCGATTGAATGCATTGAGTACCCGCACTATCTGTTGTATTTTTGGGTTAACAATAATGCCACACGTGAAACTCTTGGGATCAAGAAGGGGACCGTGAATGAGTGGGTGAGGTGCCACCAAGGGGATCTACCTTATGATGAGGATATCGTAAACGGCATAGAGTATCATCGTAAGGTTGCATCACTGAATTACCGAACTTTGGTATATAGTGGCGACCATGATGCTGTTCTGCCATTTCTTAGTACCCAAGCATGGGTGAGATCACTCAGCGACCACATTGTGGATGACTGGAGGGCCTGGCATCTTGATGGCCAGTCTGCAGGATTCACCATGACGTATGGAAACAATGTGACGTTCGCTACTGTGAAGGGCGGAGGACATACTGCACCAGAGTACCAGCCAGAGAGATGTTTTGCAATGTTCAGCCGTTGGATTTCCGACAGGCCACTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEAEELSTVVVEAVEKETSPLARLAWPPRLIGCLRVLILHTQHGGTRLGRRPPRATQATPMPQPLPPPSSSHPPRRHPSGPPSNHLAVRMTVARLLIPPVALWLGHLGAQGGGCLDLGHHVRSRNNYILTYLANEVGIHIDVSLQLFDEISAPHILHNKCIAVSPGPSDVSRRKILNEEVDLLQKPPPRPPIECIEYPHYLLYFWVNNNATRETLGIKKGTVNEWVRCHQGDLPYDEDIVNGIEYHRKVASLNYRTLVYSGDHDAVLPFLSTQAWVRSLSDHIVDDWRAWHLDGQSAGFTMTYGNNVTFATVKGGGHTAPEYQPERCFAMFSRWISDRPL</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..361#5495..5718#6535..6606#6705..6826#7473..7586#7725..7770#8761..8844#ATGGAGGCGGAGGAGCTCTCCACGGTGGTGGTGGAGGCGGTCGAGAAGGAGACCTCGCCCTTGGCTCGACTGGCCTGGCCCCCCCGACTCATCGGCTGCCTCCGCGTCCTCATCCTTCACACTCAGCACGGGGGGACCCGTCTCGGCCGGCGTCCTCCTAGGGCAACGCAGGCGACTCCCATGCCCCAGCCACTGCCGCCACCCTCCTCCTCCCATCCGCCTCGCCGCCACCCAAGTGGCCCACCATCAAATCATCTAGCTGTAAGGATGACGGTGGCGAGGCTCCTTATCCCCCCAGTAGCATTGTGGTTGGGGCACCTAGGCGCCCAAGGTGGAGGTTGCCTAGATCTGGGTCACCATGGTTGGATCCGATGAGGGGATGTTGGTGGGCATCTTTGGCCGTGGTGGTAGGCCGTGAGGCAACAGGAGTAGTAGAGTTAGCGGCTGGATGATAGGCAGTGATAGAGACAATTGCTGGTCCTCTAGGCGGTGATGGAGACTGTTGTTGGGTTACAGGAGACGGATACACGACCGCCGAGGTTGGATCCCTCCAGATCCGCTTGGTGGGGACAGGCGGTAGCGGTGACGGTAGTGACGACGCGGTTGGGTTACTTTGTGCCTGAACAGCTGTAGCAGTGGAGGAGGATGCTAGCAGGGTAGTGGGCGGTGGTGAAGGCAACAATGGGGGCTGTCGGATTTGGCATCCCCACATGCAGATCCAACGTGCTCTTGACCAGATCCGAAGAGGTGGCGGGATGGATGGCTTCAAGGTGGCGCGATGAACAGTGACGGCGTGTGGCTAGGAAGTGACATGGTGCCTTGATATGGCTTTCCCCGGCGAGGTGGCCCTCGACAACAACGAGCGATGACGATGCAGGAGGGGTGACGAAGGCGGCAGTCCTCCCCTAACCCCTTCTCCTATCATGGTGACGGTGGCGGTGATGTGGTTTGTCCATTTGTGTCACTACTACAAAAACGGTTTTTCATGGCGTCACCCTAAAATTTTCGTTGGTGGCCATACGCGAAAACTGCAGCAACAAAGTAACAAGGGGTGGGGGGCTTCGGACCGCCAGCGAAAATTGATCTTCGCTAGCAACGGAGTTGAGCGAGCCACCAGCAAAGATGTCGCAGTTTTCGCTGACGGCGAACTTAAGACACAGCTAGAGAACATGGCAAATTTTTGCTGGCGGGCGAGTGGCGTGGCCTCTAGCGAAGATGTAGCTATCTTTGCTAGTGGCCGACTTAAGCCACCACCACTCCTATTGGCTTTACAAGCGGATAACTTAAGTGACAACCATCGAAAATTGATTTTCGCTGTCGGCTGCTGCTAAAGAGAACAGCCTGTGAAAATCATCGCCACACTAAAAAAAATAGTGACATTAAAAACCACCACCCACCTACTGCCTCCCTCTCCTCGCTCCTCCTCCTCCTCTCTAGATCCACCCACCCACCCACCGGCCACCGCCTCCTCCTCCTCCTCTCAAGATCCCTCTCCTCCTCCCTCACCGGTGGCACTCCATCCCTCACCCAATGGCGGTCGTCGTACCCCTCTCCTCCTCCCTCCCCACCAGCGGTGTACAACGGCTCCAAGATGCTCTCGGCGATGGCGGCTCTCACGTCAGGATCTCTCGGCGGCGGGTGGTGGCACAGACCAGCGGTGGCACAACAAAGGGGATGCGGCGGTAGCGAAATTGCCCTCCCCTCACCTCCCCTCCTCTGTCCATAGGGGAGGAGGCCAGCAGTGGCACCCTTGCCCTCCCCTCTCCTCCTAGGCCTGTCTAGAGGGGAGGAGGCCGGCAGCAGCGGCAGCAACATTAATAGTGGAAATGGCTTCCTTCACCTCCCCTTTTCCAAATCTGGCAGGAGGGGTGGCAGCCAGCAGATGGCCGGAGGTGGTGGCTTCGGCGACCACTTGTCCCCAATGGCTTTGGTGGCTAGGGTTCTTGTGAATTGTGGGATACGCTGGGGAGCTAGGGTTTTACTGATGAATTTTTATGTTCCGTTCTTCCATTTGATGCAGCGGTGATGCAGACGATTCGATTTGAATTTCATGTTTGATATGTGGAAATGGGATGATTTGATTTGAATTTCTTGTTTGATTCATGGAAGTGGGCAGCTGAATGCATATGGTTTTTTTTGTTGCCAAAATCCATCTGCACTGTCGGTCATCTTAACTCACCGCTTGCAAAAATTGGATTTCCACAGATGGTCGGTTAAACCTAGTTGCTTGCGAAAACCATTTTCACTGGCAGTTGGGCTAGGTTGCCCACTAGTGAAAATGATTTATCGCTGGCGGCTGGTTGCCGCCATTGAAAATGGTGCATTTTGGCCATTGGTTGCTGGCGGCAGTGCTGACCGTCGTAGAAAACCCAAGCTGGCTGCCAAGAAAAATCAATTTTGTAGTAGTGTGTAGATAAGACAGAGAGACTGCGGTGCTCACTAGAGTGGTGCTGATGGTGACGGCTCTCCTCCATCACGATGATGATCTACGGTGCTAGCAATGGAGGGATGTAGTGGCACTAGCGCGGTGTGACAATGTGCGGGAGACATGTCTCTTCCTCAGGATGGGACTCCTACATGGTGTCTGTCTGGCGATGGGGCGCTAGTGTGGCGGCTAGTGGGTGCAAGGGAAAGAGGTTCTCTGGTCGAAAGCCTAAGCTGTTTTAGGGTGAACAGCGGCAGCGTTTTCTAGCACTGCTTGGAGGCGTTGTTGTGAAGTCTTCTTCCTTCCCAATCGAATCCTTTGGGTGAAAAATTTGTCTTTGTTTCCAGGGATAGGCGATGGCTGCGCCCTAGGCGTCGCAGCTTTGTTGGAGGTATTGTTTGAAGGTCATTTCGCACTAATCTATTCTATAGAGGGTTTGTTTTCCAGCTGTGGCGCTTTTGTCCACCATTTTGGCGGGTCCACGTGGTGGAGAGCAGATCCATGCTTCTCTCTCGCCCTCTCCCTCTCAGATTTGAGTGCAGTGGGATGTTGTGTTCTTGTCTATTTCTCAGTGGCGGGCCATGTGTCATAGGCATGTGGCATGACATGTTGTATTTCCTTTTTCTATCTATAGCCTTCTAGGGCTATAGTCTTGTAAAACTTTTCTATTATATCAAATGATATCTCTCACTATCATGTGCGGGTTTCGTTTAAAAAATAGAATGGAGCTAGCTAGGGAGTATTAGGGCTCCCTGATGTTTTCCAATCCTGATTGTTGCAAATAATAGAAGGGAAAGTGCGGTAATTGCCAATCCGATTTTAGTGAAGGTCATCATCAACATCTCTAGTTCCCCAGTTTCTAGTACAGCTTACCGTGGGTGTCTCTTTTTTGGTGTTCCATAAAGTGGAAAGCGTGATAATTTAGGATGTACTAATAGATCCGAAATTTGGAAATTATAGAATTTTCAGAATTTTTTAGTCCGAAATAATTAAATTTGTACAAATTTGGTCAATGATGGGGCGAAGGTTGGTGGGAGACCAGAAGGGTTGGCAAGAGGAGGAAGATCGAGAACTCCACCTCCCCGCATGGAAAAAGGTGTTGGCCATTAACGCGTGATTAATTAAGTATTAGCCCATACAAACTTGAAAATGGATTAATATAATTTTTTAAAACAACTTCCCTATAGAAAACTTTTGCAAAAAAAAACGCATCATTTATCAGTTTGAAAAGTGTGCGTGCGGAAAAAGAAGAAGGTGAGTTGGTTAAGAAGGGTGGAGAACATAGCCAGTTTTGAACTTACTTGGGTGTTGTGTCCATGCCTCTAATAATCTTTCAGCCCATCTTCTTATTGGTTCTCTATTCTACTGCTCCTCCGTGTAAATAATACTTGACATTTTGGATAAGGGTGATATCAAATATTAAAATATTTGACTATAAATATTTTCTTAAAATATATATATTACTTTATCATGTATATAGATTAGTCTCAAAAAGTACTTTAATAAAATCATACATTTGTTGATATTTGTATCTATATTTTAATAAAAAGTATTGGTCAAAGTTGTTTCTTTAAACTGTATCATTGTTTAAATGGCAAGTATTATCTATCTAGAGGGACTAGTTTTTAATATGATTTGATAATAATAACCATTCTACCCATTTTAGATAAACCTGCAGTGGCCAGGGGTTTAGGATGGATAGATGGTTTTGAAGTAGATATAGTTGAGATGTCTTCGAAATATCCTTTGCCCTAGATTCAAAATTCTTTCCTATATCTTCCATTTAAATTTTTTGCTGATTTTTTAAATTTTATTTAGAGTGAATTGCACTTTGGGCAGAATTTGTCAGGAAGTTTTACTTTGGACCACCTTTCACATAATATTTTTCTTTGAACTACGTATTTTGGCCCTATTTCATTTTGGACCAGCCCAACTCTCTTAGCACATCAACAGCCTCAAGAACATCGACATGCTCATGTCGACGATCTTCCCAATTTACATATATGTCATGCTTTTGATGGATAAGTGATTGGATGTGACTACAGAACAGTATTAGGGTGATCTAAGAGCAATAAGGGTAAAGATACCTAATCCAAACTGAAAAACAAAGGATAATGGATGGCCCGAAGTAAAATCACTCTTATTTATTACCAAGCTTACTATTATCTTAAAATCACAACCAAGTTTTACTTGTTACTAACTCCATCCCAAAATAATTATAATTCTATGTTGTTTAGCATATATTAAGGTTTGAAAAGAAAGACTATGGTGCCTCTCATTAAATGGATGTTTATGTGAGAGTGGGAAGATGGTTGAGGGTAAAATAGGGAGAAATTTAAATGAAAGATGATTGATGGGGCAATTAGTACTCTAGAATTACAATTATTTTGGGACAAATTTTGAATCCCAAAAATATAATTATTTTGGGACGGAGGTACTACAATATATTCTACTCCCTCTCTGTCTCTCTCCCCGGTTTAACATTCCTTGGCCATTCTAGTTTGTACTAGGTTAAGCATTTCTTTCCTTTGACGTCAATTGTAAAAGTTTATATAGATTAACATCATAAGATTATGATTTTAGATTTACCATCAAAAATACTTTCATAGAATATAACTCATGTATTGTTAAACTACATGAATCGTTAAAAATATATGGTGAAAATTATAAATATTTGTTTTAGGACAAAGATAGAATAACAAGTAATGTGAAATGGTGGGAGTATATATAGTTTTTAGCATGACGAGTGATATGAAAATGTTTTGTTTGGCCATAATAAGTTTTACGTATTCTCCTTTTGCCCCGAATAATTAGGATGTTGTATACTATATCGTCCAAATACTCATTTTGTTTGTCGATCAAATTATAATTTAACTGACGTGTATATCCATCATACTAAATCCCATGAACTATGGGATATAGAAGTGTAACACCATATCACTAAAATCTATATTACCCTGGCTCTACATATTAAGAGAGATACTATACTAAATTCCATGAACTATCACATACCAAGTTAACTCGTGTGTTTATATTCTAGTTATTTTGCTGCTCTACTTTTGCTTGAAGTGAGATCACGAAATAATTACATACTTACATACCTAGCTAATGAAGTTGGCATCCATATTGATGTTTCACTGCAGCTATTCGATGAAATCTCTGCGCCCCACATTCTGCATAACAAGTGCATCGCGGTGTCTCCAGGACCAAGTGATGTAAGTAGAAGAAAGATCTTGAACGAGGAGGTTGACTTACTGCAAAAGCCACCACCTCGTCCTCCGATTGAATGCATTGTAAGTTGATCAATTGTAGTTCAATACAATTGGTGAGAATTAATAGTTATTATATAATAGTGTCATTGTTATTTATGCCTGTTGGTAATATGAAAATAGATAGCTGATTAGTTAGGAACATTGGATCGAGTATCCCCATAGAGAATTAAATTAAAGTGAATCAGAGATTAGAGTTAAAATTTCACGAGACCTAAGATTTTCACAGTACTACATTATATTATGTAAAAGAGAATAAGTTTTATAAAATTACAGATACTTAACCAAACTATCACAAAATAATATTTTGCACCAAATTTATCACAAAACTACATATTTAAGAGTGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAACAAACCTACAGATTTAATGTTCAAGTTATCACAGCACTATAGATTTTGGAGTATAACTACTGTTATGTTGGAGCTGTAAACGTTTGTAACTGTGATTAAATTCACACCAAATCTATAGATTTGTGATAAATTTTCTATCTAATATGTAGTTTTGTGATGCTTCATCTTAAATATATAGTTTTGTAAAAGAAACTAGTACTAAATATGTTGACTTGTGATAAACACCTTAAAACTTTAGTTTTGCGATAATTTAATCAAACTATCTATAGTTTTATCAAATTTACTCTATATATAAACCTTCTATATATCAACCTAGCTTGACAAATAAAATTGTTTAGCACTGACAAAAGAGCTTGTTCGCTTTTTCCTACATACATTATGGGAATGTTCCATTTGAATGAGCAACTTTTCAATTTCTTGGGAAAATACAGGAGTACCCGCACTATCTGTTGTATTTTTGGGTTAACAATAATGCCACACGTGAAACTCTTGGGATCAAGAAGGTAAATTAATAGATTTTGTCCATTTCAATATAATAGTTTATACATGTAGTTTAGATATCAAATGTTGTTTTTTTTATCTTCCTGTCCTAACAAATTAGGGGACCGTGAATGAGTGGGTGAGGTGCCACCAAGGGGATCTACCTTATGATGAGGATATCGTAAACGGCATAGAGTATCATCGTAAGGTTGCATCACTGAATTACCGAACTTTGGTATATAGGTATGTATGGTTCAAACTATATTTGCATAGGGAAATTAAATAGATCTGTATTTTTCATGATAAATAGAAATTGTGTAGTTACCTTTACAGCAAATTGGTAATGGAATTCGCAAGTACCGAATATTCATTTATGTATTTGGAGTAATGTATCTTAATTTGAACCCCTAACTAGCTATTGTTTCTTTTGACACTTGATTACATAAAAAGTGAAATAGAAATTACCAATAGCCAAGAGGGATCACACCATATGTAGAAAGTACTCGTGCCACATCATGTTGCCGCTGTTGGCCCAAAACCAGAGATTATGGGTTTGGCTCTGATACCACTTGAGTGTGGCTCTGATACCACTTGAGTGTGCACAAGCTTTGGCTCTAATACCACTTATTGGCCCAAAACCGGGTGATGTTGGCCCAACCGAGAGAAAGTCTTGCTACACCCCAAAAGCTAGCTCAAAAGGTGAGGGGCTCCCCTCACTTTTAAGTTGGTTCAACTCCTTCTAGATAAGCAATGTGGGACTATTCCCAACAGTCGCAGCTCACCGGCCGGCCTGTTTTTACTTGCTTTATTAATCGTCTCATTTTTTAATCCACTCGAGAGATGTTTTTTTTTCACTAATTTCTCATCCCTTCCTATTTTATTTGGATAGTGGCGACCATGATGCTGTTCTGCCATTTCTTAGTACCCAAGCATGGGTGAGATCACTCAGCGACCACATTGTGGATGACTGGAGGGCCTGGCATCTTGATGGCCAGTCTGCAGGGTCAGATATTTGCTTCAGCATATTAGTTCATTTAATAACAGGCCACTTCAGAATATTTTTAGAATACATATAAAGGTACAAACTATTTTGAACAATAATACTTATGCATGTGTGCTCTGAAATGTAATTGATTCGCAGATTCACCATGACGTATGGAAACAATGTGACGTTCGCTACTGTGAAGGTAAAAGCCCACATATTTTTATTTCCTCTATGCATAGTTTATTATCGTTTCCAACCAAAGCTAGCTCTTTATATGCCAGTATCATTTAGAGAAATACTTCAAATTAAGGATGTATAAGTCATTGAAAATTCTGTTATGCTATAGTTTTAAATACGAATGCAACGTTTCAATTTCCAAGATACTAAACAATATTAAAAATTATTCAAATAAATAAAGAATTAAGTCTTGCTTGAGTGTATACACCGCTAGAGATTACTATATGAATTTATCATAATCATTTAAAGAAATCAATTAAGGATTTGTCCCTTGAGTTATTATAATACCGTCTTATTTGTGAGTCCGAAGAAAAAGCCATGTTGGTAATCTCATGATAGCTTTGATGTATTAGGCTGAGTTCAGGAGGTGGAGTAACTCCACTTCCCCACACGGGGAACGGTGTTGCCTATTAACACGTGATTAATTAAGTATTAGTAAAAAAGAGCTTGAAAAATGGTTTAGTATGATTTTTAAAAGTAAGTTTCCTATATAAAACATTCGCAAAAGCATGCGCACAGAAAAAGAAGAATGTGACTTGGGAAAGAAGGGGAAGAACACAGCCTTAGGCTGCGTTCGGATGAGGAGGTTCCCAGCCCCTTTCCCTCGTATTCCGCGCGCACACTTTTCAAACTGCTAAATGGTGTGTTTTTTGCAAAAAGTTTTTATACGAAAGTTGCTTAAAAAAATCATATTGATCCATTTTTAAAAAAAAATTGCTAATACTTAATTAATCACGTGCTAATAGACCGTTCCGTTTTCCGTGCACAGGATTTGGGTTCCCAACCCATAGTATTGAACACAGCCTATTCTAAGTAGTGTCCACCACAAAGGCTATTCTAATCAATTAGGTAATCCTAGGTTGTACAGTCAATGTGGGTAGCTTGCAAACAAAAAATTGACTATTAATTTTTGTATCTTTACTACAACAATATGTGTTAAATAATTTAATTTCAGGGCGGAGGACATACTGCACCAGAGTACCAGCCAGAGAGATGTTTTGCAATGTTCAGCCGTTGGATTTCCGACAGGCCACTTTGA</dnaseqindica>

External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA034083