BGIOSGA032443
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA032443 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:001-114-B12, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA032443, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA032443-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA032443-PA |
| Length |
9526 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 10:1169578..1179103 |
| Sequence Coding Region |
1169578..1169650,1169735..1170435,1170508..1170741,1170814..1171240,1171453..1171563 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:1169578..1179103 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:1169578..1179103 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCACTGCTTAGTAGATTCTTCTACAAGAGGCCTCCTGATGGATTACTGGAGTTTATTGATAGGGTCTATGTTTTTGATTCATGCTTCTGCACAGAAGTCTTGCCACATGGCATGTACCCAGTCTATTTGACTGGTATTCTTACAGATTTGCATGAAGAACATAGCCAGTCTTCATTTCTGGGTATTAATTTTAGAGACGGGGATAAGAGAAGCCAACTCGCTGATGTCCTGCGTGAATACAATGTTCCAGTAATTGACTACCCTCGTCATTTTGAAGGCTGCCCTGTGCTTCCTTTATCTCTTATCCAGCATTTCCTTCGTGTCTGTGAACACTGGTTATCCACCGGAAATAATCAAAATATCATACTGCTACATTGTGAGAGGGGAGGCTGGCCATCATTAGCATTTATGTTATCGTGTCTCCTTATTTTCAAGAAACTGCAGAGTGCAGAGCATAAAACTCTGGACCTTATTTACCGTGAGGCACCTAAAGGGTTTTTGCAGCTCTTTTCTGCCCTCAACCCAATGCCCTCTCAGCTCAGATACCTGCAGTATGTAGCTAGAAGAAATATATCTCCAGAGTGGCCTCCAATGGAGCGGGCACTCTCCTTTGACTGCCTGATTCTTCGAGCCATTCCAAGTTTCGATTCCGATAATGGATGCAGGCCATTAGTCCGAATATTTGGGCGAAATATTATTGGCAAGAACGCTAGTACGAGCAACATGATTTTTTCAATGCCTAAGAAGAAGACTTTGCGCCACTATCGGCAGGTTATTATGCAGGAGGATTGTGACGTGATAAAAATAGATATACAATGTCCAGTCCAAGGAGATGTTGTTCTGGAGTGTGTACATCTTGATCTTGATCCAGAAAAGGAAGTTATGATGTTCCGGATAATGTTCAACACTGCTTTTATTCGTTCGAATGTACTAATGCTGAACAGCGACGATATAGATATAGTATGGGGTTCAAAGGATCAGTACCCAAGAAATTTTAGAGCAGAGATGCTGTTTTGTGAGCTTGGGGGCATATCTCCTGCAAGACCTCCAACAGCAACATTGAATGGTGATATGAAAGGAGGTTTACCAATTGAAGCCTTTTCAGCTGTTCAAGAACTCTTCAATGGAGTTGACTGGATGGAAAGCAGTGACAATGCTGCCTTTTGGTTGCTCAAGGAGTTCTCAGCAAATTCCCTCCAAGAGAAATTTCAAAAGCTAATACTCAGTGATATGGAAGAGCTTTCAAAGTTTCAAGCTAAAGTTGGTCTCCAAATACCGCTAATGTCTCCTCTGGATTCTGATGAAGAAAAGTATTCAGTGGCTTCTGATTCGGTTTCTTCATCTGAGCATGAGAAGGTTCAGCCTGGTGGCAACTCATCTGACTCGGAGAACATTAATCATGATCTTACCACTGAAGATACTGCATCCATGGGCAATGTCTTGGTGAACACTCCATCTGTCCTACCTCCCACGACACCACCTCCTTGTGGTAGCTTATCTATCCTTTCCACTGATGAAAATCAGCTGCCCCCAGAAGTACAGTGTCGACCACACCCCCCAAGCTCAAAGGGTTTAAACGCACCTGCACCACCTCCACTATTGGGAAGGGGAAGAGAAGCAACTGGATCAGCAAAAGGTCGTGGAATTGGATTGGCACAGCAAAGTAACCCTCCAAAGAAAGCTTCACTAAAACCTTTGCATTGGGTAAAAGTTACACGAGCAATGCAAGGCAGTCTCTGGGAGGATGCGCAAAAACAAGGAAATCAGGCTAGGGCTCCTGATATTGATTTATCAGAATTGGAGAGCTTGTTCTCCACTGCGGTTGCAACCAATGCAAGTGAAAAAGGAGGAACAAAGCGCGGTTCAGCTATTAGCAAGCCAGAAATCGTTCATCTGGTTGATATGAGAAGAGCAAACAATTGCGAGATCATGCTTACTAAAATTAAAATGCCTCTTCCTGATATGATTAATGCAATATTGGCTTTGGATACGTCTGTTCTTGATAATGACCAAGTGGAAAATCTCATTAAGTTTTGCCCTACAAAGGAGGAAATTGAGATGTTGAAGAACTACAATGGCAATAAAGAAATGCTTGGGAAATGCGAACAGTTTTTTCTGGAGCTAATGAAAGTACCTCGCGTGGAGTCCAAACTGAGAGTGTTTGCTTTTAGGATTACATTTTCAACACAGGTAGAAGAGCTGAGAACTAACCTAACCACCATAAATGATGCAACAAAAGAGGTGAAAGAGTCTCTGAAGTTAAGGCAGATAATGCAGACCATTCTTACATTAGGGAATGCATTGAACCAAGGAACAGCTCGAGGATCTGCGGTTGGCTTCAGATTGGACAGTCTTCTTAAATTATCAGATACTCGAGCTAGAAACAACAAGATGACACTAATGCATTATTTATGCAAGCTTCTTTCTGAGAAATTGCCTGAGCTTCTTGATTTTGACAAAGATTTAATTCATTTGGAAGCTGCTTCTAAGATCCAGCTAAAGTTGCTTGCGGAAGAAATGCAAGCAATAAACAAAGGTCTAGAGAAGGTTGAGCAAGAATTAGCTGCTTCAGTGAATGACGGTGCAATTTCTGTTGGTTTCCGTGAGGCATTGAAAAGCTTTCTTGATGCAGCAGAGGCTGAGGTTAGGTCCCTAATTTCCTTGTACTCGGAAGTGGGAAGAAACGCTGATTCACTAGCTCAGTATTTTGGCGAGGATCCAGCACGGTGCCCTTTTGAGCAAGTGACATCAATTCTGGTTATATTTGTGAATATGTTCAAAAAATCACGTGATGAAAATGCTCGAACTGCGGAACTTGAGAAAAAGAAATTAGAAAAGGACAAGGAAAAGGCAACTTTGTCTGCAAAGAAAGTCTTGGAATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSLLSRFFYKRPPDGLLEFIDRVYVFDSCFCTEVLPHGMYPVYLTGILTDLHEEHSQSSFLGINFRDGDKRSQLADVLREYNVPVIDYPRHFEGCPVLPLSLIQHFLRVCEHWLSTGNNQNIILLHCERGGWPSLAFMLSCLLIFKKLQSAEHKTLDLIYREAPKGFLQLFSALNPMPSQLRYLQYVARRNISPEWPPMERALSFDCLILRAIPSFDSDNGCRPLVRIFGRNIIGKNASTSNMIFSMPKKKTLRHYRQVIMQEDCDVIKIDIQCPVQGDVVLECVHLDLDPEKEVMMFRIMFNTAFIRSNVLMLNSDDIDIVWGSKDQYPRNFRAEMLFCELGGISPARPPTATLNGDMKGGLPIEAFSAVQELFNGVDWMESSDNAAFWLLKEFSANSLQEKFQKLILSDMEELSKFQAKVGLQIPLMSPLDSDEEKYSVASDSVSSSEHEKVQPGGNSSDSENINHDLTTEDTASMGNVLVNTPSVLPPTTPPPCGSLSILSTDENQLPPEVQCRPHPPSSKGLNAPAPPPLLGRGREATGSAKGRGIGLAQQSNPPKKASLKPLHWVKVTRAMQGSLWEDAQKQGNQARAPDIDLSELESLFSTAVATNASEKGGTKRGSAISKPEIVHLVDMRRANNCEIMLTKIKMPLPDMINAILALDTSVLDNDQVENLIKFCPTKEEIEMLKNYNGNKEMLGKCEQFFLELMKVPRVESKLRVFAFRITFSTQVEELRTNLTTINDATKEVKESLKLRQIMQTILTLGNALNQGTARGSAVGFRLDSLLKLSDTRARNNKMTLMHYLCKLLSEKLPELLDFDKDLIHLEAASKIQLKLLAEEMQAINKGLEKVEQELAASVNDGAISVGFREALKSFLDAAEAEVRSLISLYSEVGRNADSLAQYFGEDPARCPFEQVTSILVIFVNMFKKSRDENARTAELEKKKLEKDKEKATLSAKKVLE</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..73#158..858#931..1164#1237..1663#1876..1986#2452..2680#3084..3207#3668..3739#4938..5036#5162..5203#5273..5353#5441..5491#5573..5654#5729..5823#7940..8011#8117..8233#8879..8947#9022..9088#9387..9526#ATGTCACTGCTTAGTAGATTCTTCTACAAGAGGCCTCCTGATGGATTACTGGAGTTTATTGATAGGGTCTATGGTGAGCCTCCAAATTTTGTAACACGGTCACATTGTCCTTTTACGTGCCATTTGAACTGATTTTGCTCTTTGTCACATTGCACAGTTTTTGATTCATGCTTCTGCACAGAAGTCTTGCCACATGGCATGTACCCAGTCTATTTGACTGGTATTCTTACAGATTTGCATGAAGAACATAGCCAGTCTTCATTTCTGGGTATTAATTTTAGAGACGGGGATAAGAGAAGCCAACTCGCTGATGTCCTGCGTGAATACAATGTTCCAGTAATTGACTACCCTCGTCATTTTGAAGGCTGCCCTGTGCTTCCTTTATCTCTTATCCAGCATTTCCTTCGTGTCTGTGAACACTGGTTATCCACCGGAAATAATCAAAATATCATACTGCTACATTGTGAGAGGGGAGGCTGGCCATCATTAGCATTTATGTTATCGTGTCTCCTTATTTTCAAGAAACTGCAGAGTGCAGAGCATAAAACTCTGGACCTTATTTACCGTGAGGCACCTAAAGGGTTTTTGCAGCTCTTTTCTGCCCTCAACCCAATGCCCTCTCAGCTCAGATACCTGCAGTATGTAGCTAGAAGAAATATATCTCCAGAGTGGCCTCCAATGGAGCGGGCACTCTCCTTTGACTGCCTGATTCTTCGAGCCATTCCAAGTTTCGATTCCGATAATGGATGCAGGCCATTAGTCCGAATATTTGGGCGAAATATTATTGGCAAGAACGCTAGTACGAGCAACATGATTTTTTCAATGCCTAAGAAGAAGACTTTGCGCCACTATCGGCAGGTATGTGCTAGAGTTAATTTAGCATTGCCATCTACTTGCTTTGTGTCACTTTTTTTTGCATTAATCTGCAAGGTTATTATGCAGGAGGATTGTGACGTGATAAAAATAGATATACAATGTCCAGTCCAAGGAGATGTTGTTCTGGAGTGTGTACATCTTGATCTTGATCCAGAAAAGGAAGTTATGATGTTCCGGATAATGTTCAACACTGCTTTTATTCGTTCGAATGTACTAATGCTGAACAGCGACGATATAGATATAGTATGGGGTTCAAAGGATCAGTACCCAAGAAATTTTAGAGCAGAGGTATGAGCATTGCACATACTCTTTGTAACTTCAAGATACAAATTAATAATTGAACCTAATTTGGAAGTGCAGATGCTGTTTTGTGAGCTTGGGGGCATATCTCCTGCAAGACCTCCAACAGCAACATTGAATGGTGATATGAAAGGAGGTTTACCAATTGAAGCCTTTTCAGCTGTTCAAGAACTCTTCAATGGAGTTGACTGGATGGAAAGCAGTGACAATGCTGCCTTTTGGTTGCTCAAGGAGTTCTCAGCAAATTCCCTCCAAGAGAAATTTCAAAAGCTAATACTCAGTGATATGGAAGAGCTTTCAAAGTTTCAAGCTAAAGTTGGTCTCCAAATACCGCTAATGTCTCCTCTGGATTCTGATGAAGAAAAGTATTCAGTGGCTTCTGATTCGGTTTCTTCATCTGAGCATGAGAAGGTTCAGCCTGGTGGCAACTCATCTGACTCGGAGAACATTAATCATGATCTTACCACTGAAGATACTGCATCCATGGGTATAGCATTTGCCATAAGCATTGTGTTATGCAACTTTATATTGCTATATACCTGTTGCTATATATTCCCTCTGGAAGAATATGCCTTGTGTTGCTAAACCTGTTGTTTCCATGCTATCGATTCCCCCAAAATCACTTCTGTTTCCTCCCAATTCTGTTCTTTTTGTTGCTATCTGTTTAAATTCTTATTCACAACCCTTAAAATTTTGCAGGCAATGTCTTGGTGAACACTCCATCTGTCCTACCTCCCACGACACCACCTCCTTGTGGTAGCTTATCTATCCTTTCCACTGATGAAAATCAGCTGCCCCCAGAAGTACAGTGTGAGTCACCAAGTGACAGGAAGCTACCATCTCCATCACCAACAGCTGCTGCACCGGCGCCGCCACCACCGGCACCACCGCCACCACCGCCTCCAAGTGGAAACAAACCTGCCTTTTCCCCACCACCACCACCACCGCCGCCACCACCACCACTTCCTCAGAGTAACTATGCATCTTCTCAGCCTCCCCCACCGCCACCACCACCACCCTTGCCAAACTGTTTAGTCCCACCTCCACCTCCACCTCCACCACCGCCACCAATCTTGCCAAACCGTTCACTCCCACCACCTCCACCGCCACCACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCTCCCCTGATGACAGGAAAGAAAGCTCCTGCAGCCACCACCTCCGCCACCTCAAGCACCAAAACCTCCTGGAACAGTACCCCCTCCGCCACCATTGCATGGTGCATCAGGTCGACCACACCCCCCAAGCTCAAAGGGTTTAAACGCACCTGCACCACCTCCACTATTGGGAAGGGGAAGAGAAGCAACTGGATCAGCAAAAGGTCGTGGAATTGGATTGGCACAGCAAAGTAACCCTCCAAAGAAAGCTTCACTAAAACCTTTGCATTGGGTAAAAGTTACACGAGCAATGCAAGGCAGTCTCTGGGAGGATGCGCAAAAACAAGGAAATCAGGCTAGGTAACTGCCATTGGAAAAGCCATAGCTTGAATTTTCCTATTTTAATGCATCACCCTTTCATTTTGCACCCTTCAATTTCCTATGATGATTTTACATTATTCATTCATACCACTTAAGTGATAAAGTACCACATCCTTGTTTGTGGACTTACAGTTATATTGCTCTCTTGACTAAAATCTAAATGAACTGGAATGCTGGATTGATGCATTTCTGCTTTTTTCATCCTAAAATTTCTTGCTGGGTTTGCAATTCGATTTTCTTTTTAACAGTTGGATAATCCCTCTATTGGAACTGTTACTTACACGTTTATTTAGATAATGAAATAAACTTTCTTTACATATGAACTATATTTTAGGGCTCCTGATATTAATTAAACTTTATTTACATATGAACTATATTTTAGGGCTCCTGATATTGATTTATCAGAATTGGAGAGCTTGTTCTCCACTGCGGTTGCAACCAATGCAAGTGAAAAAGGAGGAACAAAGCGCGGTTCAGCTATTAGCAAGCCAGAAATCGTTCATCTGGTATGTACTACTACTCAAACATTTGTATGCTAAACACTTGTATCACAACCTTTTTATTCAGTTGTTCCATGATATGTTGGAATGTTAGAACTCTTGTTTGTCTAAAGCTTTTTCTATTAGATTGCACGATGCATGGACACTGCCTTTTCTTCCGTGAATATATATTTATCCTTTCTATGTATGTGATCAGTTTATTGATAATGAGACTACATAAGCTTTTGAGTTCAATCATAAAAGTGCATAGTAAAGCATGGAATTATGATTTGTTGCATACATGGTATTCCCTGCTGCAATCTTTGCACTCTTTTGAGTGGCATTTGCTTGCAACACAGACTTCTGATTTTCTTTATTGTTATATTTGAAGACTTCAACTTATTTGTAAATCAACACCATCCTATCCTGTCATGGAGAATTCTGTTCCTCATTTCATTAGACAATGAATTATTTGTTTTTATTTCAGGTTGATATGAGAAGAGCAAACAATTGCGAGATCATGCTTACTAAAATTAAAATGCCTCTTCCTGATATGATTGTAAGTATCTTTCTTGATTGAGCCGCTCCCTTATAATAGAAAGAGATTGGACATCAGTTTCCTCATGCAGAATATTGATAACAAGTTATTTTTTGCTCTGTTGATAACCTTTATTTATTTATCTTGAATACCTGAAGTTTCTGTGTTTCCTGGGTATGTATATTTCTAGGTTTTCACAGTTTTGATTTAGGTATGGATAGGGAGACAGAGAGTACATATGATGAGCTACAGCAATGGTTTAGAGCCTAGCATAGCTAAGTTAAGAGATAATTGAGCCTGCCATGATGTTGTTAGGTTGATGGGTGGTGAGGGCCCATATTGACTATCATGAGATCTTTTCTTGTTAGCGATACACTCATCCTTTCTTATCTCTATGATCTGATCGATTGCATAAGACCCGCGATAGCAATAGAACGGGGAAGTACCACTTGGCTACATCTGCCCCTTATCCAGCTAAAGGATTTTCTAATTTAATACACAGTTATTATTTTTTTCTCAACCAGACACATTTTCAAAGATTGCTGTTTATTTTTTTAGCTTACTTATAAGATTGTATGTGCATTGGTAGAATCTATCGTGAAAGAGAATAATCATGTGATGTAAAAAAAATCACACTAACCCCTTGCATACTACGAAGAAATAACAATATGTAATGCAATCTCCTGTCCCAAAATATAACAAGTTTTGGCCTTTAGAATTTGTCCCAAATATAACAACTTCCCCACTAACATTCTCTTCCCAACCAATCACAACCCTCCATTCAATTTCCCCACCTACCTCCACTTCTCATCCAATCACAACCTTCCCCCATTTAATTCTACCTACTTTCTTAATAACTATATCCAACCTTAAAAATCCTTATATTCTGGGATGGGAGGTAGTATTGATCGATGGAAAATAATTTGTCAGTACACAACTGAGTATTAACATATTAATGATGTTTCTTGATTGATTTGCATCCATGCAATTGCATCACCTTATTTGGATTAGCAGCATACAGAAGTACTGGGAAATTTGAATGGCCCTTGCCTCTATTTATAATTTAG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|
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