BGIOSGA033130

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA033130

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA033130, complete gene.

LocusTag

OsI_34027

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA033130-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA033130-PA

Length

12385

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 10

Location

Chromosome 10:16575941..16588325

Sequence Coding Region

16575941..16576038,16576124..16576222,16576837..16576879,16577501..16577572,16577651..16577746
,16577860..16578093,16578165..16578348,16578498..16578609,16578698..16578784
,16578954..16579092,16579880..16579970,16580073..16580135,16580297..16580406
,16580560..16580664,16581233..16581306,16581630..16581705,16582037..16582273
,16582670..16582741,16583333..16583404,16583491..16583555,16583635..16583737
,16584020..16584109,16585124..16585231,16585314..16585364,16586434..16586511
,16586592..16586654,16587441..16587637,16587740..16587809,16588137..16588325

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome10:16575941..16588325 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome10:16575941..16588325 source=RiceIndica10 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGCCAAATGCGAGATTCCAAGCTGCTGGAGCAATTGGTGATGCAGCAATAAGGGAGTGGGGAATCCTTTCAGATGACAACAAAAAAAGCCTAATAGTATATTGCTTGAACTATGTTATGGAGCATGCAAGTTCCCCGGAAGGTTATGTGCAAGCAAAAGTTTCTGCCGTGGCAGCTAGACTACTCAAAAGAGGCTGGGTTGAGTTTTCAGACCAAGAAAAAGCTGCCATCTTCTTTGAGATTGAGCAATGCGTACGAGGCATCCATGGACCTAATCGACAATTTGCTACCATCAATTTCTTAGAAGCCTTGGTTTCGGAGTTTTCCCCTGGGACTGCTTCTGCTATGTGCCTGCCTAAGGAATTCCATGAGCAATGCCAATGGTCACTTGAAGTGAAGTTTCTGAAGGACTTCTATTGCTGGGCACAAGCTGCTGTGTTCAATTCTGCAGACAGGATATTGAATGTAAATGCAAGTGTAGCGGAGGAGAAAGCATGCTCAGCAGCATTTCGCCTTATGTTCCAGATATTAAGCTGGAGTTTCAAGCACAATGTGGAGCATGCAAATTCAGAAGCTAAGATAAATTCTGGTTTGAGGAGTGATGCCATAAATCTGAAGAAATTTGAGCGTTCGCTGGTGAAGCCAGGGTCTGTGTGGAGTGATATTCTAATATCAAGTGGGCATGTTCAGTGGGTTTTGAACTTTTATACTGCTGCCCGCCAGAAGTTCTCATATGATACGCTATGGGTTGATTCTCCTATTGCTACCTCCTGCAGACAGCTCATAGTGCAGCTATGCTCGTTGACAGGCTCTGTGTTTCCTAATGATAACGCAGATGGACAGATTCAATACCTTGTGCGCATATTATCTGCTGTTGTACATTGGATTGAACCTCCTGATGTCATTGCTGCATCAATTCGAAGTGGAGCAAGTGAAAGTGAGTTTGTAGATGGATGCCATGCCCTTCTTTCAATGGCGTCTTTGACTACTTGTTCGCTTTTTGACAACCTCCTGAAGTCAACGAGGAACTATGGCACAATCAACCTACTTTCTGCTTTGACATCCGAAGCTGTCAAGTCTTTTCTGGATAACCAGAATGAAGAAGAAACCTGGGGCTCGGAGGCTCTTGATATATTGTTAGAAACATGGAATGTTATTCTGGGGGATGTTGATTCCGAGAAAAGTCCTATGTCAGTTGATGGAGCAATTGCTGCTTCAAGTTTGTTTAAGATCATCGTGGAGTCACATTTGAAGGCTGCTGCTGATTCTGCATTCGAGGATACTGATGATGCCGAATACTTTCATGTTTCTGTTTCAAAGCGTGATGAGCAGCTGGCCTTGTATGCTCAGATTGCACGTTCAGCTGCTGACACAACTATACCCTTTCTTGCACAATTGTTTTCAGAGCGATTTGCACGGCTGAGTCAGAGAAATGGTGAAAATGATCCTACTCAGACTTTAGAAGAGTTGTACTGGCTGTTGCTGATAACCAGTCATGTCCTAACAGATTCAGGCGAAGGAGAAACACTGCTTATACCAGAAGCATTGCAGGTTGGATTCCCCTATGTAGTTGAAGTAGCACAGCATCCTGTAGTTGCACTCTCATGGTCCATAATAAATTTTTCTCGACAGTGTCTAGATCCAGGAATCAGGGCAAGGTACTTCAGTCCGCGACTCATGGAGGCTGTGATTTGGTTCTTGGCCAGATGGGTCGCAACCTATTTAGTACCACTTGATGTGAGTAGGGGGCAAGTAAACAGAGCAGAAATTGACAGTGTGGATAAACACATGCTCCAACATTCTAGAAAAATGCTAAACAGTTTTGCTTGGGAGAATAACCAAGGAGAGCGTGTTCTTGATTTTGTTGTTCTTATTTCAATGGTAGCACTTACTACATATCAGGGAGAAATTGAGCTGCAGACACTTACATGCCAGAAGCTACTTGCTACAGTTGTTCGAGGGAAGCACACATGTACTTATGTTGTTCAGTTGGACTCGTGGCGTGATCTTACAAGAGCTTTTGCAAGTGGACGTTCTTTATTTTCATTAACTGGACGCTTACAGAGATCTCTAGCAGAAACACTTGCCTGTGCAGCTTCCTGCATCAAAGATCCTGAAGCATCTGTGCAGTATTTGAGGGACCTCATGGGACAGGTTGCTGGATGCCTAGTAGAGAATGCTAACAGGAGTGATCTCAAATCTGTGGCACAGCAAGCAGATGTTGTTTATATGTCTGCAGTCATATACATGATACTCAAGTTCGTCGTTGATTTTGTTGATGGTCAAGCTGTGTTTTTGGATGCTAAGGAAACATCAGTTTTGGTAATGCTCTCGCTTTCTTCAAGTTTGCGCAGTGAGTCACAAGCTGAAAAATATAAGGATCTACGTGCTTTGCTTCGTCTTCTGACTAATATATGCTCAAAGGATTTGGTTGGTTTCCTATCTGATAGTAGCATTGAAGGTTCACAAGATATTGCTGAGGTCATCTATGTTGGAGTTGATATTGTGACTCCCTTGATATCTTTGGACCTTCTGAAGTACCCTAAACTCAGTCGTGATTATTTTGCTCTTATCTCTCATTTGCTGGAAGTGTACCCGGAGAAGGTTGCTAACTTAAATAAGGATTGCGACATTGTCGACAGGTGCCTTACAGCAATAAATGCTCTCGCTTCTTACCATTTCAAAGAGAGACTTGGAGGTAGGGGAGGACTTAGCTCACAGCTTATGGAATCAGAAGGATCAAATGGCAAACTTCAGGAAAGCATATCAAGTCACTTTTTGAGGCTGCTTCTGCAATTGCTTCTGTTCGAAGATTTCAGAATGGAACTAGCAGGTTCTGCTGCAGATGCTTTGCTTCCTTTGATTTTATGTGAACAACCATTATATCAGAGGCTGCTCCAGGAGTTAGTTGAGAAACAACAGAATCCAACAGTGAAATCAAGGCTGGGAATGGCATTCCATAACCTCACAAGCTCCAACAATCTCTCCAACTCGCTCGACCGCCCAAACAGGCAGAGATTCAGGAAAAACCTCCGCACTTTCTTGGGCGATGTCTCGGGCTTCATGCAGATAAAATAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MPNARFQAAGAIGDAAIREWGILSDDNKKSLIVYCLNYVMEHASSPEGYVQAKVSAVAARLLKRGWVEFSDQEKAAIFFEIEQCVRGIHGPNRQFATINFLEALVSEFSPGTASAMCLPKEFHEQCQWSLEVKFLKDFYCWAQAAVFNSADRILNVNASVAEEKACSAAFRLMFQILSWSFKHNVEHANSEAKINSGLRSDAINLKKFERSLVKPGSVWSDILISSGHVQWVLNFYTAARQKFSYDTLWVDSPIATSCRQLIVQLCSLTGSVFPNDNADGQIQYLVRILSAVVHWIEPPDVIAASIRSGASESEFVDGCHALLSMASLTTCSLFDNLLKSTRNYGTINLLSALTSEAVKSFLDNQNEEETWGSEALDILLETWNVILGDVDSEKSPMSVDGAIAASSLFKIIVESHLKAAADSAFEDTDDAEYFHVSVSKRDEQLALYAQIARSAADTTIPFLAQLFSERFARLSQRNGENDPTQTLEELYWLLLITSHVLTDSGEGETLLIPEALQVGFPYVVEVAQHPVVALSWSIINFSRQCLDPGIRARYFSPRLMEAVIWFLARWVATYLVPLDVSRGQVNRAEIDSVDKHMLQHSRKMLNSFAWENNQGERVLDFVVLISMVALTTYQGEIELQTLTCQKLLATVVRGKHTCTYVVQLDSWRDLTRAFASGRSLFSLTGRLQRSLAETLACAASCIKDPEASVQYLRDLMGQVAGCLVENANRSDLKSVAQQADVVYMSAVIYMILKFVVDFVDGQAVFLDAKETSVLVMLSLSSSLRSESQAEKYKDLRALLRLLTNICSKDLVGFLSDSSIEGSQDIAEVIYVGVDIVTPLISLDLLKYPKLSRDYFALISHLLEVYPEKVANLNKDCDIVDRCLTAINALASYHFKERLGGRGGLSSQLMESEGSNGKLQESISSHFLRLLLQLLLFEDFRMELAGSAADALLPLILCEQPLYQRLLQELVEKQQNPTVKSRLGMAFHNLTSSNNLSNSLDRPNRQRFRKNLRTFLGDVSGFMQIK</aaseq>

Gene Sequence

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