BGIOSGA001838
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001838 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001838, complete gene. |
| LocusTag |
OsJ_01411 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001838-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001838-PA |
| Length |
8183 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:11811478..11819660 |
| Sequence Coding Region |
11819203..11819660,11818962..11819088,11818017..11818047,11817151..11817816,11816736..11816947 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:11811478..11819660 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:11811478..11819660 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGAGCAAAATCGCCCCCCTTCACCTCACTAACCCTAGTTCGACTCCTCTCCTCTCTCTCCCGTCTCTCCGCCCGATTCCAATCGGGAAGGGGATTCCAATCGCTGTAGCCGCCGCCGCTCATGCGCAGGCCGGTCTGGGCCGAACTGGGCCTGTATTGGGCTTCTGCATTGCTGATGGCCCCGAAACGGCCTGCGACGTGGCCCAACAAGATGGCTACACTGTCACTCACTCACTCCGCCGCTTTTCCCTTGACCCCTTCCTCTCGTCGTCGTCGGTGCGGCGCCGCCAGGGAAAATGGAGTCATCGAGGCTGCGGAGGCGGCGGCGCTGCCGCGTCCGGTGCCTCCTCGCTCCTCCCGTTGCCGCCCGTGCGCAGCAGCTGCAGCGCGTCGCATCTTTCTCCAAACCCACGCAGATCTCCGCTTTTTCCCGGCGGCAACCACGCCGCGGCAAGCAGGAATTCTCTGCTTCCTAGATCTCTAATCATTTACTTTGGAGTTCTTAGCAATGTTTTTGGGTATTGGATTCTATCACTTGAGAAAATGAGAACCGCCATCCCGCACACACCAAATGATGAAGAAATGGTGTGGATGACTTCATATATGATATACTTTGTTCTAGTTATAAGCCTGTGCAGAATATGCAGAAGAAAGAAGTACAAGATACACGACGCAGGAGATTTGCAGCAGGAAAACATGTTCTCTGTCTTAAACTTTGATGGTGGAAATGCATACGAGCAAATTATTGAAGCGACGGAGAACTTTAGTGAAAAATATTGCATTGGAGCAGGTGGTTATGTGTCTGTCTATGTAGCTAAATTATCAAATGGTAAAAATTTTGCAGTCAAGAAGATAAATGCAACAGAGAATGGCCGTTTGATAAACGAGCAAATGTTCTATCGTGAAATAGAGGCCACAATGCAAATACGCCACAAGAACATTGTAAAAGTCTTTGGCTACTGCTGTACAGCACGAGATAAGTTTATTGTCTACGAGTATATGAAAGGAGGAAACTTGTTGACAGCTCTCAAGTCCTACAGAAGTGCAAGCGAGTTGGATTGGAAGCGCAGGTTATGTATTGCTCAGGATGTTGCTCATGCCCTATCTTACTTGCATCACGACTGTTCAGATCCTATAGTCCATCGAGATGTAACAACCAAAAACATTCTGCTAGATCTGGAGTTCAGAGCTTGTTTATCAGACTTTGGGATAGCTAAAATACTGGATGCTGATGGATCAGGACACACAAGGCTCGCTGGTACAAAAGGATATCTTGCACCAGAGCTGGCATACACTACGAAGGTGACAGAGAAATGTGACATTTATAGCTTCGGGGTGGTAGTTCTTGAGCTGTTGATGGGATCTCACCCTGGAGACTTTGTTTCGTCGATCTCATGCCCTAGCAAGAAAAGCACACCGATGAAGGATTTGTTGGACACCAGACTCCCGCCTCCAGAAGGTGAAGTTGCAAGCGAGATATTTGGATTGATCACGGTTAGAGGCGATGGCGAGATCCTAAGCCAGGTGGTATCTTCCCAAGTTGTCCAGAAAGCACTTGATGATGCAAATGTGTCAGAAAGTGATCTTTCTGCAGTGGCTGTCACCGTAGGACCAGGACTTAGTTTATGCCTCAGAGTTGGTGTTCACAAAGCTCGAAAAATAGCAAAATCATTTCACCTGCCTATTGTTGGAGTTCATCATATGGAGGCACAGGCATTAGTTTCCAGATCAACAGATGATATTCCTATTTCATCTGCTACAAAAGATGACAGACAAATAAGGGCGAACATTGCTGCCTCTTTTCAGTTATTAAAGGTTGTTTCAGGAGGCGTTGCATCAAACCAGTATGTCAGAACTCATTTGAATCAGATTGCTGAGAAGAATGGCCTACAGCTCGTATGCCCTCCACCAAGGCTTTGCACTGACAATGGTGTCATGATTGCTTGGACTGGTATTGAGCATTTCATTGCAGGCAGATTTGATGATCCTCCTGCTGTTGATGAGCCTGATGATTTGCAGTATGACCTGCGTCCAAGGTGGCCTCTTGGTGAGGAATATTCAGATGGAAGATGTGTTGCACGATCAATGAAAACTGCTCGAGTCCACCCATCACTCGCATCGATGATACAGGGTTCTGTTCATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSKIAPLHLTNPSSTPLLSLPSLRPIPIGKGIPIAVAAAAHAQAGLGRTGPVLGFCIADGPETACDVAQQDGYTVTHSLRRFSLDPFLSSSSVRRRQGKWSHRGCGGGGAAASGASSLLPLPPVRSSCSASHLSPNPRRSPLFPGGNHAAASRNSLLPRSLIIYFGVLSNVFGYWILSLEKMRTAIPHTPNDEEMVWMTSYMIYFVLVISLCRICRRKKYKIHDAGDLQQENMFSVLNFDGGNAYEQIIEATENFSEKYCIGAGGYVSVYVAKLSNGKNFAVKKINATENGRLINEQMFYREIEATMQIRHKNIVKVFGYCCTARDKFIVYEYMKGGNLLTALKSYRSASELDWKRRLCIAQDVAHALSYLHHDCSDPIVHRDVTTKNILLDLEFRACLSDFGIAKILDADGSGHTRLAGTKGYLAPELAYTTKVTEKCDIYSFGVVVLELLMGSHPGDFVSSISCPSKKSTPMKDLLDTRLPPPEGEVASEIFGLITVRGDGEILSQVVSSQVVQKALDDANVSESDLSAVAVTVGPGLSLCLRVGVHKARKIAKSFHLPIVGVHHMEAQALVSRSTDDIPISSATKDDRQIRANIAASFQLLKVVSGGVASNQYVRTHLNQIAEKNGLQLVCPPPRLCTDNGVMIAWTGIEHFIAGRFDDPPAVDEPDDLQYDLRPRWPLGEEYSDGRCVARSMKTARVHPSLASMIQGSVH</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..458#573..699#1614..1644#1845..2510#2714..2925#4280..4324#4617..4713#5133..5223#6217..6295#6534..6657#6959..7047#8058..8183#ATGAGCAAAATCGCCCCCCTTCACCTCACTAACCCTAGTTCGACTCCTCTCCTCTCTCTCCCGTCTCTCCGCCCGATTCCAATCGGGAAGGGGATTCCAATCGCTGTAGCCGCCGCCGCTCATGCGCAGGCCGGTCTGGGCCGAACTGGGCCTGTATTGGGCTTCTGCATTGCTGATGGCCCCGAAACGGCCTGCGACGTGGCCCAACAAGATGGCTACACTGTCACTCACTCACTCCGCCGCTTTTCCCTTGACCCCTTCCTCTCGTCGTCGTCGGTGCGGCGCCGCCAGGGAAAATGGAGTCATCGAGGCTGCGGAGGCGGCGGCGCTGCCGCGTCCGGTGCCTCCTCGCTCCTCCCGTTGCCGCCCGTGCGCAGCAGCTGCAGCGCGTCGCATCTTTCTCCAAACCCACGCAGATCTCCGCTTTTTCCCGGCGGCAACCACGCCGCGGCAAGCAGGTGAGAAGAGCTCAACTCGCTGCATGCAAGTTGCTCGATGAAATGCTTCCATGGAGCCAGCTTCTAGTTTCTCGTGTACATGTACAATTTACTTTTTTTCCGTTTTCTTTACAGGAATTCTCTGCTTCCTAGATCTCTAATCATTTACTTTGGAGTTCTTAGCAATGTTTTTGGGTATTGGATTCTATCACTTGAGAAAATGAGAACCGCCATCCCGCACACACCAAATGATGAAGAAATGGTATGCATACGTTTAGTGTGTTTGTAGCGTTGTTGACCTTTGAGTAATGTGCTGCAAGTGAGATGACCGATTCTTTGTTAGTTCCTCAAGGCAACCAACACATGATCCGTATCCTAGCTTAGATTGAAGCATACGGAACTAAGCAGAAACCCGGGCGATAGTAATAAGTTTATTGCATATTTTCTGCACATGGACTTAGGAAGGTTTCCTCAATTTTTTTTAATGAACTTTGGAGGGACTTCTTCAGTTTGTTTAGCTCAATTTTAATTCCTCGGTCAGAGGAACTAAGCAGAAACCCGGGCGATAATAATAAGTTTATTGCATATTTTGTGCACATGGACTTAGGAAGGTTTCCTCAATTTTTTAATGAACTTTGGAGGGACTTCTTCTGTTTGTTTAGCTCATTTTTAATTCCTCGGTCAGAGGCTTTTAACCAAACACGCTCAAAGTCAAGAGTCCAAATATAACTATCATAGTTTCACGGCACGTTGACAGTTGACACTAGATTGCCAGCTTGCTCATCAACCAAATATCACCATACAATTTCCAGTAGGAAAACCAACTACATACTCTATAATTGTTTAACCCATCTTGTTGTACTTTAGTCTAGTTAATTGATAGTTATACATGCTAAACCCAGGACTAGTATTAGGGTGCTAGCTACGCATACAAGATCCAGAAACTGCTCACACGTTACAGGAATCAAATACCAAAGCATCCAGTGACTGTGTCGCTGTTCGTTCTTTGGTCAGAAGTCCCTTACATGCATATATCTCATTCTCTTTGGCTCTCCTCCTCGCAACCTACCACAAAACTCATCCTTCAAGTTTCCGTGTCTTCTCGATTCAGTCTCACAATCCCCAACATGTATTTGCCATGGCTCATTGTGTTACTCTTTGTCTTGGCTGCTGCAGGTGTGGATGACTTCATATATGATATACTTTGGTATATGATATACTTCATATCTTCATCATGTTGCATATGTGTTCCCTCATAATTTGTTGTGCAAATGTGTGGTTTTGTTAACAACTAAAACTGTGGGTTTGTGAAACTGTTTCTTATGAATGTGTAGTTCACTGATTGCCTTTTGCATTAGAACTTATAGTTTTCTGAAATTTATCTTACTCTGTTTGTTGTTCTTGCAGTTCTAGTTATAAGCCTGTGCAGAATATGCAGAAGAAAGAAGTACAAGATACACGACGCAGGAGATTTGCAGCAGGAAAACATGTTCTCTGTCTTAAACTTTGATGGTGGAAATGCATACGAGCAAATTATTGAAGCGACGGAGAACTTTAGTGAAAAATATTGCATTGGAGCAGGTGGTTATGTGTCTGTCTATGTAGCTAAATTATCAAATGGTAAAAATTTTGCAGTCAAGAAGATAAATGCAACAGAGAATGGCCGTTTGATAAACGAGCAAATGTTCTATCGTGAAATAGAGGCCACAATGCAAATACGCCACAAGAACATTGTAAAAGTCTTTGGCTACTGCTGTACAGCACGAGATAAGTTTATTGTCTACGAGTATATGAAAGGAGGAAACTTGTTGACAGCTCTCAAGTCCTACAGAAGTGCAAGCGAGTTGGATTGGAAGCGCAGGTTATGTATTGCTCAGGATGTTGCTCATGCCCTATCTTACTTGCATCACGACTGTTCAGATCCTATAGTCCATCGAGATGTAACAACCAAAAACATTCTGCTAGATCTGGAGTTCAGAGCTTGTTTATCAGACTTTGGGATAGCTAAAATACTGGATGCTGATGGATCAGGACACACAAGGCTCGCTGGTACAAAAGGATATCTTGCACCAGGTAAACAAAATTTATTATGTTGAACCTACTGTTTTGATTATTATTTTTCTTATCTTATGTATTTTTCTTGTTGCATGAAGCTGCATTATATTACTAAAAAATATGCTCTACGCTATACTTAATATGCATGAAGAAGTTACCACAATATTAACATAAATTAATATTTAGTACATTTTAATCTGACTGAACTCCTGATACTTCAGAGCTGGCATACACTACGAAGGTGACAGAGAAATGTGACATTTATAGCTTCGGGGTGGTAGTTCTTGAGCTGTTGATGGGATCTCACCCTGGAGACTTTGTTTCGTCGATCTCATGCCCTAGCAAGAAAAGCACACCGATGAAGGATTTGTTGGACACCAGACTCCCGCCTCCAGAAGGTGAAGTTGCAAGCGAGATATTTGGATTGATCACGGTTGCTATACAGTGCCTTCACCCCAATCCATCAACTCGTCCGACGATGCCATCCACAATTCATTTGTTCTCCAAGTTTTCTAGGGCGGTTGATCTTGATTATCTGCATGCTGACATCATGGAGTTCTGCCTTCTTTGAACCTTGACCTTTGTATTCATTTTCTACTTGTGGAATGTTCCCGAGGATAAAGGGAACTACACAGGTATTCTACATTTTATGCCTTTGTTGATGTGGGAAGGAAGGGAGCTAATAGGTGTGTTGTTTTACAAGAATTGCTATCATCTTTCTTTCCCCATAATTGTGGTGTTGTTTATAGTTGAATATTTGTTTTACTTTGATATTGTATATCTCATTTAATATGCAAGTTTACAAAATAATGTTTAATGATGTAACCTATGTTTAACAACGTTGTAGAATTGTTTCATAAATTTTGAAAAAAAAATCATTTTACTTCTCGGAACTATTTCACCGGAGCACTTAACCCTCTAAACTATTGTTGGGTTCATTTTACATCCTCAAGATATTGAAAGCGGTTCACTTCACTCCTCTAACGCTCTCTCTCTTTTTTGTTTTTATCTATAGAAGTCATCGCACTGAAAATTTGGTAGAAAATATAGTTGCATTCACAACTTACGCCTCAACTTTTTTTATATTTTTTTCTCACTGTTTATGTATGTTGGAAGCAGTTAAAACTGATTTAAACATCAACATTTTAAAGTTCAAGCAAACAGCCATGAAAAAATTTCAAAATATTTTTGAACTTTGATAAAGGTGTCATCTATGGCTCTAATAAATTTTAGCTTAAAATATAACTTTTATAAAAGAGTAACAAAAAAAATAGAGCTGTTATTAAGGAGTAAACTGAATCATTTTTAATAGTTTAAGGGGTAAAATGAGCCCAAAAAATAGTTCAGGGTTAAGTGATCCATTGAATTAGTTCGGGGAGTACTAAAATGAACTTTTTTTCTAAAATTTTTATGGCAATTAGGAATAAATGCAAAGTATATATGGGTGTAATTGCGTAAAAAGTTGTGTAAATTCGGTCATGTCAGACAAATGTCAGCCCAAACTAGGCCCGTTTAATGCTAAGACTTGTCAGTCCGAAGGCCCAATCTAACTTGCGGGCTTGCGGCCTGTGCGAAAACTCTCGTGGTCAAATCTGAATATCCGATACTTCCGTTTCAAATGCAATCCAAGGCCGAAGCTGAGAGAGTGCAAAGCCGAGCCACGGTGGAATGGCGGCCACCCCCCCCCCCTCCCTTTCCCCCATGGCAGACCGCTTGTAGCTGTGGTGGAGCCATGTCTAGGATTTGTTCTTAGTGCCTTGGCTCTCTGTTGCCTTTGTTGGTTGCAGGTTAGAGGCGATGGCGAGATCCTAAGCCAGGTGGTATCTTCCCAAGTGAGACACTATGCCCCCCACCTCCCTGTCCAGCACACTTCATTTCTGTATATTTGTCATGTTATATTCTGTGCGCTGCTGATAGTATTGCTTTGTGCTTACAACATTTGGAAGGAAGATTTACTCGTGAGGTGGGGAGGCGTCGCTCCGAAGATGGCTGAGGAAGCTCATTTGCTTGCGATTGATCGGGTTTGGCTTTCAGTTTCAGAGTTTCTGTTCAGAAGTTGTGCGGATCTTGCTGTTTTTTACATTTATGTTAAAGAGTTGCTAACTTTTTGTACTTTCCTTGCAGGTTGTCCAGAAAGCACTTGATGATGCAAATGTGTCAGAAAGTGATCTTTCTGCAGTGGCTGTCACCGTAGGACCAGGACTTAGTTTATGCCTCAGAGGTATTTGATGCTTTTGTATGTTTACTCCTGATCAATAGGATTATCTGGTATTTACTGTTATGTCTTATATGCTGGCATGGTTCTGAATTTTCAGTTTGTTACAGAATCTTGTTTGCATCTTTCAATCATTCCCCACAACCAAAACCC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|
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