BGIOSGA001807
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001807 |
|---|---|
| Description |
Putative cation chloride cotransporter 2 |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001807, complete gene. |
| LocusTag |
OS01G19850 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001807-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001807-PA |
| Length |
7538 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:12327457..12334994 |
| Sequence Coding Region |
12334955..12334994,12334431..12334567,12333618..12333709,12333000..12333114,12332668..12332768 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:12327457..12334994 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:12327457..12334994 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGACATGGTTGGGTTGTTTCTACAGCAAGGAGAAAGATTTGAGTGATAGGGGCCAGTGGCTGAATGTGGGAGGAGAGGAGCCGGTGGTCTCCTACTACTTCTCCCCAGCCACCGGGACTGGGACTAGGAGGCGGTGGAGATTGGAAGCGTCGGCAGTGGGGTTGGGGAGAGAGGAAACTGAAACTAAACTTGATACCATGATGGGTGTATTCGTGCCATGCCTGCAGAACATCTTGGGAATAATCTATTATATTCGCTTTACTTGGATCGTTGGTATGGGAGGCGTATGGCAGTCACTTGTTTTAGTCGCATTTTGTGGTTCATGCACATTTTTAACTACGATATCATTAAGTGCAATTGCGACGAATGGGGCGATGAAGGGTGGTGGCCCTTACTATCTCATTGGCAGGGCACTTGGTCCGGAAGTTGGAGTTAGTATTGGATTGTGTTTCTTCCTTGGGAATGCAGTTGCCGGAGCTATGTATGTGCTGGGAGCTGTCGAAACCTTTTTGGATGCTGTTCCTTCTGCTGAATTTTTTCAAGAGAGTGTAACAGTGGTCACCAATACGTTCGTAAACGGTACCGCAGCAGGCAATGCAACAACTATCTCAACACCCAACTTGCATGACCTCCAGGTCTACGGCATCATCGTGACCATATTGCTTTGTTTTATTGTATTTGGTGGCGTCAAAATTATCAACAAAGTTGCACCTGCTTTCTTAATACCAGTGCTCTTCTCAATCCTGTGCATTTACATCGGTGTCTTTATTGCACCAAGGCCAAATGCTTCAAAGTGGATAACTGGTTTGAGTATAACTACATTGAAAGACAACTGGAGTTCAGACTACCAACGAACAAACAATGCTGGAGTTCCTGATCCAAATGGGTCTATATATTGGGATTTTAATGCTTTGTTAGGTCTCTACTTCCCAGCAGTTACAGGAATCATGGCTGGTTCAAATCGGTCTGCTTCACTGAAAGACACACAACGTTCAATACCAATTGGAACATTACATGCTACCATTTCAACTACTATGATGTATCTACTATCTGTGTTTCTGTTCGGAGCATTGTCTACAAGAGAGGGGCTTCTGACTGACAGGCTTCTATGTGCTGCAGTTGCTTGGCCCTCTCCAGCAGTAGTTTATGCTGGTATAATTCTATCCACTTTAGGTGCAGCGCTACAGAGTCTGACAGGGGCTCCAAGGTTACTTGCAGCAATAGCGAATGATGACATTCTTCCTGTACTTAATTATTTTAAGGCTTATGAAGGGTCTGAACCTCATGTGGCAACTCTGTTTACAAGCTTCATCTGTATTAGCTGTGTCATCATTGGGAACTTGGATGTAATTACACCCACTATCACCATGTTTTTCCTTCTGTGTTATGCTGGTGTGAACTTGTCATGCTTTCTGCTTGACCTCCTTGATGCTCCTAGTTGGCGCCCCCGATGGAAGTTGCACCACTGGAGCCTTTCTCTCATCGGTGCATTGCTTTGTATTGTTATCATGTTTATGATCTCTTGGACTTTTACTGTGGTCTCCCTTGCCCTTGCAAGCCTCATATACTACTATGTCAGCTTAAAAGGAAAGGCAGGGGACTGGGGGGACGGATTTAAGAGTGCATACTTTCAACTGGCTCTAAGAAGTCTTCGATCAATGGGAGCAAATCAAGTTCATCCTAAGAATTGGTACCCTATTCCTCTCATATTTTGTCGGCCTTGGGGTAAACTTCCAGAAGATGTCCCGTGCCATCCAAAACTCGCGGATTTTGCCAACTGCATGAAGAAAAAGGGCCGTGGTATGTCAATATTTGTCTCAATTATTGATGGCGACTATCATGAATCTGCTGAGGATGCAAAGACAGCATGCCGCCAACTGAGCGCTTATATTGACTATAGGCGCTGTGAGGGCGTTGCAGAGATTATCGTAGCACCCTCAACATCTATCGGTTTTCGCAGCATTGTTCAGACAATGGGCCTAGGGAATTTGAAACCAAACATTGTTGTGATGCGGTACCCAGAAATCTGGCGTCGTGAGAATCTGACACAGATACCATCAACATTTGTCAGCATCATAAACGATTGCATTACTGCTAACAAGGCTGTCGTCATTGTGAAAGGACTAGATGAATGGCCTAATGAGTACCAACGACAGTACGGGACAATCGACCTATACTGGATTGTGAGGGATGGAGGATTGATGCTCCTTCTGTCTCAGCTCCTACTCACCAAAGAAAGCTTCGAGAGCTGCAAGATTCAGGTCTTCTGCATAGCTGAAGAAGATACCGAGGCCGAGGAGCTAAAGGCAGACGTCAAAAAGTTCTTGTACGATCTTAGGATGCAAGCTGATGTGATCGTTGTGACTGTGAAGTCATGGGAAGCAGACCCAGATCGCAGCGGTGGCTCGAAGAAGGATGACCCTGAGGTGTACAGAAGCGCGCAGAGCAGAATCAGAACATACATTTCTCAGCTGAAGGAAGCCGCGGAACGCGAACGCCGGCCCCTGATGGAGGGTGGCAAGCAGGTCGTGGTTGATGAACAGAAGGTTGAAAAGTTCCTCTACACGATGCTGAAGCTGAACGCTACTATCCTTAGGCACTCCAGGATGGCAGTCGTGGTGCTCGTGAGCCTTCCACCGCCACCACTGAACCACCTGGCATACTGCTACATGGAGTACATGGATCTGCTTGTAGAGAACATCCCGAGGATCCTGATAGTTAGGGGATACAGAAGAGATGTCGTCACGCTTTTCACATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>METWLGCFYSKEKDLSDRGQWLNVGGEEPVVSYYFSPATGTGTRRRWRLEASAVGLGREETETKLDTMMGVFVPCLQNILGIIYYIRFTWIVGMGGVWQSLVLVAFCGSCTFLTTISLSAIATNGAMKGGGPYYLIGRALGPEVGVSIGLCFFLGNAVAGAMYVLGAVETFLDAVPSAEFFQESVTVVTNTFVNGTAAGNATTISTPNLHDLQVYGIIVTILLCFIVFGGVKIINKVAPAFLIPVLFSILCIYIGVFIAPRPNASKWITGLSITTLKDNWSSDYQRTNNAGVPDPNGSIYWDFNALLGLYFPAVTGIMAGSNRSASLKDTQRSIPIGTLHATISTTMMYLLSVFLFGALSTREGLLTDRLLCAAVAWPSPAVVYAGIILSTLGAALQSLTGAPRLLAAIANDDILPVLNYFKAYEGSEPHVATLFTSFICISCVIIGNLDVITPTITMFFLLCYAGVNLSCFLLDLLDAPSWRPRWKLHHWSLSLIGALLCIVIMFMISWTFTVVSLALASLIYYYVSLKGKAGDWGDGFKSAYFQLALRSLRSMGANQVHPKNWYPIPLIFCRPWGKLPEDVPCHPKLADFANCMKKKGRGMSIFVSIIDGDYHESAEDAKTACRQLSAYIDYRRCEGVAEIIVAPSTSIGFRSIVQTMGLGNLKPNIVVMRYPEIWRRENLTQIPSTFVSIINDCITANKAVVIVKGLDEWPNEYQRQYGTIDLYWIVRDGGLMLLLSQLLLTKESFESCKIQVFCIAEEDTEAEELKADVKKFLYDLRMQADVIVVTVKSWEADPDRSGGSKKDDPEVYRSAQSRIRTYISQLKEAAERERRPLMEGGKQVVVDEQKVEKFLYTMLKLNATILRHSRMAVVVLVSLPPPPLNHLAYCYMEYMDLLVENIPRILIVRGYRRDVVTLFT</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..40#428..564#1286..1377#1881..1995#2227..2327#2866..2927#3797..4045#4133..4247#4369..4563#5381..5781#6199..6360#6445..7538#ATGGAGACATGGTTGGGTTGTTTCTACAGCAAGGAGAAAGGTGAGCTCCGCCGACATGGTTGGTTTATCCATCGCTGCCCAAAAGGAGAGGCTAATGTTAAGAATTCCATTATCAGCTTCAGCTCCGTGTCCGTGGCGTCCTTCCTTCTCTTGTTGACTCTGGAGTCTGTAGATGGCCACCCCGTGGCCTCCTGGCATGTGCATGGTAGCGGCATATCTTTCTCGATGCTTGAAGAGGATGGAGCTTTCCCGCCGCCGCCGCTGCGTGCTTGAGGAGGAATCCGTCGCCGGCCACTCCCTTTGCCATTACTCCGGCACTTAGTCCGCTTCCACCATTGCAGGAGAGTGCAGCACCCTTTGCATCTGTCGCTTCCCCTCCTTCCTCTCCAGTTGTCATCGATTCCACTTCTCCCCAACCTTATTCCAGATTTGAGTGATAGGGGCCAGTGGCTGAATGTGGGAGGAGAGGAGCCGGTGGTCTCCTACTACTTCTCCCCAGCCACCGGGACTGGGACTAGGAGGCGGTGGAGATTGGAAGCGTCGGCAGTGGGGTTGGGGAGAGAGGTGCAGTGGCATGGGTTGAGAAGGACGAGGTGCGTGGGAGGAGAGGTGGCGGCGCGGGCGTAGAGAGGGGAGAATGGAATTAAATTTGAAAATACACTGTTTATTCAATTTTTTCTTATAAATATTCGGGATGTAAAAATTTTTGCGTAAATATACTGCCGATCTCGCACAACCGTTGCGCGAGAATGACGTGGGAATGACGTCATGGACAGTATCACGCGGCGAAGGCGCGAGACCGCACGGTCTCGCGGGACAACGGCGCGAGACCGCGCGGTCTCGCGGAATGGTACAGCGAGACAGAACGATCTCGCACAAGCACTGAGCGAGACCGGTGCCATGCTGATTCAATTAGCGACTAATTATCTTGATTAGCGATTAATTAATTATTAATTAATCCCTAATTAGGATAATTAGTTGCTAATTATTATTAGTTAATTGCTAATTAAGTAATTAAGCACTAATTAAATGGAGCCGCTGGACAGTTTCGCTGTTTGATTCCGCGAGACCGAACGGTCTCGCTCTTCCATTGCGCGAAACCGCGCGCTCTCGTGCCTTCGCTGCGCGAGACCGTGCGTTCTCGCACTTTCAACGCGCGATACCGCCCATGACGTCACACCCACCTCGGTATTTAGTGGGAGTTTACACCCACCAACACCAAAGGAGCTATAGACAGTTCCTTGAAATATATTTTTGTTACATTTTTTTTTTCTCTGGTGTGCAGGAAACTGAAACTAAACTTGATACCATGATGGGTGTATTCGTGCCATGCCTGCAGAACATCTTGGGAATAATCTATTATATTCGCTTTACTTGGTAAATCTTTGCGTCTGTTCTTTCTACATGTGCATAAGACACAAGGTGTTTCCTCCCGTGCTCGGCGTGCCTTCGTTTAGTATAAGTTCCACTTATGCCTTCTGCATTACTGGTTGATTTCTGACACGGAAATATGATTATGTTAGTAGTAATATTAGTGTTTCCATGCAAGCAAGGACCTCGTAATGCAAGTGACTTCTTGGTGAAGCCTTCATGAGTTCATATTGCATTTACACTCTATTTATTTACTACTATATAATCAAGTCTAGACATAGTAATGTAAAACTGCAAATATTGATATCCAGTTCTCCACTGTGGGAATTGGTGTCAATTCTTCCATTTGAGGACCTTGATATATGTTAAATTATTGTTTGGAATTTATTTATTTATTGGATATTTCACATTCTAAAATTTGTATCTCTATTCAAATTGCACCCTTATGCATAATTTGGCAATCTGTTCAAATTATCAACATTCAATTGTTTCTTTTCTGGTTTCTGTAGGATCGTTGGTATGGGAGGCGTATGGCAGTCACTTGTTTTAGTCGCATTTTGTGGTTCATGCACATTTTTAACTACGATATCATTAAGTGCAATTGCGACGAATGGGGCGATGAAGGTATGTTATAATATTTGGCAATACCATGGGAAAGAGATTGCCATTTCTTTGTGAAACAAGAAAAGCAGTGTGAGGCCAAGTGCCCAATATTCATCACCATAATATTTATTTTCGATAATTGGACAAGATGAGATGATGTATAGCATATCCACCAAGAACCACCATATAAATTAACCTTTCCACCTTGCTCAACTACAAATGGACTGACTCATCTTTCTTTTTGACCCTCAGGGTGGTGGCCCTTACTATCTCATTGGCAGGGCACTTGGTCCGGAAGTTGGAGTTAGTATTGGATTGTGTTTCTTCCTTGGGAATGCAGTTGCCGGAGCTATGTAAGTCTCCATTACAATGTGCCAACAGTCTGATGGTGAACTTCCGAAGAGTCATTTTTTTTTTCATGTTTCCTTTTGGTCAAAGTTATCTTGGTATTGTAATCTAGTATGGTGACACTGTTTGGAATATGGTACAGGAATTCTATTTCTTGCTATTTAATTATATGGTGTTTAGTGAAACATATTTTGTGGTATGGTAGAAGTGGTGGATTATTAGTGTCGTACCACCTTTTGATATTAGGCAATATTGCAGTTTGGTGTGAAACTTGTATGTTGATATTGTTCTTTAGAGAACTGCATTGGTGATACAAGCCCAATTAAGGATGAAAAGAGGGAAATAAACATACAATATTATGGAATGTGGGAAGTGGCTCTTGTTTCATATGCAACTGTGCTTAATGAGATTTTACACTACATTTTCCTGCATCCTTACTTTTTGTTGTGTGTGACGAGCATTTACACACGCTTCACTATTTCTCATTCACTCTCCACGGGATGCATTTTGACCTATTATGTTGTTATAAACCACTATTTTTAGGTATGTGCTGGGAGCTGTCGAAACCTTTTTGGATGCTGTTCCTTCTGCTGAATTTTTTCAAGGTACTTTGTTTGAGAACTGCACTTGCTGCTAGTTTGTTTCTGAACACCAAAATAATAGATCAATAAATTTGCACATTGTTTAGGTCTTTAGGAAACACAGTAGATCCAGATATTTTATGTTGATTGCTGCAAGCCATTCAAGGAACAAAAAACATGTAGCCAGAATTTATGTTTCCAAGCACATGGAAACCATGAGTATATGTTTTCAATGTATACCAAATTTGAATTGCACTTGCACAGATTGATTGGCTGATGATATATTCTAAATGTATTCAATATCTTGAAATTTTTCATGTCTGTAGAATACCCTCTCCTATATTATAAAACTTTAATATTTTTTTAGAGCTTACACACTTGCTTTCCATGGATTTTACACTTAGTTTAGTTTTCACTTGAAATTTATGTTGTTTATCTAGTTAATCAGGTCTTTACCAGTGAAGAGAAAATTTACATTGGATTATATGATTACTCTATCCTTTTTTATTAACTTAATTACAATAAAATGGACTAAGTTGCATAATCTGGCTTATTTCTAGAAATTTCATGGTACAACTGTGCGGAAATTGTGCTCGAGAAAAAAAATGTGTGTAAATTAGATTTTTTTTCATGCCATGGATGATTTTTTCTTTTTTGCAAAATTTAGAATGAAATACAAGCTTGCCTAAAGGCTAATTGGGAGATAGTTTCTTCTAGCAGTACAGACTGAATAATATAGATATTATTGTGGTACATAGGCAACTTCTTCCTTTGGAGTGTTAAGTTAAAATATATTTCTCTCTTTTGTGATGCATATATATGATTTCCGTTTACTGAAATTTAATGTTCATTTCATTTTATTTGAATTAACTTGTAGCGATTTTAAAAAGCAGAGAGTGTAACAGTGGTCACCAATACGTTCGTAAACGGTACCGCAGCAGGCAATGCAACAACTATCTCAACACCCAACTTGCATGACCTCCAGGTCTACGGCATCATCGTGACCATATTGCTTTGTTTTATTGTATTTGGTGGCGTCAAAATTATCAACAAAGTTGCACCTGCTTTCTTAATACCAGTGCTCTTCTCAATCCTGTGCATTTACATCGGTGTCTTTATTGCACCAAGGCCAAATGCTTCAAGTAAATATCCACTTGCCAATAATTCTTTCATAGTTTTCTCTTTTGTTTTTCTTGTGTTGTATTTCTGATGATGTTTTTCCTACCTAGAGTGGATAACTGGTTTGAGTATAACTACATTGAAAGACAACTGGAGTTCAGACTACCAACGAACAAACAATGCTGGAGTTCCTGATCCAAATGGGTCTATATATTGGGATTTTAAGTCTGTCCTCCTTTTGTTGTTGATACTTGTTTTTAAGATCCTCTAATTACTTGCAATTTTCATTTATCGATTTTGTAGATTCAGTATGCACTTGCTAACATTCTTTGTTTTGTTCTTTCAGTGCTTTGTTAGGTCTCTACTTCCCAGCAGTTACAGGAATCATGGCTGGTTCAAATCGGTCTGCTTCACTGAAAGACACACAACGTTCAATACCAATTGGAACATTACATGCTACCATTTCAACTACTATGATGTATCTACTATCTGTGTTTCTGTTCGGAGCATTGTCTACAAGAGAGGGGCTTCTGACTGACAGGTTTGATTTTCTTTGGCAGCACATCATCAAACTTATTGCTTAATCAGTACCGAGTTCTGAAAAAACTAGTTGTTGACTTTATGTTGTCATGGTAATGGAGTTCAGATCTTCCATGGATCAATTTATGTAGACATGTTTGTGTCTAGGATCTTTTGGTAAAATATTGCACTATTTGCATACAAGTAAATGTACTTGCCTTTGATCCAATGTGATTGTATGCATGCAATTGTTTATCTTGGAGTTTTTCTTAATTTAGACTTGTAGAATAATGCATTTAATTTCTAATTTTTTGATATCA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