BGIOSGA001785

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001785

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001785, complete gene.

LocusTag

OsI_01632

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001785-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001785-PA

Length

12181

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:13306552..13318732

Sequence Coding Region

13318628..13318732,13317044..13317323,13316527..13316630,13316191..13316370,13315355..13315573
,13314706..13314771,13313928..13314041,13313637..13313804,13312704..13312879
,13312005..13312071,13311700..13311846,13310867..13310945,13310401..13310528
,13310210..13310257,13309943..13310038,13309785..13309853,13309413..13309514
,13308175..13308426,13308000..13308067,13307749..13307866,13307079..13307318
,13306552..13306662

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:13306552..13318732 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:13306552..13318732 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGAGCCCGAGGTCTCCGCGCTCTCCGACGCCGACCTCCGCGCCCGCACCGCCAAGCTGCAGGAGCGCGCGCGCGCCGGGGAGTCCCTCGATTCCCTCCTGCCCGAAGCATTTGCAGTTGTGAGGGAAGCTTCCAAGAGAGTTTTGGGCCTTCGTCCCTTTGATGTACAATTGATTGGTGGAATGGTTCTGCACAAGGGGGAGATTGCAGAAATGAAAACAGGAGAAGGGAAGACCCTTGTGGCCATTTTACCAGCTTACTTAAATGCTTTGAGTGGAAAAGGGGTGCATGTTGTAACTGTAAATGATTATCTTGCAAGACGTGATTGCGAATGGGTTGGTCAGGTTCCCCGATTTCTAGGACTGCAGGTTGGCCTAATTCAACAAAACATGACACCTGAGCAAAGGAGGGAGAATTACTTGTGTGATATTACTTATGTTACAAACAGTGAGCTTGGTTTCGATTATCTAAGAGATAACCTTGCAATGACTGTTGATGAGCTTGTCCTGAGGAACTTTAACTATTGTGTGATAGATGAAGTTGATTCCATTCTCATTGATGAAGCAAGAACACCTCTTATAATATCAGGCCTTGCTGAAAAGCCAAGTGATCGGTATTACAAAGCAGCAAAAATAGCTGAAGTTTTTGAAAGAGATATTCATTACACTGTTGATGAAAAGCAGAGAAATGTTTTACTTACAGAAGAAGGCTATGCGGACGCTGAAGAAATACTGGACATAAATGATCTATACGATCCTCGTGAACAATGGGCTTCATATGTTCTGAATGCAATCAAAGCTAAGGAACTCTTCCTTAGAGATGTGAATTACATTGTCCGTAGCAAGGAAGTGCTTATTGTGGATGAGTTCACAGGTCGAGTAATGCCAATGTTACCTTTTGGCAGGGCAGAAGATGGAGTGATGGTCTTCACCAAGCAATTGAAGCTAAAGAAGTTTCCGAAACTATGTGGCATGACTGGAACTGCTGCTACGGAAAGCCAAGAGTTCGAAAGCATATACAAACTAAAAGTTACCGTTGTTCCAACAAACAAGCCAATGATACGAAAGGATGAATCGGATGTTGTTTTTAGAGCAACAAATGGAAAATGGCGTGCTGCTGTCGTGGAGATATCAAGAATGAACAAAGTTGGTCGCCCTGTGCTTGTTGGTACAACTAGTGTTGAACAAAGTGAAACCTTATCAGAACAATTGCATGAAGCAGGGATTCCTCATGAGGTCCTCAATGCTAAACCAGAGAATGTAGAGAGGGAGGCAGAAATTGTAGCTCAGAGTGGACGCCTTGGTGCAGTGACAATTGCCACCAATATGGCGGGACGTGGTACTGATATTATTCTTGGAGGAAATGCAGAATTCATGGCAAGGTTGAAGCTGCGTGAGATGCTTATGCCAAGAGTTGTTGATCCATTGGATGGTGTCATTATATCTAAAAAGCAGGCCTCACCTAAGAAGACATGGAAGACAAATGAAAGTTTGTTCCCATGTGAACTTTCAAAAGACGCACTATCATATGTTAAAGAGTCTGTTGAAGTGGCTGTCAAAGCCTGGGGAGAAAAATCATTGACCGAGCTAGAAGCTGAAGAGCGGCTCTCCTACTCATGTGAGAAGGGAAGATCTATACTTATAGTGGAATTTGGAGATATACTTCCAAAGGTTGCTGTAATTGCGAACAAGGGATTGACTAACTGTATAATAGGTTGCCTATCCACCCAAGAACAGTGGCTCGACGCATGCATTATTGTTGGTCAGGGCCCTGTTGGTAGTAAGCAGCCTGCTCTCCTCCAGACTCCAGTGGCATTACGCTTCTTGAGGACGGCATTGGGCTACCAGTGCACTGCACCTTGTGGGATTGAGTTTGGTGGAGGACCAACTCGTGATGAAGTAATTGCAAATCTGAGAAGTGCATTCATGAAGATAATGGATGAATATAAGGTTTACACAGAGGAGGAAAAGAAGCAGGTCATTTCAGCAGGTGGACTTCATGTAGTAGGAACAGAACGTCATGAATCTCGCAGAATTGATAATCAGCTCCGTGGTCGAAGTGGCAGGCAAGGGGATCCTGGGAGCTCTCGGTTCTTTCTTAGTCTTGAGGATAATATATTCCGAATTTTTGGAGGTGACAGGATACAGGGTTTGATGCAAGCCTTCAGAGTCGAAGATCTTCCTATTGAGTCGAAGATGCTGACAAGGGCTCTAGATGAAGCTCAACGGAAAGTTGAGAACTATTTCTTCGATATCAGGAAGCAATTATTTGAGTATGATGAGGTATTGAATAGCCAAAGAGATCGAGTATATGCAGAAAGAAGACGCGCTCTTGCGTCTGATAGTCTTGAATCACTTATTGTGGAATATGCTGAATTAACAATGGATGACATTTTAGAGGCAAACATTGGCCCTGATACCCCGAGAGAAGATTGGGATCTTAGCAAACTGATAGCTAAACTTCAACAGTATTGCTATCTATTAGATGATTTGACACCAGAATTGTTGGAGGGCAAATCGTCAAGCTATGAGGATTTGCAAGAGTACCTTCGTACCCGAGGACGTGAAGCATACTACCAAAAAGCTGAGATTGTGGAGAAACAAGCTCCAGGCTTGATGAAAGAAGCTGAGAGGTTCCTTATTCTAAGCAACATTGATAGGCTCTGGAAGGAACACTTGCAGGCATTGAAGTTTGTGCAACAGGCTGTTGGTTTGAGGGGTTACGCCCAACGAGATCCTCTTATTGAATATAAACTGGAGGGATATAATCTTTTCTTGGATATGATGGCTCAAATTCGACGGAATGTAATTTACTCTGTTTATCAGTTCAAGCCAGTGATGAAGAACCAAGAAGAGGAGAAATCTGAAAAGAAGGGGACAAAGAAGAAAGTCGACAAGGGTGCTAACAAACTTGGTGCTGCCCAAGCTGCATCTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MEPEVSALSDADLRARTAKLQERARAGESLDSLLPEAFAVVREASKRVLGLRPFDVQLIGGMVLHKGEIAEMKTGEGKTLVAILPAYLNALSGKGVHVVTVNDYLARRDCEWVGQVPRFLGLQVGLIQQNMTPEQRRENYLCDITYVTNSELGFDYLRDNLAMTVDELVLRNFNYCVIDEVDSILIDEARTPLIISGLAEKPSDRYYKAAKIAEVFERDIHYTVDEKQRNVLLTEEGYADAEEILDINDLYDPREQWASYVLNAIKAKELFLRDVNYIVRSKEVLIVDEFTGRVMPMLPFGRAEDGVMVFTKQLKLKKFPKLCGMTGTAATESQEFESIYKLKVTVVPTNKPMIRKDESDVVFRATNGKWRAAVVEISRMNKVGRPVLVGTTSVEQSETLSEQLHEAGIPHEVLNAKPENVEREAEIVAQSGRLGAVTIATNMAGRGTDIILGGNAEFMARLKLREMLMPRVVDPLDGVIISKKQASPKKTWKTNESLFPCELSKDALSYVKESVEVAVKAWGEKSLTELEAEERLSYSCEKGRSILIVEFGDILPKVAVIANKGLTNCIIGCLSTQEQWLDACIIVGQGPVGSKQPALLQTPVALRFLRTALGYQCTAPCGIEFGGGPTRDEVIANLRSAFMKIMDEYKVYTEEEKKQVISAGGLHVVGTERHESRRIDNQLRGRSGRQGDPGSSRFFLSLEDNIFRIFGGDRIQGLMQAFRVEDLPIESKMLTRALDEAQRKVENYFFDIRKQLFEYDEVLNSQRDRVYAERRRALASDSLESLIVEYAELTMDDILEANIGPDTPREDWDLSKLIAKLQQYCYLLDDLTPELLEGKSSSYEDLQEYLRTRGREAYYQKAEIVEKQAPGLMKEAERFLILSNIDRLWKEHLQALKFVQQAVGLRGYAQRDPLIEYKLEGYNLFLDMMAQIRRNVIYSVYQFKPVMKNQEEEKSEKKGTKKKVDKGANKLGAAQAAS</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..105#1410..1689#2103..2206#2363..2542#3160..3378#3962..4027#4692..4805#4929..5096#5854..6029#6662..6728#6887..7033#7788..7866#8205..8332#8476..8523#8695..8790#8880..8948#9219..9320#10307..10558#10666..10733#10867..10984#11415..11654#12071..12181#ATGGAGCCCGAGGTCTCCGCGCTCTCCGACGCCGACCTCCGCGCCCGCACCGCCAAGCTGCAGGAGCGCGCGCGCGCCGGGGAGTCCCTCGATTCCCTCCTGCCCGTGAGTACACGGCACGATCTCTCCCCCGCTACATTTCCAGCTGCGGTTTCGAGATTTCAGTCAATGTTAACTGTAGATTTTGTGGTTCTAGAAATACCAGCATGCTGCAATGCTAGCTGTTGTGGCTCCAGACAAACTAGTTGGGACTTGGGAGTAGATGATCTCTGAACATCCAGTAACAATAGGAACAAAGGTGGCCGTGAAGTTCAACGCCTAGAATCTAGATGATCAGTAACTAAATGTGTATAGTATGAGTAATACAGCGCTCCTTTTGCAACTCTTCTTGGAGAAGGATAAGAAGCAGGAGACGAGGAGACAGATAAAACCTATGGACATAGAATGAGGCCAGTGATTTCTACAAAGAAAAAAAAACAAGTGTTCAATTAATAAAAAAATCATATGTTGTTTAAGACTTCAAGGCTGTGTTTGTTTGTGCCGGTTGGGAACCTTCTCCCCCGCCACGGAAAACTGAGCAGTTCATTAGCGCATAACTAATTAAGTATTAGTTAAAAAAACTTAAAAAATGGATTAATTTGATGTTTTAAAACAATTTTTTATAGAATTTGTTTTGCAAAAAACACACCGTTTAGCAGTTTGAAAAACGTGCACACAGAAAACGAGAGAGTTGGGAACTCTAAGAAACGAACTCAGTCTAAGGACAATACTAAGCAATATCACTTGAACAATTTGCATGTTTTATGCAAATGCTGATATGCCAACTAACAGCAGCTAAGTTGTTGCTGCTGTAAGATGAAATGTGATTCATGTTCAATGTTCATTTCTATTGATTTTCTTTTGAGTGACAAACATATATTTGTACAAAATGTTATGTTCACATTTATTCTCTGCCATCAGATTATGCAATGACTCGGACTAGGGCGTAGTACATCAAGTTGAACATAAAAAGATGACCTAAACTTAAAATATTTGAAATTTGTGCATGAAAAAAAAATTCATATTGCATTAAGAAAGGAAAAACGACATCCTTGAGGTGGCTTTCCATAGAAAAAGTAACAATGATGTGGCAACCCAAATGGCAATAACAATCACCTTGAGTTTTGATGCTTGTCAGCAAAACTACCCTCTAAAACTTACTGAATGTGTAAATTGACCCTTTCTGGAAGTTTAGGGTGTTAAATAACTACCTTTTCAAGGCAGGACGTTAAATGGACTTATGTTTCAAAGTTCAGTGGTGTGAAATGTACTTATTCCGATTTTTTAATACTGTAGAAAAGCTAAATCTGTTACATATTTAGATTAGTCAACCTTAAGTTTGTTTTTTATTGCTTTGCTGGCTATTGCAGGAAGCATTTGCAGTTGTGAGGGAAGCTTCCAAGAGAGTTTTGGGCCTTCGTCCCTTTGATGTACAATTGATTGGTGGAATGGTTCTGCACAAGGGGGAGATTGCAGAAATGAAAACAGGAGAAGGGAAGACCCTTGTGGCCATTTTACCAGCTTACTTAAATGCTTTGAGTGGAAAAGGGGTGCATGTTGTAACTGTAAATGATTATCTTGCAAGACGTGATTGCGAATGGGTTGGTCAGGTTCCCCGATTTCTAGGACTGCAGGTTGGCCTAATTCAACGTATGTCATCAAATCGTTTTGTTCATTGTTGTTTTTTGTGCCATCTCCTAATTAAAAATTTTGTTCAATGTCCGGCTCAAAACTTCAAATATGATTAAGTATACTGCCCTGCCTGAGTACTAGTGTACGGAATTTTCCTGGAAGATATTAGTACTGACATATATTTTGAATAAATTGAATTATGGAAGCCCAGGGGACCTGATTTTTCATCCACAGAAGCTTGACAACTAATAAGGACGTTTAACTTGGCCTACTGTCAAAGCAAATTAGCTTGTATCAGGCACTACTAAACTATAGCTTCACAGGGCTGACTTGCGACCTCTCTTTAGATTTTGTGTTTCATTGGTTTCATTATTGGCTATTCTCTGCTTTCTTGTGATGGTTTGTTGAACCTTTACTCTTTATTTTGACAGAAAACATGACACCTGAGCAAAGGAGGGAGAATTACTTGTGTGATATTACTTATGTTACAAACAGTGAGCTTGGTTTCGATTATCTAAGAGATAACCTTGCAATGGTATGCTGTTTCCTTTGATAGTTATTTGTTAATGCCTGATTGGGCACATTCGTCTTTTAAGTGTCATAATCACATTTCCCTCTCCCTGTCCATAGGTGGAGTGCAGTGATAACAGATTCACAGATTCTGCTAACTGATTCTTCATTTTTTTTGCAGACTGTTGATGAGCTTGTCCTGAGGAACTTTAACTATTGTGTGATAGATGAAGTTGATTCCATTCTCATTGATGAAGCAAGAACACCTCTTATAATATCAGGCCTTGCTGAAAAGCCAAGTGATCGGTATTACAAAGCAGCAAAAATAGCTGAAGTTTTTGAAAGAGATATTCATTACACTGTGAGCAATGAACTATTTTTGTTCCTGTGTAATCATCTTTTGATCATGTAACATCATTTTAGACTATGTCATATAGCATATTTTCTATACTGACAAAGGCCCGTGCGATGCAATGGATATTATAAGAGATAAAAAGCAAAGCAAAAATTACATGTTTATAGCATAGTTAGTTGATTAGGCATATAATTTTATCTCCAAAGACAACCATACTGAAATATGCTGCTAGACCACCTCTTTTTTATCCTCTTCGTCTATTTCCATAAGCCATACGGTCGGTTAATACGAGATTGACGCTTATAATTCATCTATGGGTGGAAGGCGAATTTGAATGTTTTGTATGTAACCCCTTACAATTTCTAGAATCAGCAATTCTAGGGCCATTCACATATTGTGGGGACCTTATGCTTGTCGCCCCACATGTCAGTTTGTGGTGTTGAAGGCGGACTCAGACACCACCACTAGCATTATTTAAAGTAGTACAGAGTATAGATGCTTGTATCGTGATATTATATTGCTCATACAGTATGATTACTCCTAGGCACATTGTGCTTATTCATAATTTTGTCTGCTTTATTAGCTATAATGCTAATTGTGATCTTATAAATGATTTCCTTCAGGTTGATGAAAAGCAGAGAAATGTTTTACTTACAGAAGAAGGCTATGCGGACGCTGAAGAAATACTGGACATAAATGATCTATACGATCCTCGTGAACAATGGGCTTCATATGTTCTGAATGCAATCAAAGCTAAGGAACTCTTCCTTAGAGATGTGAATTACATTGTCCGTAGCAAGGAAGTGCTTATTGTGGATGAGTTCACAGGTCGAGTAATGCCAGTAAGTGTTGTATCATTGTTATCAAAATTGTGAAACATTAACTCATCCACAAAGCTGAAAAATTAATTAGTTCTGTTGCCTCCTGACTAGTACATGCATGCTCTACTTCTAATTCTCAACAACTATTTGACATAGAAAATTACTCCCTCCATTATGTGATGAACTCATTGTCATGGAATTTGTGGTTTCAAAATACAAGTTCAGTGAGGGATTAGACTAATCTGTAGCTATTGGATAATTTTACTCCATATTCTGTCCTTTAATGTTGTTAAAGTTGTAGTTCGAGTATGCTATTTAATAGTGGCATATGTGGTCTAAATCATTAACGTACTGGTTGATCTACATGGTTGTGCGTGTGGGTCCACACCATTTGTGCAAAACATTCTATTTTAAAAGCTTGGTTGTGTTTGGGAGTTGGATCAGAATTTAGTTTAAATTCGATCTAAGTACCAGCCTAGTTATCTTCCTCCAAATTCGTGAGTATTTGATGCTAAATTTTTTGTTTGCATCATTCTTCATTATTTCTGCAGTCATGGTTATCTTTTTGTTCAATATCTATCTTAGTTTAGTTTTCACTTTTCAGATGTTACCTTTTGGCAGGGCAGAAGATGGAGTGATGGTCTTCACCAAGCAATTGAAGCTAAAGAAGGTGTACCTATACAAAATGAAACAATTACCCTTGCGTCAATAAGTTATCAGAACTTCTTTCTACAGGCAAGTGACAATTTTTTTCCAATGCTGGAAAGCTACTCACACATGATTGTATGATATGTAAAATGGCAAGCATCCATTGATCATACCCATTGTTACTAGCAGAATACTTGTGGAAGAACATACATAATGTGCAAATGAACAACAATCCACAGATTGCCATGCCATACTTGAACAAATGATCTAATTATCCACCCTTAAAAGATCATGCCAACTCTAGGGGTTGTGGTGGGATGGCAGACTCAACCACCACCACAGTTAAGTTCTTTGATATAGTTGAGATACAAGGTGAACTGAGATAGCTCCTCCATCTGTCCTGAAAAGACTTGATTTCTAGCCATTCCAAGAAAGTGTAGTAGTGAGGGGAAAAGATTATAGTGCCCCTCATTAATGGGTATTGAAGGGATAAAACTGCTTGATTTGTGGACTGAGGGTACTTAACTCTTCTGGGACAAATTTTGAGTGCTAGACATCATGTCTTTTTGGAGCGAAGGGAGTACTAACCATTGTTTAGCATTTTGTTTCTTAATGGTAAATCTCCCCTTTATTTTCAATATTTTCTGTTTGTTGTTTTCTAAGGGAACTGATTCATTCTGTGGCAGTTTCCGAAACTATGTGGCATGACTGGAACTGCTGCTACGGAAAGCCA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA001785