BGIOSGA003392
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA003392 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA003392, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_01665 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA003392-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA003392-PA |
| Length |
12233 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:13608051..13620283 |
| Sequence Coding Region |
13608051..13608168,13608258..13608352,13614517..13614624,13614737..13614977,13617684..13617727 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:13608051..13620283 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:13608051..13620283 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACGCTTGCTCTCTGCATCCTCACCCTGCTCCAGCTTAGCGGCGGCGTCGCGGCCATCTCCGGCGGCACCAACGACGGCTCCGAGCGCTGGGGATACGTCCAAGTCCGGCCGAAGGCGCACCTGTTCTGGTGGTACTACAGGAGCCCGCATCGTGTGTCGTCGCCGGGGAAGCCATGGCCGACCATCCTCTGGCTTCAGGGCGGCCCGGGAGGATCTGGCGTTGGGCGCGGCAACTTCTTGGAGATTGGGCCGTTGGACGTCGACCTGAAGCCGCGCAACACGTCATGGCTGAAGAAGGCCGATCTCATATTCGTGGATCATCCTGTGGGCGTCGGCTACAGCTACGCGGACGACCCGAGCGCGCTGGCGACGACGGACTTGCAGGCGGCCACGGACGCCGCCGAGCTCATCAGGGCTCTACCCGGCGAGATACCCGCCCTGAAGCGTAGCCCGCTGTACCTCGTCGGGGAGTCCTACGGCGGCAAGCTCGCTGCCATCATTGGCGTCTCCCTCACCAAGTCCATCCATGCCGGCGACCTCGACCTCACGCTCGGAGGTGTTGTTATCGGGGATGGGTGGATCTCGCCGGCGGATTTCTCGCTCACGTACGCACGGCTTCTGGACGACGTGTCGAGGCTCGACGAAAACGCCATCGACGATGCCAACAAGTTGGCAGAGAAGGTGAGCGAGCAATCCGCGGCAGGGCAGTTCGCCGCCTCACTGCAGACGTTAACGGGCCTTCTCGATCTGATCGACAAAAGTAGTGGCGGCGTTAATATTTTCAATTTCTTGTTTAACACCAGCGGCGTAGATCTGCGAGTGCTAGCTGCAGAGGACAAACAAAAAGAAGTCCGTGGATCGCCGTTGATGAGGTTCGTCGGGCAGGACTTGTCGGGGTCGTCTGGCCCCAACACGATCGAGGGCATCATGAACGGTGTCATCAAGGAAAAGCTCAAGATCATCCCGAACAACCTCGTGTGGCAATTGGCGACGATCGCTGTTTTCAACGCGCTGGAGAACGAATTCATGAAGCCAGCAATAAACGAGGTAGATGAGCTATTATCTCTGGGTGTCAACGTCACAGTGTACAATGGGCAACGCTATACGCACACTATTGAGCAGTGCGAGCTGCTTATCTGTGCCATGGGTTTGGTTGGATGGAATGGACTAAATGACTTCTTTAGAGTGCTTAGAGAACCCATGCACTATTTCTGCTATCCCGGTCACGATAGCACTGCCTTCAGGAGGATATACAAGAACCTGCAGTACTATTGGATCCTTGAAGCTGGACATGTGGTGCCTGCTGACCAGCCTTGCGTTGCATTAAACATGATAGGCAACATCCTACAATCCGAAGATGTTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATLALCILTLLQLSGGVAAISGGTNDGSERWGYVQVRPKAHLFWWYYRSPHRVSSPGKPWPTILWLQGGPGGSGVGRGNFLEIGPLDVDLKPRNTSWLKKADLIFVDHPVGVGYSYADDPSALATTDLQAATDAAELIRALPGEIPALKRSPLYLVGESYGGKLAAIIGVSLTKSIHAGDLDLTLGGVVIGDGWISPADFSLTYARLLDDVSRLDENAIDDANKLAEKVSEQSAAGQFAASLQTLTGLLDLIDKSSGGVNIFNFLFNTSGVDLRVLAAEDKQKEVRGSPLMRFVGQDLSGSSGPNTIEGIMNGVIKEKLKIIPNNLVWQLATIAVFNALENEFMKPAINEVDELLSLGVNVTVYNGQRYTHTIEQCELLICAMGLVGWNGLNDFFRVLREPMHYFCYPGHDSTAFRRIYKNLQYYWILEAGHVVPADQPCVALNMIGNILQSEDV</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..118#208..302#6467..6574#6687..6927#9634..9677#9811..9878#9985..10090#10251..10453#10553..10622#10720..10770#11015..11073#11947..12085#12165..12233#ATGGCGACGCTTGCTCTCTGCATCCTCACCCTGCTCCAGCTTAGCGGCGGCGTCGCGGCCATCTCCGGCGGCACCAACGACGGCTCCGAGCGCTGGGGATACGTCCAAGTCCGGCCGAGTACGCGACCGCGACCGGTTTCTTCCATTCGTAAACCGTCGCGTTCCTAGCTCTCTCACTCTCTCCTGACTCCTCTATTGCGTTTGCAGAGGCGCACCTGTTCTGGTGGTACTACAGGAGCCCGCATCGTGTGTCGTCGCCGGGGAAGCCATGGCCGACCATCCTCTGGCTTCAGGGCGGCCCGGTACGTACTGCTTCTTAGCTCTAGCTAAGCAGCTAGCTATAGTAGCCATATGTTAAGGGGACTGTCTATCCATTTATCGGGTGATTTCTAACCAAAAATCACCCAGATTTTTTCTACTCTTAGATTTACATCCAACGGACTATGAAAGAATATAACAAATACATATTTACTTACACATTATTTTTATCAAAATTACAGTGCACTTACATGCCTTATCAACTAAATTTACAAATGTAATTTTAGTTATATAGGACTGTAATTTTATATTTTAAAGAAAATAACAAATATATATTTACTTACATATTATTTTTATCAAAATTACAGTGCACTTACATGCTATATCAACTCAATTTACAAATGTAATTTTAGTTATATATGACTGTAACTTTATATTTCACGATGACGACGACGACGAGAGTGGCCGTACTGCCGGCGGCCAGCTCAATCAGAGGCCACCTTGGCACTGTGCTTCTCCATCATCACGCGCGCAGAGGGTAGCTAGGTAACACAGGCCGACGTGCCAGCCGGCCGGTGAGCTGCATGGAACGTCGACCTTGCAAATTGCCGCTCGCATCGCAAGCTGCGTGGAGGCCAAAAAAGTGTCAAATGCCAGAAAAAAAATCACGCGGGAGATGGATAGCGAAATCGTATGTTAAGAACTTGCCGGAGGAAGACAAGGCGCTGACACCTGGAGGCCCAAGCGAAGACAAGGTGCTTACGGCTGAACCAAGTTTGAAGCCCACTCGTACTAAGAAAGTGAATCCTCGTTACCATGGGCCCATGTGGGCTGTGTAATTCGCTTTCTTGCTAGAGAGGAAAGAACCATTTGTGAGAGAGGAAGAAACTCCTTAAGAAGGAAGAACTGTAATAAGATTATGAACTATGAAATGAATTAGGCGGCGGCTTGGCGGCGGAGGCGATCGATTCGGTTGGATCTAGTCGGAAGAAATATTATCGTGAGTGTGCTTGGTAGAATAGGAGGAGTGCTAACAAAAGTGGTATCAGAGCCACTCATCCCTTGAAGAGTTCTTGGTCTGGCTGTAATTCTGGAGGGGATTGGATTCATCTCGTTTGAGTTGAGATCCGCGAAAAGGAAACTTGCCTCTCTAGGTCAGCTGGATTCGGAACCAAGGGGTGAGACGAGTTGCCATGCTGGAGAAGCCGAGGTATCAAACCAAGCAAGCGCTGAAGATCATGGAGAACGAGGCAAAGCTGGATCTGATCTTGAGGAAGGTGATGGAGATGGAGTAGAAGGTGGTGGATCTGGAGAAGAATTCGCGTTCGGATCTGACTTCACTCAAGACCGCGCTGGATTCATGGAAGCCGCACATGGAGAAGCGGGTGGATGATCTGAACACCGCGGTGACCAATCTCAAGGCACAGGTCGAATTGCTACAAGCGATTCCCAAGGAGGAGCAGAGCCTTGATCTTATCGGCCAATTTGGTGCCCGCGATTCCAGTACTGCACGGGTGGAGATGTTTGGAGGCCAACCTCCTTCATCTTCCCCGGCCAATGGTACGAATCCCTCCCCGTCTTCCTCCCCTGCTCCATACTTTCATGATGCTTCCATGAGAAACGCTTTGATGGGCAATTCTACAGCTGTTAATGGTAGTTTACCGCCTATGCCATGCCCTCAATTTGATGGGGATTACCCTCAAATGTGGAGGGAGAATTGCGAAGCCTATTTTGATACATATGGAATTCTTGCAACCCAATGGGTTAGGTTAGCCACACTGAATTTCATAGGAAACGCATCTTTTTGGCTTCAGTCTGTTAGGTCCCAACTGATAGGAGTCACTTGGGAAGAGCTCTGTGATCGTGTGTCTGCTAAATTCACTAGGGATAGACACCAGTTGCTCATTAGGCAATATATACACATCAAACAGACTGGTAGTGTTCATGAATATGTTGAGAAGTTTGATAGCCTGATGCACCAAATGATAGCTTATGACCATGACCTAAAACCAGTTTACTTCATTACCAAGTTTGTAGAAGGTTTAAAAGATGTTATACGCACTGTCATTATGGTGCAACGACCCCAGGATTTGGATACTGCTTGTTCCTGGCTTTGTTACAGGAGGAAGCGATGGCCGGTACCAGACGGGCAGATTATACTCGTGTTGAAGTGCCAGCTATTTCTAGACCAAGCTTTAAGACTCCTATTGCAGTGCCACCAATACTGCAGACTAGCAAGCCTGCTATTTCTGAGGACAGGAAGAATGTTGAAACTGCTAAAAGTCCTGCTAGAGAAGATAGAATCTCAGCTCTGAGGGCTTACAGAAAATCTAAAGGACTCTGTTTCACTTGTGGGGAGAGATGGGGCAGAGATCATAAGTGTGCTCAAGTCATTCAGTTGCATGTCATGGAAGAGTTACTGGATGCCTTGCAGGAGGAAGAAGATCCCACGGGTGAAGAAATTGTGGCTGCAGCTGAAGGCTCTTTACTGGCTATCTCATATCAAGCTATTGCTGGAGTTGAGGCACCTAAATCTATCAGAGTGAGGGGCTGGGTCCAGGGAATTGAACTATTGATGTTGGTTGACTGTGGTAGCACCCACTCTTTCATTGATGAGCAAGTAGCAACTAAGTTACAAGGCATTCACACATTACCAATTCCCCTTAACATCAAAATTGCTGATGGTGGCTATATGCAGTGTAGGAGGGAGGTTCCTAATTGTGACTGGTGGATGCAGGGTTGTCAGTTTTGCACTAACTTCAAGGTCCTGCAGTTAGGGGGTTATGATGCAATACTGGGAATGGATTGGCTGGAAACCTTCAGTCCCATGCAAGTGGATTGGGTTCAAAAATGGCTCGAATTTCCTGTGGACAACAGACTGGTCAGAATTCAGGGCATTCTGTCAAAGGTGGATCAGTGTACATCAATATCCTCTATGCAGGTCCAGAGCCTCATCAAGTCTGGTTCAGTTATGCATCTGGTGCAGTTACAACAGGTTGCCAAGGCTGCTGATTCTCCTATACTTGTTTGTGTGCAGCAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATCCCCTACCAGTAATAGATGGAATTACTGGATGAGTTGGCAGGTGCTAAGTATTTCTCCAAGCTAGACCTTCGAGCTGGCTACCATCAAATCAGATTACACCCAGGAGAGGAACATAAGACAGCTTTTCAAACTCACTCTGGCCATTATGAGTACAGAGTGATGTCTTTTGGGTTAACAGGGGCACCAGCAACGTTTCAGAAGGCTATGAATGATACTCTAGCTACAGTTTTAAGGAAATTTGCCTTAGTCTTCTTTGATGATATACTGGTTTATAGCCCAACTCTAGAGACACATGTACAACACTTTACCCAGGTTTTACAATTGTTGTTGGATCATCAGTGGAAGGTCAAGTTAAGCAAATGCTCTTTTGCTCAACACCAATTGGCCTATCTGGGTTATGTCATTGGAAGGGATGGAGTTACCACTGATCCTGCCAAAATAGTTGATGTGGTTAATTGGAAGGTTCTAGTAAATGTTAAAAAGTTAAGAGGATTCTTAGGATTGGCTGGGTATTATAGAAAATTTGTGAGGAACTTTGGTGCTCTCAGCAAGCCTCTCACTCAATTATTAAGGAAGGGAGTTCCTTTCAAGTGGTCACCTGAAGCTGACAAGGCCTTTCTTACACTTAAGGAAACCTTGGTCAGTGCACCAGTCTTGGCCCTTCCAGATTTTTTCAAGACTTTTACAGTGGAGACAGATGCTTGTGATGTGGGCATAGGAGCAGTTCTGTCTCAAGATAAGCATCCCATAGCATTTGTTAGTAGAGCTCTGGGACCTAAAACTAAGGGATTATCTACCTATGAAAAAGAGTATTTAGCCATTATGTTGGCTGTTGATCAGTGGAGGTCTTATCTTCAACATGGCGAATTCATCATCTTGACTGATCATCATAGTCTTATGCATCTTTCAGAACAAAGATTGCATACTCCATGGCAACACAAGGCCTTCACCAAACTGTTAGGCTCACACTACAAGATTTGTTATCGGAAGGGAACCTCAAATGCGGCAGCAGATGCATTGTCTAGGAAAGAAGAAGAGGAAGAAGTCAGTCTTTTTGCACTCTCTGAATGTCAACCTGTTTGGCTGCAGTCAGTACTTCAGGGTTATAATGAGGATGCTTACTCTAAACAACTGATTACAGAATTGTCTATTGACCCTAGTGCTAAAGAACATTTCCAGCTGTTTCAAGGGCTTTTGAAATTTAAGGGAAGAATTTGGTTGGGACAGAACACTTCATTGCAACAGCAGGTCTTTTCTGCCTTGCATGCCAGTCCTATAGGGGGTCATTCCGGGTTTCCTGTTACCTACAGAAGGATTAAGAACCTGTTTGCATGGCCACAGATGAAGTCTTTAATTCGTCAATGGGTCAAGGAATGTGTCACTTGTCAACAAGCTAAACCAGATCGAGCTAAGTACCCCGGCCTTCTTCAACCTTTACCTGTTCCTGCAGGTGCTTGGCAAGTAGTTACTTTGGACTTCATTG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