BGIOSGA001567
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001567 |
|---|---|
| Description |
(Rice Genome Annotation Project) metal transporter |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001567, complete gene. |
| LocusTag |
P0507H06.36-1 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001567-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001567-PA |
| Length |
10293 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:19197353..19207645 |
| Sequence Coding Region |
19207451..19207645,19205851..19205929,19205554..19205594,19205369..19205447,19205185..19205289 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:19197353..19207645 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:19197353..19207645 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGAGGAGGGGGCGAAGATCGGGAGGGAGCACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGGGAGGGTGAACGGTAGCGGGAGGGTCGCGGCCGTCGGTGGCGGCAGCGGCGGTGGCGGGGACGAGATTGAGATTGAGGTCGCCGCAGCCGCAGGGGCTTCGCCGTCGCGGCAACACGGCGGTCTGCACGGCGATGTCCAGGCACCCACTTGGAAGAGATTTCTTGCACATGTTGGTCCTGGATTTGTTATCTCCATCGCATACCTTGATCCTAGTAACTTGCAGACTGATTTGGTAGCTGGATCCAGCCACAGATATTCGTTGCTATGGGTACTCCTATTTGGGTTCATATTTGTGTTGACTGTACAATCATTGGCAGCAAATTTGGGTATCATTACAGGAAGGCACCTCGCTGAGTTGTGCATGGGTGAATATCCAAAGTATGTCAAGTACTGCCTATGGTTACTAGCAGAGCTTGGTGTTATTGCTGCCACTATACCAGGAGTTTTAGGAACTGCTTTAGCCTACAACATGCTACTCCACATCCCTTTCTGGGCCGGTGTCCTAGCATGTGGGGCATGCACTTTCCTAATTCTCGGGTTACAAGGATATGGGGCTCGGAAAATGGAGTTCACTATATCAGTTCTTATGTTGGTGATGGCTACTTGCTTTTTTATGGAACTTGGCAAAGTTAATCCTCCTGCTGGTGGGGTAATTAAGGGGCTTTTTATCCCAAGGCCCAAAGGGGATTATTCTACTTCAGATGCGGTTGCTATGTTTGGTTCTCTTGTTGTTCCGCATAATCTCTTCCTACATTCTTCTTTGGTGCTAACGAGAAAAATGCCATATACTTCCAAAGGACGCAAGGATGCTTCTACATTCTTCTTGCTTGAGAATGCATTAGCTCTGTTCATTGCACTACTTGTAAATGTCGCTATTGTATCAATATCTGGTACTATATGTGCCAACAATCTCTCATTTGCCGACACAAGCACGTGCAGCAGTCTAACATTGAATTCAACTTATGTACTACTCAAGAATATTTTGGGAAAATCAAGTTCAACTGTGTATGGTGTGGCCTTATTAGTTTCTGGACAGAGCTGCATGGTGGCTACGAGTTATGCTGGCCAATACATCATGCAGGGCTTCTCCGGAATGAGAAAGTGCATCATATATCTTGTTGCTCCTTGTTTCACCTTATTACCTAGTTTGATAATTTGCAGCATTGGTGGTACTTTACGAGTGCATCGAATTATCAACATAGCTGCGATTGTACTATCATTTGTGCTGCCGTTTGCTCTAATTCCACTCATTAAATTCAGTAGCAGCTGCACAAATATAGGACCATACAAGAATGCAACATCTATTATCCGAATCGCGTGGATACTGTCATTGGTGATTATTGGAATCAATATTTATTTCTTCTGTACTAGCTTTGTCGCTTGGCTTGTTCATAGCGACCTTCCAAGGGTTGTTAATGCAATAATTAGCAGCCTTGTTTTCCCTTTCATGGCAGCCTATATTGCTGCTCTGATCTACTTGGCTTTCAGAAAAGTTAACCTTTCAGATCCATTCCCCACCAATTCAGTTTCTGGTGAGATTGAAGTTCAACACATACAAATACAAGAGAAGCAGGAAGATTTAGGTGTACATTTATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MEEGAKIGREHEQQQQQHGRVNGSGRVAAVGGGSGGGGDEIEIEVAAAAGASPSRQHGGLHGDVQAPTWKRFLAHVGPGFVISIAYLDPSNLQTDLVAGSSHRYSLLWVLLFGFIFVLTVQSLAANLGIITGRHLAELCMGEYPKYVKYCLWLLAELGVIAATIPGVLGTALAYNMLLHIPFWAGVLACGACTFLILGLQGYGARKMEFTISVLMLVMATCFFMELGKVNPPAGGVIKGLFIPRPKGDYSTSDAVAMFGSLVVPHNLFLHSSLVLTRKMPYTSKGRKDASTFFLLENALALFIALLVNVAIVSISGTICANNLSFADTSTCSSLTLNSTYVLLKNILGKSSSTVYGVALLVSGQSCMVATSYAGQYIMQGFSGMRKCIIYLVAPCFTLLPSLIICSIGGTLRVHRIINIAAIVLSFVLPFALIPLIKFSSSCTNIGPYKNATSIIRIAWILSLVIIGINIYFFCTSFVAWLVHSDLPRVVNAIISSLVFPFMAAYIAALIYLAFRKVNLSDPFPTNSVSGEIEVQHIQIQEKQEDLGVHL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..195#1717..1795#2052..2092#2199..2277#2357..2461#3408..3517#5934..6115#6434..6503#6942..7112#7392..7496#7812..7937#8122..8217#10000..10293#ATGGAGGAGGGGGCGAAGATCGGGAGGGAGCACGAGCAGCAGCAGCAGCAGCACGGGAGGGTGAACGGTAGCGGGAGGGTCGCGGCCGTCGGTGGCGGCAGCGGCGGTGGCGGGGACGAGATTGAGATTGAGGTCGCCGCAGCCGCAGGGGCTTCGCCGTCGCGGCAACACGGCGGTCTGCACGGCGATGTCCAGGTTAGTTTGTTCTTCTTCCTTTCTTCCTCCTCTGCTAGGCTGCCTGCTGTCAATTTCTTCTTCTCTCCTGCTGTCCGCACAAGTAGGAAGCAAACCATGTGTAGCACGATTGCCTCAGCCAATTCAGACATCTGAGGAATATCCGTTTGATTGATTTCTGAAATGAATATGTACGGTTGATGATCTCTATGTACTCTGCTTTGTAAAATTAGCACAGACTTTTCCTCAAACGGGGATAGAAACAGGCACTAATCAAAATTTCTGATAACAATGAGGACTTTTGGCTTTGCTAGAATATTTTGTATAGGAAATCTGTTGGCTCGACCGTAGATCGTATCATCTCTTCGTCTGGTTACAAAATAATAGACCCTTTTTGTGGTATATTACTTAGTTTTGCCATGGTTTGATTATTCTTCGAGTAGTTGGCAAGGATGTTTTCTTGCAATAATGATTATCAACCGACATCGGTTAGGCATGTTTCTCTTGGGCTTCAATTTAGGAGTAGGCCGTATTCCCCAAAAAAAAATTTAGGAGTAAGCCAATTCAACTCACTCGCGTATTGCCGAGTTGAGATTTTAGTGTCATTCCTTTCACGTTGGTGTAGCTGACTTTGTATTATGACTTATTCTACAATATGCTATCAACAAATGTTGTGTTCTACAAAATACCATCGACGAACATGAATTTCACAATATAATATCAGACAATGGCTTTTCTTTCCTTTTATACCGTCATTTGTCAGTGACATGTTCTTTTCTCTATTTAGTGCCGCAAAAGTACAGTTCACCCCTACTATACATGGGTTCAACAAAAATTGCGAGGGTGTCTCGGTCTTGCAAGTGGTAGAAAACAAGAGTAATCTTTGGTGTTCCGTAGGAGCTTTGGCACTTCAAAAGCTCCTCAGTGGGATGGCTAACCTAGGCAGTTAGCGCTCCTCGGTGTGGTCTTGGGTGCGTGGGTCTCGGTGGGAGGGCTCGGGTCCTCCTACTTTGTAAATATTTTCTACTTTGTTTTTTCTTCCCCTTAATGAAATGAAACACAATTCTCCTACGTTTTCGAGAAAAAAGAAAGAAAAGAAAAAAACCATTTTATTATCATGATCTTTCATAGAGTTAAACAATTATCGATCGTAAACTTCAAAACCATGAAGTATATACCCTTGAACTTGTATTTCATTCAGTTTTCAACTTTGGCCCAAATTTAGAGTTGCTTTGATTAACATGGCTCTAATGTGGCAATCTAGCTCAAGGATCAAACAATTCTTGAATTTTTAAAATTAGATGTCTTCCAAATTTTAGAAAAATATTTCACTTGTAGTTCTCTGATATATGCATTACCTACATAAAAGATTAACTGGTTAGGGAAAAACTAATGTTTAAAACAGTGTAAAACCATCTATTACAAGACAATTGAACTTTATTCCACCAGGGAAAAAATATTTAAGTTGTAAATACTGCAACATGCAACTTTTTTTTTCAGAACTTTTTGAGTCCATTTAGTAATTTATATCTGTGAGAGCAGGCACCCACTTGGAAGAGATTTCTTGCACATGTTGGTCCTGGATTTGTTATCTCCATCGCATACCTTGATCCTAGTAACTGTAAGTCCCCTTTGTCCTTCAATCTTCCTTGGACTAGAACTATGCCTGTCTCTGCTCACCAGTTTGTGTCCATCCATCCATGCATGGTGAGAAAAAGACATTTTTAAGTCATAAATGGCTTTGGTAAATTCAACAATAGGATCAAGGAACATGGATGGATACCACTAGAATTCCTAGGCAGGACATGCTCATATACCACCGTTTTCTTTTTCTAGTACTAATATATTGAACTACTTCACTTTGAAAATTGGAACAGTGCAGACTGATTTGGTAGCTGGATCCAGCCACAGATATTCGGTATAAAGCTCTCAAAATTTCTGTGGAATATTATGTTATACATTTTTGTCAATTGATTGTAGATTTGCCATCTCACTTCTCCTTCATTCATTTTTAAAATTTTCAGTTGCTATGGGTACTCCTATTTGGGTTCATATTTGTGTTGACTGTACAATCATTGGCAGCAAATTTGGGTATCATTACAGGTGAAACTAACTACCCATATTATCAAGCTGGTGACAAAAATACATGTTCTATGAAACTTACCATATAAATATATTGTAGGAAGGCACCTCGCTGAGTTGTGCATGGGTGAATATCCAAAGTATGTCAAGTACTGCCTATGGTTACTAGCAGAGCTTGGTGTTATTGCTGCCACTATACCAGGAGGTATGTATCAGTATTTGTTGTTTGTCTTTGCTTTCTATAAAAGTTGAAATACTATTTTTACTTGTTACTTGGAAAAATAGTATCCTCTTTTACAGCATATTTGTTGTCCATGTATAAACCATGGGGGTAATCCATAAATTAGGTTAATATTTTGAATGAACTTCCTTGTGCAGAGTTTGTTTTATTGAATTATAAATTTAATAGAGCTATTCAATAACTACGGCTGGTGGTTGAGCAATAGGTTGTAAGCGAACTGAAATTTTGTGTTTCATCAATATCTGTAGCATGTTGCTTTATGTTTGGTTTATTCCTCTTGGCATGGAAAACTTGTAAATGAGTGATCATGGCTTTGTCCATCTCTGGGTGCAGTGGCCGGGATAATAAAATATTCCATTATCTAAAATATTGATGATTATTGCATATAACTCTAATTATATTTTGAAGATAGAAACACCAATAGTGTGGTTTATGAGAATGTTACTCTCACGGTATAGGGTTTCCATGTGTTTATCTTGCTTTATTTCTTAATCAAATACTCCCACTGGTCACATAAATCAATTTGGACATGTGCTAAGTCAAACTTTCAAAACTTTAAATTGTCATATTTCTTTCTAAATAGATTTGTTGTGGAAAGTTCCTTATAGTATTATATTGCTGGTTTATAATAAATATATTGTATTAGAAATTACCATCTAATGTTGCACTATGGAGACCATGTCAATGTCCAAGATAACATGTTTATGTAACTGGTGGGAGTTATTTTCTTGTGTGCCAGTTAACTTATCTATCTTGATCACATTTTTTATAATCTATTTCTTGACATAGGCTTACAAGATCTGCACTATACACTACAGTTCTCCTTTATAAATCTTACAGAACTTTACAGTTTTATCTTCTGTATTTAAATTCTTCAAGGTTCATGGTGCTTTCTGTGGTCTTTGTGCAGTTTTAGGAACTGCTTTAGCCTACAACATGCTACTCCACATCCCTTTCTGGGCCGGTGTCCTAGCATGTGGGGCATGCACTTTCCTAATTCTCGGGTTACAAGGATATGGGGTAAGAATTTTTCTCTGCTTATAAAATAAAAAAGAGTAAATTACACTAGCGGTCCTTAAACTTGTAACGAGGTTTCACTTAGGTCCACGAACTTGCAAAACGAGCATCGAGATCTCTAAACTTGGTTTAATGTATCATCCTGGTCCAAAGCATCGTTTGACTGTGGTCTTGCCTACGTGGCATGCCATGTGGACGATGACATGGATTTTTTAAAAAAAATTTCTCCCTTCTGCCGCTGACAGGTACTGGCAGGGCCTCTCTTACCTCACTTTTCCCTCACTTTCGCCGGCGACCGAAGCGGCGACGGGCGGGGTGGCCGACGAGAAAGGAGCGGCGCGCGGGAGCCGGCCGGCGGGAGGAGAGGAGCGGCGCGTGTGCGCGGGCGCCGGCCGACGGGAGGAGAGGAGCGGTGTGCGTACACGGGCGGCGGCCGGAGAGGATAGGAGCAGCACGGGCACGCGGGGGGAGGTGTCGCCGACCACGCCCGGGGAGGGGTCGCCGACTGCGGCCGTGCGTGCCAGGGGGAGGTGTTGGCCATGGAGCGCACGAGCTCGGTGGCGGAGATGAAGCCATTGCCGCCGCCGGCCTACCCGCCCCCTAGCTAACCTCGCCGGCCGGCTGCCCCGCTTCGACCCGCCCGTCACCCGCTTCGATCGCCGGCCGCCCGTCCCACTCAGTGTTGTGGATGACGGAATACGGATGTCGGACGGAGAGGGTACCGCTAAACGATTAATCGGAGTACGGACGAATAATCGGAATTTGACGGAAATTTAATGTTTTGGACAAATATATGTACATAACTCATAAATCATAATAGCTTATTATTTTTGACAGATAAATGCATATAACTACATATATACCTACTATTCTTAAGTAAAAATAAGGATAACATGACATTAACTCGACATAAAAATATGGTAGATTGGATTTGAAAGAGGTTTAGATGAAAAGAACTAACCATAGACTTGCAGGTTGTAGCGGTAGGAATGAGCTGCGAGGATTTTGGGATTGCAAACGACGTTCTGTTAGCTATATAGTGCTAGGTTACATAACTAATGGGCCAGTATAGTTATCGTGGCCTGGCTGGGCTTGCCTTGTCACGTGATTAGGCCCGTTTATTCGGCCGATTAGTCGGATACGGCCGATTAGTCGCTAATGATGGTGATTATACATCCTGAAATGACTAATGTACACCGTTTTGCTAAAACGTGACGGAGAGGTCAGCGCCACCATTTTGATGTCCGAATATACAGCCGTACCAACCGTTATCCACAACACTGGTCTCACTTAATTGGCCGAAGAGAGAGGATAGAGAAGAGGGGAGAGTA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