BGIOSGA001540
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001540 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001540, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02161 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001540-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001540-PA |
| Length |
7415 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:20074686..20082100 |
| Sequence Coding Region |
20081723..20082100,20081128..20081299,20080884..20081037,20080275..20080338,20080016..20080123 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:20074686..20082100 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:20074686..20082100 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGTCGCCGTCTCCGTCATCGGAGGCGGCGGCGGCGCACCACCACCACCACCAACGGCGCCAGCATGCGGGCGCCGCGGGGGGGAGCGGGCTCGTGCCGCTCGCCGCGCTCATCAAGGAGGAGGCCCGCGCGGAGCGGCCGATGGGCAGCGGGAGCAGGATCTGCGCGCGCGACGAGGAGGACGGCGGCGGCGGCGCCGGCGCCGAGGGGGGGCGGCGGTGGCGGAGGCCGCTGCTGCGGTACGGGTGCGCGGCGCAGTCGAAGAAGGGGGAAGACTTCTTCCTCCTCAGGACCGACTGCGCCCGGCCCTCCACCTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCTTGGCGTCCTCGCCTCCCCACACCTTCGCCGTCTTCGCCGTTCTTGATGGCCATAATGGTAATGCCGCCGCAATATACACCAGGGACAATCTGCTCAATCATGTCCTTAGCGCAATGCCAAGAGGACTCTCCAGGGAGGAGTGGTTGCATGCGCTCCCCCGTGCGCTTGTCGCAGGGTTTGTTAAGACTGACAAAGAATTCCAACACAAAGGCCAAACATCTGGCACAACTGCCACATTCGTGATCATTGACGGATGGACTATCACCGTTGCTTCAGTTGGTGATTCCCGGTGTATTTTGGATGCTCAGGGTGGCGCTGTTTCTTTGCTTACTGTGGATCACAGACTAGAAGAAAATGTGGAGGAGAGGGAACGTGTCACTGCGAGTGGAGGTGAAGTTGGAAGGCTTAGTGTTGTTGGTGGGGCAGAGATTGGTCCACTGAGATGCTGGCCAGGAGGTTTATGTCTATCAAGATCCATTGGAGATATCGATGTTGGAGAATTTATAGTTCCTGTTCCCTATGTCAAGCAAGTGAAGTTGTCGAATGCTGGAGGGAGGCTTATTATTGCATCAGATGGCATTTGGGATGCCTTGTCATCAGAGGCAGCTGCAAAGTGTTGCAGAGGTTTGCCTGCTGAGCTTGCTGCTAAGCAAGTTGTTAAGGAGGCGCTCAGGACAAGAGGGCTAAAAGATGATACGACCTGCATCGTTGTTGACATGATCCCACCTGATCAAACAATACGTCATCCATCTCCACCAAAAAAGATAAACAAGTTGAAGTCTTTAATCTTTAGAAAAAAGACAAAAGACCATCCTAATAAACTGACTAAGCAGCTGTCAGCAGCGGGTATGGTGGAAGAGTTATTCGAAGAAGGTTCAGCAATGCTATCAGAGAGGTTAGGCAATGACTCAAGTGGTCGGAGAACATCATCAAGCTTGTTTACATGTGCCATCTGCCAGGTGGACCTTGAACCAAGTGAAGGTATATCAGTCCATGCTGGTTCAATCTTCTCTTCCAGCTCCTCTAAGCCATGGGAAGGCCCTTTCCTTTGTTCCGATTGCCGCGACAAGAAGGATGCCATGGAAGGTAAACGACCAAGTGGCGTCAAGGTTCTATGA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSSPSPSSEAAAAHHHHHQRRQHAGAAGGSGLVPLAALIKEEARAERPMGSGSRICARDEEDGGGGAGAEGGRRWRRPLLRYGCAAQSKKGEDFFLLRTDCARPSTSSSSSSSLASSPPHTFAVFAVLDGHNGNAAAIYTRDNLLNHVLSAMPRGLSREEWLHALPRALVAGFVKTDKEFQHKGQTSGTTATFVIIDGWTITVASVGDSRCILDAQGGAVSLLTVDHRLEENVEERERVTASGGEVGRLSVVGGAEIGPLRCWPGGLCLSRSIGDIDVGEFIVPVPYVKQVKLSNAGGRLIIASDGIWDALSSEAAAKCCRGLPAELAAKQVVKEALRTRGLKDDTTCIVVDMIPPDQTIRHPSPPKKINKLKSLIFRKKTKDHPNKLTKQLSAAGMVEELFEEGSAMLSERLGNDSSGRRTSSSLFTCAICQVDLEPSEGISVHAGSIFSSSSSKPWEGPFLCSDCRDKKDAMEGKRPSGVKVL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..378#802..973#1064..1217#1763..1826#1978..2085#2269..2394#2537..2769#7193..7415#ATGTCGTCGCCGTCTCCGTCATCGGAGGCGGCGGCGGCGCACCACCACCACCACCAACGGCGCCAGCATGCGGGCGCCGCGGGGGGGAGCGGGCTCGTGCCGCTCGCCGCGCTCATCAAGGAGGAGGCCCGCGCGGAGCGGCCGATGGGCAGCGGGAGCAGGATCTGCGCGCGCGACGAGGAGGACGGCGGCGGCGGCGCCGGCGCCGAGGGGGGGCGGCGGTGGCGGAGGCCGCTGCTGCGGTACGGGTGCGCGGCGCAGTCGAAGAAGGGGGAAGACTTCTTCCTCCTCAGGACCGACTGCGCCCGGCCCTCCACCTCGTCGTCCTCCTCCTCCTCCTTGGCGTCCTCGCCTCCCCACACCTTCGCCGTCTTCGCCGTGAGTTTGTGTGCTCCACCGTCGTGTTCGTGTTCGTGTTCGTGAGTGTGTGTATGGCAGTGCGGCGCGATTTGGCATTTCGGGGTGCCTGCTTCGAATTTTGCCCTTCCGGTCCTTGGGTTTGTGCTCCTGAGTAGCTAAATAGCCAGCTAGTGGGGTATTACCATCAGCCGTGGCATGCGAAGCTTGGATTTCGCTCCCGTTTATGGGGTGTGTGGTTGCTAAATTGCTATGCTGTGCTATGTATATGTTATATAGTTTCAGATCTTGGTATGCTAGTTCTTTGTATGGCTTTAGGCATGCTAGTGAGACCTTGGAAATTGCAACTACGCATGTAACCATTGTATGGAGATGCTTTGAGTTGTGAGTGCCGGGATTGGACTGTTTTCACAATTCACTAATTGGGTGTTTCTCTGTCTGTAGGTTCTTGATGGCCATAATGGTAATGCCGCCGCAATATACACCAGGGACAATCTGCTCAATCATGTCCTTAGCGCAATGCCAAGAGGACTCTCCAGGGAGGAGTGGTTGCATGCGCTCCCCCGTGCGCTTGTCGCAGGGTTTGTTAAGACTGACAAAGAATTCCAACACAAAGGCATGATCCTGTATTTGGTGTTTGGGATTTACCTCTATGTATAAGTTATGCCAAACGTTGAGGCAATTTTCCTTTTTGGCTATGCACCAGGCCAAACATCTGGCACAACTGCCACATTCGTGATCATTGACGGATGGACTATCACCGTTGCTTCAGTTGGTGATTCCCGGTGTATTTTGGATGCTCAGGGTGGCGCTGTTTCTTTGCTTACTGTGGATCACAGACTAGAAGAAAATGTGGAGGAGTGAGTATCTGTCGCTTACCATTAATATGGTATTTTATTTAGAGGCTCTGCAAGTCAGCATGCATTGCATATTCTTTGCTTTGCAAATGGAATATGAAAGGGTTAACTAGAATATCTTGCATGACTGTTTTCCATATATTATCTAATTAGTTATTTGTATTGTTCTATTCAATTTCTATTTAGAATGTTCATATGTCTTCATGCAACTGCTACTTCTCCCTTCAATAAAAAAAAATGATATCCTGTTTCTATTTGCACACAAATTAAGTGGACCATGCTACTACAATTACTGGAGTTGTACTTACTACTAAAATAGTTCCTCAGATCAACAATTAAACGGTATGGAGTGAAAATGTGTCCATTTGCTGTATTCTTGAATTTCATTTAGACTCGTAGTCTTACACAACTCCAAGTGATTTGTTGTTTTATATTTTTCTGTTAATTTCCTTTGTCCCTGAGCAATAGCATGTTTTTTTTTTGGTTGACTTCTGAATAGAAAAGTAACTTGTAAGCTTTAACCAACCTTCTATATAAAATGATTGTAGGAGGGAACGTGTCACTGCGAGTGGAGGTGAAGTTGGAAGGCTTAGTGTTGTTGGTGGGGCAGAGGTGTGTTTCACTGCCTTTCTGTTACAACTTACAACGATATGGTTGCAAACATAGCTTGCTATGCTATGTAAGATAGCTCCATTGGATACATGTGCTTAGTTTTGGAAGGATTACAAAACAATGCTAACAAGCTGTATCACCCTTTTATCAGATTGGTCCACTGAGATGCTGGCCAGGAGGTTTATGTCTATCAAGATCCATTGGAGATATCGATGTTGGAGAATTTATAGTTCCTGTTCCCTATGTCAAGCAAGTGAAGGTAAAACTTTGACACTTTGCAAATAGACGCCTGGAATTCCTCCTAGGTTTCTGTTTGGCAATAATATATTTTTGACAGCCCAACAACAAAGAGACAAGAACAAATGTTCCTGCTCGATGTCCTATGTTATTGGTGGAAGATAGCTAACTGCCTTCTTTATTAATTTATTGTTATTTTCCGTAGTTGTCGAATGCTGGAGGGAGGCTTATTATTGCATCAGATGGCATTTGGGATGCCTTGTCATCAGAGGCAGCTGCAAAGTGTTGCAGAGGTTTGCCTGCTGAGCTTGCTGCTAAGCAAGTTGTTAAGGTAAGAAACTATCTAGTGTTCTCTAAATTCTTAGCAATCCTGCTGTAAAACTAGTTATTGTGCCTCGAATGGGTACCAAATTACTAATGTTGCATCATCAGACATGTTTCCTTATAAATGAGTTGTTTCCCTAATTTTTTAGGAGGCGCTCAGGACAAGAGGGCTAAAAGATGATACGACCTGCATCGTTGTTGACATGATCCCACCTGATCAAACAATACGTCATCCATCTCCACCAAAAAAGATAAACAAGTTGAAGTCTTTAATCTTTAGAAAAAAGACAAAAGACCATCCTAATAAACTGACTAAGCAGCTGTCAGCAGCGGGTATGGTGGAAGAGTTATTCGAAGAAGGTTCAGCAATGCTATCAGAGAGGTCAGTTGTAGCTCTCCTCTAAGAGTGTTTATGAACTTTCTAAGTGTTTCACTGCTAGCTCCCTGTTCTTGGGTGTAAGCAGCTGGATTCATAGTCAACCATACATCAGTGTTTATGTGTATATACATCAGTAGTTTATTTTCTTGAGCTAACTAACCACTATGTTAGTCCAGTAGTCCTGTTTTAAGTATAGCATGACGCCATGACACCCTGTGGATTATATACCCAGTCAGATTGGATCGCCATGACCCAGTCTCTTGCTTGACCAAGACCATTAACACAGGTTGATTGAGTCCATAAACTTGGCCGTGGTATTCTTGTTGAAGGTCAATGAAGTACAAAGCTATTTATCATAGTACAACCCACATATAGGAAAAAAAAAAGAAGCTGTTCTCCTTGAGCCTAATAATCCATCTGAGCAGCATTGACCACTCCTGTAGCCTAACAGCCCATAAAGGCTTTTTTTTGGATTTAAAAACACAAACAAACACGGAGGGTTTATGGATATATTGCAACTACACAGGCCGCTGGTGCCATGAATGTGAATGGAGTATGAGTCGTTGTCCGCCATCCTCTTTTCTCATGTTCTCTTCTCTCAAGCTAGCAAGCTGTGATGATGGTGATCAGCAACTTTGCCAGTGATGAATCTAGCAAGCAGTGATGGCAAGGGGGTGGAGATAGCAAGTAATGGAGGTGTTAACTGACATTTGTAGCTAGTTAGTTCAGGTTCACTATCATCTTGTCCTCTATTGTCTATCAGCAGTGATCAGGAACTAGCACAGTCTGGTCCGGTTTTGAGCCAAGACTGTTTCAGCAAGGGAGTCTCCCTGAACTAGTGACCACTGTGAAGGGCTGGTTTTGTGCTGAACTGACATTATTACTGGAGCAGTTGGATGAAGTTGAAGCCAATAAGGTCTCTCTGTGGAACCCGACTAGTCTATGTTCTACAACCCATTTAACCAACTAGCGCACGATGGTATTGCCTTAGGAGGGAAACATGTACTGTAAGGCCTGTTTTCTATGCCATACCGACAATGACTTATTTTATTAATTCTTTGAACAGTCGGTTGAACTGGTAAACCTGTGTTCTTATTGGGGAACCACTAAAGTGAGTTATTCACAGGCTAACATCTGGTTCAGTTCTTTAAACTATGCCTACGATCCCTATCCTGACAATGACAACTCTGGTTGAAACCATACCAGATCGATTTTGTTTTCTTGCAAGTCACACCCAATTGGTTTAGTGTCACACTGTCACCATTAGTTCAGTTTGACTAAGCAATAAGTGTGTTCAAACTATGCAAAAGTTCACATCAGTGGTTATCATAGTCAAAAGGAATAAATTAGTGATCACAGCCCCCGTGTGAAAGCACTGGAAACAAGATCCAATTAATATTTGATACATATTGGCCACTGACACAGTGCCAGTTAGACCCTTTCTTTTTCAGATAATAGTTAGACCTTGGTTTGAACACATTGTTTAAAATTGTGCTTCGTCTTGGCTCATTGGCCACGTTTTTGTTTCAATTTCTTATCCATCTCATTCCCTCCCAGATCTTACTTTTTTTTGGTTCAATTCAGATGATAACAGAACACAATAATCCTAGTCTGCTCACCTATGATTTTCTGGTCCATTGTACTCCTAATTTTGGAGTGCACATTTATTGCTTACTCAGTTCTCTGATGGTACTATATTATGTTGGCCCAAGATTGGCGCAACTTACTTCCTGCAAGCACAATACTTGAGCAATATGTTCCGATGTGGTGACACACTTGTCAGATGGGATGAGCTCATTGAGCCCTGGCATTAGTATTGTTCTTATTATTTAATATTAGCTCTGGGAGAGTTAGACAGTAACTATTACTACCTTGGTAAGTAACGATCAAGTAATAATGAGCAAATACAAACAACTTGAGCTGATCTTATAGGTGGACATTGCATGCTTCATGCTTATCTAGAACAAGGTGAGGATGCTTGAAAATGGACTGCTTAGATAAATAGCATTTTTGGTTTGGGAAAATAGGCCAATTTGGTCCATCAAGTTCCATTCCAGGGTCGCTTTGGTCCTTGAAATTTGATTTTGTCCAAACCAGTCATTTAACTTTACCTTTTGGGTCAATATGACCCTTGGGCCCACCTTATGTGCCATGTGGGCAAGACAGATGGCAATCCTTATCGTGAAAACACTATTTGTCCCCCTATATCTCTAGTTAGAAAAACATCATGATAAAATTATCCAGTCATTTCCTAGCCAGTCGATCGCATACTTGTTCATGCCAAAAGACAATGATAAAGCGCAGGGGCGTGCCCAGGATTTAGAGATTGGGCGTTCAAAATATGAAGGGTAATATAAGTCCTTTTAAACACCCAAATGCCTAATAATTGGCTTCTATAACATCAAACACTAGTGTTTGTACGATATCTAACATATATATAACACAAAATTGAGGCTAAATTCACATTTTCATAGAATTGATCATTACTTGAAATTGTTCAACATACAGAAGTGCTAATAGCCCCTTGTCCCTCTTCATTTTTGGACCTAGAATTTAATAGCCAACTGTACTTCTATTCTTAGAAATTAAGCCATTGCACAAGTCTAAATCCTGGTATATATACAGTAAGCATCTAAAGCCATTCCACAAGCACAAGTTCCTACTTCCCTAAATGGCTAAATCCTAAGTGTGAAATTGTGAATAACTCAGATGAGTAGAGCAAATCAACTATTCAGTAAAATTCACTAACTTCTGCTTGAGATTTTAGAAGGCAGAGCAGATGAGTAGCAATAGTTGTCAGCCGAGCTCACCCAACCCAATCACCCTTGTGGCCTCACTGGCTTGCCGCCTAGCACACCGTCCAGCCCGACCCCTTGCCCTGTCACTGCTCGGCGCCTGCACCTATGCCGCTCGGCCACTGTGCATACCTCCTTGCCACTAACATCGTGCAGCCGTAGCACGCGTGAGGCGTGCTGCCATTGCCGGTCGTCGCCAATCAGCCACTAGCAGCCTGTGCCACGCCGCCAGCCACCGCCACCCGTTGCCCCTGCCTTGTTTCCGCCCAGCGCCCTCGGCCGCCCCTGCAGCACCGCCCGGCCACCGCAGCCCGCATGGTGGCGCGCCGCCGTCACCCGATTGCCGCTGCTCAGCCACCAGCCACCCATGCCATGCCCACGCCACCGCCACCCACTGTCCCTGCCCTAGCTAGGGTTTGGTTTATGTGGGTGCCTTGGTGGTGGGTGGGCCTGGCCGGCCTGTTTGGCTGTTTGGGAGTGGGGGAAAAGTTGGGCCTAGGCTAGCGAATGGGCCAAAAGATAGGGGAGGAGGGACACGGCCTAGTAACGTGGCTTGTTTGTTCTATGGGCTGATTGAGGTCTTTTTTCTATTTTTTAACACATATACCAAATACATAGATATATGTTAGTTTTTTGCTAAAAATCTTGGGTATACATCTGAATACCCTTGAATAATGCAGGGCCCACCCCCTGATAAAGCGGTCAGCTTGTTCTATTCTCAAATAGGTATACAAGGGTAAACTAGTTTTCGCCATTGAGATAGCCACCAAGCTGAACTTATACTGAGTTGTCTTACTAACATGGTGCTCTCAGTCCACTATTAAAACAATTCTTTGTATGTGTACACAATCAACCATTCCTTTGTCCCCTTCGTATTCTCGTATATAAGGGAGGATTGGAGGAACCCTGTTGGCTGGTCCACCAAGTTGCCAAAATGCTTAGAGTCTTCCTTTCAACGTGGGAATGAGATGAGGAACATGGAGAATTGGAAATAGATAAGCTACATTTTTTTTGTGGGGGTGGTGGGGGGGTGTACATTATTCTGTTTGAGCACTTAGATCACAATTTATTTTGTACAGCTTAGAGGAATACCCTCTTCATTCATCCTTTAATTGAAAGGACCACAAGTTGGTTTGTACAAGCCTTGTGTGAGACAAATCCAATGTTTTGGGAGTGGTTAGTAATGTCATGCACATAAAGATTATAATGCTTTAGCATTTTAACTTGTTCGTTTTGATTGAATCAGCTGTTCGTCTTGGTTGATTTCCCTAATCTGCATGAATAACTTGAACAAGCTCTTTTGAGCTTGTTTGCTTGCTGCTTTATATATATAGATCAGCTTATGCTTAGTCTATGATGTTGGCAAAAGTCCATGTAACTGCTGATTTACCACCCTTCTTGCTGACTATTTTGACTGTTAGCTTGGTACTATACTGTGCTACACATAAGAATAATGCAACCATATGTTTTTTGTAATGTGATGTACAAATTTCTCTTCAGCTCGGGTTGTTTGCAATTTTTATTTCTAATATTCGTTCACTATCTTTCTTTGCAGAGATCTTATGCTTTCTGTCCATAAGACGTGCACTTTAGAATATATTTTCTGATTTCATATGCTTTTTACTACGCAGGTTAGGCAATGACTCAAGTGGTCGGAGAACATCATCAAGCTTGTTTACATGTGCCATCTGCCAGGTGGACCTTGAACCAAGTGAAGGTATATCAGTCCATGCTGGTTCAATCTTCTCTTCCAGCTCCTCTAAGCCATGGGAAGGCCCTTTCCTTTGTTCCGATTGCCGCGACAAGAAGGATGCCATGGAAGGTAAACGACCAAGTGGCGTCAAGGTTCTATGA</dnaseqindica> |
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