BGIOSGA001480
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001480 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001480, complete gene. |
| LocusTag |
OJ1029_F04.29 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001480-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001480-PA |
| Length |
8426 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:21950957..21959382 |
| Sequence Coding Region |
21959069..21959382,21958556..21958702,21957912..21958047,21957129..21957230,21956740..21956859 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:21950957..21959382 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:21950957..21959382 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCTACTATTCAAGATATAGGTGTCTCTGCAGCTATCAACATACTGAGTGCCATCACTTTCCTGCTAGCGTTTGCTTTCCTGCGACTACAGCCCATCAACGATAGGGTTTACTTCCCAAAGTGGTATCTCAAAGGTGCAAGAGAGAGTCCAAGTCATGGGGGTGCATTTGTGCGGAAGTTTGTCAATTTGGACATGCGATCATACTTGAAGGTCTTAAGTTGGATGCCTGCTGCTCTCAAAATGCCAGAGGATGAGTTAATTAGCCATGCAGGCCTTGATTCAGCTGTCTATCTGCGGATCTACTTAATAGGGCTTAAAATATTTGCTCCAATCACAGTTCTAGCATTTATTATTCTTGTGCCTGTTAATTGGACCAATATTACCCTTCAAAGCTCGAAGGTGCAGCACAGTGATATTGACAAACTTTCAATATCCAACATACCTGTAGGGTCAAAGAGGTTCGCAGCTCACCTGACCATGGCTTATGTTTTCACATTTTGGACATGCTATGTGCTGTTACGGGAGTATGAAATAGTGGCAACAATGCGTCTGCGCTTTCTTGCATCAGAGAAGCGCCGCCCAGATCAGTTCACGGTCCTTGTGCGGAATATACCGCCTGATCCTGATGAATCAATTGGTGAGCTTGTGGAACATTTCTTCCTTGTAAACCATCCTGACCATTATCTTACGCACCAGGTTGTCTATAATGCAAATAAGCTTGATAAGATGGTCAAAGAGAAGAAGAAAATGCAGAATTGGCTTGATTACTATCAGCTGAAATATGAAAGAAATACATCTCAAAGGCCTACTACAAAGACTGGTTTTCTTGGATGTTTTGGTTCAAAGGTGGATGCTATTGAATACTACACATCTGAAATTGAGAGGATAGAAAAGGAAGAAACTGATGAACGTGGAAAGATTATGAAGGATCCAAAATCAGTTGTGCCAGCAGCCTTTGTTTCCTTCCGGTCGCGGTGGGGAGCAGCAGTGTGTGCTCAGACACAGCAAACCAGTAATCCAACTGTCTGGTTGACCGAGTGGGCCCCAGAACCTCGTGATGTCTATTGGGATAACCTCTCTATTCCTTTTGTTTACCTGACAATTAGGAGGCTGATAATTGCGGTTGCATTCTTCTTCCTGAACTTCTTTTATGTGCTCCCGATTGCATTTGTTCAGTCCCTTGCAAATATTGAAGGGATTGAGAAGGCAGCTCCATTTCTGAAGCCTTTGATTGAAATGCGTACTATTAAATCATTCATCCAAGGATTTCTGCCAGGAATTGCTCTGAAGATTTTCCTTATATTGCTCCCTAGCATATTAATGTTTATGTCTAAAGTTGAAGGATTGACATCGGTGTCCTCACTGGAGAGAAGATCTGCTTTTAAGTACTATATCTTCTTGTTCTTTAATGTATTCTTGGGAAGCATTATTGCAGGATCTGCTTTAGAGCAGCTCAAAACATTTCTTCACCAATCAGCAAATGAAATACCAAGGACAATTGGTGAAGCAATTCCAATGAAAGCAACCTTTTTTATAACATACGTAATGGTTGATGGTTGGGCTGGGGTAGCTGGTGAAATTTTAAGATTGAAACCATTGATAATCTTCCACTTGAAAAACTTTTTCTTGGTCAAGACTGAGAAAGACAGAGAAGAAGCAATGGACCCTGGAAGCATTGGTTTTGACTCAAATGAGCCTCAAATACAGCTCTATTTCTTGCTCGGACTTGTCTATGCTGTGGTGACACCATTTTTGCTTCCTTTCATATTAATATTCTTTGGGTTAGCATATGTGGTATACCGTCACCAGATAATAAATGTGTACAACCAAGAATATGAAAGTGCAGCAGCATTTTGGCCAAGTGTTCATGGACGCATAATTGTAGCATTAATCGTATCACAGCTGCTTCTCCTTGGATTACTAAGCACAAAAGGTGCTGGCCAGTCAACACCGGTGCTCCTTGTTCTCCCTGTTGTAACCTTTTATTTCTATAAATACTGCAAGAATCGCTATGAGCCTGCTTTTGTGGAATATCCATTACAGGATGCAATGCGGAAGGATACCCTAGAACGCGCAAGAGAGCCAGGGTTCGACCTCAAAGGATACCTGATGAATGCCTACATCCACCCGGTGTTCAAAGGCGACGAGGACGACGAGAAGTTCTCCATCTCCGACGAACCAGAGGCGGAGCAGGTTCTCGTGGCGACAAAGCGCCAGTCCAGACGGAACACCCCAGTTCCGAGTAAATACAATGGCTCTGAATCACCTTCCCTTGCTGAAATTGTAAATGATCAACGGCTATAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATIQDIGVSAAINILSAITFLLAFAFLRLQPINDRVYFPKWYLKGARESPSHGGAFVRKFVNLDMRSYLKVLSWMPAALKMPEDELISHAGLDSAVYLRIYLIGLKIFAPITVLAFIILVPVNWTNITLQSSKVQHSDIDKLSISNIPVGSKRFAAHLTMAYVFTFWTCYVLLREYEIVATMRLRFLASEKRRPDQFTVLVRNIPPDPDESIGELVEHFFLVNHPDHYLTHQVVYNANKLDKMVKEKKKMQNWLDYYQLKYERNTSQRPTTKTGFLGCFGSKVDAIEYYTSEIERIEKEETDERGKIMKDPKSVVPAAFVSFRSRWGAAVCAQTQQTSNPTVWLTEWAPEPRDVYWDNLSIPFVYLTIRRLIIAVAFFFLNFFYVLPIAFVQSLANIEGIEKAAPFLKPLIEMRTIKSFIQGFLPGIALKIFLILLPSILMFMSKVEGLTSVSSLERRSAFKYYIFLFFNVFLGSIIAGSALEQLKTFLHQSANEIPRTIGEAIPMKATFFITYVMVDGWAGVAGEILRLKPLIIFHLKNFFLVKTEKDREEAMDPGSIGFDSNEPQIQLYFLLGLVYAVVTPFLLPFILIFFGLAYVVYRHQIINVYNQEYESAAAFWPSVHGRIIVALIVSQLLLLGLLSTKGAGQSTPVLLVLPVVTFYFYKYCKNRYEPAFVEYPLQDAMRKDTLERAREPGFDLKGYLMNAYIHPVFKGDEDDEKFSISDEPEAEQVLVATKRQSRRNTPVPSKYNGSESPSLAEIVNDQRL</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..314#681..827#1336..1471#2153..2254#2524..2643#2781..2861#3161..3501#4525..4770#5483..5807#6826..7059#8166..8426#ATGGCTACTATTCAAGATATAGGTGTCTCTGCAGCTATCAACATACTGAGTGCCATCACTTTCCTGCTAGCGTTTGCTTTCCTGCGACTACAGCCCATCAACGATAGGGTTTACTTCCCAAAGTGGTATCTCAAAGGTGCAAGAGAGAGTCCAAGTCATGGGGGTGCATTTGTGCGGAAGTTTGTCAATTTGGACATGCGATCATACTTGAAGGTCTTAAGTTGGATGCCTGCTGCTCTCAAAATGCCAGAGGATGAGTTAATTAGCCATGCAGGCCTTGATTCAGCTGTCTATCTGCGGATCTACTTAATAGGGTATGCAATTTATATTCATAAATTCTGCTAACTTTTTAAGTCGTCAATTATACTTTAGGTCAGACATATATTTAAGTGGGGGGGGGGGGGTTTAGCTTTCAGGTTTTCTCCTTGACAGAAGGGAAAGGCTCTAGTGTTGGACCATATTTTAATATTTACATACTATTCATTTTAATTGTCTTATATTTTTATGGATTCTAAATCGTTGCTATTTCTCCATGTCTTACATATGTAGAAGTGTACTTCTAGTACCGAAAATGTTGTTTTGTTGAATGTTTCTGTTTTATCCACTGGGTATCTCCCATCTCTGTTACTTTTCTCTGCCAATACTTTTACACTAATCTCCTTTACTATTAACTGTTGCAGGCTTAAAATATTTGCTCCAATCACAGTTCTAGCATTTATTATTCTTGTGCCTGTTAATTGGACCAATATTACCCTTCAAAGCTCGAAGGTGCAGCACAGTGATATTGACAAACTTTCAATATCCAACATACCTGTAGGGTCAAAGAGGTTAGTACCAGATAATTTTTCTGTCTTAAAATATAGTAATATACCTGATAGATTACTTCAAACACAATTTAAGATAGTGAGTATGGGGTTGGTTCAAATGGTAAGTGGAATGATGATTGCTCTTACTTTCTTTCCCCATTTGGGCTTAGGAAAGTCATGAAGATCCGAAGATGTATAGAGATGACCATGCAGTATAAACAACCACCCAGCCTCTGTGATAATACATGAGCTGGGAGTCAGAAACGGTAGTAGCTTGCATGTGTGGGGTGTGCAATTCTGAAGGCCATTAGTTTTAACCTAGCTTGTTGTGTCAGTTTGGTGTGATACTTTGTAATAGTAATTAGACAAATAGTCGCAAAGGTTTGATCTTGCCATAGATAAGTAGGTGAGTGGTTATAGTTGATATTAGCCTTCCAGGCAGCACATTAGTCTTGCAGGATACCCTGTTCATCAACTCTGAAACTATTGTTTTAGTGTTCACTATGCCTGTGACTTTTTTTTAATGCAGGTTCGCAGCTCACCTGACCATGGCTTATGTTTTCACATTTTGGACATGCTATGTGCTGTTACGGGAGTATGAAATAGTGGCAACAATGCGTCTGCGCTTTCTTGCATCAGAGAAGCGCCGCCCAGATCAGTTCACGGTATGATCTTGTGAACTCTATGCATTTGGCAGTTCAATTTATATTACTTGATATTTTCTTTCTAGTGTGCCTTCCAATTCTACTTAGTTCATAGCATGTCATGTCACTAACAGTGTTCATTTCACAATGAATCTAATAATGCCACTTAAGTCTTTTTACACATCTATGGAAGACAAAAAAGCTTCACCTCATGGATAGTGATTGAGGGACTACGTGGGAACTTGAATAATGTAAAATATCAGCTGATAAAAAAGATAATCATGAAAACCACTATTCTTGAAATGTTATGGACATTGAGTTGTTGACATCAAAACCATAAAAGTATCATTATTGAATGCTTGCTGTATACTGCTCATTCTGTAAAATGAAAATTGTTAGGTATGTTTGCACTGTTTATTCTTATAGATGTTCTAAGAAATGGATTTCTATCCAAAAGAAAAGACGAATTAGTTAGGGCACCAATAGTTTCAACTGCCAACTGGGTATAATTTTTAATGTGACTTTTGAACTTGCAAGTACCTGGTTCTATCCAGATATTTAACTAAGCTGAATGTGGCTAACCAAGATAGGTTGGTGGGAGAACTCATCTTTAAAATTGGAAAGCCTCTGGTGAAGGAAGATTTTGTAACTGATTATGACTGAAGAGCAATGATATACTAATTGACCAATGTTGATTTTTAGGTCCTTGTGCGGAATATACCGCCTGATCCTGATGAATCAATTGGTGAGCTTGTGGAACATTTCTTCCTTGTAAACCATCCTGACCATTATCTTACGCACCAGGTAATATTTATATTTTACAGTCTGGTATTTATGCTTCACTGGATCTTTCTGTCTGGTCAGTTCAAAGTTCATAGCGAAGTCATGTGAATAGTTATATGTCATTAACTTCTTTCATATATGCCTTTCCTTTTTATCTTTCTGCAATCAAATGTAGTTCTGTTTGATTCCTTAGTTTTAACTGCTTATCGTTACTAAAAAAAAAAAAATCTATGCTCTGATATGGCTTACCACTACCATGTTCTTATCATTCATTTCATGGACTGGTATAGGTTGTCTATAATGCAAATAAGCTTGATAAGATGGTCAAAGAGAAGAAGAAAATGCAGAATTGGCTTGATTACTATCAGCTGAAATATGAAAGAAATACATCTCAAAGGCCTACTACAAAGGTTGTTGCTAAATTTGATCATGTTAATCTCTTTACTTCTCTTACACAGTTCTTGTTGTTTTTATCAAAACAAAAAAGAATAATTTTTATTTATGATTCCTTATTTATTCTTCTTATTTTTCTATACTTCTTTTCCAGACTGGTTTTCTTGGATGTTTTGGTTCAAAGGTGGATGCTATTGAATACTACACATCTGAAATTGAGAGGATAGAAAAGGAAGTAAGTCATATATCTTTGTGCTGTGCCTCCTAATGCATTATTCTGCTTTGAGTCTAGTGTTATTTCAAAATACTACAGTTGACTTCATATAGTGTCTTAACAAAAGTAAAGCTTCTTGCTATTTTACTGAAGCAAATAGTGTCTTTCTTTCTTGTCTTTGCATCCATCAATATTGGCAAATATGTGTTAGCTTTTATTAGTAATTAGCACTGTATAAGTTGAATGTTGTGTTTCACATGTTAAAAGGATTTCCCCAGTACCATAAACCACCGGATTAACTTCTTATAAATGATATTTAGGAAACTGATGAACGTGGAAAGATTATGAAGGATCCAAAATCAGTTGTGCCAGCAGCCTTTGTTTCCTTCCGGTCGCGGTGGGGAGCAGCAGTGTGTGCTCAGACACAGCAAACCAGTAATCCAACTGTCTGGTTGACCGAGTGGGCCCCAGAACCTCGTGATGTCTATTGGGATAACCTCTCTATTCCTTTTGTTTACCTGACAATTAGGAGGCTGATAATTGCGGTTGCATTCTTCTTCCTGAACTTCTTTTATGTGCTCCCGATTGCATTTGTTCAGTCCCTTGCAAATATTGAAGGGATTGAGAAGGCAGCTCCATTTCTGAAGCCTTTGATTGAAATGTGCGTGCATTTATCTCTTTCTTCTGCAATAATTATTATCAGTTGTTCCTCAATTTTTTTTTTCAGTTGAAAGCTTACCACATACTGCTTTTCTAGTATTGGATTTTCAGAACATGGCTTTATGATCTTATCATCATCCAATATATGATTTAAGTGCTACTGCCATGTAATAAATTAGACTTCTGTGTGGGTTGCAACTTGCAAGGAATGTTATTGCAGAAAAAAAATGATAAAATATATTTTTGTTAACTTTTGATGATCAAATCCTTTCAAGATATCATAGGGTCAGTTGTCCTTTAAGGCTTTAAGTAAGCTTCAAGATAAATATCATGCAGAGGTAACAGAGGCTTTTTCCTACCGAATGAAACTGAGGAAATGTATGCATGAAATCACGGTTGAACTTGAACTTACTGTTAAAGAATTGAAAACATGGCTTGGATGCTATGAAGGGGTTTAGTCCTGCTGCACTGTGCACTCTTTACAGATGTATTTCTGTTATATATTTTGGCACATAATTTGTGAATTTCCAGTCATTGCAAATTTATTGTTTGTTAACATTTCATTCTTGCTTTCTTTTGGAAATACAACTGAAACTTGCTAGAATGAAATTAATTAGCATTATATCAGTTGTGCTTTTGCACCTGCTTTGTTGCCTGTGGCCATCAATAACTTGATGTTCTAGTGCAGCTAAAGTCTGTTCTATACACCTGATCCAGTACTTGCTGAAATCTGTCCATTGAATGGTTGATGCTAAGCAACACTGTTTTTTGCATCTTATTTTTCCTCTATTATGAAAATGTTTTGGCAATCTACCAATCTCACAACTTATCCATTAATGTACCACTTTGAGGAGCAAGCAAGTCATGGAACCTACCAAGCCAAAGTATATCTTTGAGCACCTAATGCCCTAAACAGACAAGTTCATAAACTTTACATTTGATTTACTACTTTTTTCTTCTACATTCTTCTGTTGTTGATTTGTCATTTCACTTATGTCAATTTTTCTTTTCAACTATTGCCCAGGCGTACTATTAAATCATTCATCCAAGGATTTCTGCCAGGAATTGCTCTGAAGATTTTCCTTATATTGCTCCCTAGCATATTAATGTTTATGTCTAAAGTTGAAGGATTGACATCGGTGTCCTCACTGGAGAGAAGATCTGCTTTTAAGTACTATATCTTCTTGTTCTTTAATGTATTCTTGGGAAGCATTATTGCAGGATCTGCTTTAGAGCAGCTCAAAACATTTCTTCACCAATCAGCAAATGAGTATGTCCTCTTGTCTACCCCACAAGCTGCACCTTCAATCCATTATCCTGTATGCTTGCAATTTATATATGTCCTGATACCACAATTTAATTTAATTTTAC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