BGIOSGA001351
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA001351 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001351, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_02556 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA001351-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA001351-PA |
| Length |
6727 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:24899385..24906111 |
| Sequence Coding Region |
24906084..24906111,24905667..24905788,24905440..24905522,24902534..24902580,24901359..24901480 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:24899385..24906111 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:24899385..24906111 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCCCACCCGCTCTCCTCCGAACCTCATGCTTTGGAACAAAGGGCAGTGGTAGTAACCAACAAGCATGGGGAGAAGCTCGTGGGAGTGCTGCATCACACGGGTTCAAGCAAGATCGTCGTATTGTGTCATGGTTTTATATCTACCAAGAACGACAGTCTCATTCTTGACCTGATGGCTGCATTGACAAAGAAAGGGATTAGTGTCTTTCGCTTTGATTTCAGTGGAAATGGTTTCGAGTTGTGTTGGTCGATTCCCCATGTGATCGTATCCGGCGGGTATGCTCTGGAACAAAGGGCGGTGGTAGTAACCAACAAGCATGGGGAGAAGCTCGTGGGAGTGCTGCATCACACGGGTTCAAGCAAGATCGTCGTATTGTGTCATGGTTTTATATCTACCAAGAATGACAGTCTCATTCTTGACCTGACGGCTGCATTGACAAAGAAAGGGATTAGTGTCTTTCGCTTTGATTTCAGTGGAAATGGAGAAAGTGAAGGAGAATTCGAGTATGGAAACTACAGGAAAGAGGCTGATGATTTGCACTCCGTTGTATCATATCTTTGTAAGGAAAAGTATGATGTAACAGCAATTGTTGGCCATAGTAAAGGGGGAGATGTAGTAACTCTATATGCTTCTATTTATGATGATGTACGCTTGGTTATTAATGTATCTGGTAGATTTGACTTAGAGAAAGGCATTGAAGAACGTATAGGGGAAGGATCAATTGATAGAATAAATAAAGAAGGCTACCTTGATGTCAAGGATAAATCAGGAAATGTACAGTACAGGGTAACTAAAGAGAGTTTGATGGAGCGGCTCAGCACCGATATACGTGCTGTAAGCATGTCCCTTACCAAGGAATGCAGGTTCTTCACAGTTCACGGTTCAGCAGATGAGACTATACCTGTGGAAGACGCCTATGAGTTTGCGAAGCATATACCGAATCACAAGCTGCAAGTTATTGAGGGAGCAAATCATAACTACACCGCGCATCGCGAAGAATTGGCTGATGCTGTAGTGGATTTCATCACATCTAATTAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSHPLSSEPHALEQRAVVVTNKHGEKLVGVLHHTGSSKIVVLCHGFISTKNDSLILDLMAALTKKGISVFRFDFSGNGFELCWSIPHVIVSGGYALEQRAVVVTNKHGEKLVGVLHHTGSSKIVVLCHGFISTKNDSLILDLTAALTKKGISVFRFDFSGNGESEGEFEYGNYRKEADDLHSVVSYLCKEKYDVTAIVGHSKGGDVVTLYASIYDDVRLVINVSGRFDLEKGIEERIGEGSIDRINKEGYLDVKDKSGNVQYRVTKESLMERLSTDIRAVSMSLTKECRFFTVHGSADETIPVEDAYEFAKHIPNHKLQVIEGANHNYTAHREELADAVVDFITSN</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..28#324..445#590..672#3532..3578#4632..4753#4897..4979#5351..5472#5966..6130#6258..6351#6553..6727#ATGTCCCACCCGCTCTCCTCCGAACCTCGTAAGCGCCGCCCCTCCCCTCCATGCGCCGTGTCGTGTCAGGCATCCTTCAACAATCAAAAGCAAGCAAGAGATTAGTTGATATATGGGGCATATCATATATATGGCCTCAACTAGCAAAACTTTGGCAGTTGATTGCTATCAGGTTTCGGCTGATTTTGGTCACAACTGATATTCAGTTCAGTCAGAGTTGCTGAAATATGTGCTGTCCACTCTTTTGCTGTGAGATTTGGTAATTTAACACTTCTTAAAATGGGTTTCGATTGTTTGATTATCAAATCTTTTCTTTTGGTCAGATGCTTTGGAACAAAGGGCAGTGGTAGTAACCAACAAGCATGGGGAGAAGCTCGTGGGAGTGCTGCATCACACGGGTTCAAGCAAGATCGTCGTATTGTGTCATGGTTTTATATCTACCAAGGTAACATTTGGAAAAATGCGTTTGTAATAAGTTTAAAGTGAGATGCGAACAAATGTTTGTTTAGCAGAAATGCAAGCGACATAAATTTGTGTGGAGATAGTTTGTCTTGTTGCTTCCCAATGTAAATTCACTTCTGTTTTCCAGAACGACAGTCTCATTCTTGACCTGATGGCTGCATTGACAAAGAAAGGGATTAGTGTCTTTCGCTTTGATTTCAGTGGAAATGGGTAAGTTTGCTCCAGAAAACCATGTCTTCCCCCAGCAATTTCAGTTCTTAGAAGAAGCTATAGTAATACTGCTTTAATCTTAGACTATGGGCATGGTTCTTTTTCGCATGAGTATGTCTTAGAATGGGGAGAATAGCTACTGTAGTCCCTAAAGTTTCTATGTAGGATCATTTTAGTCCCTAACCTTTTAAATAGTTCAAAGAAATCCTTAAACTTTGTCATAAGGCCTAGAATAATCCTTGGGTCCACCAAAATCGTCATATGGATATGCCATGTCATCATTCATGCAAAATCTATGATAAATTGTCTAGTTTACCTTTATGTATATCATAGAAAAATAAATGTAAGGGTGAATTAGACATAACCATAGGGAAAAAAATACTTTTCCTTTTTTTCACCCTTTTGACGTATATTTTTGCTCTTACATATACCATATATTTTTTAATTTTTCCTTTTGTTTTTTATTTTCCTATGATATATGTAAATATAAATTGGACAAATCATATAGATTTTGCATAGGAGGGTGACATGGCATGTCCATGTGGCGATTTTGATGGGACCAAGGACTATATCAGCCCATGTGACAAATTTAAAGGACTTGTTTGAACAATATGAAAAATTAAGGACTAAAATGGCCCAGGAGCGAAACCCTAGGGACCATCTTGGCTATTCTCCCTCTTAGAATGTACAACTAATGATGGACTGAGACTTGATCTTCTTGTATCTGAGGGAGGTGCTTCTGTAATTCCGTTGTTCGTTTAAAATGTAATCCATTATGAAATGCACTTAGTGAAGCCTCATAGTACACACTATCTGACTTTTACTTGCATAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGGTGGACGGTAATGATGAATTGAGAGAAGCTTAGGCGGAGATTGGGGATCAATAAATGGAATTAAGGACGACCTTTGATCTTCATGTCAGTGATGACGGTTTTTTTTTTTTGTTGTAATTGCTCTTTCAAGTGGCTTTGATGATGCAAAATAGAGATTCAAACGTGCTGGATTTTAATAACAGTGGGCCAACGACGGGAAAGTGGAAGGCTGTTTAGGTGAACCTGCTTACATGGGCCTAATTGGTGTAGACGGTGGCGCCATGTGCAGTCTTGAAGCGTTGATTTAAGATCTAACGGTGTCAGCTAATTAGGGTGACGTGGCTCATCCTCAGAGCAGCTTTATAGCTAGTGGGTACCAACTATATAAAAAGAATAGATACTAAGAGAAAAAAAATTAAAAAACTCAGTTAGTAATTGTGTCAATAACAAACTCCTCAAACCACCAGCAACCACTAACTGCCACTCCACACACCGCCAGCACCACTCTTTCTCCATGAGCCACCATCGTTCCTCCTCTTCATCTTTTCATGCACAACCACACCCTCTACTTATGGACATGTCTTTTTTCTTATCCCCTGTTGTCATGAACACTATTAACTATTATTATGGTTGTTGTTGAGGTCTGGGGTGTCTGGCTTGCAGGGACTCGGGGAGACAGGAGCCGACCTGACAAAGAGCGGAGACGCTAGATCCGGGCTCCTTCTTGCTGTATCTAGCGGTTCCCCAACTGTCAGAGGGAAAAACAAAATGGAGAGAAAGACTTAGTGTGCGGAGTGGTTGCTAAGTCACCAGACTTGGAGATGGATAGAATAGGGTGGTCCAAATTGAAATGTAAAGTTAGATGTTGTGCAGATGAAAAAATGGTTAAAGGATAATATAATATGAAAACTTTTAAGAATACATAGCACAAACTGTAATTTTTTTCTCTCTAGCACAATTGAAGATAAGTTGTCCATTACCCGATAGTTCGTGAGATGCTAAGTATGGTTAATGGTTAGGCCGGTGTACTTAGCTTTTTCTAATAATCCTATGATATGTTCATGCATGATGATACAAACTTCTACTAAGATAGGCTAATTAATTATGGTCAGATAGATCGGCTAAAAGAAGATAAAAATAATACATCAATTTTGCTCAATAATAAAGCATTTGTCCTTGGTCTCCTTTTCTCAATGCATGATATATGATGACTATATCAGTAGGTATTTCCATAATTCTTTCATATTGTTTCTTATTTTCTACATATTTGTTAATTTGTACTAATATTTTTTTCTCATAATTAAATAGATAATAAATTATTTTTTCATATTTCTCCTATAAAATGTGAATAGGGCATTGTATAATTCGAAAATTATATTATAAGTGTATATAATTTAATAAAATTATATTATAAGTATATATAACTTAATGTGTAAGATATGCACTTATAGTATAAAATTTAACTTTTTCTAAAAATACCGCACCATAATAGATAATAGATAGGTAGTTAACTGAACAATTATGAAAAAGTAGAGAAATACATTGTGTGCCACTTGATTTTGTCCATGGTATACAATATGTTGGGTTTATCAAGTTCTAATATACCATCACATTTTGCTTAATTTGTGGCGACAGATTTTTAGCAATACCTAGAATATACCATCGTCGTCTAGTTAGTTTCCGTTAGTATTGTACAATTTTATTATTATGACTGAAATACCCCTAGGACGAAAAATTCCAATATCAGATTATAAAATTTCAAAAGTCTGAGATGGATAACTTTCATGCATAATTTATAATATGATACTTCCTACGTTTCACAACGTAAAACTTTCTAGAATTACTTAAATTTATATAAATGTTAATAAATCTTTTAAGTTGAGCGTATGATTGAAATCATCACTGAGAAAATCGAGGAAATTTCCTTTTTTCCCTTTCTTGAGAGAAAATTCATGCGGTTTTAGTTTTGACAAATGATTTGAAATCCCCAACAGTTTCGAGTTGTGTTGGTCGATTCCCCATGTGATCGTATCCGGCGGGTGTAAGTGATTAACCCAACAAACTCAACTCATTTAGGTGTTGTTCGGTTACGCCCGGATTTAATCCAGACCGGGAATAACAAGTATAGTAAAAAAATATGATAGATACAATGAGAGACCGTGATTCATTCCGGGTCAGGAACCAATTTACTTATGATAGGAACAACAAAACATCCGTATTAGTTCCACACCTCTTAACTAGTGGATTGATTCCCGGTCTCTTATTATTCCTATCATGAGTAAATTGATTCCCGACCCGGAATAAATCCCGGTCTCTTATTGTATCTACATAAATTTTTTACTGTATTTGTTATTCCCGGCCCGGATTAAATCCGGGCGCCGAAGAAGGCCTTACGGGTTACTCCCTCCGTTTCAAAATGTTTGACTCCGTTGACTTTTTAGCACATGTTTGACCGTTCTTCTTATTAAAAAATTTGTGAAATATGTAAAACTATATGTGTACATGAAAGTTTATTTAACGATTAATTAAATGATATGAAAAAAATAAATAATTACTTAACTTTTTTTAAATAAGACGAACGGTCAAACACTTACTTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTCGAAACGGAGGGATTATTAGTTATTACTCATCGGTACCCTTGGTACGGAGCGTTACGCAGCCACTGGTGAGCACATCCGCCGCAGCAGCTGCGATTCCCTCGCCTCCTCCCGCGGTCACTCTTCCGCCTCCACGCCGGCGAATCCCCCCGCCCCTCGCCGCCGGAGCCCTCCTCTGCAACCGCACCGGACCGCGGGGAACACGGCCCCTACCCCCGCTGGCGATGTCCCACCCGCTCTCCTCCGAACCTCGTAAGCGCCGCCCCCCTCCCTCCCCTCCATGCGCCGTGTCGTGTCAGCATCCTTCAACAATCAAAAGCAAGCAGGAGATTAGTTGATATATGGGCGTATCATTCATATGGCCTCAACTAGCAAAACTCTGGCAGTTGATTGCTAGTATCATGTTTCGTCTGATATTCGGTCAGAGTTGCTGAAAATATGTGCTGCTCCCCATTTTTTCCACTCTTTTGCTCAGATGCTCTGGAACAAAGGGCGGTGGTAGTAACCAACAAGCATGGGGAGAAGCTCGTGGGAGTGCTGCATCACACGGGTTCAAGCAAGATCGTCGTATTGTGTCATGGTTTTATATCTACCAAGGTAACATTTGGAAAAATGCGTTCGTAATAAGTTAAGTGAGATGCGAACAAATGTTTGTTTAGCAGAAATGCAAGCGACATAAATTTGAGTGGAGATAGTTTGTCTTGTTGCTTCCCAATGTAAATTTCACTT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