BGIOSGA001299

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA001299

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA001299, complete gene.

LocusTag

P0710A02.28-1

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA001299-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA001299-PA

Length

9994

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 1

Location

Chromosome 1:25802726..25812719

Sequence Coding Region

25812690..25812719,25812295..25812581,25811989..25812128,25811290..25811371,25811039..25811189
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,25807670..25807738,25807045..25807131,25806538..25806597,25805787..25805902
,25805332..25805389,25805162..25805261,25803728..25803783,25803165..25803644
,25802888..25803033,25802726..25802804

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:25802726..25812719 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:25802726..25812719 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGACCGCGTCCTCGAATCCCTCCAGCAGGGGAAAAACGCGCTGCTGGAGAGCCCCACGGGGACGGGGAAGACGCTGTGCCTCCTCTGCTCGGCGCTCGCGTGGCGCCGCACCTTTGGGGAGTTTCTGCGTGGAGGCGGAGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGAGCCAGCAGCCGCCGTATGGGAGCCAGCCTTCTGGGAGCCAGCACTCGGGGGGTTCGGCGTCGCAGTCGTCTCGGTACCCCGTGATCATCTACGCCTCACGGACTCACAGCCAGCTCCGGCAGGTCATCAAGGAGCTCAAGGCCACCAGTTACAGGCCAAAAATGGCAGTACTGGGCTCCCGCGAGCAGATGTGCATCCACGAGGAAGTGAGCAAACTCCGGGGAAGGCAACAAAACAACGCCTGCCACTACCTCTGCAAGAAACGGTGGTGCCGCCATCACAACTCTGTCGCTGAATTCATGAGGAACAACAGTGAGCTTGGGAGTGAGGCTTGCGACATTGAAGACTTGGTTAATATTGGGAGAACTAAGGGCCCGTGTCCATATTACATCTCCCGGGAACTTTCCAAGTCGGTTGATATTCTTTTTGCTCCATACAACTATCTTATTGATCCAGGAAATCGACGTTCTTTAAATGGAATACCATGGGATAATGCAGTACTTATATTTGATGAAGCACACAACTTGGAGAGTATATGTGCAGATGCTGCATCTTTTGACTTGCTTCCCAATAACCTCTCTTCTTGCATTGCGGAAGCTCAGGAATGCATCCAATTGTGTTCAGCAAAGAGGACCTTTGAAAATTCTGCTGATAAACAATTTGACCCTGAAAATTATGCTATTCTCAAAGCCCTTTTAATGGCACTTGAAAAGAAAATTAGTGAGGTGGTGATTGATTCCAAGGAGCTGGGCCATACAAAACCTGGCAATTACATATATGAGTTCCTCTCTGAACTGAATATTACTTCTGAAACATCCAAAAAGCTAATTGACACAATTGATGGTGCTTCTCTATTACTTGAGGAAGGAAATTCTGCTGAAACTGGACCTGGGATGAAGGCGAAGGCTACTGTCTGTAGATTGGAAACAATCAGGGACATTCTTGACATAATTTTTAGAGGTGGTGGTCAAAGCCATGCAAAGTATTATCGTTTTCATGTGAATGAATGCCAACAAAATTCTGGAGATGCTCTTAAAGTTTTGGGTAAGGTATCAAGGACTCTTAGTTGGTGGTGTTTTAACCCAGGGCTTGCTATGGAAGAGTTTCTCAAGTTGGGTGTGCGCTCGATTATATTAACATCTGGCACTTTATCTCCCTTGGATTCACTTGCCCTGGAACTAAACCTGGAATTTCCAGTTAGGCTAGAGAACCCACATGTCATTGCTTCAGATCAAATCTGGGTTGGAGTTGTGCCTGTAGGCCCATCAGGACATCCACTTAATTCTTCTTACCGGACGCGTGAGACTCTGAAATACAAACAAGAATTGGGTATAACTATTGTTAATTTCGCCCGCATTGTACCAGATGGTCTGCTTGTTTTCTTTCCGTCATATTCTATGATGGATAAGTGTATCAACTGCTGGAAAGATAGGAACCATGAAAATTCAAGTGATGAGCACACAATTTGGCAACGAATCTGCAAGCACAAGCAGCCAGTTATAGAGCCTAGGCAGTCATCGAACTTTCCAAATGCAATCGAGGATTATGCAGCCAAGCTACGTGATTCTTCTACAACCGGGGCAATATTTTTTGCAGTTTGTCGGGGCAAAGTTAGTGAGGGTCTTGATTTTGCTGACCGTGCTGGAAGAGCTGTAATAGTTACTGGAATGCCCTTCGCTACCCCAACTGATCCTAAGGTTCGGCTCAAGCGTGATTATTTGGATAAGCTGGGTTCAGCATCTAACAAGAACTCAAAGGCTTTGACAGGGGAGGAATGGTATGTACAACAAGCGGCAAGAGCTGTCAATCAGGCTGTTGGACGTGTCATTAGACATCGCCATGACTATGGAGCAATTATTTATTGTGATGAAAGGTTTGTTTGGCAAAATTATCAATCTCAGATGTCATATTGGCTGCGACCTTACATAAAGTGCTATAAAAAGTATGGGGAAGTAGTCCAAGGGTTAACAAGATTTTTCCGAGATAAAGTGTCTATTGATTCTTCAAAGCCAAATGAGACAGATTTTAATGATAATATTGTACTGCTTGCAGACAAACATAAACCTCAGGAGACTATATCTGCTTTGGCTGTCACCACAGCAAATGAGAACCAGAGAACTGCATTATCTGTGAATCCAACCACCAAAAGAAGTAACTATATCAAGTTTGCCCAGATCACTCCTGCCAATCGCTCTACCCTTTCTATGAAACATGGCTGTTCATCTACTTCGCAGCTCTTATACTCAGGAGACAAACTGTCTACGGATGCTCAGGTTATTGATTTGGCTGCTGATGTGGCAACAAGTCATCTTGCAGGATATAGATTTAAGTCCTTAGGACCTAAAAAGGCTAAAGTAATGGTTGGATCCAAAGATGTTTGTTTTGATGATGGATCTCCAAAATTGCAACATAATGTTGAGTCAAGAGCTTTGGCTGGGTGCTTGGGTGAGCAATCTACAGCTTCATCAAAGAAGAGTAATATTACACATGCACCTGGAAACAGTGGGGCTATTCATGAGAAATCTGGAGGCCAGGAATCTAATGCAGGGCCGGCCTTCTTGAAGCTGGCTCGAGAAAAGCTCAGTACTGCAGAGTACAGAGATTTTGTTGAATATATGAAGGCCTTAAAATTGAAAACCATGCACATAAAGGACTCACTTGATGCAATAGCAAAACTGTTTTCGTCTCCAGAGCGACTCCCACTTCTTGAAGGGTTTAGGGTTTTTGTTCCTAAGAATCATCTTTCATTATATGAGCAGCTTGTTCAAAGCTATACTGTGCCTAATACATGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MDRVLESLQQGKNALLESPTGTGKTLCLLCSALAWRRTFGEFLRGGGGGGGGGGSQQPPYGSQPSGSQHSGGSASQSSRYPVIIYASRTHSQLRQVIKELKATSYRPKMAVLGSREQMCIHEEVSKLRGRQQNNACHYLCKKRWCRHHNSVAEFMRNNSELGSEACDIEDLVNIGRTKGPCPYYISRELSKSVDILFAPYNYLIDPGNRRSLNGIPWDNAVLIFDEAHNLESICADAASFDLLPNNLSSCIAEAQECIQLCSAKRTFENSADKQFDPENYAILKALLMALEKKISEVVIDSKELGHTKPGNYIYEFLSELNITSETSKKLIDTIDGASLLLEEGNSAETGPGMKAKATVCRLETIRDILDIIFRGGGQSHAKYYRFHVNECQQNSGDALKVLGKVSRTLSWWCFNPGLAMEEFLKLGVRSIILTSGTLSPLDSLALELNLEFPVRLENPHVIASDQIWVGVVPVGPSGHPLNSSYRTRETLKYKQELGITIVNFARIVPDGLLVFFPSYSMMDKCINCWKDRNHENSSDEHTIWQRICKHKQPVIEPRQSSNFPNAIEDYAAKLRDSSTTGAIFFAVCRGKVSEGLDFADRAGRAVIVTGMPFATPTDPKVRLKRDYLDKLGSASNKNSKALTGEEWYVQQAARAVNQAVGRVIRHRHDYGAIIYCDERFVWQNYQSQMSYWLRPYIKCYKKYGEVVQGLTRFFRDKVSIDSSKPNETDFNDNIVLLADKHKPQETISALAVTTANENQRTALSVNPTTKRSNYIKFAQITPANRSTLSMKHGCSSTSQLLYSGDKLSTDAQVIDLAADVATSHLAGYRFKSLGPKKAKVMVGSKDVCFDDGSPKLQHNVESRALAGCLGEQSTASSKKSNITHAPGNSGAIHEKSGGQESNAGPAFLKLAREKLSTAEYRDFVEYMKALKLKTMHIKDSLDAIAKLFSSPERLPLLEGFRVFVPKNHLSLYEQLVQSYTVPNT</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..30#139..425#592..731#1349..1430#1531..1681#1883..2045#2182..2358#2562..2686#3221..3272#3880..4021#4381..4535#4627..4718#4795..4902#4982..5050#5589..5675#6123..6182#6818..6933#7331..7388#7459..7558#8937..8992#9076..9555#9687..9832#9916..9994#ATGGACCGCGTCCTCGAATCCCTCCAGCAGGTAACCCCCCAATCCCCTCCGATTCCCCCCCGTCGGCGCGGAATCGGAAACCCTTCGATTCCATTCGATTTGAGTGATGGGGGCGAGCTCGCCGGATCGATCCGACAGGGGAAAAACGCGCTGCTGGAGAGCCCCACGGGGACGGGGAAGACGCTGTGCCTCCTCTGCTCGGCGCTCGCGTGGCGCCGCACCTTTGGGGAGTTTCTGCGTGGAGGCGGAGGCGGCGGGGGCGGGGGCGGGAGCCAGCAGCCGCCGTATGGGAGCCAGCCTTCTGGGAGCCAGCACTCGGGGGGTTCGGCGTCGCAGTCGTCTCGGTACCCCGTGATCATCTACGCCTCACGGACTCACAGCCAGCTCCGGCAGGTCATCAAGGAGCTCAAGGCCACCAGTTACAGGTGAAGCCCGATGGCGAGCAAATTACGCTTATCTGTCAGTTGTTTTTATCTAAGCTAACTGCGCCGGATGTATGCTGTTCTGTAATTCCATTTGAATGTCTTTGTCTTGGAGGTCTGGAGTAATGGAGTTAGTGCCCTCGCACTATTAACTCGTTCAGTTTTGTAGGCCAAAAATGGCAGTACTGGGCTCCCGCGAGCAGATGTGCATCCACGAGGAAGTGAGCAAACTCCGGGGAAGGCAACAAAACAACGCCTGCCACTACCTCTGCAAGAAACGGTGGTGCCGCCATCACAACTCTGTCGCTGGTAATTGCAATAGGATCCTTGTTACATATAACCATAAAATTTATCTCTGCACATAAAGTTAAAGCCATGGTAAATCCATGCACACCCACACACATTAGGCATTTCTGTATCATAGGCCCATTTGATTCGTACAAGAAGTTTATTGTCAATGCCACAATCAACAACTTGAATGCTTGAGTCATATAAGTTATCCTTCAAGTCAGATGTTACTGCCGCGCTGATGCTTCTGTAGTACTACCCGTGATGACAAAAAACATATCACCCTTGAATGCACAGTCAAACTATATTTATTTTGGCGAGAACTGCTGTCTAAATGTATAAAATGTAGTTCTGATATTGGAAAATGGTATGAGTAAATTTGATGTGGAAGAACTACCGTGATATTTTACAAAGTTTTCGAATAGACAATGGTCAACTTTAGTGGTTAAAGGGACATCTTGCTTTTCCTTCATAAAAGGGACACCTTGTTGACTTTGAAAATTCAAAACAACTTATTTTTGTTGTCAAAGGAAGTATCTCCCTATGTTCCCATGCTGGCCTGTCCATGTTAGGTATTTTGTTGTAGTTTCTTTTAAACAATTCTTTTACAGATTAACCATATGTTGCTTATCCTGTAGAATTCATGAGGAACAACAGTGAGCTTGGGAGTGAGGCTTGCGACATTGAAGACTTGGTTAATATTGGGAGAACTAAGGGCCCGTAAGTTTCATATTTCATCTGCCCTAACTTGCACACCACATGCACACAACAGAACGCCTACAGATTTTGCTGACTACAATTGTTTTATTTTCCATTTTAGGTGTCCATATTACATCTCCCGGGAACTTTCCAAGTCGGTTGATATTCTTTTTGCTCCATACAACTATCTTATTGATCCAGGAAATCGACGTTCTTTAAATGGAATACCATGGGATAATGCAGTACTTATATTTGATGAAGCACACAACTTGGTATGGAAATACATGCTCCAGTCCTTTGTTCAATCTACAACTATCTGAATATCTGTTTGCTTTAGTGTTAAAACTCTCTTTATGCTTAAGACTTGAGTTAAATGAACCAATCGCAATATTATCTATATACATAAGTTTCATTCAATATATGTCTGGTTATAGTTCTGTTTGTTTCGAATTTACCATTACCCTTTTATGCAGGAGAGTATATGTGCAGATGCTGCATCTTTTGACTTGCTTCCCAATAACCTCTCTTCTTGCATTGCGGAAGCTCAGGAATGCATCCAATTGTGTTCAGCAAAGAGGACCTTTGAAAATTCTGCTGATAAACAATTTGACCCTGAAAATTATGCTATTCTCAAAGGTGAACCATATTTCTTCTTACAGCAGCAAATCATACCTGTATCCATATTCTTAGTTAGAAAGTGTTTACCTATGTTAATGATTCGGACTGTGAGATTTCGTACTGTAATAGACTAATAATCAAACTTTTTCCCCAGCCCTTTTAATGGCACTTGAAAAGAAAATTAGTGAGGTGGTGATTGATTCCAAGGAGCTGGGCCATACAAAACCTGGCAATTACATATATGAGTTCCTCTCTGAACTGAATATTACTTCTGAAACATCCAAAAAGCTAATTGACACAATTGATGGTGCTTCTCTATTACTTGAGGAAGGTAATCAATTTTTCCAGGTTTCTTCTTTCCACTGAAATGTACTATTCCATTTTCTCGATCTGAATAGTTACTTTAAGCTTTCATTATTTTTCTAGCTCTAAGTGTTACCTTAGTTGAACATATTGAATTTCTGATAACTATTGATAATTGTTTGCCGGTTCATGCAAAGCAGTTGAGTGTCTGTATTTTTCCTGCACACTTAGGAAATTCTGCTGAAACTGGACCTGGGATGAAGGCGAAGGCTACTGTCTGTAGATTGGAAACAATCAGGGACATTCTTGACATAATTTTTAGAGGTGGTGGTCAAAGCCATGCAAAGTATTATCGTGTAAGTTTCTCTACCTTAGATAAGTTCTGCTGCTTTCTTCTGTCATTTAATGTTTGCAGCAACCATGCACAATAATATATGATATATACATCTCTCTCTCTCTCTCCCCCCCCCTCTTCCTGACTTCCATTGTCCCTGTTTAGAAGACAGGAAATTTTCTCAATTTCTTGAACTGTTACCTCCAAAATTCCTGTGTTCCAAGTAGGGCTTCAGTTTTTTCATCCTAGGGGTGCAAGCGGGCCGACCCGCGAGTTTAAATAAATAATAATTTATGGGTTTTCGCGTCGCGGCCTGGCTTGCCGCATCTAAATATACAAGTGGATCAATTTATAAACCCATTTATAAGTCAAATTCATAGTTAACCCGCTAGTCAAACCGGCGGGTTACACACTATTTTTGCCTATAAGCGGGTTCGCGGGTAAACCCACTTGCACCCCTATTTCATCCTACCTCTTTTCACACTTTACTGTATAAGCTTGCATACTCTGCTGGAATTTTATGCTTTTACAATTGCACTCATTCTTTTCATTCCAGTTTCATGTGAATGAATGCCAACAAAATTCTGGAGATGCTCTTAAAGTTTTGGGTAAGTTCACTCGTATTATGGTCACTCGTTATTTAAATCTGGTTCAATGTTTTCATGGCTCTGTAGCTGATGCCCATATCTTCTTTTGGTACTAATAATTCATACTTATCTAATAATATTCATCCAAATGCTAATAATTCATACTTATCTAATAATATTCATCCAAATGCTCTCATGCTGTCACCTGACAATTGTTTTTTTCATATCCGTAGTGTAAGCATATTTTTTTTATAGATTTGTATCCATTTAATGGTGGCAGAAGCTGCAAGATCTGCCTTCAGGAGTTGTGTCCAAGCTGACCTCATTTAGTTGCATCAATATTGTACAACTATCTCTTAATGGTGGAATTTACAAGATCTGCTTTTAAGATTTGTCTCCAAGCCTGCAGCATTTAGTTGCATACTTGCATCAATATTATATGTATAATCCATGAGCAAGAGTTAATTGCTCTTTAACTTCCATTGTTTGTATTCGTTCTTCTCTATTTCCATACGCTTAACTCGACTCCTGATACAATTCCCTGTAACCCGAAATATTTAAAAGTTAACATTTGAGTCAGTAATTGTTTACTTATATACTTAATTCTCTAGATTTTCTTATATTGCAGGTAAGGTATCAAGGACTCTTAGTTGGTGGTGTTTTAACCCAGGGCTTGCTATGGAAGAGTTTCTCAAGTTGGGTGTGCGCTCGATTATATTAACATCTGGCACTTTATCTCCCTTGGATTCACTTGCCCTGGAACTAAACCTGTAAGAACAAAGAAGTCTAAATTTTACTTTTATTTTTACTTAATTATCAGCTCACTCAAATTTTATATGTACTCCCTCCGCTCCAAAATATAAATATCTGTACGTTTTTTTAGCAAAAACTAAGGTAGATGGAAAAAAAAATCTCTTTTAGTCACAGTGGTCAAAATTTGAATTGTTTAGATTCTCTTCCCAAGCATCTCATTGGCTGAAAATGTATATAGATTTCCGTGCATTTGAATCAGTGCCCCAGAAATGCTTATATTGTGGTACAAATTTTGAATACTAGAAATGCTTATATTTTGGAACAGAGGGAGTTTTTGACTATTGAATGTTGAGGTCATATGTTTTCATGAATCCAGGGAATTTCCAGTTAGGCTAGAGAACCCACATGTCATTGCTTCAGATCAAATCTGGGTTGGAGTTGTGCCTGTAGGCCCATCAGGACATCCACTTAATTCTTCTTACCGGACGCGTGAGACTCTGAAATACAAACAAGAATTGGGTATAACTATTGGTAGGCAGTTGAGAACACCTAACAGTATGCAGCTGTTTGTATTTTGAAATACCTTTACTGTATGCATCTGATTTGGATACTTGTTTTGCAGTTAATTTCGCCCGCATTGTACCAGATGGTCTGCTTGTTTTCTTTCCGTCATATTCTATGATGGATAAGTGTATCAACTGCTGGAAAGATAGGGTATGTGTAATTTCAATGAGTTAT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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA001299