BGIOSGA004868
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA004868 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA004868, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_04564 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA004868-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA004868-PA |
| Length |
5946 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 1:41089417..41095362 |
| Sequence Coding Region |
41089417..41089586,41089935..41090094,41091719..41092002,41092128..41092215,41092741..41092809 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome01:41089417..41095362 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome01:41089417..41095362 source=RiceIndica01 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGATAGCGCGGGCGTTTGGCCTTGTGGGCAAAGCATGGAAGCGAACACCGGCCTCGACGCCGCCGCGCCGCCGCTCCGACTTACCGGCGCTGCTTCGTCGCCTCCACAGCAGGTCGGCACAACCGGAAATATTCCGCGAAGAACGGCCCCAGCTACAAAATAATAGCGGGGATACTGTTGAGGGGAGTTTTGATCAGAGGTTCGCAACACTAAAGAGCATTGGGGAGGACCGTGTCAAAGACAGCGAGCTTGAGTTACTGCTAAAGAAGAAATCTGCCCCCGTTTGCTATGTTTGGTGTGATCCCACCCCCTTTATGCGCATATCCCAGGGGATCATAACGACTCTTTCTGTTAATAAGATGGTTAAATCTGGTTGCAAAGTTAAAATCCTAATGGCAGACTGGATTGCCCAGATGAACCGTAATATTGGTGGCAATCTAAGTGAAATGCGGACTATTGGCTTGTACAATATTGAGATGTGGAAAGCAGCTGGTATGGCCCTTGATAGGGTAGAGATAGTGTGGTTGTCAGATGAAATAAGTCGGCTTGCTGATGAATATTGGCCACTTGCCATAGATGTTGCAAGAAAAACCACTGTGAGTATAATAAAAAGGTGTTGTGGGAGAGATCTAATTGAAGAATTCACTGCTGCTGATATATTTTACCTTTCTTTTCAGTGTGCTACCATATTATTTCAGAAGGTTGACATATGGCTCTTGGGCATGGATCAACATGAGGCCAATTTGTTAGCTAGAGAATACTGCAAGCATGTTGATATCAGTAGAAAAATAAAACATGCTTTCTGCCCTCCAAAATTAGCAGAAGGCAATCCATGTTTGGAGTACATAAAATATATCATCTTACCATGGTATGGAAAGTTTGAGGTGGTTCGGGAGAAAGAGGATGGTGGTAACAAGACGTTCCTGAGCATGGAGGAGCTTACTGCTGATTATGTAAGTGGGGTTCTGCATCCTGGTGACATGAAGCTGGCTCTCGCAAATTCATTAATCAAAATATTGCAGCCGGTCTATGATCACTTCAAAAGCAATGCTGAAGCCAAAAAAGCACTGCAAGGCATTGAGGATATATAG</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MIARAFGLVGKAWKRTPASTPPRRRSDLPALLRRLHSRSAQPEIFREERPQLQNNSGDTVEGSFDQRFATLKSIGEDRVKDSELELLLKKKSAPVCYVWCDPTPFMRISQGIITTLSVNKMVKSGCKVKILMADWIAQMNRNIGGNLSEMRTIGLYNIEMWKAAGMALDRVEIVWLSDEISRLADEYWPLAIDVARKTTVSIIKRCCGRDLIEEFTAADIFYLSFQCATILFQKVDIWLLGMDQHEANLLAREYCKHVDISRKIKHAFCPPKLAEGNPCLEYIKYIILPWYGKFEVVREKEDGGNKTFLSMEELTADYVSGVLHPGDMKLALANSLIKILQPVYDHFKSNAEAKKALQGIEDI</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..170#519..678#2303..2586#2712..2799#3325..3393#4316..4461#4698..4803#5673..5732#5938..5946#ATGATAGCGCGGGCGTTTGGCCTTGTGGGCAAAGCATGGAAGCGAACACCGGCCTCGACGCCGCCGCGCCGCCGCTCCGACTTACCGGCGCTGCTTCGTCGCCTCCACAGCAGGTCGGCACAACCGGAAATATTCCGCGAAGAACGGCCCCAGCTACAAAATAATAGCGGGTAAGATCTCCGTGCCTGTTTCATCTTGGAGTGGGATCGATTTTCGGTGTGGTTGGAGTAGATAAACTCACTCATGCTCGGAAAAGAACGTTAAATCTCATGAGTTGTTATGATGAAATTGGGGAAGGAAAAAATACATCTTTCTCACCGCAACCTGATTATTTTGCTACTACAGAGGAGCTCCGCCAAGGCTGGACTTAATCTCAGAACAAAACTGGAGCAAGCAGTGCTATAAATGTCAACACTATGACTTGAGCCGATTCTGCCGTCGACTCTATTAGGTAACCTTGCTCTTCTGAACTTCAATCTTGACCCAAGCTTTGTAATGTTACGATTGTTTACATCCAGGGATACTGTTGAGGGGAGTTTTGATCAGAGGTTCGCAACACTAAAGAGCATTGGGGAGGACCGTGTCAAAGACAGCGAGCTTGAGTTACTGCTAAAGAAGAAATCTGCCCCCGTTTGCTATGTTTGGTGTGATCCCACCCCCTTTATGCGCATATCCCAGGTATATGAACGAATATATTTTTCGTGGTAGCATTTTTAAATTCTGCATACTGAAACTGGTAAATTTCTATGAATGAATTATCCACATCAACTGTATTGTAGTCCTCCTAAGGAAGAACGAGGATAGTCTGATGAAGATAATACACTTTTAGTCTGTAATGGATTTCAAAAAATTAAAATTTTGATGAATCATGAATGAATATGTTTTAGACTGGTTTTATCTTTCAGAGAGCAATCATCAATGCCTTACAACCCCTCACAACAGTAACGACTTGAAGTTTGGACTTTGGAGATGGAAAAAGAAAAACTAAATGTACAATCATTTGGGTTGCAATGCAATTTAAAAGAACTAAAGAACTTTGCTTTTTTACATCACTTGGATTCAGGGAGTAAAATTGAACTAGCATGTTTCATTGAAAAAATGTGATGGCTTAGGATTATCTGAACGATTCTAGAACATTCTTAAGTCTTCCTATTAGTGAAATATTCGGAAAGATTATAGGGTGGAGTGGCCTGACAATACCGTAGGGTGAAGATGCTACATGCCTGTTATTAACGACGTTCTTGCATCTAGCACTCTACTTGATAGTCTTTTTCTAACGACATTCAGGCAGGGGCTCTTAAGAAGATGACTTGCTTCCGCACCTTTGTTCGCAATCTCTAATTTCCTCCAACAGTATAAGCTCTTCCTCTTCTTCTTTTTTTTTGATTGGGGGTGGGGGGTGGGGTTGTTAATTTGGCACTTGTATAACTATGTAATGGTATTGGGTTAAGGATCCCTCTTGGTTTGGCTTCATGCAGTCATGCTACACCACTGAATTGTATATCTTTTCTCTAACACTATTTGGAAAATTTGGACCTGTATGTACGATTTGATTTACCTAATAAATCCACTTTCTAGTGAAATCTTTCCTGCTCAGGGTGTCAATTTTTTTCTTAATGATTTCCCAAGCTCTTTTTGCCAATGCACTGCTGAAGCCATCAGCACTAGATTCTCTACTACTCCCCCCCGTCCCAAAATATAAGCATGTTTAGTATAGTGTCAAGTCAAACAATTTTAATTTTGACTATTAATAGTAAAAAATTTAAAAAGATCAATCATGTAAAATTGATGTTACTAGATTTATCATTAAGCAAACTATCATTTAAAACATCTTATTTTTATATAGATATTGTTGGTCAAAGTAGCATCTCAAAGACAAGTCCAAAAATGCTTATATTTTGGGAAGGAGGGAGTATCTTTTGGCATACACTGTTATATCATCAATCTCATGCAAACAAAAGGTGTTCAAATACAGCTAGGAGGGATTTCCCTGGACCATAAATATCGGTTGGATCGAAGTGTAATTTAGTGAACTGTGAATATACCGTTGTTCCCTTTATCCTGATGATAATAAGCTTTCAGGGTGGATGGTTCTTGTGCTGATGTTGTAGGTCAATGGGCTGTGGAAAATATTAACTTTTGTTTGAGTGGTACTCAGCCAATTCATTTGCTATTTTAAATTACCCATTTAACCATTTTTATTTTGAGATGATGCCATCATGCCAATTATACTGACAAATTGCTCAAGTTTGTAATGCGATTTTCACTCTGAGTTTTGCACTGATCTATTCTCATGCTGCAGGGGATCATAACGACTCTTTCTGTTAATAAGATGGTTAAATCTGGTTGCAAAGTTAAAATCCTAATGGCAGACTGGATTGCCCAGATGAACCGTAATATTGGTGGCAATCTAAGTGAAATGCGGACTATTGGCTTGTACAATATTGAGATGTGGAAAGCAGCTGGTATGGCCCTTGATAGGGTAGAGATAGTGTGGTTGTCAGATGAAATAAGTCGGCTTGCTGATGAATATTGGCCACTTGCCATAGATGTTGCAAGAAAAACCACTGTGAGTATAATAAAAAGGTATATTCTTGTTTGGATCATTTGTAAAAATGTGTACTGTTACTTGTCAACCTTTAAATTTGGTCGTCAAATCAAATGAAGGATCATTTGAATGTACAAGTTGTTTCATTTCTGTTTACCCACAGGTGTTGTGGGAGAGATCTAATTGAAGAATTCACTGCTGCTGATATATTTTACCTTTCTTTTCAGTGTGCTACCATATTATTTCAGAAGGTTATTTTTTTCCCTCTTTAGAAATATATCAACCTTATGCAATTTCAAAGTAACATGCCACAGATATGAGTTTATTTACTAGCAAAATCTTGATTTACCATGGCGCATGCGTACCACCTTCATACAATGTAGCGTTGCCCCTGAACCTTAGGATGTTTGTTTGTCACCATCTCTGTTTGTCACCAAGGGTAGTTATATTGATATGGAGTCATAGACTAGTCCAACCTTGCTTGCTTCCCATTGATTTTGGACCTTATAGATTCTTGTGCGCGAGGCATATTTGATCTATATTTTCTATGGCATAGCATAGCTTTGTGTTGGTTCTTGTTTAGATGATGCACGTGTTCAGTTTCACTAAACTGTTACTGTGCAGGTCTGTATAATAAATTCTGCAACCACCATATCCAGTAAATTAGTAGTCTCAATATGCTTCTATATTTTTCCTGACACGTATAGTTTTTATATCGAACTTTTTAAAAGCATTATTCATGTACATCTATGAATTCATGTACATTTTGTATTCAGGTTGACATATGGCTCTTGGGCATGGATCAACATGAGGCCAATTTGTTAGCTAGAGAATACTGCAAGCATGTAAAAAGGCGGAACAAGCCAGTTGCAGTGTCACACAGTATCTTTAGATGTTCTATCTAGTTGATATTCCAATCTGTTTTATTGTGGATGAGTGGTCTAATTTGGTATTTGGTCCTTATATAATGGTAATTTATGTCGAACACATACATGCTGACACACATGCACGGGTATACCAAAGCATACTCAGACACACATCCTTAACATAAAGTTCAGAAAAGCTTCCTAATTTATTACAATATCCTGAAGAAGAACATAGGAGGAACCCATTCCTAGCCATCTTCATGGATGATTCTACGGTTCGTATTGTGTTATTAGTATGTTCAGCTTTGTTAATATTCTATTGGTTGCATTGTTTTATAATTTTATTTCAAATATTTAATACAAGAGCTAGTGAAAGGTTCTTGCAACTCTTGCTCACTATTTATAGGCCAACATAACTATAGTGTAAGGTAGCCCATCTTGGTTCAGGAAGATGGGCAAAAATAGTTGACTTTCCATGCCTATGGGTTATGCAAGAGTAATGGTACAATTTGCATGGTTCAGTTAGATGCAAATATATATTGAATAGAATAGTAAAAAAAAAGTGATTTTTTATTAATTCTATTATGGATACCTCATAATATCTATTCAGAAGAAGCAACTTCTCTTATGTATTTTAAAAAAGGAACTAGTGTCATTAACCAGTTTGTTTTGGCCTTTTTGTTGTTGGAGCCTGTATGTGAGATTAATTATCTTGCCCGGTCAAAAAATATAATTATCCTGTATGTTGTTTAACATTTTGTCAACCAATTTAACCATAGAGGTACAGACATTAGCTGCTTTATATTGTTTACTGGCTGATGTTTGTCTCAGGGAATCATTGGTTTTTGTGATTGATAGTTTTACAAATGAGTCTGTTCAATATACGTTTAGTGTATTGCAGGTTGATATCAGTAGAAAAATAAAACATGCTTTCTGCCCTCCAAAATTAGCAGAAGGCAATCCATGTTTGGAGTACATAAAATATATCATCTTACCATGGTATGGAAAGTTTGAGGTGGTTCGGGAGAAAGAGGATGGTGGTAACAAGTAAGATTCTCTCCAAGTCACTTCTCCATGTTTCCTGACAAATGCTTATAATCATGTAATTGACCAGTAGAATGCATTCATCCAGTTCATGACAACTCGACAATTAGTCAGGCATTAAACAAGTCACAACTAAATGAATTCATTCACAAAAGATCCATGTGCTAGTACCAGTGTCAGGAGATGATATTATCATTGCATTTCATTGTGATGACTATATATTGACTATAAATATACAGGACGTTCCTGAGCATGGAGGAGCTTACTGCTGATTATGTAAGTGGGGTTCTGCATCCTGGTGACATGAAGCTGGCTCTCGCAAATTCATTAATCAAAATATTGCAGGTAACCTTTTTCTCTCTTGCCTGGCAGTCATCTTTCTTTTGCCTGGGTGCTGCCATTTTGAGATTTCTCTGCATTTGCTATGATTGACAA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