BGIOSGA013067
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA013067 |
|---|---|
| Description |
cDNA clone:J013129E17, full insert sequence |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA013067, complete gene. |
| LocusTag |
' |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA013067-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA013067-PA |
| Length |
7720 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 3:25423461..25431180 |
| Sequence Coding Region |
25423461..25423814,25424326..25424490,25424764..25424853,25424955..25425083,25425514..25425614 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:25423461..25431180 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:25423461..25431180 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGAAGCGCAAGCAACGCAAGGCGGCGACGGAGCAGGAGGTAGAGAACCACGACGAGGCCACTGTCGCCGCTGAGGCGGGGCCCGAGAATGACGGGCACACGGCGCACGCCGCCGAAGAGGCTGCGGCCGCTGAGGAGGGTGTCGAGCGCGAAGGAGGAGGCGAGGGCGGCGCGGAGGGGGAGGAGGGCCCGGACGCTGCAGCCAGGGGAGGTGAGGAGGGCAAGGAAGAGGAGGAGAGGGAGGTGAGCTTTGACGAGCTTGGCTTGGACGAGCAACTGAAGAGGGCTTTGAGGAAGAAGGGCTTGGACAAGGCCACCCCGATCCAGAGAGAGGCCATCCCGCTCATCCTGGAAGGGAAGGATGTGGTCGCTAAGGCCAAGACTGGCTCCGGAAAGACCTTTGCTTACCTCCTCCCTATGCTGCATGAGCTATTGAAGTTGTCTGCAGAAGGGCGTATCCGAAAATCTGCTCCAAATGTTTTCATCCTTGTGCCAACTCGCGAGTTATGCCAGCAGGTTCATAATGAGGCATCATCTCTCCTTGAATTCTGTACATCCAAATTGAAGGTTGTGCAAGTGAATGCGAGCATGTCAGACAAAGATATTAAAGTTGCATTGTCTGGCCCCCCTAATATCCTTGTTACAACTCCTGCTTGTGTTGCATCATGCATATCAAAGGGCATTATCCGTGGATCATCTATCAAAGAATCACTATCAATGATGATTCTAGACGAGGCTGACCTCCTCCTATCCTATCGTTGTGAAGATGACATAAAAGCTCTCGTTCCACATATCCCAAGAAGCTGCCAGTCCATCCTGATGTCTGCAACGTCAAGCGCTGATATTGAGAAACTGACTAAGCTACTTCTGCACAACCCTTTTATTCTGACCCTTACGGAGGTTGGTCATGCGAAGGATGATTTGATCCCAAAAAATGTGCAGCAGTTTTGGATATCATGTGATGCTAAGGATAAGATGCTTTATATCCTTGTACTCCTGAAGTTGGAGCTTATTCAGAAGAAAGTTCTCATATTTGTAAACTCAATTGACTCGGCATTCAAATTAAGGCTGTTTCTGGAGAAGTTTGGGATAAGATCTTCAGTGCTAAATGCTGAATTACCACAAAATTCACGCCTCCATATCATTCAGGCATTCAATGCTAGGCTATTTGATTATCTGATAGCAACGGATGACAGTAAGTCTAAAGAGGAGAGGCAAGCCAATAAGGGAAACAAAAAGGATTCTAGGGTGTCACGCAAGCAGTTGCAGCAAACTTTAGATGCTGAATTCGGTGTTGTCAGAGGAATTGACTTCAAAAATGTATTCACGGTAGTTAATTATGACATGCCTCCAGATCCTGCTGGGTATATTCACAGAGTAGGAAGGACAGGGAGAGCAAATAAAACTGGTGCATCCATATCGCTTGTTTCACCAAAGGAGAATGGCATTTTTGAAGATATTGAAAATATGTTGAAAGATGTTGAAAATAGAGACACCAGTTGCATTTCACCTTTCCCATTACTTACAAAAAATGCCGTTGAGTCTTTACGCTATAGAGCTCAGGATGTTGCCAGGAGTGTGACAACCCGTGATATAAAAGAAGCACGTCGCCAAGACATAAAGAATGAAATCCTCAACTCTGAGAAGTTGAAGGCTCATTTTGATGAGAATCCGAGAGACCTTGATTTGCTCAAACATGATAAGTTATTGAGCAACAAGGAAATCCCTGCACACCTACGTGATGTCCCTGAGTACCTTATTGATCCCACAACAAAAGAAGCAAGCAATGTAGTCAAACTTTCAAGGGCTGCTATGGATATCGATAAGCCACGGAGGAGGAAAAGAATGGGATTCAAGGGAGGATCTGGCAGAAGTAGTGATCCCCTTAAGACTTTCTCTGCTGAGGGGAAATCACGGAGGCGAGGGAGGAAGGAAAGAGACGGAGAACAGGATAGAAGAAAGAGGAAGAAGGTGGAAAGCTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MAKRKQRKAATEQEVENHDEATVAAEAGPENDGHTAHAAEEAAAAEEGVEREGGGEGGAEGEEGPDAAARGGEEGKEEEEREVSFDELGLDEQLKRALRKKGLDKATPIQREAIPLILEGKDVVAKAKTGSGKTFAYLLPMLHELLKLSAEGRIRKSAPNVFILVPTRELCQQVHNEASSLLEFCTSKLKVVQVNASMSDKDIKVALSGPPNILVTTPACVASCISKGIIRGSSIKESLSMMILDEADLLLSYRCEDDIKALVPHIPRSCQSILMSATSSADIEKLTKLLLHNPFILTLTEVGHAKDDLIPKNVQQFWISCDAKDKMLYILVLLKLELIQKKVLIFVNSIDSAFKLRLFLEKFGIRSSVLNAELPQNSRLHIIQAFNARLFDYLIATDDSKSKEERQANKGNKKDSRVSRKQLQQTLDAEFGVVRGIDFKNVFTVVNYDMPPDPAGYIHRVGRTGRANKTGASISLVSPKENGIFEDIENMLKDVENRDTSCISPFPLLTKNAVESLRYRAQDVARSVTTRDIKEARRQDIKNEILNSEKLKAHFDENPRDLDLLKHDKLLSNKEIPAHLRDVPEYLIDPTTKEASNVVKLSRAAMDIDKPRRRKRMGFKGGSGRSSDPLKTFSAEGKSRRRGRKERDGEQDRRKRKKVES</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..354#866..1030#1304..1393#1495..1623#2054..2154#2512..2626#2873..3004#3636..3701#4058..4237#4476..4571#4691..4828#5793..5875#6178..6215#6299..6519#7643..7720#ATGGCGAAGCGCAAGCAACGCAAGGCGGCGACGGAGCAGGAGGTAGAGAACCACGACGAGGCCACTGTCGCCGCTGAGGCGGGGCCCGAGAATGACGGGCACACGGCGCACGCCGCCGAAGAGGCTGCGGCCGCTGAGGAGGGTGTCGAGCGCGAAGGAGGAGGCGAGGGCGGCGCGGAGGGGGAGGAGGGCCCGGACGCTGCAGCCAGGGGAGGTGAGGAGGGCAAGGAAGAGGAGGAGAGGGAGGTGAGCTTTGACGAGCTTGGCTTGGACGAGCAACTGAAGAGGGCTTTGAGGAAGAAGGGCTTGGACAAGGCCACCCCGATCCAGAGAGAGGCCATCCCGCTCATCCTGGTGCGTGATTTCTTGCATCCATGCTTTGTTTTTTTTTTGCTTTGTTTTGTTGAATTACTGGAAATATTCGTCGTTAATATCCAATTATTAGTGTTTCAATGATTGATTACTGCATTTGTGATTTAAGCCCTCTCTCCGTTGTGAGAAGATTAAGCATGGATAATGTGATGCCATTGTGCAAATTGTTGTGCCGTTTGCATATTTGGGTTGTCTGCTTTGTCTGGTGAACCTTTTCGATTAGTTTTGCTATATTTCTACTGTTTGTCAGGGGCAGACATGCTAAGTTTAAGTTATTTAGAAAAAAAGGGACTATCTAAAAAAACTGCCGCAAGTTTTTTAAGGGAAAAACTTTCAAATCTAATTATAGTATAATTGTAATATAATTCTGATATAGTTACATTTGCATGTTTTTTTCCCAAAAAACTTGCGACGTTTTTTTAGCAATTCCAGCAGACATTCAGGTTTTCAATAATTTGTGCAACTGACGAATAGTGTAATACTGTGATTTCAGGAAGGGAAGGATGTGGTCGCTAAGGCCAAGACTGGCTCCGGAAAGACCTTTGCTTACCTCCTCCCTATGCTGCATGAGCTATTGAAGTTGTCTGCAGAAGGGCGTATCCGAAAATCTGCTCCAAATGTTTTCATCCTTGTGCCAACTCGCGAGTTATGCCAGCAGGTATCACTCATGTACTTGTTATGAGATGAGATGATTTTTGTGGGCAGTTTAATATTTATTATTAGCTATGACGTATGAGTAGTTCAATGATCTATGTCAAGTTGAGGATTAATTCTGAATTCATAGGCTACATATGAATGGACATATGAGTATATCTTTTAATTTAATGCCAGACCCTCATACTAGTCCTTTGGTTTATTTTTTAATGTACTGCATTATATGGTCATAATCCATAACATCTATGTGATTGTTTATTTGAATTGCTTGTGGTAGGTTCATAATGAGGCATCATCTCTCCTTGAATTCTGTACATCCAAATTGAAGGTTGTGCAAGTGAATGCGAGCATGTCAGACAAAGATATTGTGAGAAGTCTATCTTATTCTGTTGTTATTTTCTGTAAATAATATTCATGTTTTTCGTATGAATGCTGGCAAACTAACTTGTTTCTTACTGTTGTTTGCAGAAAGTTGCATTGTCTGGCCCCCCTAATATCCTTGTTACAACTCCTGCTTGTGTTGCATCATGCATATCAAAGGGCATTATCCGTGGATCATCTATCAAAGAATCACTATCAATGATGATTCTAGACGAGGTGCAGTTTATTTGCCTTTTCATGATTTATTTTAGTTTGATACATATCATCAATGGGTAATTTGATAAGATTTTATTTCCACAAGGGATGATAATTTTCTTTATACATAAAAAATATGGCTGTTTAAACTGTGTATGTTTCTACATTTTGGCTGTCGTGCCCTTCCTCAAGTTAAACAAAATACTTTTGTGATTATTTTAAGTGAGTATGGAGTTTATTTTGTATGATCACATAATGCTGACATTGACATGTGCCGCTGCAACAGTGTGAAATTTGCTATGGTGTTGAAAATTTCAAGAACATTTTGACAACTAATATGCTGTCTTACTCTCTTAGACTGTTGTATATTCAAATTTGACACCTTTTCTGTGTAATATTATACTAAGTTTCTTTTGAAGGAGGCACTAATCCATTAATGGTTAGTTCTCAGGCTGACCTCCTCCTATCCTATCGTTGTGAAGATGACATAAAAGCTCTCGTTCCACATATCCCAAGAAGCTGCCAGTCCATCCTGATGTCTGCAACGTCAAGGTGAAATTTGGTTCCATCTTCCTTCCTTTTCTTCAATTGTTCAATTGTTTTGATTTTGCAGTTACACGATTTGGTTGTTCTGAGCATCAACATTTCAATCGAATGGATGGAACCTGCAATTTAAATAACCAAAAATTGGGATTTTTCTGTTTTGAATTTTTACCATACTATTCCAGCATGTCTGTCATTGCATCTGTTGATGAGATTTTGCTAGCAGTCAACCTGGAGGTTGAATCCCCAATATTGCTGCCCTTGAGTTGGTAGAACACTGTTGTAGTTTGATTGTCCCTCCTTGCCCTTGCTTCCATTTAGATTTCATATATTTGGTCTGATAGTAACGTTGACTTCTTTTTACAGCGCTGATATTGAGAAACTGACTAAGCTACTTCTGCACAACCCTTTTATTCTGACCCTTACGGAGGTTGGTCATGCGAAGGATGATTTGATCCCAAAAAATGTGCAGCAGTTTTGGGCAAGTACTTTTTCCTGCATTTCAGACAATCAGCCTTTCAGTCGTATCACTGAAACATATTAAGATCCCTCTTGGATATCCATAGATTCCCAACAAACATTTAAACAACCTATGGTTTCATGTTCCTTTCTAGTATTTTTTCTGGTACAATTCTTTAGTGGTGATTATTTTTGCCCTGCTGATTTCCCCCTAAGCTTTCCTGTAGTAGCTTGTATATCATGTACTCCTATTCAATTTTGTCCACAGATATCATGTGATGCTAAGGATAAGATGCTTTATATCCTTGTACTCCTGAAGTTGGAGCTTATTCAGAAGAAAGTTCTCATATTTGTAAACTCAATTGACTCGGCATTCAAATTAAGGCTGTTTCTGGAGAAGGTAAAATGGAACCACTACCTTACAGTAGTCAATAATTAAACACGTTTGATGATTTGGTTTCTTAATTTGTTGTCTGTAATTTTTTTCCATTGTTTTATTTCAGTATGTTAAGTGCAGTCCAAACCTTAATTTTAGGCCATTGTCTGATTGCTGTCTGAACATAAATCAAAGTGAAAATGTTGTGCTAGTCTAGAATACTTGGTACAAGAGTGTCGAGTTTTTGAAGACTCCATGGTAAACAGATAGTTATGGGGCAGCATGTCAGGATATGTTTCTGTTGAGTCTGTAGAATGAATCTAAGTGCTAGATTATTGGACACTTGAAAACTTTCACAAAATACTGAATTTGGAACGTTACTTTGTTTAATCTTAATTGCATGTACTGGAGTAAGAGTGTATAAAGTACCGTGGACTGAAGTTAAACAGGCCAGTGCCTTGTCTTTGATTGTCATATTGGGCATGTTATGGCTCCTCGCTATGATATTTGTTACATTATTTCTTTGTGTTGCTTTTTTCTGGCAGAATTCTTTGTCCAACAATTTTCTTCCTTGGTTCTTGCATCATTTTTTAAAAATAAATATGCTTATTGATGAATAATTTATCCTTATGGTGGCTATGTTGTACTTTTACAGTTTGGGATAAGATCTTCAGTGCTAAATGCTGAATTACCACAAAATTCACGCCTCCATATCATTCAGGTAGCATATCCACAGTGCACGCTCTTATTGCTGCTATTGTGCTTTATTATTACATAATTGATGATAATTCCCACTGAATATATCTTTCTCTTTCAAATGTTTGTTGAACAAGTAAATCGCTTACCTATGTTTCCATAGATTTTCATCTTATTTTGGATTATCATAATCTTTAGGGAAACTGAATCTGGTTCAGTTATATTTAGTTTTTAAGCTTACCAACATGTCCACATCAAAGAATTTCCAGAACAAAAAGTGAGTGGGCTCCAGGAAATGTTTAGGCTCTAGTGTTCTAAAGAAGTCTGAAAGAATATCTTCTTGCGTTGTCCTACCGATTTAAACTATTATCTTTCTTTTAGGCATTCAATGCTAGGCTATTTGATTATCTGATAGCAACGGATGACAGTAAGTCTAAAGAGGAGAGGCAAGCCAATAAGGGAAACAAAAAGGATTCTAGGGTGTCACGCAAGCAGTTGCAGCAAACTTTAGATGCTGAATTCGGTGTTGTCAGAGGAATTGACTTCAAAAATGTATTCACGGTAAGTTAATATATTGATATATGCAAGCATGCCACCAGATCTCATTGTGGCCAGAGGGTAACTTGAGCATACAACTGTTTGACATACTTTGCTATCATTTTGTTTTAAAATAGTATTTTATCTTGAGCCTGATGGTAAATTATTTGTTATTTTTATAGTTCCCATTCGACCTTTTGTTTCTGAAACAGGTATTCAGGTTGCAGGATTGATATTCTTTTATATTTGGCCTTTTCTTTAGGTAGTTAATTATGACATGCCTCCAGATCCTGCTGGGTATATTCACAGAGTAGGAAGGACAGGGAGAGCAAATAAAACTGGTGCATCCATATCGCTTGTAAGTTCACCATTTTATGTGGCTCAATAAAAAAAAATCATCGCAGAGATAGCTAACTTGTTTTATAGATCCTATCTGTTATTTATTTATTCCTTTGGTTTGGTGTTGGACCTTTTCAGGTTTCACCAAAGGAGAATGGCATTTTTGAAGATATTGAAAATATGTTGAAAGATGTTGAAAATAGAGACACCAGTTGCATTTCACCTTTCCCATTACTTACAAAAAATGCCGTTGAGTCTTTACGCTATAGAGCTC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