BGIOSGA009627

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Annotated Information

Function

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Expression

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Evolution

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Labs working on this gene

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA009627

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA009627, complete gene.

LocusTag

OSJNBA0052F07.7

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA009627-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA009627-PA

Length

7621

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 3

Location

Chromosome 3:37684348..37691968

Sequence Coding Region

37691891..37691968,37688782..37690770,37688650..37688707,37687009..37687157,37686641..37686727
,37686123..37686149,37685507..37685635,37684348..37684431

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome03:37684348..37691968 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome03:37684348..37691968 source=RiceIndica03 preset=GeneLocation </gbrowseImage2>

Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGCGCCTTGGCGGCGGCGACGTCGTCGGCGATCTGGCTCGTCGAGGACGACATCCTCCTCAAGAACGCCGTCGAGACTGGTGCCTCATTGGAGGCCTTGGCAAAAGGAGCCGTATGTTTCTCCCGTAAATTCACTCTTAAAGAAATACAGGATCGTTGGAATTCTCTGCTATATGACCCAGAGATCTCAACACAAGCTTCTGCTCGTATGGTTGAGTATGAGAATGATCTTTCCACTTCCAATCCTCTGAAGGCTAAAGTTATCAACGCAAAGCAAAAGGATTTGTCATTCCAGAAACGGAAAATAGATAGTGTGAAGAATCAATATTATGCGATGAGAAAGAGAGTCCGCAATGAACCATGTAGTACTGTCGACCTTGGTTTTCTTATTGACCCTTGTTCATGTACAATGAATGGCGGGCAGTGTGTATGTGGAGGCCTAGATAAACATTCACAAGGTCACCATGTGGTTCATAATACAGAACCAGGGGTAAGTACAATGAACTGCTTTGGGCAACAGGATGGAAGTTACAATGGTGGACAAACTATGTTTGTTGGAATGAATGGACATTCTTTCCCTGCAAAGCATGCTGAGACTGATAGCATGGTTAAAGGTGGAGATATTGCTAATAGTGTCCCGTATGGCTATTCTGATGTAAGTCAAATATATGAGCAAGATGCATACACGCGAAAGGACCCTGATACTAATGAAGGGAACAATGTTTCTTTAAAGGGTATAACAGATTTTCAGGGTTCCATGCAGTTCCAGAATCTGGGCTCTAGCAACCAATGTGGCAGCAAAGTAACAGAATCAAAGACAATAGTGATTGCTGATCACTGTGGAGTTGAACATGTCCATTTCCCTGTGAACAGCAGTTCAAGAATGCAAGAACCTGGCTCACTCCAGGTGATTGGCCAACCAGAGGGTTCTCAAACACCAGTTGGTTCAATCTGGACTGAGGTTGACGAAAGAGGCACATTTACTCTTGACGATGATAAGAAAATAAAGACAGACAACAGTGACCCTCTAGCATTGCAACCAAATTTAGATGGTGGGATTTGTGCAGCTGGTTTAGATCATGCAGCCATAACAGAAGGTGATTTCATGGATTTTCCCTATTTCAGCAACAGTGAAGATTTAGATCTCCTGAATGGTGAAAACTTTTTGAATATTCCACATGAGACAAATCAGGAGGATTTAGATGATCCTGATCATGTGAAAAATCTGTTGCATCCTGATGAGGCCAACATTTGCTATGATCAGACAGATCCTGATCATGTGAAGCATAATGTAGATGTTTCTGGGATAATCTCGGTTCCTACTTCATTGGAAGTGCCTTATCCTGGTCGGTTTGTTGAATGTGTGTTGAACAGAGAAGATCCTGAAATTCCTTGCAATGACGATGTTATTTTTCCTGGCGAGTCTCCTCTACAATGCTCTGCTACTGATTTTGGCCAGAACTCTGAGCACAATACCTGTTTGGTTTCCCCTGCAACTAGCCCTGCATCAAATGTCGAACATTCCAATGTGAGTGACAAAGCCCTAATAAAGAGGGAAGATACGACAAATACTGAACCTTCTTCACAACCAATGAATCTCAGCCCACCCACCTCAGAACAAAAAGAAGGTTCAACAGCACCTAGTAAAGGCTGTGTCCCACTAGGAGCTGAACCATCAGAAGGTCCTTCAACTGCTGGTACACTCGTGCATTGTCACGTTGACACTAATGATGCAAACTCATGTGCGTCAAATTTACCCTCTATCAGTGCTGCTGTATTTGCTGAAGGATCACCTTGCCATTTAGAACAGCAGAATAACTTTGATGACTCACTGAGTTTTCCTTTGCCCAATTCAGTTGAAGTGCCCGATCACATGAATTACAACTCACATGATAATCAACCAGAATTAGGAGATGGGGCTCCTCTACAGAACTGCATTCCACCACATGAATTGCCAGATTTGGGTCTTCAAGACCCCATTACAACTGTTCCTGTATCAAATCAAGTAGAAGAATGCTCTGACAATGAAAATGATGTTCCAAACTACTATGATCTAGAAGCTTTGATACTTGATCAAGATTTAATCCCATGGGTTCAGGACTCTGAGCAGCATCCAGAAGGAGTTTCCAGGTTTCAGCATCCAGAAAGCAGGAAATCATTGATACGACTGGAGCAGAGTGCCAGGTCTTATATGAACAGAGCCATTGTGTCCAAAGGTGCCTTCGCAGTTATTTATGGACTGCACCTGAGATATTATATGAAGGACAGTGAGGTGACTCTTGGAAGAGAGACAGAAGACATAAAAGTTGATGTTGATTTGGGAAAAGAAGGGAGGGCAAACAAAATATCTCGTAGACAGTTAGAAACTGGTGGCTTTAATGTTTTGGCGGTTATCAAGATGGATGAAGCTGGTTCTTTTCATATCAAAAACATTGGGAAATGTTCAATTTTTGTTAATAGCAAGGAAGTACCAAGCTGCAAACGCATCATCTTAAGTTCAGATTCGTTAATTGAGATAAAGGATATGAGGTTCATTTTTCATGTAAACCAGGATGCTGTAACGCAATTCGTCACACGCACCCCGAAGCCGGAGCACTAG</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGALAAATSSAIWLVEDDILLKNAVETGASLEALAKGAVCFSRKFTLKEIQDRWNSLLYDPEISTQASARMVEYENDLSTSNPLKAKVINAKQKDLSFQKRKIDSVKNQYYAMRKRVRNEPCSTVDLGFLIDPCSCTMNGGQCVCGGLDKHSQGHHVVHNTEPGVSTMNCFGQQDGSYNGGQTMFVGMNGHSFPAKHAETDSMVKGGDIANSVPYGYSDVSQIYEQDAYTRKDPDTNEGNNVSLKGITDFQGSMQFQNLGSSNQCGSKVTESKTIVIADHCGVEHVHFPVNSSSRMQEPGSLQVIGQPEGSQTPVGSIWTEVDERGTFTLDDDKKIKTDNSDPLALQPNLDGGICAAGLDHAAITEGDFMDFPYFSNSEDLDLLNGENFLNIPHETNQEDLDDPDHVKNLLHPDEANICYDQTDPDHVKHNVDVSGIISVPTSLEVPYPGRFVECVLNREDPEIPCNDDVIFPGESPLQCSATDFGQNSEHNTCLVSPATSPASNVEHSNVSDKALIKREDTTNTEPSSQPMNLSPPTSEQKEGSTAPSKGCVPLGAEPSEGPSTAGTLVHCHVDTNDANSCASNLPSISAAVFAEGSPCHLEQQNNFDDSLSFPLPNSVEVPDHMNYNSHDNQPELGDGAPLQNCIPPHELPDLGLQDPITTVPVSNQVEECSDNENDVPNYYDLEALILDQDLIPWVQDSEQHPEGVSRFQHPESRKSLIRLEQSARSYMNRAIVSKGAFAVIYGLHLRYYMKDSEVTLGRETEDIKVDVDLGKEGRANKISRRQLETGGFNVLAVIKMDEAGSFHIKNIGKCSIFVNSKEVPSCKRIILSSDSLIEIKDMRFIFHVNQDAVTQFVTRTPKPEH</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..78#1199..3187#3262..3319#4812..4960#5242..5328#5820..5846#6334..6462#7538..7621#ATGGGCGCCTTGGCGGCGGCGACGTCGTCGGCGATCTGGCTCGTCGAGGACGACATCCTCCTCAAGAACGCCGTCGAGGTAGACGATCCCCCCCTCCCCTCTCTCGCCCCGGTCCCTTACAATTCGGGGCGGCTCGAAGTCTGTTCGTCTCGCCGCGTCGCTTAGGTTAGGCTTCGATTGGAGAGTTCGGGCTTCGTTCTTAAGTTGTTTATGGCGGAGGTCGACGGAGCCATTTTTCTTTCTTTAAATTTTTTGTCATGATAGTCAGGTCGTCAGGGTTTAACACTTTAACCCTCGGCCTTGCGAAATTGCTCAGCTGTTAGTCCGTATCTAATTTGGGTGGTTATTCCCTGTGCGGAGTCCTGAACACCGTTGTACTGAATCGCTTTGTTGGGGAATCAAAATCTTGAAGCAGCATAGGGATTTGTTTTCATAGCAGTTCAGTGGCTCTGCTATCATCTAGCCAAGAATTTAATGTGGCGCGTGTGCAACCGGGTCAGGTTTGGCAGGACACACACCACCGGGTGCAATTTCTATTGACCCCACACAGAGACCAGTCGCTTGACATTTTGCTTGGGAGAAATTTGCATACTCAGTGTCTGCAGGTAGATCCTATGTGGTGGAGGAAATAATAATGAGTGTTATATTCCTCTGCAAGAGTTTTTGACCGTTTTATTTGAATTTATTTTCAATAAATAAAGCAAATTGTTTAGGTCTTGTATGCACCTACCATGGTGTGATTGATCTATAGTTTTTGTACAAGACTGCCCTGATTAATCTATTTAATCCCATGCGTTGGTACCTGTAATTATATGAACACATTCCATATAGTGCCATGCCAAATTCTGTGATTAACTAGCTTTGCAACTCAAGACAATGAATACTGTTTTATCTTACATGGCAACTTGACCTTGTAATCATAGTAAGTGGGCTTATCATATTAACATTATTATGCCTATCTATGAAGTATGCGAGATATTTAGTACTCCAATCCTGAGTTAGTCATGTTGAATACTAGGGATTTGTTCAGGAAAATTTGATCTGAAGTTAGTTAATCTCCAGTCTGCAGGGTCAGGCAAACCTTATCTGTGAGACATTCTTCATATAAGTTTAAGTGTCTAGCTGCATATTCGTTCTGAATTCTGATGTTGTGAATGGTTCCCCATCTCTTCCTAACTGATTGTTATGATACTTGTAGACTGGTGCCTCATTGGAGGCCTTGGCAAAAGGAGCCGTATGTTTCTCCCGTAAATTCACTCTTAAAGAAATACAGGATCGTTGGAATTCTCTGCTATATGACCCAGAGATCTCAACACAAGCTTCTGCTCGTATGGTTGAGTATGAGAATGATCTTTCCACTTCCAATCCTCTGAAGGCTAAAGTTATCAACGCAAAGCAAAAGGATTTGTCATTCCAGAAACGGAAAATAGATAGTGTGAAGAATCAATATTATGCGATGAGAAAGAGAGTCCGCAATGAACCATGTAGTACTGTCGACCTTGGTTTTCTTATTGACCCTTGTTCATGTACAATGAATGGCGGGCAGTGTGTATGTGGAGGCCTAGATAAACATTCACAAGGTCACCATGTGGTTCATAATACAGAACCAGGGGTAAGTACAATGAACTGCTTTGGGCAACAGGATGGAAGTTACAATGGTGGACAAACTATGTTTGTTGGAATGAATGGACATTCTTTCCCTGCAAAGCATGCTGAGACTGATAGCATGGTTAAAGGTGGAGATATTGCTAATAGTGTCCCGTATGGCTATTCTGATGTAAGTCAAATATATGAGCAAGATGCATACACGCGAAAGGACCCTGATACTAATGAAGGGAACAATGTTTCTTTAAAGGGTATAACAGATTTTCAGGGTTCCATGCAGTTCCAGAATCTGGGCTCTAGCAACCAATGTGGCAGCAAAGTAACAGAATCAAAGACAATAGTGATTGCTGATCACTGTGGAGTTGAACATGTCCATTTCCCTGTGAACAGCAGTTCAAGAATGCAAGAACCTGGCTCACTCCAGGTGATTGGCCAACCAGAGGGTTCTCAAACACCAGTTGGTTCAATCTGGACTGAGGTTGACGAAAGAGGCACATTTACTCTTGACGATGATAAGAAAATAAAGACAGACAACAGTGACCCTCTAGCATTGCAACCAAATTTAGATGGTGGGATTTGTGCAGCTGGTTTAGATCATGCAGCCATAACAGAAGGTGATTTCATGGATTTTCCCTATTTCAGCAACAGTGAAGATTTAGATCTCCTGAATGGTGAAAACTTTTTGAATATTCCACATGAGACAAATCAGGAGGATTTAGATGATCCTGATCATGTGAAAAATCTGTTGCATCCTGATGAGGCCAACATTTGCTATGATCAGACAGATCCTGATCATGTGAAGCATAATGTAGATGTTTCTGGGATAATCTCGGTTCCTACTTCATTGGAAGTGCCTTATCCTGGTCGGTTTGTTGAATGTGTGTTGAACAGAGAAGATCCTGAAATTCCTTGCAATGACGATGTTATTTTTCCTGGCGAGTCTCCTCTACAATGCTCTGCTACTGATTTTGGCCAGAACTCTGAGCACAATACCTGTTTGGTTTCCCCTGCAACTAGCCCTGCATCAAATGTCGAACATTCCAATGTGAGTGACAAAGCCCTAATAAAGAGGGAAGATACGACAAATACTGAACCTTCTTCACAACCAATGAATCTCAGCCCACCCACCTCAGAACAAAAAGAAGGTTCAACAGCACCTAGTAAAGGCTGTGTCCCACTAGGAGCTGAACCATCAGAAGGTCCTTCAACTGCTGGTACACTCGTGCATTGTCACGTTGACACTAATGATGCAAACTCATGTGCGTCAAATTTACCCTCTATCAGTGCTGCTGTATTTGCTGAAGGATCACCTTGCCATTTAGAACAGCAGAATAACTTTGATGACTCACTGAGTTTTCCTTTGCCCAATTCAGTTGAAGTGCCCGATCACATGAATTACAACTCACATGATAATCAACCAGAATTAGGAGATGGGGCTCCTCTACAGAACTGCATTCCACCACATGAATTGCCAGATTTGGGTCTTCAAGACCCCATTACAACTGTTCCTGTATCAAATCAAGTAGAAGAATGCTCTGACAATGAAAATGATGTTCCAAACTACTATGATCTAGAAGCTTTGGTATGTCCCTTAGCTTAGCTACTTAAAAGAATTGATTGTTCTTCTGATTTATCCCTTTTTGTTATTCATTGCAGATACTTGATCAAGATTTAATCCCATGGGTTCAGGACTCTGAGCAGCATCCAGAAGGAGGTAAATATCTCCTTTTATCAAATCAGTGTGAAAATTTTTTTGGTATAAGACTCTACCAACACATGCAAATATTTGATATTAAAGATGTGTGTTTTAAGCTTAGCATGAGTAACGTACTAATATTATGATAGAGTTGTGGAAGGAAGTACTGTGCTCAATTGTTAGCGCCCTTATCACGATAATACTATGTGTGAAACTGAAATATTGACCACTTTATTGGAATAATTTACAGTCGAGTGGTAGTGCTTAGTGTTAGCCTCGAAGGAGACTGACCATGATAAGAGTATGGAGTATGAAATGTTGATTGGCTGTGAGGCTTAAGGGGTATATATTCTATTCAGAATAGCTGAATGCCCGTGCTTTGCTATGGATAAAATATATTTTTCATGAAGTGTGCTACCCATTGTTTGCTATAGGAAATATTCATCTTATTTTAATTTTATATGTTGCTATCCATTTTGATTTGATTGTTTTTAATGTTAAGAAGCTCAAGGAGTGATTTGCAAAATTTACAATGTGAGTACTTGAGGTGGCAGAATGGCAGATTCACTGCCACCATCACTAGAGCCTTTTAAAGTAGTACTCCCTCCGTATTTTAATGTATGACGCTGTTGACTTTTTGATTAACGTTTGACCATTCGTCTTATTCAAAAAATTTCTATAATTATCATTTATTTTATTGTGACTTAATTTATCATCGAAAAATCTTTAAGCATGACATAAATATTTTCATATTTGCACAAAAAAAAAGACGAATGGTCAAATGTTGGTTAAAAAGTCAATGGCGTCATACATTAAAATACGGAGGGAGTATGATAATGGAACAAGGAAAATTGTTCTGATAATAGTGCATGCGCGTGTGCACGCATGCATGTGTAGCTTCATGGACACATGTTAGTTTTATTAAGGCAATCCACATCCAGGTTGTAAACGTAGCCGATAGATTTACTGAATTTAGTTTGCCATTAACTTGTTGGTACTTTAGTGTTTGCTTGGCAAATACTTTCTTTTTGCTGCGGCTTATAAGCTACTCCTCCATCCCAAAATATAGCATCTTCCAGCGTTCAAAATTTGTCCCAAAATATAACAACTTCTCCACCTACTCCCTCCTTTCAACTAATCACAATTGTTCGCCATTTAAGTTCTCGACCTACTTCCTCATCTCAACCAATCAAAACCATCCCCCATTTAGTTCCACCTACTTTCTTAATAGCTGTGCGATCCTCTAAAACTTCTTATATTTTGGGATGGAGGGAGTAGCTAGGCAACAAAAAATAATTTTAGGGCAAGCCTTTTATACTCCTACTCTCAGCGTTCCAAAAGCGAAAGCTAAAAATTAGAAAACACTGAAAAATACCCCAAATCAACTCAAAAATTAAGTTCTAAAATTCAAATTTGTCTGTGGCTTATAAGCCAACGAGCAGCCAAAGAAGCATTTTGTCCTGTTTTTGAAGCCACAAATGGGCATTTATCAATGTTTTTGCATGATCAGTTTCCAGGTTTCAGCATCCAGAAAGCAGGAAATCATTGATACGACTGGAGCAGAGTGCCAGGTCTTATATGAACAGAGCCATTGTGTCCAAA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External Link(s)

EnsemblPlants:BGIOSGA009627