BGIOSGA021860
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA021860 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA021860, complete gene. |
| LocusTag |
SSI |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA021860-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA021860-PA |
| Length |
6814 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:3609454..3616267 |
| Sequence Coding Region |
3615970..3616267,3614706..3615061),complement(3613972..3614049,3613760..3613884),complement(3612843..3612924 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:3609454..3616267 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:3609454..3616267 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGGCGACGGCGGCGGGGATGGGGATCGGGGCGGCGTGCCTGGTGGCGCCGCAGGTGAGGCCGGGGAGGAGGTTGCGGCTCCAGCGGGTGCGGAGGCGGTGCGTGGCGGAGCTGAGCAGGGACGGTGGGTCGGCGCAGCGCCCGCTGGCACCGGCGCCGCTGGTGAAGCAGCCGGTCCTGCCGACCTTCCTCGTGCCGACGTCGACGCCACCCGCGCCCACGCAGTCGCCGGCGCCGGCGCCGACCCCGCCGCCGTTGCCGGACTCCGGCGTGGGGGAGATCGAGCCCGATCTAGAAGGTCTCACAGAAGATTCCATCGACAAAACAATTTTTGTGGCTAGTGAGCAGGAGTCTGAGATCATGGATGTGAAGGAGCAAGCTCAAGCTAAAGTAACACGCAGCGTTGTCTTTGTAACCGGTGAAGCTTCTCCTTATGCAAAGTCAGGTGGACTAGGAGATGTTTGTGGTTCACTGCCAATTGCTCTTGCTCTTCGTGGTCATCGTGTGATGGTTGTAATGCCGAGATACATGAACGGGGCCTTGAACAAAAATTTTGCAAACGCATTTTACACTGAGAAGCACATTAAGATTCCATGCTTTGGCGGAGAACATGAAGTTACTTTTTTTCACGAGTATAGGGATTCTGTTGATTGGGTGTTTGTTGATCATCCCTCATATCATAGACCTGGAAATTTGTATGGAGATAATTTTGGTGCTTTTGGCGATAATCAGTTCAGATACACACTCCTGTGCTATGCGGCGTGTGAAGCCCCATTAATTCTTGAACTGGGAGGATATATCTATGGACAGAAATGCATGTTTGTTGTGAATGATTGGCATGCCAGTCTTGTGCCAGTCCTTCTTGCTGCAAAATATAGACCATATGGTGTTTACAGGGATGCCCGCAGTGTTCTTGTCATACATAATCTAGCACATCAGGGTGTGGAGCCTGCCAGTACATATCCTGACCTGGGATTGCCACCTGAATGGTATGGAGCATTAGAATGGGTGTTTCCAGAGTGGGCAAGGCGGCATGCCCTTGACAAGGGTGAGGCAGTCAATTTTTTAAAAGGCGCAGTTGTGACAGCAGATCGAATTGTGACTGTCAGCCAGGGGTATTCATGGGAGGTCACAACTGCTGAAGGTGGGCAAGGCCTCAATGAGCTCTTAAGCTCCCGGAAGAGTGTATTGAATGGAATTGTAAATGGAATTGACATTAATGATTGGAACCCATCCACAGACAAGTTTCTCCCTTATCATTATTCTGTTGATGACCTGTCCGGAAAGGCCAAGTGTAAAGCTGAATTGCAGGAGGAGCTGGGTTTACCTATAAGGCCCGATGTGCCTCTGATTGGCTTTATTGGAAGATTGGACTATCAAAAAGGCATTGATCTAATTAAACTTGCCATTCCAGATCTCATGCGGGACAATATTCAATTCGTCATGCTTGGATCTGGTGACCCAGGTTTTGAAGGATGGATGAGATCCACAGAATCAGGGTACAGGGATAAATTTCGTGGATGGGTTGGATTTAGTGTTCCAGTTTCCCACCGAATAACTGCAGGTTGCGATATATTGTTGATGCCATCCAGATTCGAACCTTGTGGCCTCAATCAGCTATATGCTATGCAATATGGTACAGTGCCTGTTGTTCATGGAACTGGAGGCCTCAGAGATACAGTGGAGAATTTTAACCCGTTTGCTGAGAAAGGAGAGCAGGGTACAGGGTGGGCATTCTCGCCACTAACCATTGAAAAAATGCTGTGGGCATTGCGGATGGCAATTTCGACATACAGGGAACACAAGTCCTCTTGGGAGGGTCTAATGAAGCGAGGCATGTCAAGCGACTTTACATGGGACCATGCCGCCTCACAGTATGAACAGATCTTCGAATGGGCCTTCATGGATCAACCATATGTCATGTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MATAAGMGIGAACLVAPQVRPGRRLRLQRVRRRCVAELSRDGGSAQRPLAPAPLVKQPVLPTFLVPTSTPPAPTQSPAPAPTPPPLPDSGVGEIEPDLEGLTEDSIDKTIFVASEQESEIMDVKEQAQAKVTRSVVFVTGEASPYAKSGGLGDVCGSLPIALALRGHRVMVVMPRYMNGALNKNFANAFYTEKHIKIPCFGGEHEVTFFHEYRDSVDWVFVDHPSYHRPGNLYGDNFGAFGDNQFRYTLLCYAACEAPLILELGGYIYGQKCMFVVNDWHASLVPVLLAAKYRPYGVYRDARSVLVIHNLAHQGVEPASTYPDLGLPPEWYGALEWVFPEWARRHALDKGEAVNFLKGAVVTADRIVTVSQGYSWEVTTAEGGQGLNELLSSRKSVLNGIVNGIDINDWNPSTDKFLPYHYSVDDLSGKAKCKAELQEELGLPIRPDVPLIGFIGRLDYQKGIDLIKLAIPDLMRDNIQFVMLGSGDPGFEGWMRSTESGYRDKFRGWVGFSVPVSHRITAGCDILLMPSRFEPCGLNQLYAMQYGTVPVVHGTGGLRDTVENFNPFAEKGEQGTGWAFSPLTIEKMLWALRMAISTYREHKSSWEGLMKRGMSSDFTWDHAASQYEQIFEWAFMDQPYVM</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..298#1207..1562#2219..2296#2384..2508#3344..3425#3522..3695#3885..3966#4063..4154#4265..4327#4406..4495#5160..5284#5409..5517#5599..5651#5786..5825#6656..6814#ATGGCGACGGCGGCGGGGATGGGGATCGGGGCGGCGTGCCTGGTGGCGCCGCAGGTGAGGCCGGGGAGGAGGTTGCGGCTCCAGCGGGTGCGGAGGCGGTGCGTGGCGGAGCTGAGCAGGGACGGTGGGTCGGCGCAGCGCCCGCTGGCACCGGCGCCGCTGGTGAAGCAGCCGGTCCTGCCGACCTTCCTCGTGCCGACGTCGACGCCACCCGCGCCCACGCAGTCGCCGGCGCCGGCGCCGACCCCGCCGCCGTTGCCGGACTCCGGCGTGGGGGAGATCGAGCCCGATCTAGAAGGTACGTGGCTTGTCTCGTGCTGATCCTCCCTCTCCTCCCGTATCAATGCCCGATCCGTGCAGTTCCATGCGCGCCTTTGATCACTTGATTAATCGAACAAACCCTGCGGATTAATTACCACGCGAGAAATTGGAACCCCAATTCGAGCACATCACTAACAATTTTTATACTGCACATATACACAATATATATATTTATTGGATCGCGATATGATGGGGGTGGCGATGGGGTGGGCACCTGGGAGGTTTCGAGGCCTGTGCACGTGGCTGGGTTTGAGCAGACACGCCATTGATGTAGTAGTATTTGATATCGTAATTTAGTGGGAAGAGGAATGGTGAGGTTTGGTGTAGGAAGCGTTGGAAACTGAGTAAATTGACGACTTTGTCTTTTCCTTAGGCAAGTACGGAGTATATGCGATACTCAAGTTGGGAGTTCAATTCTCAGCCGTCAACTGAATTTTCTGTAGAGTGACAGTAGCATTTCGTAATTTTCGTTGCACTGAATTGTGGTCGATGGCGCCATTTTCTGTGGACGGTCCATGTGTACCTAGACAATCACATGGGCGCCTGGGACCAATATGTGCTTTTCCTATCACTAGACCCACCTCGCTATCTGTTGGATTCTCTGGGCTGCCACCAATATGTGTTTCCTGATTATATGACGTACTCTCACCTCACCTCACCTCTCTAAAATCCAATTATTTAGAGGGCAGAAGGGAGCAATGACAACCTGAATTTGGCGTTATTCAGATCAGAATGTTGTTTGCATTATTGTAATGCTCCCATTACTGCTGTACTGCCATGCCAAGATGTGGCTAGAAAACGATAATTATTTATGTTTCTGCTGTATTTTTCTTGGGCCTCTCGGCCAATACTATACCATATGAATATCTTTTATTTTGCATTCAGGTCTCACAGAAGATTCCATCGACAAAACAATTTTTGTGGCTAGTGAGCAGGAGTCTGAGATCATGGATGTGAAGGAGCAAGCTCAAGCTAAAGTAACACGCAGCGTTGTCTTTGTAACCGGTGAAGCTTCTCCTTATGCAAAGTCAGGTGGACTAGGAGATGTTTGTGGTTCACTGCCAATTGCTCTTGCTCTTCGTGGTCATCGTGTGATGGTTGTAATGCCGAGATACATGAACGGGGCCTTGAACAAAAATTTTGCAAACGCATTTTACACTGAGAAGCACATTAAGATTCCATGCTTTGGCGGAGAACATGAAGTTACTTTTTTTCACGAGTATAGGGATTCTGTTGATTGGGTGAGTATTCAATCTCCTTACTATTTTCTGATGAAAACAACTATCTGCTTATCTTTTTGTTCTTATCCCACTGAAGACATGATCATATCATATTCTGTACTCTGTTTCTATGTCTTACTGTCTATACACTTGTGCACTGGTTGATGTCTGGTGTTTCCAGATCAAAATGCAAAAGATTCCTTCATATGACTTAATGTATCCATTTTATGTCTCAAGCATTTGTGACTTCTGTTTGCAACAAGCACTTAATATTAATAAGTTGTACTGTTTGGCTTTTCCATTGCATTAATAGTCATCAGTAACATTGTAGTTATATCATGGGAATTATGTACTTCAATCGCATTTTTATTTCTTGAAAGTGAACATGTGGGTTACATTGAAACATGTATTGTCACAACTGGTAATAGATGTAGATGGCATGACATGATAATCATTAAGGAACAAGGATGTGTATAACCTAGGAGGAAACATTTCTAGCATTTTTGGTTGCAAGATTGATTCCTTGTTGAGTTTACCAAATGTTTACTTATTCCTATTGGAACTTGGTAGTGTTCACTCCGCAGCACCATCACCCATGACACAACATGCTGATTGTAGAAAGCATACCTGCATTTTGGGTACTTATTTTTTTGTTACACCTCACTTCTCCTGTTCAGGTGTTTGTTGATCATCCCTCATATCATAGACCTGGAAATTTGTATGGAGATAATTTTGGTGCTTTTGGCGATAATCAGGTATTCTTACATCAAGATCCTATTTGACCAGTCTAAATTATATCACATTGAGTCATTGATTCGACTTGACTTCCCTATATACTGCAGTTCAGATACACACTCCTGTGCTATGCGGCGTGTGAAGCCCCATTAATTCTTGAACTGGGAGGATATATCTATGGACAGAAATGCATGTTTGTTGTGAATGATTGGCATGCCAGTCTTGTGCCAGTGTATGTTCTGGATCTGAAACTCTGCAACCAAATTGATTAACATTGAATATCTCTTATAAACCATTTTTTTCATACGTTTGCTTTGTGTTTGTGTGTGTCTATGTTAGATAAGAGGAACAAAATATTAGATTGAGTGAATAGGAGGATTTTCTCAATCATTTTTTTTCTCAAAAGCGCAGGAGAACTGCGATTCATTTCATTATTTTCTCAATCATTTTGATATTTCCAAAAACATGAACAGTCCAGTACATCATTTATGTGTTTAAATGATTTAGTTTTGTGCTACACTAGTTCATAGCTGATCTGAAAATCTCCCTGCCTATGTTTTTTTTGGAATATTTCTGAGCTAGTGCGAAGTTTCTTATTATGGTAGTGCCTATTTTGAGTTCATCTTCTACAGATACAATTCAATACCCAAAGGATTTGGGAAAAATCCTGTAGTCTAAATGGCCTATCATGCTACTAGGTGACTGAGGTGATAGTTTGCAACCCTCTAATTTGTGGTAAATTTAAACTGCTTGTTTCACACCATAATTTGATGTTATAATTATTAAGAGAGTGCGTGGTACATGCTTTCTAACTTCTAAGACACTTCAGAACAACATGAGGTTAATGGTGTAATGTCTTTCGCTGCATATTATGAATATGGTTTGATCCATCAGATGCTACATTGCTACTCCTTTGTTTTGGCATGTTCCTCACGGTGGTTAAGATACTAATGCCAGTGAAAAACTCATCACACTTATTTTTTAGTCCCTTTTTACTTCAATGCTGAATGTTAAATTGGTTTTCCTTACATATCAATTTAAATATAACTTTTATCTTGTTTATCCAGCCTTCTTGCTGCAAAATATAGACCATATGGTGTTTACAGGGATGCCCGCAGTGTTCTTGTCATACATAATCTAGCACATCAGGTTTGAGCCTATCATTTTGCATATCTTTTAAGTAGTTTTGTAATGGCACTTTGTAAGTGCAGTATGTTAGTATTTCATTGTGTTTCAATGTGATAGGGTGTGGAGCCTGCCAGTACATATCCTGACCTGGGATTGCCACCTGAATGGTATGGAGCATTAGAATGGGTGTTTCCAGAGTGGGCAAGGCGGCATGCCCTTGACAAGGGTGAGGCAGTCAATTTTTTAAAAGGCGCAGTTGTGACAGCAGATCGAATTGTGACTGTCAGCCAGGTGAGATTCCTTCCTTTTCGTCTACTAGTTGGCTTACGGCCACAGTCAAAATTTGAAATTTGAACTTAACCTTAGAGTTGATTTTTTTTCCCATCCTAGTCTATTTTTATGCCTTGGCTTTTAAACCGCAAATTCTTTGTTCATTTTGTCTTGCACTCAATTAAGGAATCATTTATGTTTCATTACCAGGGGTATTCATGGGAGGTCACAACTGCTGAAGGTGGGCAAGGCCTCAATGAGCTCTTAAGCTCCCGGAAGAGTGTATTGAATGGTACCTATATTTGGGTTTTTATATTTTGTTCTTGGACTGATCATTGTAATAGGGTGGATGATACAAATTAATTCAATCTATTCCCTGGATATGTAGGAATTGTAAATGGAATTGACATTAATGATTGGAACCCATCCACAGACAAGTTTCTCCCTTATCATTATTCTGTTGATGACCTGTCCGGAAAGGTGAAGTATAGTACCATGTATATACAGATTGTCATCTCGTTTCATTTTTTTCTTTGCACCTCGTCGTTTCTTTCACAGACTAATTTATGAAACCTCGAATTCATGTTTAGGCCAAGTGTAAAGCTGAATTGCAGGAGGAGCTGGGTTTACCTATAAGGCCCGATGTGCCTCTGGTTAGATACAAATATTTATGAAATTATTTATTTTAGTATTCTTTTATGGGCAGTTGGATTTATTAGCTTTATTTACAGATTGGCTTTATTGGAAGATTGGACTATCAAAAAGGCATTGATCTAATTAAACTTGCCATTCCAGATCTCATGCGGGACAATATTCAATTCGTAAGTTCTGTTTTCTTTTTCTGCGTGAGACTAGAAAGTGAATGTGATAGATCTTAGTGTATATAGTAGTATATTGACACTTATATAGCTTGTTATCATGAATCTAAGGAATGTAATATGCAGCTATTGCTTTCATTGTGAACGCATATGCAAGTAAACTAGTATTTCAGATGCAAATATTAGTGCTATAAGAAAAAATGCATATGCAAGTCATAAAAGAAAGATAGCAGTAGTATAACTTGACCACTGTATGACTTATTAGCAACCATCCAGTGTGATATCAATTGGAGCACCTGCTTGGCCAGCCAGTCTGTTATTTCCACCCTTTAT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