BGIOSGA020727
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Structured Information
| Gene Name |
BGIOSGA020727 |
|---|---|
| Description |
Putative uncharacterized protein |
| Definition |
Oryza sativa Indica Group BGIOSGA020727, complete gene. |
| LocusTag |
OsI_24018 |
| Ensembl Transcript ID |
BGIOSGA020727-TA |
| Ensembl Protein ID |
BGIOSGA020727-PA |
| Length |
8071 |
| Source |
Oryza sativa Indica Group ORGANISM Oryza sativa Indica Group
Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
|
| Chromosome | |
| Location |
Chromosome 6:29119338..29127408 |
| Sequence Coding Region |
29127289..29127408,29127056..29127119,29126308..29126447,29125373..29125516,29125128..29125250 |
| Genome Context |
<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:29119338..29127408 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1> |
| Gene Structure |
<gbrowseImage2> name=IndicaChromosome06:29119338..29127408 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage2> |
| Coding Sequence |
<cdnaseq>ATGTCGGCGGACTCGGCGGCGGCGGGGAGGGACGCTCTCCTGGACGAGCTGCGCGCGCTCATGGCGGCCCACTCCCCGCCGCTCCACGCGCTCGTCGTCCCGTCCGAGGACGCCCACCAGAGCGAGTATGTGTCGGAGCGGGACAAGCGGCGGCAGTTCGTCTCCGGCTTCACCGGGAGCGCTGGTTTGGCGCTTATCACTATGAAGGAGGCGCTACTTTGGACGGATGGGCGTTACTTCTTGCAGGCAGAGCAGCAACTCACTAATCGCTGGAAATTGATGCGCATGGGAGAAGATCCCCCAGTTGAAGTTTGGATAGCTGATGATCGTCCTCCTGTTAATGCTCTACCTGTATTTATGCAACCTGTAGAGTATGCTGGGTGTAGTGTTACCGAAAAACTTAAGGAGTTAAGAGAAAAATTACAACATGAAAAGGCTAGGGGCATTATAATTGCTGCGCTTGATGAGGTTGCGTGGTTGTACAACATTAGAGGAAATGATGTGCACTACAGCCCAGTGGTCCATTCTTATTCTATTGTAACCTTGCACAGTGCTTTCTTTTATGTGGATAAGAGAAAAGTATCTGTTGAGGTCCAGAACTACATGACTGAGAATGGTATTGACATCAAAGACTATAATATGGTTCAATCAGATACAAGCTTGCTTGCATCTGGACAGCTAAAAGGTTCTGCAGTCAATGGTAGCTCTCATGGGGAAAATGATATGAATGAGAATTCAAAAGTTTGGATTGATTCAAATTCATGCTGCCTTGCACTCTACTCAAAACTGGATCAATATCAAGTTCTGATGCTGCAATCACCTATTGCTCTTCCAAAGGCTGTGAAGAATCCCGTAGAGCTGGATGGTTTGAGGAAGGCACATATTCGAGATGGTGAGGCTGTCGTGCAATACCTTGCTTGGCTTGACAAGCAGATGCAAGAGAATTATGGAGCTTCTGGTTACTTTACTGAGGCCAAGGGATCACAGAAAAAGGAGCATATGAATGTAAAACTTACAGAGGTTTCTGTGAGCGATAAACTTGAAGGTTTCCGTGCATCTAAAGAGCACTTCAAAGGTCTGAGTTTTCCTACGATTTCATCCGTGGGACCAAATGCAGCAGTGATTCATTATAAACCAGAAGCAAGTTCATGTGCTGAACTTGATGCTGATAAAATATATCTGTGTGACTCTGGGGCTCAGTATCTTGATGGTACTACAGACATTACAAGAACTGTACATTTTGGCAAACCCTCTGAGCATGAGAAGTCCTGCTACACAGCTGTTTTGAAAGGCCACATTGCACTGGACACTGCTGTATTTCCCAATGGAACCACAGGGCATGCTATTGATATTCTCGCACGAACACCACTTTGGAGAAGTGGTCTTGATTACCGGCACGGTACAGGCCATGGTATTGGATCTTATTTGAATGTTCATGAAGGTCCTCATCTAATTAGCTTCAGACCTTCTGCTAGAAATGTACCACTACAAGCATCGATGACTGTAACAGATGAACCTGGTTACTATGAAGACGGAAGCTTTGGTATAAGGTTGGAGAATGTTCTGATAGTTAAAGAAGCCAATACTAAATTTAATTTTGGAGATAAGGGTTATTTGGCTTTTGAACATATAACATGGACTCCGTACCAGACAAAACTGATAGACACCACCTTACTTACCCCTGCTGAGATTGAATGGGTAAATGCGTATCACTCGGATTGCAGAAAAATTTTGCAACCTTACCTGAATGAGCAGGAGAAGGAATGGCTGAGGAAAGCTACTGAACCTATCGCTGCGAGCTGTTAA</cdnaseq> |
| Protein Sequence |
<aaseq>MSADSAAAGRDALLDELRALMAAHSPPLHALVVPSEDAHQSEYVSERDKRRQFVSGFTGSAGLALITMKEALLWTDGRYFLQAEQQLTNRWKLMRMGEDPPVEVWIADDRPPVNALPVFMQPVEYAGCSVTEKLKELREKLQHEKARGIIIAALDEVAWLYNIRGNDVHYSPVVHSYSIVTLHSAFFYVDKRKVSVEVQNYMTENGIDIKDYNMVQSDTSLLASGQLKGSAVNGSSHGENDMNENSKVWIDSNSCCLALYSKLDQYQVLMLQSPIALPKAVKNPVELDGLRKAHIRDGEAVVQYLAWLDKQMQENYGASGYFTEAKGSQKKEHMNVKLTEVSVSDKLEGFRASKEHFKGLSFPTISSVGPNAAVIHYKPEASSCAELDADKIYLCDSGAQYLDGTTDITRTVHFGKPSEHEKSCYTAVLKGHIALDTAVFPNGTTGHAIDILARTPLWRSGLDYRHGTGHGIGSYLNVHEGPHLISFRPSARNVPLQASMTVTDEPGYYEDGSFGIRLENVLIVKEANTKFNFGDKGYLAFEHITWTPYQTKLIDTTLLTPAEIEWVNAYHSDCRKILQPYLNEQEKEWLRKATEPIAASC</aaseq> |
| Gene Sequence |
<dnaseqindica>1..120#290..353#962..1101#1893..2036#2159..2281#2394..2648#2970..3056#3199..3266#4456..4519#5557..5691#5775..5855#6483..6537#7076..7180#7286..7357#7504..7628#7904..8071#ATGTCGGCGGACTCGGCGGCGGCGGGGAGGGACGCTCTCCTGGACGAGCTGCGCGCGCTCATGGCGGCCCACTCCCCGCCGCTCCACGCGCTCGTCGTCCCGTCCGAGGACGCCCACCAGGTCCGTCCGCGCCCGCTGCCACCTCCCGCGGAGTCGATCAGATCAGATCGGGCTTGGATTTTTGTTGTTGTTGTTGTTGGATTTTCCGTTTTGCGCGATCTCTTCTTCCTCTCGATGATGGTTGAGGATTTGGGTGTGGTTTTGTGGGTGATTGATTGATTGATTGCAGAGCGAGTATGTGTCGGAGCGGGACAAGCGGCGGCAGTTCGTCTCCGGCTTCACCGGGAGCGCTGGTATGTTGCTTCCTCAATTCATCCCTTCTCGTTTCCCAGGCGATGAGCGCTGTGTATTGTCCTAGACCACCAGCCGATGAGTCTGTTGCGATGAGTTCATTATACAATAGTGCAATTGGATTATGCAACGTTGTTCAGGGTTGCAATTTTTACCATTTTGGTGATACACAAAGTGGAGTTCTTTTTGCTCTGCCTGACATGAATCAGAAAGCAGTTGACTAGTAGTAGAGGCTAATGGTTGAAATTTTAGGAGCAGTTATGATTTATGACACTGTTATGTTTTTGGAAATTTAGGTGATTAACAGACATTTTTGGACTGGATTATTTTATACATTGCTTCGACCAAGCAAATCGTAATAAAATTATTGATAGCTTCGCTACCATTTATAGTTATGGTTTAATCTAGCTGGACTAAAGTATGGAATGATAACCACCTTTGTACTGGGAGGAGCTTAATTGATTCCTATTTTGTAGTAGGATGGAGTTGAATATCATAAAATGTGGATGTAACATATTGAACTTGTTGATTTCTTTTGTTTTCCCCCAGTTGTCGTAATCAGAGAGTTGCATTAATTTCTCAGACCGAGCTATATTGCGTTGCTACACAGGTTTGGCGCTTATCACTATGAAGGAGGCGCTACTTTGGACGGATGGGCGTTACTTCTTGCAGGCAGAGCAGCAACTCACTAATCGCTGGAAATTGATGCGCATGGGAGAAGATCCCCCAGTTGAAGTTTGGATAGCTGATGTAAGTGTTGACATCTCTTCTTGATCATGTTCATGAGTTTAATTTCCCAAGTCTTACATAATAAAAATATTGGTTCACAAAACTTGTACATGGAAATGAATTTATTTGGTTATACCCTCTCATTTTTTTTTGAACAGCCAGATCAAAGGTTTATCCTTGCTTTTTGAATTCTGCCACAGTTTTTGTGTTGTGAAATCCCAAAAGTGGTTTTATTCTTGTTAATTTTAGCTAGTTTTATCTCCCAAATATGGTCCTTTTCATTTTGTTAACCATATTCAGTTGTTTTGTTAATACCCCAAGCCTACTATCTTTCTTCCTGTCTGCTGTAGATTCAAGGAACTGCATGATAGTTGGTTTGATATATGGGAGTTCCTTCCAAAATTATCAGAACTACCAGAATTTTGGGCACATTAATTTATTTTGATCATACCAAATGCAAGCAGAAATTTAAAGATCTACTTGAGGCTTTTATTTTGCTAGGGAGAAAACTAAGAATACTCATGCCAATTATTCAATGATTAGAGAGAATGGGTTTAGTTATTTGTTGATCTGCATTGCATAGCAATACTCATGATTAGCGTTTAATTTTATTCTGAATAATGTTGTTTCTAACTAACTTTTGTGGCTTGTGTTTGTTGCTGTGCAATCAGAACCTGTCAGATGAAGCTGTCATTGGAATTAATCCATGGTGCATCTCTGTTGACACTGCCCAGAGATATGAGCATGCATTTTCAAAGAAGCACCAGACACTGTTTTAGCTTTCTTCTGACTTGGTAGATGAAATATGGAAGGATCGTCCTCCTGTTAATGCTCTACCTGTATTTATGCAACCTGTAGAGTATGCTGGGTGTAGTGTTACCGAAAAACTTAAGGAGTTAAGAGAAAAATTACAACATGAAAAGGCTAGGGGCATTATAATTGCTGCGCTTGATGAGGTACTATTAGACTTATTTATTTCTTGGTTTCTTATCCACTACAATATATTCAATTTTGATTTCTTGAGAATTTTGTCAACTTTGCCAGTTTTAATAGTTGTCCTTTTGTTATTCTTATTTAGGTTGCGTGGTTGTACAACATTAGAGGAAATGATGTGCACTACAGCCCAGTGGTCCATTCTTATTCTATTGTAACCTTGCACAGTGCTTTCTTTTATGTGGATAAGAGAAAAGTATCTGTTGAGGTCAGCTAATCCACTGAACACATTTTCTTCAATTATTCCATTATGTCGTTCATAGAATCGTAGTCATGATTTTGAGGGGCATGTAGTGAACTGTGGCTCTTGTTTGGTCCAGGTCCAGAACTACATGACTGAGAATGGTATTGACATCAAAGACTATAATATGGTTCAATCAGATACAAGCTTGCTTGCATCTGGACAGCTAAAAGGTTCTGCAGTCAATGGTAGCTCTCATGGGGAAAATGATATGAATGAGAATTCAAAAGTTTGGATTGATTCAAATTCATGCTGCCTTGCACTCTACTCAAAACTGGATCAATATCAAGTTCTGATGCTGCAATCACCTATTGCTCTTCCAAAGGCTGTGAAGGTTTTTTTTCCTTTTGTTTTTAATTCATACCACGCCTGCTGAAAGTTTCAGAAGAACGGGGATAGAACATTTTACACTAGAAGTGTATTTTGTTCAAGTATTCCTTTTGTTTCATTCTATTTATTTTAGGCTTTTTATCTATGGAAAATCTGCTATCTGACATTAAAAGCTTTATCATTTATTAATCTATCTCTTTTTTTATTTCTTCTAATGATGGTATACTAAAATCCTGTCGAGCTGGATGGTTTGAAAATCTGCTATATTTGCAAGTTTTATCATTTATTATGCCTATATTTTTAATTTCTTGTAATCATGGTACAGAATCCCGTAGAGCTGGATGGTTTGAGGAAGGCACATATTCGAGATGGTGAGGCTGTCGTGCAATACCTTGCTTGGCTTGACAAGCAGGTCAGTATGAATTTGTCTCTCATGCGGCGTATTAGTCTTGGACTTCAAGCAAGTGTTCTTTTGCAGCTGCAAATTTGTTTAGTTGTGATGTAGTCCTTCTAATTATTTTCTACTAGCTCAGATGATCTTGTTTTAATGACAGATGCAAGAGAATTATGGAGCTTCTGGTTACTTTACTGAGGCCAAGGGATCACAGAAAAAGGAGCATATGTGAGTATGCACTGATATTAAACTTATGGTTCTTTTGGGAACATACTCCCTCTGGCCACAAATGTCATTTGACTTTCTTTTCCAGTCAAACTTTTGAAACTTTGTCGATCAATAAATTTTAAAATACATAGTTTGAAAACATAGAAATGGTATGCATAGATATTGTCTTGAAAAGTATTTTAATATTATCATGAAATTATTAGAATTTACCATAATAAAAGAATAATGATCAAAGTCACACCCTGAAGACAAAAGAGTGTCAAACGAAATTATATCATCATTGTATGGAGTATTGACCTTTTATTCACCTATACAAATTGGAACCATCTATTATCAAAAGATGCCCAGCTTTTCTTTGTAGCTTAGGTCTATTATCCTCGTTAGGCCCAGCTTTTGGCTGTCAGAACTGTCTAAATCAGTGGTTTCATGCCTTCCTGATAATTATAAATTTTAGAATTTTTTTCTAAGGAGGTTGTGATAGAGTTTTCTTGAACTTCATGTGCAATACTGCAACGTAACTTGGTTGCAAACTTGAGACGCATTTTTTTTAATATACGTTGTTACTGTCATTGTTCCTTTTTGTATAATATTTAAAATGTAGTTCCTTCATTTTTTTTCACTTCTGCATCTCAGTAGTGTGTGCTTACTCTGAACACGCTTTCAGAAAAAAAAAATCTTCTGTATTCAGATCATAGACCAAGGTTGACATGTTCCTTCTTTGTTTTACCTATCTGGAATTTTTGTTTGTCCAATTTTCTCATTTACACTGCCCATTTATTTCCTTTGGGAGGTGTGCACATTGTTTTGTTGTTTTCACTGACCATGATAGTATGACACCGTGTGCTCTGCTCAGACAGTTGTATTTCTCTGCCCCCTTGTGTATTTTTTCTAAAATTCAATGTTGTACCAAATGTACTTGGTCATACTTGTGGGCTCTTGTACTATTGCTACGATAATACATATGGAGTACGACTTTTACATTTGGCAAATCCCCTGAAGTCTGAAGTTTCAATGCTCCATGATTCCTTTGTTCTTAGCCTGATTTTTGTTATATATATAAAGAATCTTACCATTTTCTTGATACGTCATTTGTTCTATGCATTATATTAATCAATTATCGTCCACTTTATTAATTATGAACAATAGTGTGCATTTGGTTGTGTTAATGTTTTTTGTTTCACTCCTGTAGGAATGTAAAACTTACAGAGGTTTCTGTGAGCGATAAACTTGAAGGTTTCCGTGCATCTAAAGAGGTATGCTGCTAACGTGACCTTTTTTCAAGCTTAAGTATACTATATTACTAGAGATCTTTTATAACTGCCATAAACAGCTATAGTTACTGCCATTACCATTTTTAAAAGTCAAAAGCCAGTAAGTGCACTTTTGGTATTATGGAAATTGTTAAAATAAACAAGTTCCTCATACTTACCTATGACTTTGTTGTAGCAACCCCAAATATCCATTGAAACTTTGGAACTGATATAGCCAAGGCCCATCGGTTTCATTTGTATCCGTTAAAGAGACAATGGAAAAAATTCTACTATACTAACT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