BGIOSGA022429

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References

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Structured Information

Gene Name

BGIOSGA022429

Description

Putative uncharacterized protein

Definition

Oryza sativa Indica Group BGIOSGA022429, complete gene.

LocusTag

OSJNBB0036B04.6

Ensembl Transcript ID

BGIOSGA022429-TA

Ensembl Protein ID

BGIOSGA022429-PA

Length

12795

Source

Oryza sativa Indica Group

 ORGANISM  Oryza sativa Indica Group
           Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; Embryophyta; Tracheophyta;
           Spermatophyta; Magnoliophyta; Liliopsida; Poales; Poaceae; BEP
           clade; Ehrhartoideae; Oryzeae; Oryza.
Chromosome

Chromosome 6

Location

Chromosome 6:4695065..4707859

Sequence Coding Region

4695065..4695112,4695820..4695870,4696173..4696194,4696309..4696423,4696518..4696550
,4697058..4697183,4698063..4698169,4698259..4698330,4698405..4698785
,4700930..4701087,4701605..4701787,4702321..4702411,4703160..4703313
,4704281..4704401,4704492..4704575,4704970..4705089,4705205..4705417
,4705506..4705568,4705692..4705807,4706156..4706214,4707540..4707859

Genome Context

<gbrowseImage1> name=IndicaChromosome06:4695065..4707859 source=RiceIndica06 preset=GeneLocation </gbrowseImage1>

Gene Structure

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Coding Sequence

<cdnaseq>ATGGGGGATAGGCCAGACATGGGTGCTGGTGTGGCCTTGCGATTCTCGCATAATGATTGGACCCTTGAGGAAGACTCAAAAGCCCTACATTTTCTCCAGCCAGATTTGGTACTTTTTACAGGTGATTATGGCAACGAGAATGTTCAACTTGTTAAAAGCATTTCAGATCTTCAGCTCCCCAAAGCAGCTATTCTTGGGAATCATGACTGTTGGCACACGTATCAGTTTTCAGAGAAGAAGGTAGATCGTGTCCAGCTTCAGCTAGAGAGCCTTGGTGAGCAGCATGTTGGGTACAAATGTTTGGATTTTCCAACAATAAAGCTGAGTGTTGTTGGTGGACGACCATTTTCCTGCGGGGGTAATAGGATATTTAGACCAAAGCTTCTGTCAAAATGGTATGGTGTCAATGATATGGCTGAAAGTGCAAAGAGGATATATGATGCTGCTACAAATGCACCAAAGGAGCATGCTGTCATATTACTGGCACACAATGGGCCAACAGGTCTAGGCTCAAGAATGGAGGATATTTGTGGGCGGGATTGGGTTGCTGGTGGTGGTGATCATGGTGATCCAGATCTGGAGCAAGCCATATCTGATCTGCAAAGAGAAACCGGAGTTTCGATACCGCTGGTCGTGTTCGGTCACATGCACAAGAGCCTCGCCTACGGGAGAGGCCTTCGGAAGATGATTGCCTTTGGAGCTAACCGGACTATATATCTGAACGGCGCCGTTGTGCCTAGAGTGAATCATGCGCAATCAAGCAGGCAGCCTGCAATCTCCACAAGCGAAAAGACTGGGCTCGAAGGATTAACAGGACTGATGGTTCCGACATCGCGGGCGTTCACCATTGTTGATCTCTTTGAAGGCGCCGTTGAGAAAATCTCCGAGGTCTGGGTGACGGTGGGTGATGCCAGGACGGAGCTTGAGCAGGAATTAGTCTTGTACAAGCAACCACATAAAAGTGTCCCTTCCAACATTGCCATTTGGAGCACTATGGGTTGGTTGACCAAATTTTTTAGAGGTTCAACCCACAAAATCTCGGAAGGGCAATACCACAGCAAACCCGCGGAGGAGACGATATGGAATGGACCCTCTAATTCCGCAGTTGTGACGATGGTGTACCCACTAGAGTCCACATTTGGTCAACTCGACTTGCTATTGTTGGCTACTGATCTCCGTCAACTTGTCATTGACGATGTAGATTGTTGTAAGTTGAGGCAACAGGCCCAACCAGTCTTGCACCTCATGTACTCACAATTGCAACTCTTGCAAACTTCTCATGCTCATCAGCATGGTGATGTCCCGTCAGAATTTGACAATGAAGATATCGCTCGTGCTATATCACTCTCTCTATTAGAGGAGGAACAAAGAAAGGCAAAGGCAATAGAAAAGGACATGCATTTGGAGGAGGATGAACAACTTGCAAGAGCTATCCAGGAAAGTTTGAATGTTGAATCGCCTCCTCGTGCTCGTGAAAATGGCAACGCCAATGGTGGCAATATGTATCAACCACTGCCATTTATGTTTTCTTCTGGATTCAGGACTTGTGCCGGATGTCACAGTGAGATTGGTCATGGGCGTTTCCTTAGTTGCATGGGAGCTGTTTGGCATCCAGAATGTTTTCGCTGTCATGCTTGTAATCAACCAATATATGACTATGAGTTCTCCATGTCGGGAAACCATCCATACCATAAAACATGCTACAAGGAGCGCTTTCACCCAAAATGTGATGTCTGCAAGCAATTTATTCCTACAAATATGAATGGCCTGATTGAATATAGAGCACATCCTTTCTGGTTACAAAAATACTGTCCATCACATGAGGTGGACGGTACTCCAAGATGCTGTAGTTGTGAAAGAATGGAGCCAAGGGAATCAAGATATGTATTGCTGGACGATGGTCGCAAACTCTGCCTAGAGTGCCTTGATTCTGCAGTTATGGATACGAGCGAGTGCCAACCTCTTTATCTTGAAATACAGGAATTTTATGAAGGCCTAAATATGAAAGTGGAACAACAAGTTCCCTTGCTTCTTGTAGAAAGACAGGCTTTAAATGAAGCCATGGAAGGAGAGAAGACTGGTCACCACCATCTTCCAGAAACAAGAGGTTTATGCTTATCAGAAGAGCAAACTGTCAGCACGATATTGAGGAGACCAAGAATGGCTGGAAATAAAGTTATGGAAATGATAACGGAGCCATATAGGTTGACTCGTCGATGTGAAGTGACTGCAATTCTCATTCTTTATGGTCTCCCAAGATTGTTGACAGGTTCAATTTTAGCTCATGAGATGATGCATGCGTGGTTGCGACTTAAAGGATATCGCACACTTAGTCCAGACGTAGAAGAGGGCATATGCCAAGTTCTTGCTCACATGTGGATTGAGTCAGAGATCATTGCAGGATCAGGCAGTAATGGTGCTTCAACGTCTTCATCCTCATCAGCATCCACATCATCGAAAAAGGGGGGAAGATCTCAGTTTGAGCGAAAGCTTGGTGATTTTTTCAAGCACCAAATTGAGTCAGATACCTCAATGGCCTATGGCGATGGTTTTAGAGCTGGCAACCGAGCTGTTCTTCAGTATGGTCTAAAGCGCACCCTTGAGCATATCCGGTTAACAGGGACTTTCCCATTTTGA</cdnaseq>

Protein Sequence

<aaseq>MGDRPDMGAGVALRFSHNDWTLEEDSKALHFLQPDLVLFTGDYGNENVQLVKSISDLQLPKAAILGNHDCWHTYQFSEKKVDRVQLQLESLGEQHVGYKCLDFPTIKLSVVGGRPFSCGGNRIFRPKLLSKWYGVNDMAESAKRIYDAATNAPKEHAVILLAHNGPTGLGSRMEDICGRDWVAGGGDHGDPDLEQAISDLQRETGVSIPLVVFGHMHKSLAYGRGLRKMIAFGANRTIYLNGAVVPRVNHAQSSRQPAISTSEKTGLEGLTGLMVPTSRAFTIVDLFEGAVEKISEVWVTVGDARTELEQELVLYKQPHKSVPSNIAIWSTMGWLTKFFRGSTHKISEGQYHSKPAEETIWNGPSNSAVVTMVYPLESTFGQLDLLLLATDLRQLVIDDVDCCKLRQQAQPVLHLMYSQLQLLQTSHAHQHGDVPSEFDNEDIARAISLSLLEEEQRKAKAIEKDMHLEEDEQLARAIQESLNVESPPRARENGNANGGNMYQPLPFMFSSGFRTCAGCHSEIGHGRFLSCMGAVWHPECFRCHACNQPIYDYEFSMSGNHPYHKTCYKERFHPKCDVCKQFIPTNMNGLIEYRAHPFWLQKYCPSHEVDGTPRCCSCERMEPRESRYVLLDDGRKLCLECLDSAVMDTSECQPLYLEIQEFYEGLNMKVEQQVPLLLVERQALNEAMEGEKTGHHHLPETRGLCLSEEQTVSTILRRPRMAGNKVMEMITEPYRLTRRCEVTAILILYGLPRLLTGSILAHEMMHAWLRLKGYRTLSPDVEEGICQVLAHMWIESEIIAGSGSNGASTSSSSSASTSSKKGGRSQFERKLGDFFKHQIESDTSMAYGDGFRAGNRAVLQYGLKRTLEHIRLTGTFPF</aaseq>

Gene Sequence

<dnaseqindica>1..48#756..806#1109..1130#1245..1359#1454..1486#1994..2119#2999..3105#3195..3266#3341..3721#5866..6023#6541..6723#7257..7347#8096..8249#9217..9337#9428..9511#9906..10025#10141..10353#10442..10504#10628..10743#11092..11150#12476..12795#ATGGGGGATAGGCCAGACATGGGTGCTGGTGTGGCCTTGCGATTCTCGGTGGGTTTCGTGTGGCGTAGCATAGGGGATTCGGAGTGAGAGGGAGATGGCTTTGGGGACGGAAGCATTCTACCAATTCCCGCCCCCCCCCCCCCCCTCCCCAAAAAAAAAAAGAAGAAAAAAACTGAGGCATCTATACTTGTTGACTTTCTTAGCTCAGTTTAGCTCCGATCTTGAGATGCTGTGAGAGGAGTGCATGATGAGTGTGATTCATCACTGTGGCTGTGTGGGGGTTTGCGTTTAAGGTGGCGTTTGATTGTAGTAGAAGAAGTTTGGATGGAGGTGAATTTGGTGGTGCGAAGAGGTTCATGAGGGATAAAGCTTTGACTTCCATCTGAAGGGACAAATGCAGAGATAGTTTTTTTTTGTGAACTACAATGTGAAAAGCCAAAACTGTAAAATGTCTTCTTGGAGAGAAGATGCAGGGAGTGAGATTTTAGCGGAGTGACAACATATTGTGGCTTGAACCAGTCACTAGGATAGTGTGTTTTGATACCATGCTTTGTTGATCTTGTGGGTTTGAAATCTCTTAGCTCGCTTTCCTGTCGAGATGTGCTTTACTTCTTGTACTAAGAGGAATATGATGGCTTTTACTTTATTTGCATGCTTGACTTGGTTATAACATCAATTATGGCTCAAGGGATTATAATATCCTCTTGATGAGAACAATGCACTAATTGGCTGTTGTGATGTGCTGAACATTGCAGCATAATGATTGGACCCTTGAGGAAGACTCAAAAGCCCTACATTTTCTCCAGGTATTGCAAATCCAGATAAATTCAGTCAATTGTATCTGTGTATTGCATTAAGTTATTCACATCTGATTATTGTAGCATGTCTCTAGTTTTATGATGTAAGATCATCTGAAGTGCAGTCTGTCCTTTTCTTTATTCATGTTCTACGCCTTTTTGTATGCCTGCCATCAACATGTACTGATGTACAGTCCAGCTGCCAAAATGACACTGGAGTTTGATAGAAAAATATCCGTACTACATTTATTTTCTATAACATTATGTTTCTTATTCCCAGAAGATCTAACTTTCTCTCCGTGTGAATGCAGCCAGATTTGGTACTTTTTACAGGTGTGCCCTTTGCCCTATTATATCTGTACTACATAATATACTCATTACTTTGTGAAGTTACACTTAAATGCTTATTCCTTACATCTCCTGTTTGCTGTCCTCCATTTATGGCAGGTGATTATGGCAACGAGAATGTTCAACTTGTTAAAAGCATTTCAGATCTTCAGCTCCCCAAAGCAGCTATTCTTGGGAATCATGACTGTTGGCACACGTATCAGTTTTCAGAGAAGTAAGAATAATTCTTTCATCCGACAAGGATAGTGTTCAACATAAATGCACTGATATTTGATGAAATGATGAATGTATCCTTGGTTGGCATTCAGGAAGGTAGATCGTGTCCAGCTTCAGCTAGAGAGGTAAGATGTTCCTCCTTTAATGTGAATATGCTTTTATGTTTAATACAACAGTGTTATGATTAACACTAGCATTTGATGAATTTCTATTGTAAGAAATGCCAATGAATGGGTTATATGAGTTGCACAATTGTTGTTATTTTGAAGGAAAACTTGCATTATTTAAAGTTGTTTCAGTTGCACCAGAGCACTAAACAGGTATTACTTTGATTTTTAGCATTGTTGCTAGGTCATTTCATGATTTGCTTCTCTTTTTTTTTGAAAGAAATAAAAGAAGCTGATACTGCACTTAAATCCAAGAAGAAGTGAGTTGTTTAAAACTGTGCTAGTAATTGCTGGAAAAAATGTGATTCTCAGGAAATTTTGGCCTGATTATTCCATGATTTTTAATAAGCTGTGGCAATTCAGGATGATTCTGGGTTATAACTTGTCTTCACCAGACTCTGGTACAATTTTTGCAGACCTTGCGGCAAGTAATTTTCTGTTGTTATTTTTTGTTGCCAATTTCAGCCTTGGTGAGCAGCATGTTGGGTACAAATGTTTGGATTTTCCAACAATAAAGCTGAGTGTTGTTGGTGGACGACCATTTTCCTGCGGGGGTAATAGGATATTTAGACCAAAGCTTCTGTCAAAATGGTTGGTAAGAGACATGCTAACCAATAGATACACATGTTTATCAGTTTTCTTTGGTATATACTTCTCCTTACCAAGGAGTCCTTAGTTGTCCTTTCTTTTTCATGAAACAGTAGAAGAGGGCTCTACTGAAAAAATACTACTGCTATTTATAATAGATTTATGTAAAATAGACCTAATGATCCACAGTATCCAAAAAATAGTTACAAGGTTCATGTGAAACATGCAGTAATTTAGGTAAGGCATAAGAGAAATGAGTTGCAGCATACTTTTCCTAAAGATACTAGTTTGGTATATCCTTGTCATTTTGGTCTACAAGTCATTTTTACCTTCCCTTCTTTTCATATTGAATTAAGAAGCAAACGATGTATGTGAACTCGTGAAATGATGGGTGAATGGCACAATAAACAGTAGAGTTACCAACTTATACTTCGTTCTCATCTGTAGCACTACTGTATTAGGTAGTGAATATTTTAGAGTTTGATGATATATATTGTTGATAGCTGTCATTCTTAGTTGCTTCACCGGGTTGGTTTCTTATTGCATACTACTTCTGCTGTGTAGTAACATGCAGTGAAATCGAGCTACAGTGGTAAGGATATTGGTGGAGTAGGTGATTATGCTTTGACCTGATTCTTGTCGATCAGCGCAGTATATATTGGTAATGATAAAATAAACATAGCACACTGTAATAAGAAGTGTGAAGCTATAGTAAATTATTATTTTGGTGGTGTAGTCAGGGATGGTTAGTCCACCTCGTAAAACAAAGTGCATAAGACAGACACAATACTGCTACCTTTTTTTACTTGGTGAACTCTTACTCTTGTTCATAATTGGAAACTTGTCTACCATCGTTTATTTGATCCTACGATTATTATGTAGGTATGGTGTCAATGATATGGCTGAAAGTGCAAAGAGGATATATGATGCTGCTACAAATGCACCAAAGGAGCATGCTGTCATATTACTGGCACACAATGGGCCAACAGGTGTCTGAACGTTTAAACTAGCAAACTACATATACTTGCACTTGCACACATATGCTGTAACATGCCTACATTAAATTATGGTTACACAGGTCTAGGCTCAAGAATGGAGGATATTTGTGGGCGGGATTGGGTTGCTGGTGGTGGTGATCATGGTGATCCAGGTCTGATATTCCATCGATGATACTTCCACTTGTACAGTTGCTTAATATGCCATCTTAGACAAGAACCTCCGCAGATCTGGAGCAAGCCATATCTGATCTGCAAAGAGAAACCGGAGTTTCGATACCGCTGGTCGTGTTCGGTCACATGCACAAGAGCCTCGCCTACGGGAGAGGCCTTCGGAAGATGATTGCCTTTGGAGCTAACCGGACTATATATCTGAACGGCGCCGTTGTGCCTAGAGTGAATCATGCGCAATCAAGCAGGCAGCCTGCAATCTCCACAAGCGAAAAGACTGGGCTCGAAGGATTAACAGGACTGATGGTTCCGACATCGCGGGCGTTCACCATTGTTGATCTCTTTGAAGGCGCCGTTGAGAAAATCTCCGAGGTCTGGGTGACGGTGGGTGATGCCAGGACGGAGCTTGAGCAGGAATTAGTCTTGTACAAGCAACCACGTGAGCACATATGACTTCCACAAACTGGTACCGAAACTAAGTACTCCGTACATGAATGTAAATGTGATACTAGTATGATCCGAATTTCGCAATACAGAGAAGTACAAAACGCACTGTCAAAATGTCCGTGGAGTGAAGTAATGCAATGTAAATTCGCTGATGGTTTGCCTGCACCAGCACCTCCCTATGTAATCATGTTCTTTGCTCACTAAATTCTAACACCAAGGTTTTCTGTCATGCTTACATGAGAACTGCCTTTAATTTCAGTAAACAGCCAAAGTGGGTCATATTTCCTTCAGAAACTCGTCTCTACACCACTACATATTAGGAAAAAAAAATGGTCGTTGGAAGATTGCACATGGAAAATTCAAACTGGTGACAAAATCAAACAGCGCCATGCCTAGGTTCAAAGTCCAAACGTAGCGCTCAACTGCTACCACCAAGTCTCCTGTACGCTCTGCCGGCGTCAACACGACCCCTCGTCGCTTGCTTCTCCGCGTGAGCTCTCGCTCGCCTCCCGGCGCCGGTTTCGTGTCCCTCTTCGTCGTCTCACGCGGTGACGGCGGTGGTCCGTCCGTCCGTCGTCGGGTTCCTCCGGAAAACCCCTGAAAAAAACGCAACCAGAGCCAAAAACAAATATAACCAATCCGATATAAGCGAATAGGTTCCGTGCAAAACTGCATATTTGACTTTCTGAAAGGGAAAAGAAACAAATGACAACTTTAAGGATGTATAGGCTGTCTAGTCGTTTCTTGTGAGGTGGGTATTTTGATTTTAAATATGTAGTTACGCTATTTTATTTATATCTGTTTAGATAATTATTCGATAACTTGTAAACTTTCATCTAATTCACAATTAGATGGTCGTATTCGCTTACAGGAACAGATCTAGCGTCAAGTTAGAGGGAGTAATGCACCGGCGCGTAGCTCGGTGATAGGACAGCTACTTAGAGTAAGATGGTATTTAGATCCAGAGACTTATTATAGGTGGGTTTTATTAATAGTCTACGTTTAATATTTATAATTAGTGC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